New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 304784 = | 34 (1.000) | 3 (0.090) | 3/252 | NT | 8.6% | coding (422/711 nt) | ecpE | putative fimbrial chaperone EcpE |
? | NC_000913 | 304813 = | 31 (0.950) | coding (393/711 nt) | ecpE | putative fimbrial chaperone EcpE |
GCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCTGTCACCTTGTCGAAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTACGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACTCGCTCTCACCAGCCTGCAACGCCAGCTGGCGG > NC_000913/304674‑304948 | gCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCTGTCACCTTGTCGAAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAGTGGTATCCATCACCACCACCGGCTCGGGGCTGACCACGCCGCCGGTgggg > 1:400993/1‑143 (MQ=255) tAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCTGTCACCTTGTCGAAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTg > 1:592890/1‑143 (MQ=255) agtattttaaattttactatcatggtccacgggataaccgcgagcgctactaccgggtctcatttcgcgaggtccccactcgtaaccatacaagacgcagcccaACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGt > 1:353414‑M1/105‑143 (MQ=255) aTGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCTGTCACCTTGTCGAAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCtt > 1:560867/1‑143 (MQ=255) gtgtTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCTGTCACCTTGTCGAAGGACCATTTAATCTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGt < 2:86295/143‑1 (MQ=255) gtTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCTGTCACCTTGTCGAAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTCTGGCTGCGTCTTGTAt > 1:650243/1‑143 (MQ=255) tgtTACTTACCGTTCCTGTCACCTTGTCGAAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGCCTTGTATGGTTCCgc > 2:255965/1‑142 (MQ=255) actatcatggtccacgggataaccgcgagcgctactaccgggtctcatttcgcgaggtccccactcgtaaccatacaagacgcagcccaACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTACGa > 1:31071‑M1/90‑143 (MQ=255) ttacttacCGTTCCTGTCACCTTGTCGGAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTTTGGTTACGAGt > 2:229208/1‑143 (MQ=255) aaatacCGGTCCTGTCACCTTGTCGAAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTACGAGTgg < 1:376776/140‑1 (MQ=255) cttacCGTTCCTGTCGCCTTGTCGAAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTACGAGTggg < 2:383374/143‑1 (MQ=255) cttacCGTGCCTGTCACCTTGTCGAAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTACGAGTggg < 2:391746/143‑1 (MQ=255) ttacCGTTCCTGTCACCTTGTCGAAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTGCGAGTgggg > 1:129963/1‑143 (MQ=255) cTGTCAGCTTGTCAAAGCACCATTGAAACCGAACCGGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGTGCTGCGTCTTGCATGGTTACGAGTGGGGACCTCGCGa < 1:159355/143‑1 (MQ=255) tGTCACCTTGTCGAAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTACGAGTGGGGACCTCGCGaa < 1:471703/143‑1 (MQ=255) tCACCTTGTCGAAGTACTACTTAAACTGAACCTGACGTGGGCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCTCCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGTGCTGCGTCTTGTATGGTTACGAGTGGGGACCTCGCGAAAt < 2:565272/143‑1 (MQ=255) gcgccgtGTCGAAGGACCAGTGCAACTGAACCTGACGTGGTCGTAGTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCGCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTACGAGTGGGGACCTCGCGAAAt < 1:92280/137‑1 (MQ=255) cACCTTGTCGAAGGATCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTACGAGTGGGGACCTCGCGAAATg < 1:376233/143‑1 (MQ=255) ccgttGTCGAAGGACCATTTAGACTGAGCCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTACGAGTGGGGACCTCGCGAAATga < 1:589088/140‑1 (MQ=255) gAAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTCCGTCTTGTATGGTTACGCGTCTGGACCTCGCGAAATGAGACCCgga > 1:404745/1‑142 (MQ=255) aaGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGGCTTGGATGGTTACGAGAGGGGACCTCGCGAAAGGAGCCCCggca > 2:598788/1‑141 (MQ=255) aaGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACAAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTCCGCGCGGGGACCCCCCGCAAAGACACCCGgtc > 1:258940/1‑142 (MQ=255) aCCCTTTAAACTGATCCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTACGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGtagtag < 1:87364/143‑1 (MQ=255) cATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTACGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAgcg > 1:192139/1‑143 (MQ=255) tAAACCGAACCTGACGCGGTCGTACTACCCGAATGGTATCCAGCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTACGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTcg < 2:642447/143‑1 (MQ=255) aCTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAAGGGTAGCCATCACCGCCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTACGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCgg < 2:592890/143‑1 (MQ=255) cTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTACGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGt < 2:560867/143‑1 (MQ=255) tGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCAGCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTGACGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGAc < 2:284814/143‑1 (MQ=255) tcgtaaccatacaagacgcagcccaaccggcggcgtggtcagcacggagccggtTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTACGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGt > 1:31071‑M2/55‑143 (MQ=255) cAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTACGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTaaa > 1:462453/1‑143 (MQ=255) aaTGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTACGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTTGTCGCGCTCGCGCGTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAAtg > 2:620356/1‑142 (MQ=255) gTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTACGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTGGTAGCGCGCGCGGTTATCCCGTGGAGCATGATAGTAAAATTGaaa > 1:23699/1‑143 (MQ=255) tATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTACGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGAACCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTaaaa > 1:81525/1‑143 (MQ=255) acgcagcccaaccggcggcgtggtcagcacggagccggtTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTACGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACt > 1:353414‑M2/40‑143 (MQ=255) accaccGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGCTACGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACTCGCtctc < 2:225218/143‑1 (MQ=255) ccggcggcgtggtcagcacggagccggtTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTACGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAACTTAAAATACTCGCTCtccccc > 2:254459‑M2/29‑142 (MQ=255) GCTCCGTGCTGCCCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTACGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACTCGCTCTCACCAGcc > 2:390147‑M1/1‑143 (MQ=255) cGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTACGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCAGGTAGTAGCGCTCGCGGGTATCCCGTGGACCCTGCTAGTAAACTTTAAAATACTCGCGTTCACCAGCCTGCa > 2:586658/1‑143 (MQ=255) ccgccgGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTACGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACTCGCTCTCACCAGCCTGCAACGCCAGCTGGCg < 1:640380/143‑1 (MQ=255) cgccgGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTACGAGTGGGGACCTCGCGAACTGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGCCCATGCTAGTAAACTTTAAACTACTCGCTCTCACCACCCTGCACCACCCGCTCGccg > 2:258072/1‑141 (MQ=255) | GCTTAAACCATGTGTTGCCAGTGTTACTTACCGTTCCTGTCACCTTGTCGAAGGACCATTTAAACTGAACCTGACGTGGTCGTACTACCAGAATGGTATCCATCACCACCACCGGCTCCGTGCTGACCACGCCGCCGGTTGGGCTGCGTCTTGTATGGTTACGAGTGGGGACCTCGCGAAATGAGACCCGGTAGTAGCGCTCGCGGTTATCCCGTGGACCATGATAGTAAAATTTAAAATACTCGCTCTCACCAGCCTGCAACGCCAGCTGGCGG > NC_000913/304674‑304948 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |