New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 570695 = | 3398 (23.750) | 194 (1.430) | 38/262 | NT | 5.8% | intergenic (+267/‑198) | ybcK/ybcL | DLP12 prophage; putative recombinase/DLP12 prophage; periplasmic protein YbcL |
? | NC_000913 | 570719 = | 3127 (23.030) | intergenic (+291/‑174) | ybcK/ybcL | DLP12 prophage; putative recombinase/DLP12 prophage; periplasmic protein YbcL |
Only 100 of 624 total aligned reads displayed.
TCCTTTATCTCATTATGCATAAAGGCGCAATGTTCATGCAAAAGCAATCACAATTGTACCCCCAACCCAATTATTTGCCACAATATACACAAAGCACATTGATACTATCTAAAAACTCTGCTTTATTATTAGTAACACCTACGAAAGTCGGTGTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/570850‑570695 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggtgttaCTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAAC > NC_000913/570719‑570867 TCCTTTATCTCATTATGCATAAATTCGCAATTTTCATGCAAAAGAAATCACAATTGTACCCCCAACCCAATTATTTGCCACAATATACACAAAGCACATTGATACTATCTAAAAACTCTGCTTTATTATTAGTAACACCTACGAAAGTCG < 1:861455/150‑1 CCTTTATCTCATTATGCATAAAGGCTCAATGTTCATGCAAAAGCAATCACAATTGTACCCCCAACCCAATTATTTGCCACAATATACACAAAGCACATTGATACTATCTAAAAACTCTGCTTTATTATTAGTAACACCTACGAAAGTCGG < 1:2289918/150‑1 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2:719052/1‑150 CCTTTATCTCATTATGCATAAAGGCGCAATGTTCATGCAAAAGCAATCACAATTGTACCCCCAACCCAATTATTTGCCACAATATACACAAAGCACATTGATACTATCTAAAAACTCTGCTTTATTATTAGTAACACCTACGAAAGTCGG < 1:1898937/150‑1 CCTTTATCTCATTATGCATAAAGGCGCAATGTTCATGCAAAAGCAATCACAATTGTACCCCCAACCCAATTATTTGCCACAATATACACAAAGCACATTGATACTATCTAAAAACTCTGCTTTATTATTAGTAACACCTACGAAAGTCGG < 1:478307/150‑1 CCTTTATCTCATTATGCATAAAGGCGCAATGTTCATGCAAAAGCAATCACAATTGTACCCCCAACCCAATTATTTGCCACAATATACACAAAGCACATTGATACTATCTAAAAACTCTGCTTTATTATTAGTAACACCTACGAAAGTCGG < 1:2251571/150‑1 CTTTATCTCATTATGCATAAAGGCGCAATGTTCATGCAAAAGCAATCACAATTGTACCCCCAACCCAATTATTTGCCACAATATACACAAAGCACATTGATACTATCTAAAAACTCTGCTTTATTATTAGTAACACCTACGAAAGTCGGT > 1:818108/1‑150 CTTTATCTCATTATGCATAAAGGCGCAATGTTCATGCAAAAGCAATCACAATTGTACCCCCAACCCAATTATTTGCCACAATATACACAAAGCACATTGATACTATCTAAAAACTCTGCTTTATTATTAGTAACACCTACGAAAGTCGGT > 2:1083368/1‑150 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ATCTCATTATGCATAAAGGCGCAATGTTCATGCAAAAGCAATCACAATTGTACCCCCAACCCAATTATTTGCCACAATATACACAAAGCACATTGATACTATCTAAAAACTCTGCTTTATTATTAGTAACACCTACGAAAGTCGGTGTaa > 1:701265/1‑148 ATCTCATTATGCATAAAGGCGCAATGTTCATGCAAAAGCAATCACAATTGTACCCCCAACCCAATTATTTGCCACAATATACACAAAGCACATTGATACTATCTAAAAACTCTGCTTTATTATTAGTAACACCTACGAAAGTCGGTGTTA > 1:1558094/1‑150 atcCATAAACCCGCAATGATCATGCAAAATCAATAACAATTCTACCCCCAACCCAATTATTTGCCACAATATACACAAAGCACATTGAAACTATCTAAAAACTCTGCTTTATTATTAGTAACACCAACGAAAGTCGGTCTTACTAATAAT < 1:1277813/147‑1 TTGCCACAATATACACAAAGCACATTGATACTATCTAAAAACTCTGCTTTATTATTAGTAACACCTACGAAAGTCGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGT > 2:827524/1‑150 CAAAGCACATTGATACTATCTAAAAACTCTGCTTTATTATTAGTAACCCCGACGAAAGTCGGTGTTACTAATAATAATGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTTCTATTGT > 1:993801/1‑150 GCACATTGATACTATCTAAAAACTCTGCTTTATTATTAGTAACACCTACGAAAGTCGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATT > 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TACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGAATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAA > 1:447286/1‑150 TACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATAATGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGAGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAA > 2:1696667/1‑150 ACTAATAATAAAGCATAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAAC < 1:575203/150‑1 ACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATATTTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAAC < 1:624851/150‑1 ACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAAC < 2:2308400/150‑1 ACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAAC < 1:2370048/150‑1 ACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAAC < 2:510199/150‑1 ACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAAC < 1:159629/150‑1 ACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGAATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAAC > 1:2438597/1‑150 ACTAATAATAAAGCAGAGGATTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTCTGATTGCTTTGGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAAC < 2:1307248/150‑1 TCCTTTATCTCATTATGCATAAAGGCGCAATGTTCATGCAAAAGCAATCACAATTGTACCCCCAACCCAATTATTTGCCACAATATACACAAAGCACATTGATACTATCTAAAAACTCTGCTTTATTATTAGTAACACCTACGAAAGTCGGTGTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/570850‑570695 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggtgttaCTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAAC > NC_000913/570719‑570867 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |