| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,391,775 | IS1 (+) +9 bp | 100% | coding (1259‑1267/1530 nt) | nuoM ← | NADH:quinone oxidoreductase subunit M |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | 39 (1.150) | 38/264 | NT | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 2391783 | 0 (0.000) | coding (1259/1530 nt) | nuoM | NADH:quinone oxidoreductase subunit M | |||||
| * | ? | NC_000913 | 2391775 = | 0 (0.000) | 44 (1.290) | 39/264 | NT | 100% | coding (1267/1530 nt) | nuoM | NADH:quinone oxidoreductase subunit M |
| ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
TGTGGAGCAAGATGAAATGGCTGCCAGCACTGTCGCTGTTCTTTGCGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2391912‑2391775‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTAT < NC_000913/3584195‑3584059 TGTGGAGCAAGATGAAATGGCTGCCAGCACTGTCGCTGGTCTTTGCGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAGTTTATGATTCTGTTCGGCCGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACGGGGggg > 1:519001/1‑140 gcgGCAAGATGGAATGGCTGCCAGGACTGTCGCTGTTCTTTGCGGTGTTAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTGCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGA < 2:619751/140‑1 GAGCAAGATGAAATGGCTGCCAGCACTGTCGCTGTTCTTTGCGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGAC > 1:637672/1‑143 AGATGAAATGGCTGCCAGCACTGTCGCTGTTCTTTGCGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTCCCGGGTAATGCCTCCAA > 2:110053/1‑143 AGATGAAATGGCTGCCAGCACTGTCGCTGTTCTTTGCGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAA > 1:575258/1‑143 aagaGCTGCCAGCACCGTCGCTGTCCTTTGCGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATTATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATT < 1:101548/139‑1 CTGCCAGCACTGTCGCTGTTCTTTGCGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAG > 1:595976/1‑143 CAGCACTGTCGCTGTTCTTTGCGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCCGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTT < 1:460964/143‑1 GTCGCTGTTCTTTGCGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTT > 1:607568/1‑143 GCTGTTCTTTGCGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAG > 2:263195/1‑143 CTTTGCGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACAGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATG > 2:297021/1‑143 GCGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCG < 1:59410/143‑1 CGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTGCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGA < 1:78971/143‑1 CGGTGGCAACGCTTGGGAGGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGA < 1:77091/143‑1 GGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGAT < 2:641143/143‑1 GTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATGGATAGCGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATG > 2:663706/1‑143 tcagCGCTTGGGGTGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGGATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGCCTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACT < 2:609805/139‑1 GCATCGCTTGGGAGGCCGCGCACCGGTGACTTCGGCGGCGAATTTAGGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTCGTACTAGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACT < 1:383452/143‑1 GCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTAATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACT > 1:265570/1‑143 AACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTCATTGATAGTGTCTTATGTTCAGAAAATGCCCGATGACTTT > 2:53814/1‑143 ACGCTTGGGATGCCTGGCTCCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTACGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTG < 1:640522/143‑1 ACGCTTGGGATGCCGGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTG < 1:476238/143‑1 ACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTGCACCGAT > 1:49342/1‑143 CGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTT > 1:482278/1‑143 GGTAGCTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTT < 1:515168/143‑1 GTATCTGCGTCGGCGAATTTATGCTTCTGTTAGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGCTTTCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTG < 2:76963/143‑1 AACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAG < 1:33473/143‑1 TTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAAC < 2:607568/143‑1 CGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAG < 1:263195/143‑1 GGCGAATTTAGGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCGGATAATGCCCGATGACTGTGTCATGCAGCTCCACCGAATTTGACCACGACAGC > 2:145246/1‑143 GCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCG > 1:559959/1‑143 CGAATTTATGATGCGGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGA < 2:20125/143‑1 TTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTCAACCCCTGTTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGATTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACACCGACCTCCGTCCCA > 2:205509/1‑143 CTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGC < 1:303271/143‑1 GCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAGTGACTCCAACTCATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCCGCTCCACCGATTTTGAGAACGAGACCGACGCCCGTCCCCGCCGCGCCA > 2:75810/1‑143 CTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCCGCTCCACCGCTTTTGAGAACGACAGAGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCTGGTc > 2:304531/1‑142 gtgCCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCCACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGCTGACTTTGTCCTGCAGCTCCACCGATTTTGCGAACGACAGCCACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGA < 1:496833/140‑1 gtttATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAG < 1:297021/139‑1 GGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAG < 1:400171/143‑1 GGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCAC < 1:50443/83‑1 GGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCAC > 2:50443/1‑83 GTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGG < 2:482278/143‑1 TGATTACCGGGTAATTACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGT < 1:410026/143‑1 ATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTA < 2:595976/143‑1 TTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGCTGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCCTCCCAGCCGTGCCCGGTCCTGCCTCAGATTCcaattat > 2:201335/1‑136 TGTGGAGCAAGATGAAATGGCTGCCAGCACTGTCGCTGTTCTTTGCGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2391912‑2391775‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTAT < NC_000913/3584195‑3584059 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |