New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1922031 | 42 (0.920) | 4 (0.090) | 4/252 | NT | 9.1% | intergenic (+15/‑90) | yebV/yebW | protein YebV/protein YebW |
? | NC_000913 | = 1922040 | 40 (0.920) | intergenic (+24/‑81) | yebV/yebW | protein YebV/protein YebW |
TGCAACTGGATGCCTGGGATGCTGAAACCAGTATCCCTGCCCTGCTAAATGGCGAACACTCTGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAA‑CCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGAT > NC_000913/1921895‑1922171 | tgCAACTGGATGCCTGGGATGCTGAAACCAGTATCCCTGCCCTGCTAAATGGCGAACACTCTGTCCTTTCCCGTACCCGTTACGATCCACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAACAAGAA‑CCCGTAGGCa > 2:704967/1‑143 (MQ=255) tgCAACTGGATGCCTGGGATGCTGAAACCAGTATCCCTGCCCTGCTAAATGGCGAACACTCTGTCCTTTCCCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAACCCCGTCGGc > 1:9497/1‑143 (MQ=255) tgCAACTGGATGCCTGGGATGCTGAAACCAGTATCCCTGCCCTGCTAAATGGCGAACACTCTGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGCTCCAAAAAGAA‑CCCGTCGGCa > 2:703347/1‑143 (MQ=255) gCAACTGGATGCCTGGGATGCTGAAACCAGTATCCCTGCCCTGCTAAATGGCGAACACTCTGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAACAAGAA‑CCCGTCGGCAt > 1:173028/1‑143 (MQ=255) cAACTGGATGCCTGGGATGCTGAATCCGGTATCCCTGCCCTGCTAAATGGCGAACTCTCTGTCCTTTACCGTAACCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAA‑CCCATCGGCATg < 2:695041/143‑1 (MQ=255) cAACTGGATGCCTGGGATGCTGAAACCAGTATCCCTGCCCTACTAAATGGCGAACACTCTGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAA‑CCCGTCGGCATg > 2:128770/1‑143 (MQ=255) aaCTGGATGCCTGGGATGCTGAAACCAGTATCCCTGCCCTGCTAAATGGCGAACACTCTGTCCTTTCCCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAA‑CCCGTCGGCATgg > 1:274143/1‑143 (MQ=255) tGGATGCCTGGGATGCTGAAACCAGTATCCCTGCCCTGCTAAATGGCGAACACTCTGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAA‑CCCGTCGGCATGGcgg > 1:723091‑M2/1‑140 (MQ=255) gcggggatgGTGAAACCAGTCTCCCTGCCCTGCTAAATGGCGAACACTCTGGCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCGGGTGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAA‑CCCGccatgccgacgggttctt < 2:344711‑M1/140‑19 (MQ=255) tGGGATGCTGAAACCAGTATCCCTGCCCTGCTAAATGGCGAACACTCTGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAA‑CCCGTCGGCATGGCGGGTTAGTTg > 1:640494/1‑143 (MQ=255) gggATGCTGAAACCAGTATCCCTGCCCTGCTAAATGGCGAACACTCTGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAA‑CCCGccatgccgacgggttcttttt < 1:671471‑M1/143‑22 (MQ=255) atgagtaaaCCATGATCCATTCCATGCTAAATGGCGAACACTCTGTCCTGTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAA‑CCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCt < 1:597836/137‑1 (MQ=255) gCTGAAACCAGTATCCCTGCCCTGCTAAATGGCGAACACTCTGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAA‑CCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTgg < 1:481136/143‑1 (MQ=255) tGAAACCAGTATCCCTGCCCTGCTAAATGGCGAACACTCTGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAA‑CCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGtt > 1:405664/1‑143 (MQ=255) aaCCAGTATCCCTGCCCTGCTAAATGGCGAACACTCTGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATACGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAA‑CCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTAtt > 1:608017/1‑143 (MQ=255) aCCAGTATCCCTGCCCTCCTAAAGGGCGATCACTCTGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAA‑CCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTc < 2:74075/143‑1 (MQ=255) tCCCTGCCCTGCTAAATGGCGAACACTCTGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAA‑CCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGtt < 1:369583/143‑1 (MQ=255) ggCGAACACTCTGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAA‑CCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTaaa < 1:286063/143‑1 (MQ=255) ggCAAACACTCTGTCCCGTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATGATACGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAA‑CACGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTaaa < 2:443253/143‑1 (MQ=255) gAACACTCTGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAA‑CCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACtt > 1:470345/1‑143 (MQ=255) gAACACTCTGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGGCTTGCCTGATCCAAAAAGAA‑CCCGTCGGCATGGCGGGTCATTTGTCCTGACTATTCCACCGAACTAAAATCTCCCCTAAACtt > 2:4169/1‑143 (MQ=255) gAACACTCTGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCATCTTGCCTGATCCAAAAAGAA‑CCCGTCGGCATGGCGGGGTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAAGtt > 1:336288/1‑143 (MQ=255) aaCACTCTGTCCTTTACCGTACCCGTTCCGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAA‑CCCGTCGGCATGGCGGGGTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTa > 2:17737/1‑143 (MQ=255) ctctGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAACAGAA‑CCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACgg < 1:522855/143‑1 (MQ=255) tctGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAA‑CCCGccatgccgacgggttctttttgga < 2:198416‑M1/102‑25 (MQ=255) tctGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAA‑CCCGccatgccgacgggttctttttgga > 1:198416‑M1/1‑78 (MQ=255) tctGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAA‑CCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTACACTTAACGGt > 1:488289/1‑143 (MQ=255) tctGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAA‑CCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTACCGGt > 1:643908/1‑143 (MQ=255) cTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAA‑CCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGca > 1:816975/1‑143 (MQ=255) ttgaCCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCGGGAGTAGGCGTCTTGCCTGGTCCAAAAAGAA‑CCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTACACTTAACGGTACGGcac < 2:201846/140‑1 (MQ=255) gttACCCTACCTGTTACCAACAACAAGCGGATGCCTCGATTATGCTTCTCGCCTGATCCAAAAAGAA‑CCCGTCGCCATGGCGGGTTATTTCTACTTATTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGcac < 2:488608/142‑1 (MQ=255) cGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAA‑CCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTGTCCTAAACTTAACGGTACGGCCCCacac > 2:821540/1‑143 (MQ=255) ccGTTACGATCAACAATCTGTTGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAT‑CCCGTCGGCATGGAGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCgg < 2:604370/143‑1 (MQ=255) ccGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAA‑CCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCgg < 1:671544/143‑1 (MQ=255) gTTACGATACACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAA‑CCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAAGCGCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCgggg < 2:816381/143‑1 (MQ=255) tACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAA‑CCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTACCACACCGCAAAACCGCTCCTAAACTGAACGGGACTGCACGACACTTAGGCGAt > 2:770551/1‑143 (MQ=255) gATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAA‑CCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGaa > 2:698764/1‑143 (MQ=255) tCAACAATCTGATGCCTAGACTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAA‑CCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCCCACGTCGGGGATGaagt > 2:110799/1‑141 (MQ=255) caaTCTGATGCCGGGATTATGCGTCTTGCCTCTTCCAAAAAAAA‑CCCGTCGGCATTGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTTAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTc < 1:588250/143‑1 (MQ=255) caaTCTGATGCCCGCATTACGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAC‑CCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTc < 1:27578/143‑1 (MQ=255) cTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAA‑CCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCAGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCgcgc > 2:449820/1‑143 (MQ=255) ttATGCGTCTTGCCTGTTCCAAAAAGAA‑CCTGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCTCCTGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGTGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTtttg < 2:222867/143‑1 (MQ=255) ccTGATCCAAAAAGAA‑CCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACGTTTTGTTTGCTGCCtag > 2:726520/1‑141 (MQ=255) cTGATCCAAAAAGAA‑CCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTGCGTGTGCTACGTggg > 1:327582/1‑142 (MQ=255) tCCAAAAAGAA‑CCCGTCGGCATGGcgggttctttttggatcaggcaagacgcataatccaggcatcagattgttgatcgtaacgggtacggtaaaggacaga > 1:198416‑M2/1‑24 (MQ=255) tCCAAAAAGAA‑CCCGTCGGCATGGcgggttctttttggatcaggcaagacgcataatccaggcatcagattgttgatcgtaacgggtacggtaaaggacaga < 2:198416‑M2/102‑79 (MQ=255) ccAAAAAGAA‑CCCGTCGGGATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCg < 2:843627/143‑1 (MQ=255) aaaaaGAA‑CCCGTCGGCATGGcgggttctttttggatcaggcaagacgcataatccaggcatcagattgttgatcgtaacgggtacggtaaaggacagagtgttcgccatttagcagggcagggatactggtttcagcatccc < 1:671471‑M2/143‑123 (MQ=255) aaaaaGAA‑CCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGt > 1:641596/1‑143 (MQ=255) aaaaGAA‑CCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGtt < 1:606545/143‑1 (MQ=255) aaGAA‑CCCGTCGGCATGGcgggttctttttggatcaggcaagacgcataatccaggcacccgattgttgatcgtaacgggtacggtaaaggccagagtgttcgccatttagcagggcagggagactggtttcaccatccccgc < 2:344711‑M2/143‑126 (MQ=255) gAA‑CCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGa < 1:516727/143‑1 (MQ=255) a‑CCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTCGTGAAg > 1:840647/1‑143 (MQ=255) a‑CCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGAACCACACTTCGGGGCTCAAATGTTCGCGCTGGTACTCTTTGTTGGCTACCTGGATGCCGGTGGTGAAg > 2:295712/1‑143 (MQ=255) ccGccatgccgacgggttctttttggatcaggcaagacgcataatccaggcatcagattgttgatcgtaacgggtacggtaaaggacagagtgttcgccatttagcagggcagggatactggtttcagcatcccaggcatcca > 1:723091‑M1/1‑3 (MQ=255) ccGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGat > 1:719041/1‑143 (MQ=255) | TGCAACTGGATGCCTGGGATGCTGAAACCAGTATCCCTGCCCTGCTAAATGGCGAACACTCTGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAA‑CCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGAT > NC_000913/1921895‑1922171 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |