New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 2771953 = | 102 (1.110) | 8 (0.090) | 7/260 | NT | 7.8% | coding (202/315 nt) | yfjU | CP4‑57 prophage; ArsC family protein YfjU |
? | NC_000913 | 2771980 = | 93 (1.070) | coding (175/315 nt) | yfjU | CP4‑57 prophage; ArsC family protein YfjU |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
TTCATATGATCAACCATTCTTGATAAACCCATGAGACGGACTAACTTTTTCATTAAAATTAAAAAGATATGAATGAATACTGCGGATATCAACATGGCCAATCACATTCAAGGACAAGGCAGGCATCAGGTGACATTGCTCCCTGATGCACTCGATGATTTTGTCACTGAAGATATCTGAAATAAGTTTAATCAGTTCATCACGGGTCGGTGGCATATCGAGATAATTAATTATTGTCGGTTCGTTGCCGTTGTTATGAAGCATCTCCAGCGTGTTGCGTGAGGTGCCACAGGCCGGGT > NC_000913/2771831‑2772129 | ttCATATGATCAACCATTCTTGATAAACCCATGAGACGGACTAACTTTTTCATTAAAATTAAAAAGATATGAATGAATACTGCGGATATCAACATGGCCAATCACATTCAAGGACAAGGCAGGCATCAGGTGACATTGCTCCCTGATGCa > 1:995117/1‑150 (MQ=255) gctggagatgcttcataacaacggcaacgaaccgacaataattaattatctcgatatgccaccgacccgtgatgaactgattaaacttatttcagatatcttcagtgacaaaatcatcgagtGCATCAGGTGACATTGCTCCCTGATGCa > 2:351784‑M1/123‑150 (MQ=255) ctggagatgcttcataacaacggcaacgaaccgacaataattaattatctcgatatgccaccgacccgtgatgaactgattaaacttatttcagatatcttcagtgacaaaatcatcgagtGCATCAGGTGACATTGCTCCCTGATGCAc > 2:1124938‑M1/122‑150 (MQ=255) 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ttcataacaacggcaacgaaccgacaataattaattatctcgatatgccaccgacccgtgatgaactgattaaacttatttcagatatcttcagtgacaaaatcatcgagtGCATCAGGTGACATTGCTCCCTGATGCACTCGATGAttt > 1:937987‑M1/112‑150 (MQ=255) aCCATTCTTGATAAACCCATGAGACGGACTAACTTTTTCATTAAAATTAAAAAGATATGAATGAATACTGCGGATATCAACATGGCCAATCACATTCAAGGACAAGGCAGGCATCAGGTGGCATTGCTCCCTGATGCACTCGATGAtttt > 2:304699/1‑150 (MQ=255) ccATTCTTGATAAACCCATGAGACGGACTAACTTTTTCATTAAAATTAAAAAGATATGAATGAATACTGCGGATATCAACATGGCCAATCACATTCAAGGACAAGGCAGGCATCAGGTGACATTGCTCCCTGATGCACTCGATGATTTTg > 1:1395751/1‑150 (MQ=255) ccATTCTTGATAAACCCATGAGACGGACTAACTTTTTCATTAAAATTAAAAAGATATGAATGAATACTGCGGATATCAACATGGCCAATCACATTCAAGGACAAGGCAGGCATCAGGTGACATTGCTCCCTGATGCACTCGATGATTTTg < 2:310910/150‑1 (MQ=255) cATTCTTGATAAACCCATGAGACGGACTAACTTTTTCATTAAAATTAAAAAGATATGAATGAATACTGCGGATATCAACATGGCCAATCACATTCAAGGACAAGGCAGGCATCAGGTGACATTGCTCCCTGATGCACTCGATGATTTTGt < 1:1333928/150‑1 (MQ=255) 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aTTGCTCCCTGATGCACTCGATGATTTTGTCACTGAAGATATCTGAAATAAGTTTAATCAGTTCATCACGGGTCGGTGGCATATCCAGATAATTAATTATTGTCGGTTCGTTGCCGTTGTTATGAAGCATCTCCAGCGTGTTGCGTGAgg < 2:429159/150‑1 (MQ=255) gCTCCCTGATGCACTCGATGATTTTGTCACTGAAGATATCTGAAATAAGTTTAATCAGTTCATCACGGGTCGGTGGCATATCGAGATAATTAATTATTGTCGGTTCGTTGCCGTTGTTATGAAGCATCTCCAGCGTGTTGCGTGAGGTGc > 1:933986/1‑150 (MQ=255) cccTGATGCACTCGATGATTTTGTCACTGAAGATATCTGAAATAAGTTTAATCAGTTCATCACGGGTCGGTGGCATATCGAGATAATTAATTATTGTCGGTTCGTTGCCGTTGTTATGAAGCATCTCCAGCGTGTTGCGTGAGGTGCcac > 1:982341/1‑150 (MQ=255) cccTGATGCACTCGATGATTTTGTCACTGAAGATATCTGAAATAAGTTTAATCAGTTCATCACGGGTCGGTGGCATATCGAGATAATTAATTATTGTCGGTTCGTTGCCGTTGTTATGAAGCATCTCCAGCGTGTTGCGTGAGGTGCcac > 2:1458121/1‑150 (MQ=255) cccTGATGCACTCGATGATTTTGTCACTGAAGATATCTGAAATAAGTTTAATCAGTTCATCACGGGTCGGTGGCATATCGAGATAATTAATTATTGTCGGTTCGTTGCCGTTGTTATGAAGCATCTCCAGCGTGTTGCGTGAGGTGCcac < 2:238187/150‑1 (MQ=255) cctgatgcACTCGATGATTTTGTCACTGAAGATATCTGAAATAAGTTTAATCAGTTCATCACGGGTCGGTGGCATATCGAGATAATTAATTATTGTCGGTTCGTTGCCGTTGTTATGAAGCATCTCCAGCGTGTTGCGTGAGGTGCcaca > 1:419020‑M2/9‑150 (MQ=255) tgatgcACTCGATGATTTTGTCACTGAAGATATCTGAAATAAGTTTAATCAGTTCATCACGGGTCGGTGGCATATCgag > 1:29532‑M2/7‑79 (MQ=255) tgatgcACTCGATGATTTTGTCACTGAAGATATCTGAAATAAGTTTAATCAGTTCATCACGGGTCGGTGGCATATCgag < 2:29532‑M2/73‑1 (MQ=255) tgatgcACTCGATGATTTTGTCACTGAAGATATCTGAAATAAGTTTAATCAGTTCATCACGGGTCGGTGGCATATCGAGATAATTAATTATTGTCGGTTCGTTGCCGTTGTTATGAAGCATCTCCAGCGTGTTGCGTGAGGTGCCACAgg > 2:799060‑M2/7‑150 (MQ=255) cACTCGATGATTTTGTCACTGAAGATATCTGAAATAAGTTTAATCAGTTCATCACGGGTCGGTGGCATATCGAGATAATTAATTATTGTCGGTTCGTTGCCGTTGTTATGAAGCATCTCCAGCGTGTTGCGTGAGGTGCCACAGGCCggg < 1:799060‑M2/149‑1 (MQ=255) aCTCGATGATTTTGTCTCTGAAGATATCTGAAATAAGTTTAATCAGTTCATCACGGGTCGGTGGCATATCGAGATAATTAATTATTGTCGGTTCGTTGCCGTTGTTATGAAGCATCTCCAGCGTGTTGCGTGAGGTGCCACAGGCCGGGt > 2:912543/1‑150 (MQ=255) aCTCGATGATTTTGTCACTGAAGATATCTGAAATAAGTTTAATCAGTTCATCACGGGTCGGTGGCATATCGAGATAATTAATTATTGTCGGTTCGTTGCCGTTGTTATGAAGCATCTCCAGCGTGTTGCGTGAGGTGCCACAGGCCGGGt < 2:1375198/150‑1 (MQ=255) | TTCATATGATCAACCATTCTTGATAAACCCATGAGACGGACTAACTTTTTCATTAAAATTAAAAAGATATGAATGAATACTGCGGATATCAACATGGCCAATCACATTCAAGGACAAGGCAGGCATCAGGTGACATTGCTCCCTGATGCACTCGATGATTTTGTCACTGAAGATATCTGAAATAAGTTTAATCAGTTCATCACGGGTCGGTGGCATATCGAGATAATTAATTATTGTCGGTTCGTTGCCGTTGTTATGAAGCATCTCCAGCGTGTTGCGTGAGGTGCCACAGGCCGGGT > NC_000913/2771831‑2772129 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |