New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1914760 = | 48 (1.060) | 3 (0.070) | 3/244 | NT | 6.5% | coding (57/2049 nt) | prc | tail‑specific protease |
? | NC_000913 | 1914786 = | 42 (1.000) | coding (31/2049 nt) | prc | tail‑specific protease |
GAGAACGGGTGAAGCGCGACGTTACGCGCTCACTTACCGTCGCATGCTGCGTCTCTTCCTTTAATACCGGAATTTGATCAGCACGCGTGATATCTTCTACAGCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCCTGGCCCGGCCTCCGTTTCAGAACACCAGGTGTTCTGCGCGCACAATCAAAGACATACCCGAATTCAGCTGGACGCGGACGCCGTCTTTGGTGATTTCTAATACGGTG > NC_000913/1914651‑1914926 | gagaACGGGTGAAGCGCGACGTTACGCGCTCACTTACCGTCGCATGCTGCGTCTCTTCCTTTAATACCGGAATTTGATCAGCACGCGTGATATCTTCTACAGCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAAcgcg > 2:476596/1‑143 (MQ=255) gaACGGGTGAAGCGCGACGTTACGCGCTCACTTACCGTCGCATGCTGCGTCTCTTCCTTTTATACCGGTATTTGATCAGCACGCGTGATATCTTCTACAGCGAAGTTCTGCACTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAACGCggc > 1:76542/1‑142 (MQ=255) gggCGAAGCGCGACGTTACGCGCTCACTTACCGTCGCATGCTGCGTCTCTTCCTTTAATACCGGAATTTGATCAGCACGCGTGATATCTTCTACAGCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGc < 1:152921/143‑1 (MQ=255) aGCGCTACGCTGCGCGCTCACTTACCGTCGCATGCTGCTTCTCTTCCTTTAATACCGGAATTTGATCAGCACGCGTGATATCTTCTACAGCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGCCTa‑aaa < 1:308797/143‑1 (MQ=255) aGCGCGACGTTACGCGCTCACTTACCGTCGCATGCTGCGTCTCTTCCTTTAATACCGGAATTTGATCAGCACGCGTGATATCTTCTACAGCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGCCTa‑aaa > 1:801440/1‑143 (MQ=255) cgcgCCGTTACGCGCTCACTTACCGTCGCATGCTGCGTCTCTTCCTTTAATACCGGAATTTGATCAGCACGCGTGATATCTTCTACAGCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGCCTa‑aaaaa < 1:669108/143‑1 (MQ=255) cgACGTTACGCGCTCACTTACCGGCGCATGCTGCGTCTCTTCCTTTAATACCGGAATTTGATCAGCACGCGTGATATCTTCTACAGCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACa < 2:377121/143‑1 (MQ=255) ttACGCGCTCACTTACCGTCGCATGCTGCGTCTCTTCCTTTAATACCGGAATTTGATCAGCACGCGTGATATCTTCTACAGCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCGAACGCGGTGAGCCTA‑AAAAACATGTTc > 1:422084/1‑143 (MQ=255) tACGCGCTCACTTACCGTCGCATGCTGCGTCTCTTCCTTTAATACCGGAATTTGATCAGCACGCGTGATATCTTCTACAGCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGCCTG‑AAAAGCATGTTCa > 1:761986/1‑143 (MQ=255) tcTCACTTACCCTCGCATGCTGCGTCTCTTCCTTTAATACCCGAATTTGATCAGCACGCGTGATATCTTCTACAGCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCCt < 1:823570/142‑1 (MQ=255) gcTCACTTACCGTCGCCGGCTGCGTCTCTTCCTTTAATACCGGAATTTGATCAGCACGCGTGATATCTTCTACAGCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCCt < 1:115578/143‑1 (MQ=255) gcTCACTTACCGTCGCATGCTGCGTCTCTTCCTTTAATACCGGCATTTGATCAGCACGCGTGATATCTTCTACAGCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCGGGCCGGCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACCTGTTCATGCCt > 1:115228/1‑143 (MQ=255) gTCGCATGCTGCGTCTCTTCCTTTAATACCGGAATTTGATCAGCACGCGTGATATCTTCTACAGCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCCTGGCCCGGCCTc > 2:386742/1‑143 (MQ=255) aTGCCGCGTCTCTCCCGTGAATCCCGGAATTGCATCAGCACGCGTGATATCTTCTACAGCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCCTGGCCCGGCCTCCGttt < 1:222566/143‑1 (MQ=255) tgcGTCTCTTCCTTTAATACCGGAATTTGATCAGCACGCGTGATATCTTCTCCAGCGAAGGTCTGCCCTGCTATTGCGAGCAGGCCAGCTAACGCGGTTAGCCTC‑ACACACATGCTCTTGCCCGGCCGGCCCACCAGTTCAgg > 1:324766/1‑142 (MQ=255) tgcGTCTCTTCCTTTAATACCGGAATTTGATCAGCACGCGTGATATCTTCTACAGCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCCTGGCCCGGCCTCCGTTTCAGa < 1:29172/143‑1 (MQ=255) gcGTCTCTTCCTTTAATACCGGAATTTGATCAGCACGCGTGATATCTTCTACAGCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCCTGGCCCGGCCTCCGTTTCAGaa < 1:617289/143‑1 (MQ=255) tctcTTCCTTTAATACCGGAATTTGATCAGCACGCGTGATATCTTCTACAGCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCCTGGCCCGGCCTCCGTTTCAGAacac > 1:146144/1‑143 (MQ=255) ctTCCTTTAATACCGGAATTTGATCAGCACGCGTGATATCTTCTCCAGCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCCTGGCCCGGCCTCCGTTTCAGAACACCAg < 2:656234/143‑1 (MQ=255) ctTCCTTTAATACCGGAATTTGATCAGCACGCGTGATATCTTCTACAGCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCCTGGCCCGGCCTCCGTTTCCGACCCCCAg > 1:730463/1‑143 (MQ=255) tgaaacggaggccgggccaggcatgaacatgttttttaggcttaccgcgttagCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAAcgc > 2:637817‑M1/54‑86 (MQ=255) tgaaacggaggccgggccaggcatgaacatgttttttaggcttaccgcgttagCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAAcgc < 1:637817‑M1/33‑1 (MQ=255) ccTTTAATACCGGAATTTGATCAGCACGCGTGATATCTTCTACAGCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGCCCATCAATTCAT‑TACTTCTCTGGGCGGGCCTCCGTCTCAGAACACCAGgtg > 1:199482/1‑143 (MQ=255) cTTTAATACCGGAATTTGATCAGCACGCGTGATATCTTCTACAGCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCCTGGCCCGGCCTCCGTTTCAGAACACCAGgtgt < 1:250044/143‑1 (MQ=255) tttAATACCGGAATTTGATCAGCACGCGTGATATCTTCTACAGCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCCTGGCCCGGCCTCCGTTTCAGCACACCAGGTGtt > 2:809188/1‑143 (MQ=255) tttAATACCGGAATTTGATCAGCACGCGTGATATCTTCTACAGCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCCTGGCCCGGCCTCCGTTTCAGAACACCAGGTGtt > 1:861360/1‑143 (MQ=255) tAATACCGGAATTTGATCAGCACGCGTGATATCTTCTACAGCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCCTGGCCCGGCCTCCGTTTCAGAACACCAGGTGTTCt > 2:684157/1‑143 (MQ=255) gagtACCGGAATTTGATCAGCACGCGTGATAGCGTCTACAGCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAACCATGTTCATGCCTGGCCCGGCCTCCGTTTCAGAACACCTGGTGTTCt < 2:113594/140‑1 (MQ=255) aTACCGGAATTTGATCAGCACGCGTGATATCTTCTACAGCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCCTGGCCCGGCCTCCGTTTCAGAACACCAGGTGTTCTgc < 1:625937/143‑1 (MQ=255) aCCGGAATTTGATCAGCACGCGTGATATCTTCTACAGCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCCTGGCCCGGCCTCCGTTTCAGAACACCAGGTGTTCTgcgc < 1:476596/143‑1 (MQ=255) cGGAATTTGATCAGCACGCGTGATATCTTCTACAGCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAAAGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGGTCATGCCTGACCCGGCCTCCGTTTCAGAACCCCAGGTGTTCTgcgcgc > 1:58271/1‑143 (MQ=255) ctCAGCACCGGTGATATCTTCTACAGCACAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCCTGGCCCGGCCTCCGTGTCAGAACACCAGGTGTTCTGCGCGCACAATCaaa < 2:370700/142‑1 (MQ=255) tCAGCACGCGTGATATCTTCTACAGCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCCAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGCCTC‑AAAAACCTGCTCATGCCTGGCCCGGCCCCCGTTTCAGAACACCAGTCGCTCTGCGCCCACACTccacg > 2:752680/1‑139 (MQ=255) tctACAGCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCCTGGCCCGGCCTCCGTTTCAGAACACCAGGTGTTCTGCGCGCACAATCACAGACATCCCCGCATTCAGCt > 1:353975/1‑143 (MQ=255) ctACAGCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCCTGGCCCGGCCTCCGTTCAAGAACACCAGCAGCTCAGCGAGCACAATCAATGCCATAGCAGAATTCAGCTg > 2:378214/1‑143 (MQ=255) tACAGCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAACGCGGT‑AGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCCTGGCCCGGCCTCCGTTTCAGAACACCAGGTGTTCTGCGCGCACAATCAAAGACATACCCGCATTCAGCTgga > 1:852823/1‑143 (MQ=255) cAGGGAAGGTCTGGCCTGCTATGGCAAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCCTGGCCCGGCCTCCGTTTCAGAACACCAGGTGTTCTGCGCGCACAATCAAAGACATACCCGAATTCAGCTggac < 2:76542/143‑1 (MQ=255) aGCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCATGGCGGGAGGTGCTTTTAAGAACACCAGATGTTCTGCGCGCACAATCAAAGACGTACCCGAATTCAGCGggacg > 2:632500/1‑143 (MQ=255) gCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCGAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTCTATGCCTGGCCCGGCCTCCGTTTCAGAACACCAGGTGTTCTGCGCGCACAATCAAAGACATACCCGAATTCAGCTggacgc < 1:448244/143‑1 (MQ=255) gCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCCTGGCCCGGCCTCCGTTTCAGAACACCAGGTGTTCTGCGCGCACAATCAACGACCTCCCCGCATTCAGCTggacgc > 1:574331/1‑143 (MQ=255) gcgttagctggcctgcttgcaatagcaggccagCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCCTGGCCCGGCCTCCGTTTCa < 1:637817‑M2/53‑1 (MQ=255) gcgttagctggcctgcttgcaatagcaggccagCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCCTGGCCCGGCCTCCGTTTCa > 2:637817‑M2/34‑86 (MQ=255) cGAAGGTCAGGGCTGCCATTGCAAGCAGGCGAGCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCCTGGCCCGGCCTCCGTTTCAGAACACCAGGTGTTCTGCGCGCACAATCAAAGACATACCCGAATTCAGCTggacgcg < 2:828927/143‑1 (MQ=255) gAAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCCTGCCTGGCCCGGCCTCCGTTTCAGAACACCAGGGGGTCTGCGCGCACCAACAAAGACCGACCCGAATTCAGCTggacgccg > 2:512058/1‑141 (MQ=255) aaGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAACACACGACCATGTTTGGTCCGGCCTCCGTTTCAGAACACCAGGTGTTCTGCGCGCACAATCAAAGACATACCCGAATTCAGCTggacgcgga > 1:243964/1‑143 (MQ=255) gTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCCTGGCCCGGCCTCCGTTTCAGAACACCAGGTGTGCTGCGCGCACAATCAAAGACACACCCGAATTCAGCTggacgcggacgc > 2:820761/1‑143 (MQ=255) tggcctgcttgcaatagcaggccagCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCCTGGCCCGGCCTCCGTTTCAGAACACCAGGTGTTCTGCGCGCACAATCAAAGACATACCCGAATTCAGCTGGACGCGGACGCCGt > 1:95690‑M2/26‑143 (MQ=255) TGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTTACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCCTGGCCCGGCCTCCGTTTCAGAACACCAGGTGTTCTGCGCGCACAATCAAAGACATACCCGAATTCAGCTGGACGCGGACGCCGTCTTTg > 2:752832‑M1/1‑143 (MQ=255) agcaggccagCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCCTGGCCCGGCCTCCGTTTCAGAACACCAGGTGTTCTGCGCGCACAATCAAAGACATACCCGAATTCAGCTGGACGCGGACGCCGTCTTTGGTGATTTCTa < 2:861360‑M2/133‑1 (MQ=255) gcaggccagCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCCTGGCCCGGCCTCCGTTTCAGAACACCAGGTGTTCTGCGCGCACAATCAAAGACATACCCGAATTCAGCTGGACGCGGACGCCGTCGTTGGTGATTTCTaa < 1:705902‑M2/134‑1 (MQ=255) aggccagGTAACGCGGTAAGCCTA‑AAGAACATGTTCATGCCTGGCCCGGCCTCCGTTTCAGAACACCAGGTGTTCTGCGCGCACAATCAAAGACATACCCGAATTCAGCTGGACGCGGACGCCGTCTTTGGTGATTTCTAATa < 2:340952‑M2/136‑1 (MQ=255) cagCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCCTGGCCCGGCCTCCGTTTCAGAACACCAGGTGTTCTGCGCGCACAATCACTGACATACCCTAATTCAGCTGGACGCGGACGCCGTCTTTGATAATTTCTAATACGGt > 1:48829‑M2/4‑143 (MQ=255) cagCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCCTGGCCCGGCCTCCGTCTCAGAACACCAGGTGTTCTGCGCGCACAATCAAAGACATACCCGAATTCAGCTGGACGCGGACGCCGTCTTTGGTGATTTCTAATACGGt < 1:122709‑M2/140‑1 (MQ=255) agCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCCTGGCCCGGCCTCCGTTTCAGAACACCAGGTGTTCTGCGCGCACAATCAAAGACATACCCGAATTCAGCTGGACGCGGACGCCGTCTTTGGTGATTTCTAATACGGTg < 2:801440‑M2/141‑1 (MQ=255) agCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCCTGGCCCGGCCTCCGTTTCAGAACACCAGGTGTTCTGCGCGCACAATCAAAGACATACCCGAATTCAGCTGGACGCGGACGCCGTCTTTGGTGATTTCTAATACGGTg < 1:841164‑M2/141‑1 (MQ=255) | GAGAACGGGTGAAGCGCGACGTTACGCGCTCACTTACCGTCGCATGCTGCGTCTCTTCCTTTAATACCGGAATTTGATCAGCACGCGTGATATCTTCTACAGCGAAGGTCTGGCCTGCTATTGCAAGCAGGCCAGCTAACGCGGTAAGCCTA‑AAAAACATGTTCATGCCTGGCCCGGCCTCCGTTTCAGAACACCAGGTGTTCTGCGCGCACAATCAAAGACATACCCGAATTCAGCTGGACGCGGACGCCGTCTTTGGTGATTTCTAATACGGTG > NC_000913/1914651‑1914926 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |