| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 570695 = | 3398 (23.750) | 194 (1.430) | 38/262 | NT | 5.8% | intergenic (+267/‑198) | ybcK/ybcL | DLP12 prophage; putative recombinase/DLP12 prophage; periplasmic protein YbcL |
| ? | NC_000913 | 570719 = | 3127 (23.030) | intergenic (+291/‑174) | ybcK/ybcL | DLP12 prophage; putative recombinase/DLP12 prophage; periplasmic protein YbcL | |||||
Only 100 of 5582 total aligned reads displayed.
GGCTGTATTGGGGTAGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGAT > NC_000913/570546‑570844 | gCTGTATTGGGGTAGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATA < 1:867972‑M1/150‑1 (MQ=255) tGTATTGGGGTAGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAAC < 1:1052453‑M1/150‑1 (MQ=255) attttatttgatattcctttatctcattatgcataaaggcgcaatgttcatgcaaaagcaatcacaattgtacccccaacccaattatttgccacaatatacacaaagcacattgatactatctaaaaactctgctttattattagTAac > 1:1472870‑M1/147‑150 (MQ=255) 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gtagtaAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACttt > 2:959331/1‑150 (MQ=255) gtagtaAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACttt > 2:188041/1‑150 (MQ=255) gtagtaAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTAAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTTTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACtgt > 2:1636791/1‑148 (MQ=255) agtaAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCg < 2:1219744/150‑1 (MQ=255) agtaAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCg > 1:2012789/1‑150 (MQ=255) 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aaTCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACtaataa > 2:1264653/1‑150 (MQ=255) aaTCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACtaataa < 1:163745/150‑1 (MQ=255) tCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACtaataata < 1:209555/150‑1 (MQ=255) ttAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATaaa < 1:1192538/150‑1 (MQ=255) ttAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATaaa < 1:2465642/150‑1 (MQ=255) 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TAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGAt > 1:1138943‑M1/1‑150 (MQ=255) TAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGAt > 1:265695‑M1/1‑150 (MQ=255) | GGCTGTATTGGGGTAGTAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGAT > NC_000913/570546‑570844 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |