New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4113199 = | 71 (0.770) | 4 (0.050) | 4/264 | NT | 5.5% | coding (233/300 nt) | yiiS | DUF406 domain‑containing protein YiiS |
? | NC_000913 | 4113226 = | 69 (0.780) | coding (260/300 nt) | yiiS | DUF406 domain‑containing protein YiiS |
CGAAGAAGCAGAGTCTTTTATGACCAAACTGAAAGAGCTTGCCGCCGCTACATCCTCTGCAGATGAAGGGGCCAGCGTGGCCTATAAGATTAAGGATCTGGAGGGGCAAGTTGAGCTTGATGCGGCCTTCACTTTCTCATGCCAGGCCGAGATGATTATTTTTGAGTTATCACTGCGTTCGTTAGCTTGATGGAGTTGCTTTAGAAGGAGTTAAACATGGCTTATAAACACATTGGCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAG > NC_000913/4113077‑4113375 | cgAAGAAGCAGAGTCTTTTATGACCAAACTGAAAGAGCTTGCCGCCGCTACATCCTCTGCAGATGAAGGGGCCAGCGTGGCCTATAAGATTAAGGATCTGGAGGGGCAAGTTGAGCTTGATGCGGCCTTCACTTTCTCATGCCAGGCCga < 1:140823/150‑1 (MQ=255) aaggcatcttcttcattcccggaaattgccacgccaatgtgtttataagccatgtttaactccttctaaagcaactccatcaagctaacgaacgcagtgataactcaaaaataatcatctCGGCCTTCACTTTCTCATGCCAGGCCgaga > 1:839346‑M1/121‑150 (MQ=255) aagaagCAGAGTCTTTTATGACCAAACTGAAAGAGCTTGCCGCCGCTACATCCTCTGCAGATGAAGGGGCCAGCGTGGCCTATAAGATTAAGGATCTGGAGGGGCAAGTTGAGCTTGATGCGGCCTTCACTTTCTCATGCCAGGCCgaga > 2:945392/1‑150 (MQ=255) agagTCTTTTATGACCAAACTGAAAGAGCTTGCCCCCGCTACATCCTCTGCAGATGAAGGGGCCAGCGTGGCCTATAAGATTAAGGATCTGGAGGGGCAAGTTGAGCTTGATGCGGCCTTCACTTTCTCATGCCAGGCCGAGATGattat > 2:311208/1‑150 (MQ=255) gagTCTTTTATGACCAAACTGAAAGAGCTTGCCGCCGCTACATCCTCTGCAGATGAAGGGGCCAGCGTGGCCTATAAGATTAAGGATCTGGAGGGGCAAGTTGAGCTTGATGCGGCCTTCACTTTCTCATGCCAGGCCGAGATGattatt > 1:318185/1‑150 (MQ=255) tcctccatccccgaaaatgccaccccaatgggtttataagccatgtttaactccttctaaagcaactccatcaagctaacgaacgcagtgataactcaaaaataatcatctCGGCCTTCACTTTCTCATGCCAGGCCGAGATGATTAttt > 1:519497‑M1/112‑150 (MQ=255) gTCTTTTATGACCAAACTG‑AAGAGCTTGCCGCCGCTACATCCTCTGCAGATGAAGGGGCCAGCGTGGCCTATAAGATTAAGGATCTGGAGGGGCAAGTTGAGCTTGATGCGGCCTTCACTTTCTCATGCCAGGCCGAGATGATTAttttt > 2:548929/1‑150 (MQ=255) tttttATGACAAAACTGAAAGAGATTGCCGCCGCTACATCCTCTGCAGATGAAGGGGCCAGCGTGGCCTATAAGATTAAGGATCTGGAGGGGAAAGTTGAGCTTGATGCGGCCTTCACTTTCTCATGCCAGGCCGAGATGATTATTTTTg < 2:89450/149‑1 (MQ=255) cTTTTATGACCAAACTGAAAGAGCTTGCCGCCGCTACATCCTCTGCAGATGAAGGGGCCAGCGTGGCCTATAAGATTAAGGATCTGGAGGGGCAAGTTGAGCTTGATGCGGCCTTCACTTTCTCATGCCAGGCCGAGATGATTATTTTTg < 2:1513849/150‑1 (MQ=255) tttATGACCAAACTGAAAGAGCTTGCCGCCGCTACATCCTCTGCAGATGAAGGGGCCAGCGTGGCCTATAAGATTAAGGATCTGGAGGGGCAAGTTGAGCTTGATGCGGCCTTCACTTTCTCATGCCAGGCCGAGATGATTATTTTTGAg < 1:805392/150‑1 (MQ=255) tATGACCAAACTGAAAGAGCTTGCCGCCGCTACATCCTCTGCAGATGAAGGGGCCAGCGTGGCCTATAAGATTAAGGATCTGGAGGGGCAAGTTGAGCTTGATGCGGCCTTCACTTTCTCATGCCAGGCCGAGATGATTATTTTTGAGtt > 1:606173/1‑150 (MQ=255) tATGACCAAACTGAAAGAGCTTGCCGCCGCTACATCCTCTGCAGATGAAGGGGCCAGCGTGGCCTATAAGATTAAGGATCTGGAGGGGCAAGTTGAGCTTGATGCGGCCTTCACTTTCTCATGCCAGGCCGAGATGATTATTTTTGAGtt < 2:1063354/150‑1 (MQ=255) tATGACCAAACTGAAAGAGCTTGCCGCCGCTACATCCTCTGCAGATGAAGGGGCCAGCGTGGCCTATAAGATTAAGGATCTGGAGGGGCAAGTTGAGCTTGATGCGGCCTTCACTTTCTCATGCCAGGCCGAGATGATTATTTTTGAGtt > 1:615041/1‑150 (MQ=255) aTGACCAAACTGAAAGAGCTTGCCGCCGCTACATCCTCTGCAGATGAAGGGGCCAGCGTGGCCTATAAGATTAAGGATCTGGAGGGGCAAGTTGAGCTTGATGCGGCCTTCACTTTCTCATGCCAGGCCGAGATGATTATTTTTGAGTTa > 1:486339/1‑150 (MQ=255) aCCAAACTGAAAGAGCTTGCCGCCGCTACATCCTCTGCAGATGAAGGGGCCAGCGTGGCCTATAAGATTAAGGATCTGGAGGGGCAAGTTGAGCTTGATGCGGCCTTCACTTTCTCATGCCAGGCCGAGATGATTATTTTTGAGTTATCa > 1:1202639/1‑150 (MQ=255) cAAACTGAAAGAGCTTGCCGCCGCTACATCCTCTGCAGATGAAGGGGCCAGCGTGGCCTATAAGATTAAGGATCTGGAGGGGCAAGTTGAGCTTGATGCGGCCTTCACTTTCTCATGCCAGGCCGAGATGATTATTTTTGAGTTATCACt > 1:924724/1‑150 (MQ=255) gAAAGAGCTTGCCGCCGCTACATCCTCTGCAGATGAAGGGGCCAGCGTGGCCTATAAGATTAAGGATCTGGAGGGGCAAGTTGAGCTTGATGCGGCCTTCACTTTCTCATGCCAGGCCGAGATGATTATTTTTGAGTTATCACTGcgttc > 2:370174/1‑150 (MQ=255) gAAAGAGCTTGCCGCCGCTACATCCTCTGCAGATGAAGGGGCCAGCGTGGCCTATAAGATTAAGGATCTGGAGGGGCAAGTTGAGCTTGATGCGGCCTTCACTTTCTCATGCCAGGCCGAGATGATTATTTTTGAGTTATCACTGcgttc > 1:1388319/1‑150 (MQ=255) 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cgccgcTACATCCTCTGCAGATGAAGGGGCCAGCGTGGCCTATAAGATTAAGGATCTGGAGGGGCAAGTTGAGCTTGATGCGGCCTTCACTTTCTCATGCCAGGCCGAGATGATTATTTTTGAGTTATCACTGCGTTCGTTAGCTTGATg > 1:943777/1‑150 (MQ=255) gccgcTACATCCTCTGCAGATGAAGGGGCCAGCGTGGCCTATAAGATTAAGGATCTGGAGGGGCAAGTTGAGCTTGATGCGGCCTTCACTTTCTCATGCCAGGCCGAGATGATTATTTTTGAGTTATCACTGCGTTCGTTAGCTTGATgg > 1:291371/1‑150 (MQ=255) gcTACATCCTCTGCAGATGAAGGGGCCAGCGTGGCCTATAAGATTAAGGATCTGGAGGGGCAAGTTGAGCTTGATGCGGCCTTCACTTTCTCATGCCAGGCCGAGATGATTATTTTTGAGTTATCACTGCGTTCGTTAGCTTGATGGAGt < 2:205549/150‑1 (MQ=255) tACATCCTCTGCAGATGAAGGGGCCAGCGTGGCCTATAAGATTAAGGATCTGGAGGGGCAAGTTGAGCTTGATGCGGCCTTCACTTTCTCATGCCAGGCCGAGATGATTATTTTTGAGTTATCACTGCGTTCGTTAGCTTGATGGAGTTg < 2:1484229/150‑1 (MQ=255) ccTCTGCAGATGAAGGGGCCAGCGTGGCCTATAAGATTAAGGATCTGGAGGGGCAAGTTGAGCTTGATGCGGCCTTCACTTTCTCATGCCAGGCCGAGATGATTATTTTTGAGTTATCACTGCGTTCGTTAGCTTGATGGAGTTGCTTTa < 1:1290098/150‑1 (MQ=255) tctGCAGATGAAGGGGCCAGCGTGGCCTATAAGATTAAGGATCTGGAGGGGCAAGTTGAGCTTGATGCGGCCTTCACTTTCTCATGCCAGGCCGAGATGATTATTTTTGAGTTATCACTGCGTTCGTTAGCTTGATGGAGTTGCTTTAGa < 2:320615/150‑1 (MQ=255) tctGCAGATGAAGGGGCCAGCGTGGCCTATAAGATTAAGGATCTGGAGGGGCAAGTTGAGCTTGATGCGGCCTTCACTTTCTCATGCCAGGCCGAGATGATTATTTTTGAGTTATCACTGCGTTCGTTAGCTTGATGGAGTTGCTTTAGa < 2:326557/150‑1 (MQ=255) tGCAGATGAAGGGGCCAGCGTGGCCTATAAGATTAAGGATCTGGAGGGGCAAGTTGAGCTTGATGCGGCCTTCACTTTCTCATGCCAGGCCGAGATGATTATTTTTGAGTTATCACTGCGTTCGTTAGCTTGATGGAGTTGCTTTAGAAg < 2:318185/150‑1 (MQ=255) aGATGAAGGGGCCAGCGTGGCCTATAAGATTAAGGATCTGGAGGGGCAAGTTGAGCTTGATGCGGCCTTCACTTTCTCATGCCAGGCCGAGATGATTATTTTTGAGTTATCACTGCGTTCGTTAGCTTGATGGAGTTGCTTTAGAAGGAg < 1:516871/150‑1 (MQ=255) aGATGAAGGGGCCAGCGTGGCCTATAAGATTAAGGATCTGGAGGGGCAAGTTGAGCTTGATGCGGCCTTCACTTTCTCATGCCAGGCCGAGATGATTATTTTTGAGTTATCACTGCGTTCGTTAGCTTGATGGAGTTGCTTTAGAAGGAg < 1:370174/150‑1 (MQ=255) 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ggggCCAGCGTGGCCTATAAGATTAAGGATCTGGAGGGGCAAGTTGAGCTTGATGCGGCCTTCACTTTCTCATGCCAGGCCGAGATGATTATTTTTGAGTTATCACTGCGTTCGTTAGCTTGATGGAGTTGCTTTAGAAGGAGTTAAACa > 2:1419629/1‑150 (MQ=255) ggggCCAGCGTGGCCTATAAGATTAAGGATCTGGAGGGGCAAGTTGAGCTTGATGCGGCCTTCACTTTCTCATGCCAGGCCGAGATGATTATTTTTGAGTTATCACTGCGTTCGTTAGCTTGATGGAGTTGCTTTAGAAGGAGTTAAACa > 2:13508/1‑150 (MQ=255) ggCCAGCGTGGCCTATAAGATTAAGGATCTGGAGGGGCAAGTTGAGCTTGATGCGGCCTTCACTTTCTCATGCCAGGCCGAGATGATTATTTTTGAGTTATCACTGCGTTCGTTAGCTTGATGGAGTTGCTTTAGAAGGAGTTAAACATg > 2:143716/1‑150 (MQ=255) aGCGTGGCCTATAAGATTAAGGATCTGGAGGGGCAAGTTGAGCTTGATGCGGCCTTCACTTTCTCATGCCAGGCCGAGATGATTATTTTTGAGTTATCACTGCGTTCGTTAGCTTGATGGAGTTGCTTTAGAAGGAGTTAAACATGGCtt < 2:1529122/150‑1 (MQ=255) ggCCTATAAGATTAAGGATCTGGAGGGGCAAGTTGCGCTTGATGCGGCCTTCACTTTCTCATGCCAGGCCGAGATGATTATTTTTGAGTTATCACTGCGTTCGTTAGCTTGATGGAGTTGCTTTAGAAGGAGTTAAACATGGCTTATaaa > 1:668682/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |