| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 122,012 | IS1 (+) +9 bp | 7.9% | intergenic (‑461/‑72) | aroP ← / → pdhR | aromatic amino acid:H(+) symporter AroP/DNA‑binding transcriptional dual regulator PdhR |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 20563 | NA (NA) | 12 (0.080) | 12/276 | NT | 8.1% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 122020 | 128 (0.960) | intergenic (‑469/‑72) | aroP/pdhR | aromatic amino acid:H(+) symporter AroP/DNA‑binding transcriptional dual regulator PdhR | |||||
| * | ? | NC_000913 | 122012 = | 128 (0.960) | 10 (0.070) | 10/276 | NT | 6.8% | intergenic (‑461/‑80) | aroP/pdhR | aromatic amino acid:H(+) symporter AroP/DNA‑binding transcriptional dual regulator PdhR |
| ? | NC_000913 | 257908 = | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
TTTTATAGTTTAATAATCGTTAAAAAACTCCTTTCCTACGTAAAGTCTACATTTGTGCATAGTTACAACTTTGAAACGTTATATATGTCAAGTTGTTAAAATGTGCACAGTTTCATGATTTCAATCAAAACCTGTATGGACATAAGGTGAATACTTTGTTACTTTAGCGTCACAGACATGAAATTGGTAAGACCAATTGACTTCGGCAAGTGGCTTAAGACAGGAACTCATGGCCTACAGCAAAATCCGCCAACCAAAACTCTCCGATGTGATTGAGCAGCAACTGGAGTTTTTGATCC > NC_000913/121863‑122161 | gaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattacca < 1:2148646‑M1/1‑1 (MQ=255)gaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattacca < 1:2140094‑M1/1‑1 (MQ=255) tataGTTTAATAATCGTTAAAAAACTCCTTTCCTACGTAAAGTCTACATTTGTGCATAGTTACAACTTTGAAACGTTATATATGTCAAGTTGTTAAAATGTGCACAGTTTCATGATTTCAATCAAAACCTGTATGGACATAAGGTGAATa > 1:1708305/1‑150 (MQ=255) ataGTTTAATAATCGTTAAAAAACTCCTTTCCTACGTAAAGTCTACATTTGTGCATAGTTACAACTTTGAAACGTTATATATGTCAAGTTGTTAAAATGTGCACAGTTTCATGATTTCAATCAAAACCTGTATGGACATAAGGTGAATAc > 1:1512465/1‑150 (MQ=255) gTTTAATAATCGTTAAAAAACTCCTTTCCTACGTAAAGTCTACATTTGTGCATAGTTACAACTTTGAAACGTTATATATGTCAAGTTGTTAAAATGTGCACAGTTTCATGATTTCAATCAAAACCTGTATGGACATAAGGTGAATACttt > 2:310161/1‑150 (MQ=255) ttAATAATCGTTAAAAAACTCCTTTCCTACGTAAAGTCTACATTTGTGCATAGTTACAACTTTGAAACGTTATATATGTCAAGTTGTTAAAATGTGCACAGTTTCATGATTTCAATCAAAACCTGTATGGACATAAGGTGAATACTTTGt < 2:2067669/150‑1 (MQ=255) ttAATAATCGTTAAAAAACTCCTTTCCTACGTAAAGTCTACATTTGTGCATAGTTACAACTTTGAAACGTTATATATGTCAAGTTGTTAAAATGTGCACAGTTTCATGATTTCAATCAAAACCTGTATGGACATAAGGTGAATACTTTGt < 1:128236/150‑1 (MQ=255) taataaTCGTTAAAAAACTCCTTTCCTACGTAAAGTCTACATTTGTGCATAGTTACAACTTTGAAACGTTAAATATGTCAAGTTGTTAAAATGTGCACAGTTTCATGATTTCAATCAAAACCTGTATGGACATAAGGTGAATACTTTGtt > 2:1368733/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |