| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 2097900 | 135 (0.940) | 10 (0.070) | 6/264 | NT | 6.9% | coding (402/981 nt) | wzzB | regulator of length of O‑antigen component of lipopolysaccharide chains |
| ? | NC_000913 | = 2097921 | 141 (1.030) | coding (381/981 nt) | wzzB | regulator of length of O‑antigen component of lipopolysaccharide chains | |||||
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
TCTTAAAGAGTCCTGCAAGTTTTTCCGTCCCAGAGCAATGTTGTCTTTGAGATCCTTTTCTAGCTCTTGATTCACTTTATCGTCAACTTGCTGAATGTATTGGGCCAACTTCATTTGTGCGCCCTCTGCAGTTTGCCCAACATAAGAAACAGTCAATGGTAATTGCTGGTTCTTAACAGAAGGTTCGATGGTAAGTTTTTCTCGTTCTTCCTGATTATCCAGCGTTTCTGCTAATGCAGAGAAGGCAGAACTGAAGCGACCAATTAACGTCTCCTGCAAATCCGATACTTTCGGTGC > NC_000913/2097753‑2098049 | tCTTAAAGAGTCCTGCAAGTTTTTCCGTCCCAGAGCAATGTTGTCTTTGAGATCCTTTTCTAGCTCTTGATTCACTTTATCGTCAACTTGCTGAATGTATTGGGCCAACTTCATTTGTGCGCCCTCTGCAGTTTGCCCAACATAAGAAAc > 1:1013057/1‑150 (MQ=255)tCTTAAAGAGTCCTGCAAGTTTTTCCGTCCCAGAGCAATGTTGTCTTTGAGATCCTTTTCTAGCTCTTGATTCACTTTATCGTCAACTTGCTGAATGTATTGGGCCAACTTCATTTGTGCGCCCTCTGCAGTTTGCCCAACATAAGAAAc > 2:1867725/1‑150 (MQ=255) cTTAAAGAGTCCTGCAAGTTTTTCCGTCCCAGAGCAATGTTGTCTTTGAGATCCTTTTCTAGCTCTTGATTCACTTTATCGTCAACTTGCTGAATGTATTGGGCCAACTTCATTTGTGCGCCCTCTGCAGTTTGCCCAACATAAGAAACa < 2:2144465/150‑1 (MQ=255) aaaGAGTCCTGCAAGTTTTTCCGTCCCAGAGCAATGTTGTCTTTGAGATCCTTTTCTAGCTCTTGATTCACTTTATCGTCAACTTGCTGAATGTATTGGGCCAACTTCATTTGTGCGCCCTCTGCAGTTTGCCCAACATAAGAAACAGTc < 1:1030708/150‑1 (MQ=255) aaaGAGTCCTGCAAGTTTTTCCGTCCCAGAGCAATGTTGTCTTTGAGATCCTTTTCTAGCTCTTGATTCACTTTATCGTCAACTTGCTGAATGTATTGGGCCAACTTCATTTGTGCGCCCTCTGCAGTTTGCCCAACATAAGAAACAGTc > 2:529317/1‑150 (MQ=255) gTCCTGCAAGTTTTTCCGTCCCAGAGCAATGTTGGCTTTGAGATCCTTTTCTAGCTCTTGATTCACTTTATCGTCAACTTGCTGAATGTATTGGGCCAACTTCATTTGTGCGCCCTCTGCAGTTTGCCCAACATAAGAAACAGTCAATgg < 1:404201/150‑1 (MQ=255) gTCCTCCAAGTTTTTCCGTCCCAGAGCAATGTTGTCTTTGAGATCCTTTTCTAGCTCTTGATTCACTTTAACGTCAACTTGCTGAATGTATTGGGCCAACTTCATTTGTGCGCCCTCTGCAGTTTGCCCAACATAAGAAACAGTCAATgg > 2:1985070/1‑150 (MQ=255) tGCAAGTTTTTCCGTCCCAGAGCAATGTTGTCTTTGAGATCCTTTTCTAGCTCTTGATTCACTTTATCGTCAACTTGCTGAATGTATTGGGCCAACTTCATTTGTGCGCCCTCTGCAGTTTGCCCAACATAAGAAACAGTCAATGGTAAt > 1:2180506/1‑150 (MQ=255) tGCAAGTTTTTCCGTCCCAGAGCAATGTTGTCTTTGAGATCCTTTTCTAGCTCTTGATTCACTTTATCGTCAACTTGCTGAATGTATTGGGCCAACTTCATTTGTGCGCCCTCTGCAGTTTGCCCAACATAAGAAACAGTCAATGGTAAt > 1:613786/1‑150 (MQ=255) aGTTTTTCCGTCCCAGAGCAATGTTGTCTTTGAGATCCTTTTCTAGCTCTTGATTCACTTTATCGTCAACTTGCTGAATGTATTGGGCCAACTTCATTTGTGCGCCCTCTGCAGTTTGCCCAACATAAGAAACAGTCAATGGTAATTGCt < 2:1808095/150‑1 (MQ=255) tCCGTCCCAGAGAAATGTTGTCTTTGAGATCCTTTTCTAGCTCTTTATTCACTTTATCGTCAACTTGCTGAATGTATTGGGCCAACTTCACTTGTGCGCCCTCAGCAGTTTGCCCAACATAAGAAACAGTCAATGGTAATTGCTGGttat < 2:698098‑M2/150‑5 (MQ=255) gTCCCAGAGCAATGTTGTCTTTGAGATCCTTTTCTAGCTCTTGATTCACTTTATCGTCAACTTGCTGAATGTATTGGGCCAACTTCATTTGTGCGCCCTCTGCAGTTTGCCCAACATAAGAAccagcaattaccattgactgtttcttat < 1:1985447‑M1/150‑29 (MQ=255) gTCCCAGAGCAATGTTGTCTTTGAGATCCTTTTCTAGCTCTTGATTCACTTTATCGTCAACTTGCTGAATGTATTGGGCCAACTTCATTTGTGCGCCCTCTGCAGTTTGCCCAACATAAGAAccagcaattaccattgactgtttcttat < 1:1753127‑M1/150‑29 (MQ=255) gTCCCAGAGCAATGTTGTCTTTGAGATCCTTTTCTAGCTCTTGATTCACTTTATCGTCAACTTGCTGAATGTATTGGGCCAACTTCATTTGTGCGCCCTCTGCAGTTTGCCCAACATAAGAAACAGTCAATGGTAATTGCTGGTTCTTaa < 2:1198999/150‑1 (MQ=255) tCCCAGAGCAATGTTGTCTTTGAGATCCTTTTCTAGCTCTTGATTCACTTTATCGTCAACTTGCTGAATGTATTGGGCCAACTTCATTTGTGCGCCCTCTGCAGTTTGCCCAACATAAGAAACAGTCAATGGTAATTGCTGGTTCTTAAc < 1:1525357/150‑1 (MQ=255) cAGAGCAATGTTGTCTTTGAGATCCTTTTCTAGCTCTTGATTCACTTTATCGTCAACTTGCTGAATGTATTGGGCCAACTTCATTTGTGCGCCCTCTGCAGTTTGCCCAACATAAGAAccagcaattaccattgactgtttcttatgttg < 2:1703936‑M1/150‑33 (MQ=255) cAGAGCAATGTTGTCTTTGAGATCCTTTTCTAGCTCTTGATTCACTTTATCGTCAACTTGCTGAATGTATTGGGCCAACTTCATTTGTGCGCCCTCTGCAGTTTGCCCAACATAAGAAACAGTCAATGGTAATTGCTGGTTCTTAACAGa > 1:2466639/1‑150 (MQ=255) gagCAATGTTGTCTTTGAGATCCTTTTCTAGCTCTTGATTCACTTTATCGTCAACTTGCTGAATGTATTGGGCCAACTTCATTTGTGCGCCCTCTGCAGTTTGCCCAACATAAGAAccagcaattatcattgactgtttcttatgttggg < 1:1861922‑M1/150‑35 (MQ=255) 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tCCTTTTCTAGCTCTTGATTCACTTTATCGTCAACTTGCTGAATGTATTGGGCCAACTTCATTTGTGCGCCCTCTGCAGTTTGCCCAACATAAGAAACAGTCAATGGTAATTGCTGGTTCTTAACAGAAGGTTCGATGGTAAGTTTTtct > 2:1900347/1‑150 (MQ=255) tCCTTTTCTAGCTCTTGATTCACTTTATCGTCAACTTGCTGAATGTATTGGGCCAACTTCATTTGTGCGCCCTCTGCAGTTTGCCCAACATAAGAAACAGTCAATGGTAATTGCTGGTTCTTAACAGAAGGTTCGATGGTAAGTTTTtct < 1:935469/150‑1 (MQ=255) cTTTTCTAGCTCTTGATTCACTTTATCGTCAACTTGCTGAATGTATTGGGCCAACTTCATTTGTGCGCCCTCTGCAGTTTGCCCAACATAAGAAACAGTCAATGGTAATTGCTGGTTCTTAACAGAAGGTTCGATGGTAAGTTTTTCTCg < 1:1227707/150‑1 (MQ=255) ttttCTAGCTCTTGATTCACTTTATCGTCAACTTGCTGAATGTATTGGGCCAACTTCATTTGTGCGCCCTCTGCAGTTTGCCCAACATAAGAAACAGTCAATGGTAATTGCTGGTTCTTAACAGAAGGTTCGATGGTAAGTTTTTCTCGt > 1:681897/1‑150 (MQ=255) tttCTAGCTCTTGATTCACTTTATCGTCAACTTGCTGAATGTATTGGGCCAACTTCATTTGTGCGCCCTCTGCAGTTTGCCCAACATAAGAAACAGTCAATGGTAATTGCTGGTTCTTAACAGAAGGTTCGATGGTAAGTTTTTCTCGtt < 2:2253115/150‑1 (MQ=255) 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tGCCCAACATAAGAAACAGTCAATGGTAATTGCTGGTTCTTAACAGAAGGTTCGATGGTAAGTTTTTCTCGTTCTTCCTGATTATCCAGCGTTTCTGCTAATGCAGAGAAGGCAGAACTGAAGCGACCAATTAACGTCTCCTGCAAATcc > 1:969486/1‑150 (MQ=255) gCCCAACATAAGAAACAGTCAATGGTAATTGCTGGttcttatgttgggcaaactgcagagggcgcacaaatgaagttggcccaatacattcagcaagttgacgataaagtgaatcaagagctagaaaaggatctcaaagacaacattgct < 1:1475301‑M2/150‑116 (MQ=255) gCCCAACATAAGAAACAGTCAATGGTAATTGCTGGTTCTTAACAGAAGGTTCGATGGTAAGTTTTTCTCGTTCTTCCTGATTATCCAGCGTTTCTGCTAATGCAGAGAAGGCAGAACTGAAGCGACCAATTAACGTCTCCTGCAAATCCg < 2:1613810/150‑1 (MQ=255) cccAACATAAGAAACAGTCAATGGTAATTGCTGGttcttatgttgggcaaactgcagagggcgcacaaatgaagttggcccaatacattcagcaagttgacgataaagtgaatcaagagctagaaaaggatctcaaagacaacattgctg < 1:1036516‑M2/150‑117 (MQ=255) cccAACATAAGAAACAGTCAATGGTAATTGCTGGTTCTTAACAGAAGGTTCGATGGTAAGTTTTTCTCGTTCTTCCTGATTATCCAGCGTTTCTGCTAATGCAGAGAAGGCAGAACTGAAGCGACCAATTAACGTCTCCTGCAAATCCGa > 1:1630228/1‑150 (MQ=255) cccAACATAAGAAACAGTCAATGGTAATTGCTGGTTCTTAACAGAAGGTTCGATGGTAAGTTTTTCTCGTTCTTCCTGATTATCCAGCGTTTCTGCTAATGCAGAGAAGGCAGAACTGAAGCGACCAATTAACGTCTCCTGCAAATCCGa > 1:324679/1‑150 (MQ=255) cccAACATAAGAAACAGTCAATGGTAATTGCTGGTTCTTAACAGAAGGTTCGATGGTAAGTTTTTCTCGTTCTTCCTGATTATCCAGCGTTTCTGCTAATGCAGAGAAGGCAGAACTGAAGCGACCAATTAACGTCTCCTGCAAATCCGa > 1:2478275/1‑150 (MQ=255) ccAACATAAGAAACAGTCAATGGTAATTGCTGGttcttatgttgggcaaactgcagagggcgcacaaatgaagttggcccaatacattcagcaagttgacgataaagtgaatcaagagctagaaaaggatctcaaagacaacattgctct < 1:1735360‑M2/150‑118 (MQ=255) ccAACATAAGAAACAGTCAATGGTAATTGCTGGttcttatgttgggcaaactgcagagggcgcacaaatgaagttggcccaatacattcagcaagttgacgataaagtgaatcaagagctagaaaaggatctcaaagacaacattgctct < 1:2239223‑M2/150‑118 (MQ=255) ccAACATAAGAAACAGTCAATGGTAATTGCTGGTTCTTAACAGAAGGTTCGATGGTAAGTTTTTCTCGTTCTTCCTGATTATCCAGCGTTTCTGCTAATGCAGAGAAGGCAGAACTGAAGCGACCAATTAACGTCTCCTGCAAATCCGAt < 2:171267/150‑1 (MQ=255) 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aGAAACAGTCAATGGTAATTGCTGGTTCTTAACAGAAGGTTCGATGGTAAGTTTTTCTCGTTCTTCCTGATTATCCAGCGTTTCTGCTAATGCAGAGAAGGCAGAACTGAAGCGACCAATTAACGTCTCCTGCAAATCCGATACTTTCgg < 1:1310858/150‑1 (MQ=255) aaCAGTCAATGGTAATTGCTGGTTCTTAACAGAAGGTTCGATGGTAAGTTTTTCTCGTTCTTCCTGATTATCCAGCGTTTCTGCTAATGCAGAGAAGGCAGAACTGAAGCGACCAATTAACGTCTCCTGCAAATCCGATACTTTCGGTGc < 1:2243975/150‑1 (MQ=255) | TCTTAAAGAGTCCTGCAAGTTTTTCCGTCCCAGAGCAATGTTGTCTTTGAGATCCTTTTCTAGCTCTTGATTCACTTTATCGTCAACTTGCTGAATGTATTGGGCCAACTTCATTTGTGCGCCCTCTGCAGTTTGCCCAACATAAGAAACAGTCAATGGTAATTGCTGGTTCTTAACAGAAGGTTCGATGGTAAGTTTTTCTCGTTCTTCCTGATTATCCAGCGTTTCTGCTAATGCAGAGAAGGCAGAACTGAAGCGACCAATTAACGTCTCCTGCAAATCCGATACTTTCGGTGC > NC_000913/2097753‑2098049 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |