New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1314673 = | 37 (0.810) | 3 (0.070) | 3/246 | NT | 8.0% | intergenic (+15/+45) | ompW/yciE | outer membrane protein W/DUF892 domain‑containing protein YciE |
? | NC_000913 | 1314694 = | 35 (0.830) | intergenic (+36/+24) | ompW/yciE | outer membrane protein W/DUF892 domain‑containing protein YciE |
TTAACATGTCAGTGTGGTACATGGATATCGATACCACCGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAAT‑ATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGTCGGCCATTTGCTTT > NC_000913/1314531‑1314814 | ttAACATGTCAGTGTGGTACATGGATATCGATACCACCGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTACTTCCGCACAAAAACg > 2:370159/1‑143 (MQ=255) gaagcgattttaaatgaggaaaagcaaatggccgactggctgattcagaatattccgcaaacaactgagaaatttttaattcgctctgaaactgatggcgtagcagcgaagaaataataccctttataccatgtccttattGa < 1:675862‑M1/2‑1 (MQ=255) ggatgttacatgaagacaagcaaatggcctactggctgattccgaatattccgcaaacaactgagaaatttttaattcgctctgaaactgatggcgtagaagcgaagaaataataccctttataccatgtccttattGAcccc > 2:137390‑M1/138‑143 (MQ=255) aGTGTGGTACATGGATATCGATACCACCGCCAAGTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAat < 1:567621/143‑1 (MQ=255) ggTACATGGATATCGATACCACCGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAAT‑ATACg < 1:623107/143‑1 (MQ=255) gTACATCGATATCGATGCCACCGCCAATGAGAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAAT‑ATACgg < 1:707423/143‑1 (MQ=255) accATGGATGTGGAGACCACCGCCAATTATAAGCCGGGCGGTGCACAGCAACACGAGAGCGGACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATAGCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAAT‑ATACggg < 1:881887/141‑1 (MQ=255) aCATGGATATCGATACCACCGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTAAGCAAAAAAACGACTCCAGAAT‑AGACgggg > 1:604607/1‑143 (MQ=255) aaaagcaaatggccgactggctgattcagaatattccgcaaacaactgagaaatttttaattcgctctgaaactgatggcgtagaagcgaagaaataataccctttataccatgtccttattGACCCCGTAAT‑ATACGGGGTc > 1:501471‑M1/123‑143 (MQ=255) aTGGAGAGCGAGACCAGCGCGAATTAGAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTATA‑TTACGGGGTc < 2:196405/143‑1 (MQ=255) aTACCACCGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAAGGA‑TCAGTGATCATACGGGGTCAATAAGGACa > 1:796708/1‑143 (MQ=255) accGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAAT‑ATACGGCGTCAATAAGGACacgaga > 2:697345/1‑138 (MQ=255) cGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAAT‑ATACGGGGTCAATAAGGACATGGaata > 2:104577/1‑143 (MQ=255) cGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATACGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCGGCACAAAAACGACCCCGTAAT‑ATACGGGGTCAATAAGGACATGGtata > 1:637751/1‑143 (MQ=255) gCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAAT‑ATACGGGGTCAATAAGGACATGGTGTaa > 1:559152/1‑143 (MQ=255) tataCGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAACGTACGCCTCGATCCGTTGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAAT‑ATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGta < 2:554468/143‑1 (MQ=255) taAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGGACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAAT‑ATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGtatt < 2:215846/143‑1 (MQ=255) gcggcgCGCAGCAACACGACAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAAT‑ATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATttcttc < 1:290107/143‑1 (MQ=255) gcaaacaactgagaaatttttaattcgctctgaaactgatggcgtagaagcgaagaaataataccctttataccatgtccttattGACCCCGTAAT‑ATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATttctt < 2:686095‑M1/54‑1 (MQ=255) gcaaacaactgagaaatttttaattcgctctgaaactgatggcgtagaagcgaagaaataataccctttataccatgtccttattGACCCCGTAAT‑ATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATttctt > 1:686095‑M1/86‑139 (MQ=255) cTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAAT‑ATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAAt > 1:584672/1‑143 (MQ=255) cTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGAGATCGTTTTTAATTGCGCACAAAAACGACACCGTAAT‑ATACGGGGTAAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTGCTACGACATCAGTTTCCGAGCGAAt > 2:84626/1‑143 (MQ=255) gATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAAT‑ATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGGATTGTTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTaa > 1:519320/1‑143 (MQ=255) ccGTGGGTGTGGATGGTCTCAGCAGGATATCGTTTTGAATTCCGCACAAATACGACCCGGTAAT‑ATACGGGGTCACTAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTaaaaa < 2:447871/143‑1 (MQ=255) tttATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAAG‑ATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAAGTAAAAATTTCTCAgt > 1:169055/1‑143 (MQ=255) aTGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAAT‑ATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAgttgt > 2:797443/1‑143 (MQ=255) tGTTCGCAGCAGGATATCGTTTTTGATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAAT‑ATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAgttgtt < 2:536380/143‑1 (MQ=255) ttCTCAGCAGGACATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAAT‑ATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTGAGTTGTTTg > 1:73321/1‑143 (MQ=255) tcAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAAT‑ATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCgg < 1:443967/143‑1 (MQ=255) agcagGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAAT‑ATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGaa > 2:378657/1‑143 (MQ=255) agcagGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAAT‑ATACGGGGTCAAT‑AGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCCCTTCTACGCCAACAGTTCCGGAGCGCATTAACAAGTTTCCAGTCGtttcgcgaac > 2:134663/1‑136 (MQ=255) cagGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAAT‑ATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAata > 1:95879/1‑143 (MQ=255) atatCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAAT‑ATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGCATATTCt > 1:788588/1‑143 (MQ=255) tatCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAAT‑ATCCGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTg < 2:796708/143‑1 (MQ=255) tCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAAT‑ATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGACATCAGTTTCAGCGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGaa > 2:584052/1‑143 (MQ=255) cGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAAT‑ATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAAt < 1:329667/143‑1 (MQ=255) tttttAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAAT‑ATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGACTTAACAATTTCTCAGTGGTTTGCGGACTATTCTGAGTCa > 1:113055/1‑143 (MQ=255) tttttAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAAT‑ATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCa > 2:514812/1‑143 (MQ=255) gtttAATTCGGCACAACAACGACCCCGTAAT‑ATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAg < 2:477288/142‑1 (MQ=255) tCCGCACAAAAACGACCCCGTAAT‑ATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGTCg < 1:378657/143‑1 (MQ=255) ccGCACAAAGTCGACCCCGTAAT‑ATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGTCgg < 2:344853/143‑1 (MQ=255) gCACAAAAACGACCCCGTAAT‑ATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCTGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAACCAGCCAGTCGGcc > 2:463301/1‑143 (MQ=255) gCACAAAAACGACCCCGTAAT‑ATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGTCGGcc > 1:698124/1‑143 (MQ=255) aaaaCGACCCCGTAAT‑ATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGTCGGCCATTTg < 2:427785/143‑1 (MQ=255) aCGACCCCGTAAC‑ATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTGGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGTCGGCCATTTGCtt < 1:460492/143‑1 (MQ=255) cGACCCCGTAAT‑ATACGGGGTCAATGAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGCATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAGTCAGCCAGTCGGCCAGTTGCttt > 2:561939/1‑143 (MQ=255) cGACCCCGTAAT‑ATACGGGGTCAATAAGCACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTGTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGTCGGCCATTTGCttt < 1:370159/143‑1 (MQ=255) | TTAACATGTCAGTGTGGTACATGGATATCGATACCACCGCCAATTATAAGCTGGGCGGTGCACAGCAACACGATAGCGTACGCCTCGATCCGTGGGTGTTTATGTTCTCAGCAGGATATCGTTTTTAATTCCGCACAAAAACGACCCCGTAAT‑ATACGGGGTCAATAAGGACATGGTATAAAGGGTATTATTTCTTCGCTTCTACGCCATCAGTTTCAGAGCGAATTAAAAATTTCTCAGTTGTTTGCGGAATATTCTGAATCAGCCAGTCGGCCATTTGCTTT > NC_000913/1314531‑1314814 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |