New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1922031 | 42 (0.920) | 4 (0.090) | 4/252 | NT | 9.1% | intergenic (+15/‑90) | yebV/yebW | protein YebV/protein YebW |
? | NC_000913 | = 1922040 | 40 (0.920) | intergenic (+24/‑81) | yebV/yebW | protein YebV/protein YebW |
AACTGGATGCCTGGGATGCTGAAACCAGTATCCCTGCCCTGCTAAATGGCGAACACTCTGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAACCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGA > NC_000913/1921898‑1922182 | aaCTGGATGCCTGGGATGCTGAAACCAGTATCCCTGCCCTGCTAAATGGCGAACACTCTGTCCTTTCCCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAACCCGTCGGCATgg > 1:274143/1‑143 (MQ=255) tGGATGCCTGGGATGCTGAAACCAGTATCCCTGCCCTGCTAAATGGCGAACACTCTGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAACCCGTCGGCATGGcgg > 1:723091‑M2/1‑140 (MQ=255) tGGGATGCTGAAACCAGTATCCCTGCCCTGCTAAATGGCGAACACTCTGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAACCCGTCGGCATGGCGGGTTAGTTg > 1:640494/1‑143 (MQ=255) atgagtaaaCCATGATCCATTCCATGCTAAATGGCGAACACTCTGTCCTGTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAACCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCt < 1:597836/137‑1 (MQ=255) gCTGAAACCAGTATCCCTGCCCTGCTAAATGGCGAACACTCTGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAACCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTgg < 1:481136/143‑1 (MQ=255) tGAAACCAGTATCCCTGCCCTGCTAAATGGCGAACACTCTGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAACCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGtt > 1:405664/1‑143 (MQ=255) aaCCAGTATCCCTGCCCTGCTAAATGGCGAACACTCTGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATACGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAACCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTAtt > 1:608017/1‑143 (MQ=255) aCCAGTATCCCTGCCCTCCTAAAGGGCGATCACTCTGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAACCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTc < 2:74075/143‑1 (MQ=255) tCCCTGCCCTGCTAAATGGCGAACACTCTGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAACCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGtt < 1:369583/143‑1 (MQ=255) ggCGAACACTCTGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAACCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTaaa < 1:286063/143‑1 (MQ=255) ggCAAACACTCTGTCCCGTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATGATACGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAACACGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTaaa < 2:443253/143‑1 (MQ=255) gAACACTCTGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAACCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACtt > 1:470345/1‑143 (MQ=255) gAACACTCTGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGGCTTGCCTGATCCAAAAAGAACCCGTCGGCATGGCGGGTCATTTGTCCTGACTATTCCACCGAACTAAAATCTCCCCTAAACtt > 2:4169/1‑143 (MQ=255) gAACACTCTGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCATCTTGCCTGATCCAAAAAGAACCCGTCGGCATGGCGGGGTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAAGtt > 1:336288/1‑143 (MQ=255) aaCACTCTGTCCTTTACCGTACCCGTTCCGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAACCCGTCGGCATGGCGGGGTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTa > 2:17737/1‑143 (MQ=255) ctctGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAACAGAACCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACgg < 1:522855/143‑1 (MQ=255) tctGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAACCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTACACTTAACGGt > 1:488289/1‑143 (MQ=255) tctGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAACCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTACCGGt > 1:643908/1‑143 (MQ=255) cTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAACCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGca > 1:816975/1‑143 (MQ=255) ttgaCCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCGGGAGTAGGCGTCTTGCCTGGTCCAAAAAGAACCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTACACTTAACGGTACGGcac < 2:201846/140‑1 (MQ=255) gttACCCTACCTGTTACCAACAACAAGCGGATGCCTCGATTATGCTTCTCGCCTGATCCAAAAAGAACCCGTCGCCATGGCGGGTTATTTCTACTTATTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGcac < 2:488608/142‑1 (MQ=255) cGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAACCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTGTCCTAAACTTAACGGTACGGCCCCacac > 2:821540/1‑143 (MQ=255) ccGTTACGATCAACAATCTGTTGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGATCCCGTCGGCATGGAGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCgg < 2:604370/143‑1 (MQ=255) ccGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAACCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCgg < 1:671544/143‑1 (MQ=255) gTTACGATACACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAACCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAAGCGCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCgggg < 2:816381/143‑1 (MQ=255) tACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAACCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTACCACACCGCAAAACCGCTCCTAAACTGAACGGGACTGCACGACACTTAGGCGAt > 2:770551/1‑143 (MQ=255) gATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAACCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGaa > 2:698764/1‑143 (MQ=255) tCAACAATCTGATGCCTAGACTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAACCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCCCACGTCGGGGATGaagt > 2:110799/1‑141 (MQ=255) caaTCTGATGCCGGGATTATGCGTCTTGCCTCTTCCAAAAAAAACCCGTCGGCATTGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTTAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTc < 1:588250/143‑1 (MQ=255) caaTCTGATGCCCGCATTACGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGACCCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTc < 1:27578/143‑1 (MQ=255) cTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAACCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCAGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCgcgc > 2:449820/1‑143 (MQ=255) ttATGCGTCTTGCCTGTTCCAAAAAGAACCTGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCTCCTGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGTGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTtttg < 2:222867/143‑1 (MQ=255) ccTGATCCAAAAAGAACCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACGTTTTGTTTGCTGCCtag > 2:726520/1‑141 (MQ=255) cTGATCCAAAAAGAACCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTGCGTGTGCTACGTggg > 1:327582/1‑142 (MQ=255) tCCAAAAAGAACCCGTCGGCATGGcgggttctttttggatcaggcaagacgcataatccaggcatcagattgttgatcgtaacgggtacggtaaaggacaga < 2:198416‑M2/102‑79 (MQ=255) tCCAAAAAGAACCCGTCGGCATGGcgggttctttttggatcaggcaagacgcataatccaggcatcagattgttgatcgtaacgggtacggtaaaggacaga > 1:198416‑M2/1‑24 (MQ=255) ccAAAAAGAACCCGTCGGGATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCg < 2:843627/143‑1 (MQ=255) aaaaaGAACCCGTCGGCATGGcgggttctttttggatcaggcaagacgcataatccaggcatcagattgttgatcgtaacgggtacggtaaaggacagagtgttcgccatttagcagggcagggatactggtttcagcatccc < 1:671471‑M2/143‑123 (MQ=255) aaaaaGAACCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGt > 1:641596/1‑143 (MQ=255) aaaaGAACCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGtt < 1:606545/143‑1 (MQ=255) aaGAACCCGTCGGCATGGcgggttctttttggatcaggcaagacgcataatccaggcacccgattgttgatcgtaacgggtacggtaaaggccagagtgttcgccatttagcagggcagggagactggtttcaccatccccgc < 2:344711‑M2/143‑126 (MQ=255) gAACCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGa < 1:516727/143‑1 (MQ=255) aCCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTCGTGAAg > 1:840647/1‑143 (MQ=255) aCCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGAACCACACTTCGGGGCTCAAATGTTCGCGCTGGTACTCTTTGTTGGCTACCTGGATGCCGGTGGTGAAg > 2:295712/1‑143 (MQ=255) ccGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGat > 1:719041/1‑143 (MQ=255) cGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATAttg < 2:488289/143‑1 (MQ=255) tcagggCGGGTTATTTGTCCTGGTTAGTCTCTCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTATCGGTATGGCACTTCTTTTCTGTGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATAttgtt < 1:322924/139‑1 (MQ=255) gCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATAttgtt < 1:703347/143‑1 (MQ=255) tGGCGGGTTATTTGTCGTGGTTCTTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTACACTTAACGGTACGGCACCACGCTGCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTtgtg < 2:570173/143‑1 (MQ=255) gCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGCTGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGCGAAGATATTGTtgtgaa > 2:878087/1‑141 (MQ=255) | AACTGGATGCCTGGGATGCTGAAACCAGTATCCCTGCCCTGCTAAATGGCGAACACTCTGTCCTTTACCGTACCCGTTACGATCAACAATCTGATGCCTGGATTATGCGTCTTGCCTGATCCAAAAAGAACCCGTCGGCATGGCGGGTTATTTGTCCTGGTTATTCCCCCGTTGTAAAATCTCTCCTAAACTTAACGGTACGGCACCACACTTCGGGGATGAAATGTTCGCGCTGGTACTTTTTGTTTGCTACCTGGATGGCGGTTGTGAAGATATTGTTGTGGA > NC_000913/1921898‑1922182 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |