New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 3498808 = | 47 (1.180) | 4 (0.100) | 3/254 | NT | 9.0% | coding (981/1374 nt) | cysG | siroheme synthase |
? | NC_000913 | 3498902 = | 36 (0.940) | coding (1075/1374 nt) | cysG | siroheme synthase |
CGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGACTGGGAAAACCTGGCGGCAGAAAAACAGACGCTGGTGTTCTATATGGGGTTGAATCAGGCCGCGACTATTCAGCAAAAGCTGATTGAACACGGAATGCCAGGCGAAATGCCGGTGG > NC_000913/3498760‑3499043 | cGAAGAGCCGCAAACACTGCGCACCGCGGGTATCCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGac < 1:136050/143‑1 (MQ=255) gAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTGCGGGAACTATAACAAATACTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTCTGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGcca > 2:8549/1‑143 (MQ=255) aaGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGCATTACCGCAGATTGGGGGTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGacac < 1:364025/143‑1 (MQ=255) agagCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTCGCGGGTACAACCGAAACATCTGCTTGCTCTGCCTCTTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTACGCCCAGAGCGTACGCCTAATTACCGGACACt > 2:140172/1‑143 (MQ=255) tcaggttttcccagtccagctcgccaccggtttttaagtgtccggtaattaagcgtacgctctgggcataatcgcgatgcgtgagtggaatacccgaataggcagagcaaccagaagctgcggtaatacccggaCACTTa < 2:324018‑M2/6‑1 (MQ=255) tcaggttttcccagtccagctcgccaccggtttttaagtgtccggtaattaagcgtacgctctgggcataatcgcgatgcgtgagtggaatacccgaataggcagagcaaccagaagatgcggtaagacccggaCACTTa > 1:324018‑M2/135‑140 (MQ=255) aaaCACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAAcc < 1:512870/143‑1 (MQ=255) tgtgCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTCGCCGGGACATCCACAACAAAAGGTTGCTCCGCCTATTCGAGTCTTCCACTCACGAATCACGATTATGACAACAGCGGACACCTAATTACCGGGCACTTAAAAACCGCTG‑Gc > 2:434254/1‑143 (MQ=255) gCAACGCGGGTCTTCCGTTCTCGGTGGTTGCGGGAACAACCGCAGCAACTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGCCTTCCCCTCACGCATCACGCTCATGCCCAGCGCGTCCGCTTACTTACCGGACACGTCAAAACCGGTA‑Gccgg > 2:353948/1‑140 (MQ=255) aaCGCGGGTAGTCCGTTGTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACCCACGCAGCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAACCGGTG‑GCGAGCt < 2:142860/143‑1 (MQ=255) gcgGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTACTCCCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGa < 1:212263/143‑1 (MQ=255) tagcccGTTCTGGGTCGATGGGGGGAGTACCGGAGCCCCTGGGTGCGCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCGCGCGGCGCGATGGTGCCGAGAGCGTACGCTTAAGTACCGGACACGAAAAGACCGGTG‑GCGAGCGGGACTggg < 2:605542/139‑1 (MQ=255) ttCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCGTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGACTGGGaa < 1:310313/143‑1 (MQ=255) ccgggcgcGGTGGTGCCGGGTAGGACCGCAGCGTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATGCCACTCACGCGTCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGAGACTTAAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGACTGGGaaaa < 1:197599/136‑1 (MQ=255) ccGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGACTGGGaaaa > 1:717969/1‑143 (MQ=255) ctcGGTGGTGGCGCGTATTGCCGCAGCTGCTGGGTGCCCTGCCTGGGCGGGGCTTCCACGCACGCACCGCGTGTAGGCCCAGGGCGTACGCTTAATTACCGGACACTGAAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGACTGGGAAAACCTgg < 2:611282/143‑1 (MQ=255) tcGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGCTTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGACTGGGAAAACCTggc > 1:554880/1‑143 (MQ=255) taagtgTCCGGGTCTTACCGCATCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGACTGGGAAAACCtga > 1:324018‑M1/7‑139 (MQ=255) taagtgTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGACTGGGAAAACCtga < 2:324018‑M1/134‑2 (MQ=255) aCCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGACTATGCCCAGCGCGTCCGCCTCACTACCGGACACTTAAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGACTGCGAAAACCTGGCGGCAGCAAACCAGACGcc > 2:93791/1‑142 (MQ=255) agcgtacgctctgggcataatcgcgatgcgtgagtggaatacccgaataggcagagcaaccagaagctgcggtaatacccggaCACTTAAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGACTGGGAAAACCTGGCGGCAGAAAAACAGACGCTg > 1:366706‑M2/84‑143 (MQ=255) tCTGGTTGCCCTGCCTATGCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGCTGATGCCCAGAGCGTACGCTTAAGTGCCGGACACTTAAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGTCTGGGAAAACCTGGCGGCAGAAAAACAGACGCTGGTGTTCta < 2:531656/143‑1 (MQ=255) ttGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGACTGGGAAAACCTGGCGGCAGAAAAACAGACGCTGGTGGTCTACATgg > 2:502310/1‑143 (MQ=255) tGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGAGTGGGAGAACCTGGCGGCAGAAAAACAGAAGCGGGTGTCCTATATggg > 1:682709/1‑143 (MQ=255) gCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGACTGGGAAAACCTGGCGGCCCAAAAACAGACGCTGGGGTACGATATgggg > 1:120099/1‑143 (MQ=255) tctGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGACTGGGAAAACCTGGCGGCAGAAAACCAGACGCTGGTGTTCTATATGGGGtt > 1:311784/1‑143 (MQ=255) tGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGACTGGGAAAACCTGGCGGCAGAAAAACAGACGCTGGTGTTCTATATGGGGGTGa > 1:349125/1‑143 (MQ=255) gcaTTCGGGCATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGAGTACGCTTAATTAACGGACACTGAAAGGCCGGTG‑GCGAGCGGGACTGGGAATACCTGGCGGCAGAAAAACAGACGCTGGTGTTCTATATGGGGTTGAATc < 2:597549/141‑1 (MQ=255) cTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGACTGGGAAAACCTGGCGGCAGAAAAACAGACGCTGGTGTTCTATATGGGGTTGAATc < 1:344584/143‑1 (MQ=255) ttCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGACTGGGAAAACCTGGCGGCAGAAAAACAGACGCTGGTGTTCTATATGGGGTTGAATCAgg < 1:99974/143‑1 (MQ=255) ggTATTCCACTCACGCAGCGCGATTATGCCCAGAGGGGACGCTTAAGTACCGGACACTT‑AAACCAGCTCAACAATCTGCAAACGGTGGTGATATTGGTATAAAAACAGACGCTGGTGTTCTATATGGGGTTGAATCAGGCcgc < 1:785055/143‑1 (MQ=255) tATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGACTGGGAAAACCTGGCGGCAGAAAAACAGACGCTGGTGTTCTATATGGGGTTGAATCAGGCCGCGa < 1:11661/143‑1 (MQ=255) tATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGACTGGGAAAACCTGGCGGCAGAAAAACAGACGCTGGTGTTCTATATGGGGTTGAATCAGGCCGCGa > 2:522621/1‑143 (MQ=255) cACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGACTGGGAAAACCTGGCGGCAGAAAAACAGACGCTGGTGTTCTATATGGGGTTGAATCAGGCCGCGACTAtt > 1:151104/1‑143 (MQ=255) gCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGACTGGGAAAACCTGGCGGCAGAAAAACAGACGCTGGTGTTCTATATGGGGTTGAATCAGGCCGCGACTATTCAGCaaa > 1:725325/1‑143 (MQ=255) gaataggcagagcaaccagaagctgcggtaatacccggaCACTTAAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGACTGGGAAAACCTGGCGGCAGAAAAACAGACGCTGGTGTTCTATATGGGGTTGAATCAGGCCGCGACTATTCAGCaaaa < 2:366706‑M2/104‑1 (MQ=255) aTCGCCAGTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGACTGGGAAAACGTGGCGGCAGAAAAACAGACGCTGGTGTTCTATATGGGGTTGAATCAGGCCGCGACTATTCAGCAAAAg < 2:188073/143‑1 (MQ=255) tCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTTAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGACTGGGAAAACCTGGCGGCAGAAAAACAGACGCTGGTGTTCTATATGGGGTTGAATCAGGCCGCGACTATTCAGCAAAAGc > 2:363587/1‑143 (MQ=255) tCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGACTGGGAAAACCTGGCGGCAGAAAAACAGACGCTGGTGTTCTATATGGGGTTGAATCAGGCCGCGACTATTCAGCAAAAGc > 2:784888/1‑143 (MQ=255) ggcgATTATGCCCAGAGCGGAGGCTAAATTACCGGACAGTTAGGAGCCGGTG‑GCGAGCTGGACTGGGAAAACCTGGCGGCAGGAAAACAGACGCTGGTGTTCTAGATGGGGTTGAATCAGGCCGCGACTATTCAGCAAAAGCt < 2:619887/142‑1 (MQ=255) cgccATTATGCCCCGAGCGTCCGCGTCATTCCCGGCCACTTAAAAACCCGTG‑GCGAGCTGGACTGGGAAAACCTGGCGGCAGAAAAACAGACGCTGGTGTTCTATATGGGGTTGAATCAGGCCGCGACTATTCAGCAAAAGCt < 1:93791/143‑1 (MQ=255) cgATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGACTGGGAAAACCTGGCGGCAGTAAAACAGACGCTGGGGTTCTATACGGGGTTGAATCAGGCAGCGACTATTCCGCAAAACCTGa > 2:127547/1‑143 (MQ=255) cgATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGACTGGGAAAACCTGGCGGCAGAAAAACAGACGCTGGTGTTCTATATGGGGTTGAGTCAGGCCGCGACTATTCAGCAAAAGCTGa > 1:206382/1‑143 (MQ=255) cgATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGACTGGGAAAACCTGGCGGCAGAAAAACAGACGCTGGTGGTCTATATGGGGTGGAATCGGGCCGCGACTATTCAGCAAAAGCTGa > 2:584261/1‑143 (MQ=255) acacctccccAGAGCCCATGCATAATTACCGGACCCTCAAACGCGGGTC‑GCGAGGTGGGCTGGGAACGCCGGGCGGCAGAAAGGCAGCCGCTGGTGTTTTATATGGGGTTGTATCAGGCCGCGACTATTCAGCAAAAGCTGAt < 2:328450/136‑1 (MQ=255) gTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGACTGGGAAAACCTGGCGGCAGAAAAACAGACGCTGGTGTTCTATATGGGGTTGCATCAGGCCGCGACTATTCAGCAAAAGCTGATTGAACACGGCATGcc > 1:352484/1‑143 (MQ=255) aaTCACCGCACACTTAAAACCCGGTG‑CCGAACTGGACTGGCAAAACCTGGCGGCAGAAAAACAGACGCTGGTGTTCTATATGGGGTTGAATCAGGCCGCGACTATTCAGCAAAAGCTGATTGAACACGGAATGCCAGGCGaaa < 1:248007/143‑1 (MQ=255) cggaCACTTAAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGACTGGGAAAACCTGGCGGCAGAAAAACAGACGCTGGTGTTCTATATGGGGTTGAATCAGGCCGCGACTATTCAGCAAAAGCTGATTGAACACGGAATGCGAGGCAAAGTGCCgg > 2:487293‑M2/5‑143 (MQ=255) cggaCACTTAAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGACTGGGAAAACCTGGCGGCAGAAAAACAGACGCTGGTGTTCTATATGGGGTTGAATCAGGCCGCGACTATTCAGCAAAAGCTGATTGAACACGGAATGCCAGGCGAAATGCCgg > 1:605688‑M2/5‑143 (MQ=255) gaCACTTAAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGACTGGGAAAACCTGGCGGCAGAAAAACAGACGCTGGTGTTCTATAAGAGGTTGAATCAGGCCGCGACTATTCAGCAAACGCTGATTGACCACGGAATGCCAGGCGAAATGCCGGTg > 1:295053‑M2/3‑143 (MQ=255) aCACGTAAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGACTGGGAAATCCCGGCGGCAGAAAAACAGACGCTGGTGTTCTATATGGGGTTGAATCAGGCCGCGACTATTCAGCAAAAGCTGATTGAACACGGAATGCCAGGCGAAATGCCGGTgg < 1:743177‑M2/142‑1 (MQ=255) | CGAAGAGCTGGAAACACTGTGCAACGCGGGTATTCCGTTCTCGGTGGTTCCGGGTATTACCGCAGCTTCTGGTTGCTCTGCCTATTCGGGTATTCCACTCACGCATCGCGATTATGCCCAGAGCGTACGCTTAATTACCGGACACTTAAAAACCGGTG‑GCGAGCTGGACTGGGAAAACCTGGCGGCAGAAAAACAGACGCTGGTGTTCTATATGGGGTTGAATCAGGCCGCGACTATTCAGCAAAAGCTGATTGAACACGGAATGCCAGGCGAAATGCCGGTGG > NC_000913/3498760‑3499043 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |