New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 433694 = | 41 (0.900) | 4 (0.090) | 3/250 | NT | 9.8% | coding (240/1104 nt) | ribD | fused diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase/5‑amino‑6‑(5‑phosphoribosylamino)uracil reductase |
? | NC_000913 | 433734 = | 35 (0.810) | coding (280/1104 nt) | ribD | fused diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase/5‑amino‑6‑(5‑phosphoribosylamino)uracil reductase |
GGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGTGAAAAAGCCAAAGGTGCGACCGCCTATGTCACACTCGAACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCGCGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGATGAGTGAAGCCGAGCAATTGAATAAAGGCTTTCTCAAG > NC_000913/433593‑433874 | atcaggccgtggctgacgtcaatgccagcctgttgcagacggtaaagtccacgcccagcgacctgcgggttaggatcttgcatcgaggcaaccacgcgcgcTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAgc > 1:118641‑M1/102‑143 (MQ=255) gTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGTGAAAAAGCCAAAGGTGCGACCGCCTATGTCACACTCGAACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGACGCGGGCGTAgcg > 2:527787/1‑143 (MQ=255) acaTGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGTGAAAAAGCCAAAGGTGCGACCGCCTATGTCACACTCGAACCCTGTAGCAATCATGGTCGTACGCCACCGCGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCGCGCTTgg > 2:584732/1‑143 (MQ=255) tGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGTGAAAAAGCCAAAGGTGCGACCGCCTATGTCACACTCGAACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCGCGCGTGGTTg > 1:501189/1‑143 (MQ=255) cGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGTGAAAAAGCCAAAGGTGCGACCGCCTATGTCACACTCGAACCCTGTAGCCATCATGGTCGTCCGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCGCGCGTGGTTGCCt < 1:464108/143‑1 (MQ=255) aaGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGTGAAAAAGCCAAAGGTGCGACCGCCTATGTCACACTCGAACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCTCTGGCGTAGCGCGCGCGGTTGCCtac > 2:820162/1‑141 (MQ=255) gTACACGCGTTGCGTATGGCGGGTGAAAAAGCCAAAGGAAGGACCGCCTGTGTCACACTCGAACCGTGTAGCAATCCTGGTCGTACGCCGCCGTGCTGGGACGCACTCATCGCCACTGGCGCAGCGCGCGCGGTTGCCTCGAt > 2:317973/1‑143 (MQ=255) tACACGCGTTGCGTATGGCGGGTGAAAAAGCCCAAGGTGCGACCGCCTACGTCACACTCGAACCCTGTAGCCATGACGGCCGTGCGCCACCGCGCGGTGATGCACGACTCGCAGCTGGAGCAGCGCGCGCGGTTGCCTCGaag > 2:657784/1‑141 (MQ=255) acGCGTTGCGTATGGCGGGTGAAAAAGCCAAAGGTGCGACCGCCTATGTCACACTCGAACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCGCGCGTGGTTGCCTCGATGCaa > 1:819495/1‑143 (MQ=255) gCGTATGGCGGGTGAAAAAGCCAAAGGTGCGACCGCCTATGTCACACTCGAACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCACGCGTGGGTGCCTCGATGAAAGagacta > 2:679957/1‑138 (MQ=255) cttATGGCCGGTGAGACAGCCAGAGGTGCTGCCGCCTATGTCACACTCGCACCCAGTAGCCATCATGGTCGGACGCCGCCGTGCTGTGACGCACTCATCGCAGCTGGCGTAGCGCGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGAACCTaa < 2:419313/141‑1 (MQ=255) cGTATGGCGGGTGACAAAGCCAAAGGTGTGACCGCCTATGTCACACTCGAACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCGCGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTaa < 2:157387/143‑1 (MQ=255) tATGGCGGGTGAAAAAGCCAAAGGTGCGACCGCCTATGTCACACTCGAACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCGCGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAAcc > 1:174034/1‑143 (MQ=255) gAAAAAGCCAAAGGTGCGACCGCCTATGTCACACTCGAACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCGCGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGc < 1:858795/143‑1 (MQ=255) atccAAAGGTGCGACCGCCTATGTCACACTCGAACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCGCGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGc < 1:722322/141‑1 (MQ=255) ccAAAGGTGCGACCGCCTATGTCACACTCGAACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGATGGCGTAGCGCGCGTGGTTGCATCGATGAAAGAGCCTACCCCGCAGGCGGCTGGGCGt > 2:696826/1‑143 (MQ=255) gACCGCCTATGTCACACTCGACCCATGTGGCCTTCGTGGTCGTATGCTACGCGGCTGTGACGCACTCATCGTCGCTGGCGTAGCGCGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTAcc < 1:647487/143‑1 (MQ=255) aCCGCCTATGTCACACTCGAACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCGCGCGTGGTTGCCTCGCTGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGCGGACTTTAcag > 2:792406/1‑141 (MQ=255) gCCTATGTCACACCCGAACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCGCGTTTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCt < 1:562872/143‑1 (MQ=255) ccTATGTCACACTCGGTCCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCGCGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTg < 1:230507/143‑1 (MQ=255) cTATGTCACACTGGTGCCCTGTTGCCATCGTGGTCGTACGCGACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCGCGGGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGc < 2:4874/143‑1 (MQ=255) aTGTCACACTCGAACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCGCGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCaa < 1:777210/143‑1 (MQ=255) gTCACACGCGGACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTTACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCGCGCGGGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTACCCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACa < 2:142638/143‑1 (MQ=255) tCACACTCGAACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGATGTGAAGCACTCATCGCCGCTAGCGTAGCGCGCGTGGTTACCTCGATGCAATATCCTAAACCGCAGGTCGCTGAGCGCGGAATTTACAGTGTGCACCac > 2:125030/1‑142 (MQ=255) cacaCTCGAACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCGCGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAgg < 2:734908/143‑1 (MQ=255) aCCCTGTATCCATCATGGTCGTACGCCCCCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCGCGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTg < 1:59903/143‑1 (MQ=255) gTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCGCGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGCGGCCTTTACCGTCTGCACCACGCTCGCATTGACGTc > 1:18835/1‑143 (MQ=255) agcctGGTCGCACGCGTCCGTGTTGTGCCGCAGTCATCTCCGCTGTCGTGGCGCGCGTGGTTGCCTCCATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCTTGGACTTTACCGTCTGTAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCAc < 2:48260/139‑1 (MQ=255) tcatGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCGCGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACg < 1:430772/143‑1 (MQ=255) cagggTCGTACGCCGCCGTGGTGTGGCGCACACATCACCGCTGGCGTAGCGCGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGAGCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACgg < 1:557020/140‑1 (MQ=255) tGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCGCGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGTCTTTACCGTCTGCAACAGGGTGGCATTGACGTCGGCCGCGGcc > 1:364524/1‑143 (MQ=255) tCGTACGCCACCGTGCTGTGGCGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCGCGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCtga < 1:245269/143‑1 (MQ=255) gctacgccagcggcgatgagtgcgtcacagcacggtggcgtaGCGCGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCtgat > 1:118641‑M2/43‑143 (MQ=255) cGTACGCCACCGTGCTGGGACGCACTCATCGCCGCCGGCGTAGCGCGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGCCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCtgat < 1:679957/143‑1 (MQ=255) tacgccagcggcgatgagtgcgtcacagcacggtggcgtaGCGCGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTCCCGTCCGCACCAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGgcctgacgc > 2:668748‑M2/41‑140 (MQ=255) tacgccagcggcgatgagtgcgtcacagcacggtggcgtaGCGCGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGAACCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACACTACGGCCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCtgatga > 2:531157‑M2/41‑143 (MQ=255) gccagcggcgatgagtgcgtcacagcacggtggcgtaGCGCGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCacggccagaccatca > 1:787515‑M2/38‑137 (MQ=255) ggCTGTGACGCGCTCAGCGCCGCTGGCGTAGCGCGCGTGGTGGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGATGAGTGAAGc < 1:62920/142‑1 (MQ=255) tgtgACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCGCGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGATGAGTGAAGCCGa < 1:530674/143‑1 (MQ=255) cTCATCGCCGCTTGCGTAGCGCGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGATGAGTGAAGCCGAGCAATTGaa < 2:27965/143‑1 (MQ=255) tCATCGCCGCTGGCGTAGCGCGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGGCGCGGGGCGTGGACTCTACCGACTGCAACACGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGAGGAGTGAAGCCGAGCacgtgact > 2:432378/1‑136 (MQ=255) gccgcTGGCGTAGCGCGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGATGAGTGAAGCCGAGCAATTGAAtgacgg > 1:390854/1‑138 (MQ=255) gccgcTGGCGTAGCGCGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGATGAGTGAAGCCGAGCAATTGAATAAAgg > 1:531297/1‑143 (MQ=255) taGCGCGCGTGGGTGCCTCGGTGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGATGAGTGAAGCCGAGCAATTGAATAAAGGCTTTCTCAAg < 2:241271‑M2/141‑1 (MQ=255) | GGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGCGGGTGAAAAAGCCAAAGGTGCGACCGCCTATGTCACACTCGAACCCTGTAGCCATCATGGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCGCGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGATGAGTGAAGCCGAGCAATTGAATAAAGGCTTTCTCAAG > NC_000913/433593‑433874 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |