New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 3498808 = | 47 (1.180) | 4 (0.100) | 3/254 | NT | 9.0% | coding (981/1374 nt) | cysG | siroheme synthase |
? | NC_000913 | 3498902 = | 36 (0.940) | coding (1075/1374 nt) | cysG | siroheme synthase |
AAGAGATTAACCAGATCCTGCTGCGGGAAGCGCAAAAAGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAACCGGTGGCGAGCTGGACTGGGAAAACCTGGC > NC_000913/3498666‑3498942 | ccaccggcatttcgcctggcattccgtgttcaatcagcttttgctgaatagtcgcggcctgattcaaccccatatagaacaccagcgtctgtttttctgccgccgggatttcccagtccagctcgccaccggtttttacgtgt < 1:743177‑M1/1‑1 (MQ=255) caccggcatttcgcctggcattccgtggtcaatcagcgtttgctgaatagtcgcggcctgattcaacctcttatagaacaccagcgtctgtttttctgccgccaggttttcccagtccagctcgccaccggtttttaagtgTc > 1:295053‑M1/142‑143 (MQ=255) ccggcatttcgcctggcattccgtgttcaatcagcttttgctgaatagtcgcggcctgattcaaccccatatagaacaccagcgtctgtttttctgccgccaggttttcccagtccagctcgccaccggtttttaagtgTCCg > 1:605688‑M1/140‑143 (MQ=255) ccggcactttgcctcgcattccgtgttcaatcagcttttgctgaatagtcgcggcctgattcaaccccatatagaacaccagcgtctgtttttctgccgccaggttttcccagtccagctcgccaccggtttttaagtgTCCg > 2:487293‑M1/140‑143 (MQ=255) agaTTAACCAGGTCCTGCGGCGGGAAGCGCAAAAAGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCg < 1:59931/143‑1 (MQ=255) aTTAACCAGATCCTGCTGCGGGAAGCGCAAAAAGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGTGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTGCggg > 1:188073/1‑143 (MQ=255) ccAGATCCTGCTGCGGGAAGCGCAAAAAGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTCTTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTGCCggtgatga > 2:593086/1‑137 (MQ=255) tctctgctgCGGGAAGCGGAAAAAGGCAAACGCGTGGTGCGGCGGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGc < 1:726235/140‑1 (MQ=255) tCCGGCTGCGGGAAGCGCAAAAAGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCa < 1:787882/143‑1 (MQ=255) ctgctgCGGGAAGCGCAAAAAGGCAAACGCGTGTTGCGGCTGATACCTTTGTTTTCGTTTATTGTTGGCCCCGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGc < 1:147063/143‑1 (MQ=255) ggctaGCGCAAAAGGGCAAACGCGTGCTGCGGCTGCAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACCCTGGGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGt < 1:101206/139‑1 (MQ=255) gggaGCGCAGAAAGGGAAACGCGTGGGGCGGCTGAAGGGTGGCGATCCGTGTATTGTTGGCCGTGGTGGGGAAGAGCTGGAAACGCTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGtt < 1:755707/140‑1 (MQ=255) gcctcccAAACACGCAAACGCGTCGCGCCCCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTTGAACCACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTg < 1:515623/137‑1 (MQ=255) gAAGCGCAAAAAGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCTATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAATCACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTg < 1:337549/143‑1 (MQ=255) aGCGCAAAAAGGCAAACGCGTGGAACGGCTTCGTTGGGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGct < 1:25524/143‑1 (MQ=255) cgcAAAAAGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGctct > 1:99624/1‑143 (MQ=255) gcAAAAAGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTCCCGCAGCTTCTGATTGctggg > 1:568580/1‑140 (MQ=255) cAAAAAGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGc > 1:597549/1‑143 (MQ=255) aaaaaGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGcc < 1:322219/143‑1 (MQ=255) aGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTCGCGGGTACAACCGCAGCTCATGGCTGCTCTGCCtctg > 2:618255/1‑140 (MQ=255) ttttgctgaatagtcgcggcctgattcaaccccatatagaacaccagcgtctgtttttctgccgccaggttttcccagtccagctcgccaccggtttttaagtgTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTc < 2:366706‑M1/39‑1 (MQ=255) aaaCGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCggg > 1:14705/1‑143 (MQ=255) aaaCGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCggg > 2:91995/1‑143 (MQ=255) aaaCGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTAGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTCCCGGGTTCTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCGTAGTCggg > 2:279390/1‑143 (MQ=255) gcgTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTGGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTAtt < 1:604840/143‑1 (MQ=255) gtgCGGCGGAAAGGGGGCGATCCGTTTAGTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACt < 1:135099/143‑1 (MQ=255) gCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACACGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCAGGTCTCCCACTCa > 1:711729/1‑143 (MQ=255) aaGGCGGCGACCCGTGTATTTTGGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATcgc < 1:647893/143‑1 (MQ=255) aGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATcggg > 1:774945/1‑141 (MQ=255) ggCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTa < 1:91995/143‑1 (MQ=255) gATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCTGGGTATTACCGCAACGTGTCGATGCTCTGACTATTCAGGTAGCTCACTCCCGCAACGCGATTATgg > 2:310012/1‑142 (MQ=255) cGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCCGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGAGTATGccgcg > 2:331201/1‑140 (MQ=255) tttttGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGAGTATGCCCAGAGCGTa > 1:94511/1‑143 (MQ=255) tttGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACg < 1:449954/143‑1 (MQ=255) tGGCCGGGGGGGCGAAGAGCTGCAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCt < 1:378269/143‑1 (MQ=255) cagcgtctgtttttctgccgccaggttttcccagtccagctcgccaccggtttttaagtgTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCt > 1:366706‑M1/61‑143 (MQ=255) ccGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTCGCGGGGATAACCGAAGCATCTGGTTGCTCTGCCCATTCGGGTATTCCACTAACGCACCAAGCATATGCGCCGAGAGTCCGCttga > 2:576495/1‑141 (MQ=255) gtggtgGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTAGCGGTGCCCCACCCCGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCCCTCACGCATCCCGCTTATGCCCAGAGCGCACGCTTAAtt > 1:784864/1‑143 (MQ=255) gtggCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTAcc < 1:600028/143‑1 (MQ=255) gggCGAAGAGCTGGAAACGCTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGTCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCg < 1:615233/142‑1 (MQ=255) cGAAGAGCCGCAAACACTGCGCACCGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGac < 1:136050/143‑1 (MQ=255) gAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTGCGGGAACTATAACAAATACTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTCTGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGcca > 2:8549/1‑143 (MQ=255) aaGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGATTGGGGGTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGacac < 1:364025/143‑1 (MQ=255) agagCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTCGCGGGTACAACCGAAACATCTGCTTGCTCTGCCTCTTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTACGCCCAGAGCGTACGCCTAATTACCGGACACt > 2:140172/1‑143 (MQ=255) aaaCACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAAcc < 1:512870/143‑1 (MQ=255) tgtgCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTCGCCGGGACATCCACAACAAAAGGTTGCTCCGCCTATTCGAGTCTTCCACTCACGAATCACGATTATGACAACAGCGGACACCTAATTACCGGGCACTTAAAAACCGCTGGc > 2:434254/1‑143 (MQ=255) gCAACGCGGGTCTTCCGTTCTCGGTGGTTGCGGGAACAACCGCAGCAACTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGCCTTCCCCTCACGCATCACGCTCATGCCCAGCGCGTCCGCTTACTTACCGGACACGTCAAAACCGGTAGccgg > 2:353948/1‑140 (MQ=255) aaCGCGGGTAGTCCGTTGTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACCCACGCAGCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAACCGGTGGCGAGCt < 2:142860/143‑1 (MQ=255) gcgGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTACTCCCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAACCGGTGGCGAGCTGGa < 1:212263/143‑1 (MQ=255) tagcccGTTCTGGGTCGATGGGGGGAGTACCGGAGCCCCTGGGTGCGCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCGCGCGGCGCGATGGTGCCGAGAGCGTACGCTTAAGTACCGGACACGAAAAGACCGGTGGCGAGCGGGACTggg < 2:605542/139‑1 (MQ=255) ttCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCGTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAACCGGTGGCGAGCTGGACTGGGaa < 1:310313/143‑1 (MQ=255) ccgggcgcGGTGGTGCCGGGTAGGACCGCAGCGTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATGCCACTCACGCGTCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGAGACTTAAAAACCGGTGGCGAGCTGGACTGGGaaaa < 1:197599/136‑1 (MQ=255) ccGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAACCGGTGGCGAGCTGGACTGGGaaaa > 1:717969/1‑143 (MQ=255) ctcGGTGGTGGCGCGTATTGCCGCAGCTGCTGGGTGCCCTGCCTGGGCGGGGCTTCCACGCACGCACCGCGTGTAGGCCCAGGGCGTACGCTTAATTACCGGACACTGAAAAACCGGTGGCGAGCTGGACTGGGAAAACCTgg < 2:611282/143‑1 (MQ=255) tcGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGCTTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAACCGGTGGCGAGCTGGACTGGGAAAACCTggc > 1:554880/1‑143 (MQ=255) taagtgTCCGGGTCTTACCGCATCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAACCGGTGGCGAGCTGGACTGGGAAAACCtga > 1:324018‑M1/7‑139 (MQ=255) taagtgTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAACCGGTGGCGAGCTGGACTGGGAAAACCtga < 2:324018‑M1/134‑2 (MQ=255) | AAGAGATTAACCAGATCCTGCTGCGGGAAGCGCAAAAAGGCAAACGCGTGGTGCGGCTGAAAGGTGGCGATCCGTTTATTTTTGGCCGTGGTGGCGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAACCGGTGGCGAGCTGGACTGGGAAAACCTGGC > NC_000913/3498666‑3498942 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |