New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 167280 = | NA (NA) | 3 (0.100) | 3/242 | NT | NA | intergenic (+16/‑204) | mrcB/fhuA | peptidoglycan glycosyltransferase/peptidoglycan DD‑transpeptidase MrcB/ferrichrome outer membrane transporter/phage receptor |
? | NC_000913 | 167307 = | NA (NA) | intergenic (+43/‑177) | mrcB/fhuA | peptidoglycan glycosyltransferase/peptidoglycan DD‑transpeptidase MrcB/ferrichrome outer membrane transporter/phage receptor |
TCAGGCAATCCGTTTGATCAGTCTTCTCAGCCGCAGCAACAGCCGCAACAGCAACCTGCTCAGCAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCCGCCAGCGTTTCGAAT > NC_000913/167139‑167416 | acgagaatgattattataaagataagataatattcgaaacgctggcgggttcgcaagcggtacgcaatctgagcgttcctgaagggttaataaacaaccagatgaaaagaaagggttaatatcttagatgggatgttatttTa > 1:410825‑M1/142‑143 (MQ=255) cgagaatgattattataaagataagataatattcgaaacgctggcgggttcgcaagcggtacgcaatctgagcgttcctgaagggttaataaacaaccagatgaaaagaaagggttaatatcttagatgggatgttatttTAc > 1:427489‑M1/141‑143 (MQ=255) gCAATCCGTTTGATCAGTCTTCTCAGCCGCAGCAACAGCCGCAACAGCAACCTGCTCAGCAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCgg > 2:586752/1‑143 (MQ=255) cAATCCGTCTGATCAGTCTTCTCCGCCGCAGCAACAGCCGCAACAGCAACCTGCTCAGCAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGCTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGa < 2:288579/143‑1 (MQ=255) aatgattattataaagataagataatattcgaaacgctggcgggttcgcaagcggtacgcaatctgagcgttcctgaagggttaataaacaaccagatgaaaagaaagggttaatatcttagatgggatgttatttTACCGGa > 2:174559‑M1/137‑143 (MQ=255) aaTCCGTTTGATCAGTCTTCTCAGCCGCAGCAACAGCCGCAACAGCAACCTGCTCAGCAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGAt > 2:269852/1‑143 (MQ=255) tgtttattataaagataagataatattcgaaacgctggcgggttcgcaagcggtacgcaatctgagcgttcctgaagggttaataaacaaccagatgaaaagaaagggttaatatcttagatgggatgttatttTACCGGATg > 1:3380‑M1/135‑143 (MQ=255) tgattagtataaagataagataatattcgaaacgctggcgggttcgcaagcggtacgcaatctgagcgttcctgaagggttaataaacaaccagatgaaaagaaagggttaatatcttagatgggatgttatttTACCGGATg > 1:389468‑M1/135‑143 (MQ=255) attattataaagataagataatattcgaaacgctggcgggttcgcaagcggtacgcaatctgagcgttcctgaagggttaataaacaaccagatgaaaagaaagggttaatatcttagatgggatgttatttTACCGGATGGc < 2:67047‑M1/11‑1 (MQ=255) tCAGTCTTCTCAGCCGCAGCAACAGCCGCAACAGCAACCTGCTCAGCAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGcc > 2:288604/1‑143 (MQ=255) gataggagactattcgaatcggttgccggttcgcaagcggtacgccatctgagcgttcctgaagggttaataaacaaccagatgaaaataaagggttaatatcttagatgggatgttatttTACCGGATGGCGAGTTGCCATc > 2:419406‑M1/122‑143 (MQ=255) ttctCAGCCGCAGCAACAGCCGCAACAGCAACCTGCTCAGCAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCGTCAgg > 1:171057/1‑143 (MQ=255) cAGCCGCAGCAACGGCCGCAACAGCAACCTGCGCAGCAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTaaa < 2:126142/143‑1 (MQ=255) gcagcaACAGCCGCAACAGCAACCTGCCCAGCAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGAGCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAAc < 2:281712/143‑1 (MQ=255) aagcggtacgcaatctgagcgttcctgaagggttaataaacaaccagatgaaaagaaagggttaatatcttagatgggatgttatttTACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAAccc < 1:50540‑M1/56‑1 (MQ=255) tGCTCAGCAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCctt > 2:409487/1‑143 (MQ=255) aGCAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTGAAGTAACATCCCATCTCAGACATTAACCctgtcttt > 1:288726/1‑143 (MQ=255) aGCAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCctttcttt < 1:449760/143‑1 (MQ=255) cAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTgg < 1:222418/143‑1 (MQ=255) atgACGGCGACGCGGCAGCCGGTTGGATCAAGGATATGGCTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCTGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGgttgt < 2:473309/141‑1 (MQ=255) aGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGgttgtt > 1:23178/1‑143 (MQ=255) caaggTGTAGCCGGTTGGACCAAGGATATGTTGAGTCGTTATTAATGGCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCTGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAAc < 1:87232/140‑1 (MQ=255) taataaacaaccagatgaaaagaaagggttaatatcttagatgggatgttatttTACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCa > 2:50540‑M1/55‑143 (MQ=255) ccGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAATCCTTCAGGaa > 1:228578/1‑143 (MQ=255) ccGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAAAATGGAATAATAGAGACTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGaa > 1:640890/1‑143 (MQ=255) ggTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATACGGTAAAATAACATCCCATCTAAGCTCTTAACCCATTCTATTCATCCGGTTGTCTATTCACCCTTCAGGAACg > 2:492256/1‑143 (MQ=255) aTCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGa < 1:288604/143‑1 (MQ=255) aTCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTATATTAACCCTTCAGGAACGCCCaca > 2:155800/1‑141 (MQ=255) tCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGGTTATTAACCCTTCAGGCACGCTCAGAt > 2:367117/1‑143 (MQ=255) aaGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTg > 2:358767/1‑143 (MQ=255) tttGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCt > 2:185087/1‑143 (MQ=255) tagtaATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGa > 1:613320/1‑143 (MQ=255) agtaATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGaa > 1:255923/1‑143 (MQ=255) tAACATCTAAGCGGGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCAGCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCCGcc < 2:270325/143‑1 (MQ=255) tatgcttGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCCTCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCCGCCAGCGttt < 2:503735/137‑1 (MQ=255) tAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCCGCCAGCGttt > 2:509289/1‑143 (MQ=255) gTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATAACGACTGGGTGGGTAGCCATTCCTTGGCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCCGCCAGCGTTTCGAat < 1:440011/143‑1 (MQ=255) | TCAGGCAATCCGTTTGATCAGTCTTCTCAGCCGCAGCAACAGCCGCAACAGCAACCTGCTCAGCAAGAGCAGAAAGACAGCGACGGTGTAGCCGGTTGGATCAAGGATATGTTTGGTAGTAATTAACATCTAAGCGTGAAATACCGGATGGCGAGTTGCCATCCGGTAAAATAACATCCCATCTAAGATATTAACCCTTTCTTTTCATCTGGTTGTTTATTAACCCTTCAGGAACGCTCAGATTGCGTACCGCTTGCGAACCCGCCAGCGTTTCGAAT > NC_000913/167139‑167416 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |