New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2327312 | 42 (0.950) | 4 (0.100) | 4/238 | NT | 9.2% | intergenic (+19/+55) | atoB/yfaP | acetyl‑CoA acetyltransferase/DUF2135 domain‑containing protein YfaP |
? | NC_000913 | = 2327320 | 41 (1.020) | intergenic (+27/+47) | atoB/yfaP | acetyl‑CoA acetyltransferase/DUF2135 domain‑containing protein YfaP |
GCTCGTATTCTGGTCACACTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACTTTTCACCAGCGTCAGCTCGCCAGCATTACGCATCGGTACAATAAATGTTTCCTGTTTCTCATTGACCGATC > NC_000913/2327174‑2327452 | gCTCGTATTCTGGTCACACTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGCTAACTTACTCAATAACAACATCCGATAGCgc > 2:442313/1‑142 (MQ=255) tCGTATTCTGGTCACACTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGcaa > 1:764098/1‑143 (MQ=255) tCGTATTCTGGTCACACTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGaaa > 1:323729/1‑143 (MQ=255) tGGTCACACTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAactttcgctatcgg < 1:448265‑M1/143‑15 (MQ=255) ggTCACACTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTtatcggg < 1:708272‑M2/143‑8 (MQ=255) acTATTACATGCCATGTAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCGGGGGGGGGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATACAAACACCCGATAGCGAAAGTtatcgggtgtttt < 1:329339‑M2/143‑14 (MQ=255) acTATTACATGCCAGGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAactttcgctatcgggtgtttt < 1:754556‑M1/143‑22 (MQ=255) tATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATCAAAACACCCGATAGCGGAAGTTATCGGGTGTTTTCt > 2:27814/1‑143 (MQ=255) tATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTACGACGGTGATTGAACGGCTGTTTTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCt > 1:240820/1‑143 (MQ=255) atgccatgcAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACa > 2:640492/1‑143 (MQ=255) catgcAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGTACTCGCGATGGTGATTGAACGGTTTAATTAATCAATAAAAAAAACCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGa > 1:134297/1‑143 (MQ=255) catgcAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGa > 1:832841/1‑143 (MQ=255) gATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACGATGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTGGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGGGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTGAc > 1:268724/1‑143 (MQ=255) tAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTAGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAAccc > 2:426546/1‑143 (MQ=255) agcGCTGGGGCTGGGAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAAGTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCAt < 2:466661/141‑1 (MQ=255) ggggCGGGCAACGCAGGGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCa < 1:223631/143‑1 (MQ=255) gggCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGGCGGCGAAGGTAACCCCATCAATCAc > 2:472037/1‑143 (MQ=255) gggCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCAc < 1:415208/143‑1 (MQ=255) gtGGGAAGACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAAGTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGAGAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGTCGAAGGTAACCCCATTAATCAccgg < 2:866774/142‑3 (MQ=255) aaCACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAactttcgctatcgggtgtttttattgattaattcaaccgttcaatcaccatcgcaattccct < 2:159003‑M1/139‑63 (MQ=255) aaCACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAactttcgctatcgggtgtttttattgattaattcaaccgttcaatcaccatcgcaattccct > 1:159003‑M1/1‑77 (MQ=255) aaCACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGGTATCGGGTGTTTTCTTGAACATGGACGGCGAAGGGAACCCGCGTAATCACCAGTCaaa > 2:873880/1‑143 (MQ=255) acacTGTGCATGGGCGGCGGTAAGGGAATTGCGATTGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCaaaa < 2:365966/143‑1 (MQ=255) acTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAAGAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACt < 2:425367/143‑1 (MQ=255) cTGTGGATGCGCGTCGGTCAGCGAAGTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTCTATTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACtt < 2:378327/143‑1 (MQ=255) cTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACtt < 2:253056/143‑1 (MQ=255) cttGGCCGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACTTTTCAcc < 2:175124/142‑1 (MQ=255) tgcggcgGTGAGTGAGTGGCGATGGGGATTGAGGGGTTGAATTGATCAATAAAAACACCCGATAGCGACAGTTGTCGGGTGGTTGCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCGAAACTTTTCACCAGc < 2:328564/142‑1 (MQ=255) cggcggTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACTTTTCACCAGCGt < 1:428852/143‑1 (MQ=255) tCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACTTTTCACCAGCGTCAGCTc > 2:210368/1‑143 (MQ=255) aGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTtatcgggtgtttttattgattaattcaaccgttcaatcaccatcgcaattccctgaccgccgccaatgcacagtgtt < 2:159003‑M2/139‑78 (MQ=255) aGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTtatcgggtgtttttattgattaattcaaccgttcaatcaccatcgcaattccctgaccgccgccaatgcacagtgtt > 1:159003‑M2/1‑62 (MQ=255) gggAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACTTTTCACCAGCGTCAGCTCGcc > 1:368090/1‑143 (MQ=255) ggAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCGATCAAACACCACTCAAAACTTTTCACCAGCGTCAGCTCGCCa > 2:181700/1‑143 (MQ=255) aaTTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATCAAAACAGCCTACAGCGAACGTTATCGTGTGCTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCTCCAGTCAAAACTTTTCACCAGCGTCAGCTCGCCAGc < 1:785365/143‑1 (MQ=255) aaTTGCGATGGTGATTGAACGGGTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACTTTTCACCAGCGTCAGCTCGCCAGc < 1:455731/143‑1 (MQ=255) aTTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCCTTAATCACCAGTCAAAACTTTTCACCAGCGTCAGCTCGCCAGCa < 1:112137/143‑1 (MQ=255) ttGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATGGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACTTTTCACCAGCGTCAGCTCGCCAGCAt > 1:530578/1‑143 (MQ=255) cgggtGGTGATTGCACGGTTGACTTAATCAATAAAAGCACCCGATCGCGAACGTTTTCGCGTGTTCTCTGCAACCTCGACGGCCAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCCACACTTTTCACCAGCGTCAGCTCGCCAGCATTa < 2:78087/139‑1 (MQ=255) attgttaTTTAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGCGTGTTTTCTTGAACATCTACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACTTTTCACCAGCGTCAGCTCGCCAGCATTACGc < 1:242573/137‑1 (MQ=255) tGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGCAAGTTATCGGGTGTTTTCTTCAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACTTTTCACCAGCGTCAGCTCGCCAGCATTACGCATCg < 2:205815/143‑1 (MQ=255) gATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGCTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTCATCACCCGTCAAAACTTTTCACCAGCGTCAGCTCGCCACCATTACCCATCgg > 2:304697/1‑143 (MQ=255) aTTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCTAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACTTTTCACCAGCGTCAGCTCGCCAGCATTACGCATCGGt < 1:736066/143‑1 (MQ=255) aaTTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGACAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACTTTTCACCAGCGTCAGCTCGCCAGCATTACGCATCGGTACAATAAATGtt < 1:566640/143‑1 (MQ=255) aTTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCATGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCGATTACTCACCAGTCACAACTTTGCACCACCGTCAGCTCGCCAGCATTCCGCATCTGTACAAGAAATGctt > 2:78435/1‑143 (MQ=255) ttAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCAGTAATCACCAGTCAAAACTTTTCACCAGCGTCAGCTCACCAGCATTACGCATCGGTACACTAAGTGGTTc > 2:325100/1‑143 (MQ=255) aaTCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCCTTAATCACCAGTCAAAACTTTTCACCAGCGTCAGCTCGCCAGCATTACGCATCGGTACAATAAATGTTTCCt > 1:788167/1‑143 (MQ=255) aTCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACTTTTCACCAGCGTCAGCTCGCCAGCATTACGCATCGGTACACTAAATGTTTCCTg > 1:565735/1‑143 (MQ=255) aaTAAAAACACCCGGTAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACTTTTCACCAGCGTCAGCTCGCCAGCATTACGCATCGGTACAATAAATGTTTCCTGttt < 2:456376/143‑1 (MQ=255) tAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGCACACCGACGGCGAAGGTAACCCCATGAATCACCAGTCAAAACTTTTCACCCGCGTCAGCTCGCCAGCATTACGCATCTCTACAATAAATGTTTCCTgctcct > 2:100458/1‑138 (MQ=255) aaaaCACCCGATAactttcgctatcgggtgtttgtattgattaattcaaccgttcaatcaccatcgcccccccccgaccgccgccaatgcacagtgttgccagccccagcgttttatcgcgtgcctacatggcatgtaatagt < 1:329339‑M1/143‑131 (MQ=255) aaaaCACCCGATAGCGAAAGTtatcgggtgtttttattgattaattcaaccgttcaatcaccatcgcaattccctgaccgccgccaatgcacagtgttgccagccccagcgttttatcgcgtgcctgcctggcatgtaatagt < 1:754556‑M2/143‑123 (MQ=255) cccGATAactttcgctatcgggtgtttttattgattaattcaaccgttcaatcaccatcgcaattccctgaccgccgccaatgcacagtgttgccagccccagcgttttatcgcgtgcctgcatggcatgtaatagtgtgacc < 1:708272‑M1/143‑137 (MQ=255) ccGATAGCGAAAGTtatcgggtgtttttattgattaattcaaccgttcaatcaccatcgcaattccctgaccgccgccaatgcacagtgttgccagccccagcgttttatcgcgtgcctgcatggcatgtaatagtgtgacca < 1:448265‑M2/143‑130 (MQ=255) ccGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACCTCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACTTTTCACCAGCGTCAGCTCGCCAGCCTTCCGCATCGGTACAATAAATGTTTCCTGTTTCCCATTGAccc > 2:401279/1‑142 (MQ=255) aTAGCGAAAGTTATCTGGTGTTTTATTTAACATCGCCGGCGCAGGTATCCCCATTAATCACCAGTCAAAACTGTTCACCAGCGTCAGCTCGCCAGCATTACGCATCGGTACAATAAATGTTTCCTGTTTCTCATTGACCGATc < 2:816412/143‑1 (MQ=255) | GCTCGTATTCTGGTCACACTATTACATGCCATGCAGGCACGCGATAAAACGCTGGGGCTGGCAACACTGTGCATTGGCGGCGGTCAGGGAATTGCGATGGTGATTGAACGGTTGAATTAATCAATAAAAACACCCGATAGCGAAAGTTATCGGGTGTTTTCTTGAACATCGACGGCGAAGGTAACCCCATTAATCACCAGTCAAAACTTTTCACCAGCGTCAGCTCGCCAGCATTACGCATCGGTACAATAAATGTTTCCTGTTTCTCATTGACCGATC > NC_000913/2327174‑2327452 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |