| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 2097921 | 141 (1.030) | coding (381/981 nt) | wzzB | regulator of length of O‑antigen component of lipopolysaccharide chains | |||||
Only 100 of 164 total aligned reads displayed.
TTTTTCCGTCCCAGAGCAATGTTGTCTTTGAGATCCTTTTCTAGCTCTTGATTCACTTTATCGTCAACTTGCTGAATGTATTGGGCCAACTTCATTTGTGCGCCCTCTGCAGTTTGCCCAACATAAGAAACAGTCAATGGTAATTGCTGGTTCTTAACAGAAGGTTCGATGGTAAGTTTTTCTCGTTCTTCCTGATTATCCAGCGTTTCTGCTAATGCAGAGAAGGCAGAACTGAAGCGACCAATTAACGTCTCCTGCAAATCCGATACTTTCGGTGCAGCCTGACCATAGATAACAT > NC_000913/2097772‑2098069 | tttttCCGTCCCAGAGCAATGTTGTCTTTGAGATCCTTTTCTAGCTCTTGATTCACTTTATCGTCAACTTGCTGAATGTATTGGGCCAACTTCATTTGTGCGCCCTCTGCAGTTTGCCCAACATAAGAAACAGTCAATGGTAATTGCTgg < 1:815990/150‑1 (MQ=255) tCCGTCCCAGAGAAATGTTGTCTTTGAGATCCTTTTCTAGCTCTTTATTCACTTTATCGTCAACTTGCTGAATGTATTGGGCCAACTTCACTTGTGCGCCCTCAGCAGTTTGCCCAACATAAGAAACAGTCAATGGTAATTGCTGGttat < 2:698098‑M2/150‑5 (MQ=255) cagtcCCAGAGCAATGTTGTCTTTGAGATCCTTTTCTAGCTCTTGATTCACTTTATCGTCAACTTGCTGAATGTATTGGGCCAACTTCATTTGTGCGCCCTCTGCAGTTTGCCCAACATAATAAACAGTCAATGGTAATTGCTGGttctt < 1:113848‑M2/148‑6 (MQ=255) 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tGAGATCCTTTTCTAGCTCTTGATTCACTTTATCGTCAACTTGCTGAATGTATTGGGACAACTTCATTTGTGCGCCCTCTGCAGTTTGCCCAAAATAAGAAACAGTCAATGGTAATTGCTGGTTCTTAAAAGAAGGTTCGATGGTAAGtt > 1:2097181/1‑150 (MQ=255) gagaTCCTTTTCTAGCTCTTGATTCACTTTATCGTCAACTTGCTGAATGTATTGGGCCAACTTCATTTGTGCGCCCTCTGCAGTTTGCCCAACATAAGAAACAGTCAATGGTAATTGCTGGTTCTTAACAGAAGGTTCGATGGTAAGttt > 2:1834624/1‑150 (MQ=255) gaTCCTTTTCTAGCTCTTGATTCACTTTATCGTCAACTTGCTGAATGTATTGGGCCAACTTCATTTGTGCGCCCTCTGCAGTTTGCCCAACATAAGAAACAGTCAATGGTAATTGCTGGTTCTTAACAGAAGGTTCGATGGTAAGttttt > 2:1732578/1‑150 (MQ=255) gaTCCTTTTCTAGCTCTTGATTCACTTTATAGTCAACTTGCTGAATGTATTGGGCCAACTTCATTTGTGCGCACTCTGCAGTTTGCCCAAAATAAGAAACAGTCAATGGTAATTGCTGGTTCTTAACAGAAGGTTCGATGGTAAGtgttt > 1:2472821/1‑150 (MQ=255) caTCCTTTTCTAGCTCTTGATTCACTTTATCGTCAACTTGCTGAATGTATTGTGCCAACTTAATTTGTGAGCCCTCTGCAGTTTGCACAAAATAAGAAACAGTCAATGGTAATTGATGGTTATTAACAGAAGGTTCGATGGTAAGttttt > 1:2472814/2‑150 (MQ=255) 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gCTGGTTCTTAACAGAAGGTTCGATGGTAAGTTTTTCTCGTTCTTCCTGATTATCCAGCGTTTCTGCTAATGCAGAGAAGGCAGAACTGAAGCGACCAATTAACGTCTCCTGCAAATCCGATACTTTCGGTGCAGCCTGACCATAGATaa > 1:2040226/1‑150 (MQ=255) gCTGGTTCTTAACAGAAGGTTCGATGGTAAGTTTTTCTCGTTCTTCCTGATTATCCAGCGTTTCTGCTAATGCAGAGAAGGCAGAACTGAAGCGACCAATTAACGTCTACTGCAAATCCGATACTTTCGGTGCAGACTGACCATAGATaa > 1:274651/1‑150 (MQ=255) | TTTTTCCGTCCCAGAGCAATGTTGTCTTTGAGATCCTTTTCTAGCTCTTGATTCACTTTATCGTCAACTTGCTGAATGTATTGGGCCAACTTCATTTGTGCGCCCTCTGCAGTTTGCCCAACATAAGAAACAGTCAATGGTAATTGCTGGTTCTTAACAGAAGGTTCGATGGTAAGTTTTTCTCGTTCTTCCTGATTATCCAGCGTTTCTGCTAATGCAGAGAAGGCAGAACTGAAGCGACCAATTAACGTCTCCTGCAAATCCGATACTTTCGGTGCAGCCTGACCATAGATAACAT > NC_000913/2097772‑2098069 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |