| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 572325 | 2070 (46.590) | 18 (0.440) | 15/244 | NT | 0.91% | intergenic (+74/‑43) | ybcM/ylcH | DLP12 prophage; putative DNA‑binding transcriptional regulator/DLP12 prophage; uncharacterized protein YlcH |
| ? | NC_000913 | = 572334 | 2010 (48.980) | intergenic (+83/‑34) | ybcM/ylcH | DLP12 prophage; putative DNA‑binding transcriptional regulator/DLP12 prophage; uncharacterized protein YlcH | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 366 total aligned reads displayed.
CCTTCTCGTTTTACTGAAAGATTTCATAATCGTTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATCAACACGGCATAATTATGTCACCGGAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/572174‑572325‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gtcaccggagTTGTTCAGGCTCCGGTGACATAATTATGCCGTGTTGATTTCCCAAAATCAAAATCGATAGAATTGCTCCTTCTTAAAACACTTTTACTCTCTGGAAGCTTTTCTTATCTCTCTTGGTGTTATATTAAAACGATTATGAAATC < NC_000913/572334‑572193 CTTCTCGTTTTACTGAAATATTTCATAATCGTTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATCAACACGGCATAATTATGT < 2:218679/143‑1 CTTCTCGTTTTACTGAAAGATTTCATAATCGTTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATCAACACGGCATAATTATGT > 1:51625/1‑143 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CGGAGTTGTTCAGGCTCCGGTGACATAATTATGCCGTGTTGATTTCCCAAAATCAAAATCGATAGAATTGCTCCTTCTTAAAACACTTTTACTCTCTGGAAGCTTTTCTTATCTCTCTTGGTGTTATATTAAAACGATTATGA > 1:352253/1‑143 CGGAGTTGTTCAGGCTCCGGTGACATAATTATGCCGTGTTGATTTCCCAAAATCAAAATCGATAGAATTGCTCCTTCTTAAAACACTTTTACTCTCTGGAAGCTTTTCTTATCTCTCCTGGTGTTGTATTCAAACGATAATGA > 2:203450/1‑143 CGGAGTTGTTCAGGCTCCGGTGACATAATTATGCCGTGTTGATTTCCCAAAATCAAAATCGATAGAATTGCTCCTTCTTAAAACACTTTTACTCTCTAGAAGCTTTTCTTATCTATCTTGGTGTTATATTCAAACAATTATGA > 2:380999/1‑143 CGGAGTTGTTCAGGCTCCGGTGACATAATTATGCCGTGTTGATTTCCCAAAATCAAAATCGATAGAAATGACTCTCCTTAAAACACTCTTCATGTCACGGAGCTTTTCTTATCTCTCTTGGTGTTATATTAAAACGATTATGA > 1:600542/1‑143 GGAGTTGTTCAGGCTCCGGTGACATAATTATGCCGTGTTGATTTCCCCAAATCAAACTCGATAGAATTGCTAACGGCTAAGACACTTTTACTCTCTGGCAGCTTTTCTTATCTCTCTTTGTGTTATATTAAAACGATTATGAA > 1:644997/1‑143 GGAGTTGTTCAGGCTCCGGTGACATAATTATGCCGTGTTGATTTCCCAAAATCAAAATCGATAGAATTGCTCCTTCTTAAAACACTTTTACTCTCTGGAAGCTTTTCTTATCTCTCTTGGTGTTATATTCAAAAGATTtgtag > 1:494797/1‑138 GGAGTTGTTCAGGCTCCGGTGACATAATTATGCCGTGTTGATTTCCCAAAATCAAAATCGATAGAATTGCTCCTTCTTAAAACACTTTTACTCTCTGGAAGCTTTTCTTATCTCTCTTGGTGTTATATTAAAACGCTTATGct > 1:318269/1‑141 GGAGTTGTTCAGGCTCCGGTGACATAATTATGCCGTGTTGATTTCCCAAAATCAAAATCGATAGAATTGCTCCTTCTTAAAACACTTTTACTCTCTGGAAGCTTTTCTTATCTCTCTTGGTGTTATATTAAAACGATTATGAA < 1:671086/143‑1 GAGTTGTTCAGGCTCCGGTGACATAATTATGCCGTGTTGATTTCCCAAAATCAAAATCGATAGAATTGCTCCTTCTTAAAACACTTTTACTCTCTGGAAGCTTTTCTTATCTCTCTTGGTTGTATATTAAAACGATTATAAAA > 1:877049/1‑143 GAGTTGTTCAGGCTCCGGTGACATAATTATGCCGTGTTGATTTCCCAAAATCAAAATCGATAGAATTGCTCCTTCTTAAAACACTTTTACTCTCTGGAAGCTTTTCTTATCTCTCTTGGTGTTATATTAAAACGATTATGAAA > 1:695197/1‑143 GAGTTGTTCAGGCTCCGGTGACATAATTATGCCGTGTTGATTTCCCAAAATCAAAATCGATAGAATTGCTCCTTCTTAAAACACTTTTACTCTCTGGAAACTTTTCTTATCTCTCTTGGTGTTCTATTAACACGATTATGAAA > 2:80922/1‑143 AGTTGTTCAGGCTCCGGTGACATAATTATGCCGTGTTGATTTCCCAAAATCAAAATCGATAGAATTGCTCCTTCTTAAAACACTTTTACTCTCTGGAAGCTTTTCTTATCTCTCTTGGTGTTATATTAAAACGATTATGAAAT > 2:348951/1‑143 AGTTGGTCAGGCTCCGGTGACATAATTATGCCGTGTTGACTTCCCTTGTTCAAGATCGATAGAATTGCTCCTTCTTAAATCACTTTTACTCTCTGGAAGCTTTTCTTATCTCTCTTGGTGTTATATTAAAACGATTATGAAAT < 2:759159/143‑1 GTTGTTCAGGTTCCGGTGAGATAATTATGCCGTGTTGCTTGCTCAAACTCGAAATGGATAGAATTGCTCCTTCTTAAAATACTTTTACTCTCAGGAAGCTTTTCTTATCTCTCTTGGTGTTATATTAAAACGATTATGAAATC < 2:876562/143‑1 GTTGTTCAGGCTCCGGTGACATAATTATGCCGTGTTGATTTCCCAAAATCAAAATCGATAGAATTGCTCCTTCTTAAAACACTTTTACTCTCTGGAAGCTTTTCTTATCTCTCTTGGTGTTATATTAAAACGATTATGAAATC > 1:472193/1‑143 GTTGTTCAGGCTCCGGTGACATAATTATGCCGTGTTGATTTCCCAAAATCAAAATCGATAGAATTGCTCCTTCTTAAAACACTTTTACTCTCTGGAAGCTTTTCTTATCTCTCTTGGTGTTATATTAAAACGATTATGAAATC < 1:575556/143‑1 GTTGTTCAGGCTCCGGTGACATAATTATGCCGTGTTGATTTCCCAAAATCAAAATCGATAGAATTGCTCCTTCTTAAAACACTTTTACTCTCTGGAAGCTTTTCTTATCTCTCTTGGTGTTATATTAAAACGATTATGAAATC < 1:722828/143‑1 GTTGTTCAGGCTCCGGTGACATAATTATGCCGTGTTGATTTCCCAAAATCAAAATCGATAGAATTGCTCCTTCTTAAAACACTTTTACTCTCTGGAAGCTTTTCTTATCTCTCTTGGTGTTATATTAAAACGATTATGAAATC < 1:772593/143‑1 GTTGTTCAGGCTCCGGTGACATAATTATGCCGTGTTGATTTCCCAAAATCAAAATCGATAGAATTGCTCCTTCTTAAAACACTTTTACTCTCTGGAAGCTTTTCTTATCTCTCTTGGTGTTATATTAAAACGATTATGAAATC < 1:807434/143‑1 GTTGTTCAGGCTCCGGTGACACACTTATGCCGTGTTGATTTCCCAAAATCAAAATCGATAGAATTGCTCCTTCTTAAAACACTTTTACTCTCTGGAAGCTTTTCTTATCTCTCTTGGTGTTATATTAAAACGATTATGAAATC < 1:332074/143‑1 CCTTCTCGTTTTACTGAAAGATTTCATAATCGTTTTAATATAACACCAAGAGAGATAAGAAAAGCTTCCAGAGAGTAAAAGTGTTTTAAGAAGGAGCAATTCTATCGATTTTGATTTTGGGAAATCAACACGGCATAATTATGTCACCGGAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/572174‑572325‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gtcaccggagTTGTTCAGGCTCCGGTGACATAATTATGCCGTGTTGATTTCCCAAAATCAAAATCGATAGAATTGCTCCTTCTTAAAACACTTTTACTCTCTGGAAGCTTTTCTTATCTCTCTTGGTGTTATATTAAAACGATTATGAAATC < NC_000913/572334‑572193 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |