New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2700077 | 41 (1.000) | 3 (0.080) | 3/240 | NT | 7.1% | intergenic (+154/+40) | yfhL/shoB | putative 4Fe‑4S cluster‑containing protein YfhL/toxic peptide ShoB |
? | NC_000913 | = 2700087 | 41 (1.100) | intergenic (+164/+30) | yfhL/shoB | putative 4Fe‑4S cluster‑containing protein YfhL/toxic peptide ShoB |
ATTATATTACTGGGAAGCCTTAACGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCGTTTTTCCTTAAACAAGGAATGCAG > NC_000913/2699950‑2700224 | attaTAGTACGGGAAAGCCTTAACTCCATTATATTGATTTAATTGATGACATTAGCATCATCCTTCCCTAAGTGGAGGCATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACcggac > 2:702379‑M2/1‑138 (MQ=255) aCTGGGCAGCCTTAACGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTTGCCTAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTa < 2:741001/143‑1 (MQ=255) aCTGGGAAGCCTTAACGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTa > 1:232026/1‑143 (MQ=255) cTGGGAAGCCTTAACGCTATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTaa < 2:82659/143‑1 (MQ=255) cTGGGAAGCCTTAACGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTaa > 1:442466/1‑143 (MQ=255) ccTTAACGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGttt < 1:447463/143‑1 (MQ=255) ttAACGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGAGTGGTTCACAGGACGCATCGTAAGTACGTGTcg > 2:138667/1‑142 (MQ=255) ttAACGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTACCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTcc < 1:138436/143‑1 (MQ=255) gCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCGtgtg > 1:665656/1‑143 (MQ=255) ccATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTgtgt > 1:680394/1‑143 (MQ=255) ttATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTtat < 2:272403/143‑1 (MQ=255) tataTTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTtata > 1:606523/1‑143 (MQ=255) atatTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATaa < 1:289130/143‑1 (MQ=255) tttatttaATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGaa < 1:70799/143‑1 (MQ=255) tttaATTGATGACATTAGCATAATCCTTCATCAAGTTAATTTATATCGTATCTGCCCAGACACTTATTTACAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGCTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGa < 1:770576/143‑1 (MQ=255) ttaATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGaa < 2:682422/143‑1 (MQ=255) aaTTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTCTCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATCAGAACAGAAgg > 2:499149/1‑143 (MQ=255) ttGATAACATCAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGAt < 2:689442/143‑1 (MQ=255) aTTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAATTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTa < 2:441908/143‑1 (MQ=255) aTTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTa > 1:321413/1‑143 (MQ=255) ttAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTaa < 2:146400/143‑1 (MQ=255) aaTCAGTCACTAAGTTGATTTATAAAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCa < 2:423881/143‑1 (MQ=255) tCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTCTAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGATTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAGCAACAGAAGGCTCAGCTGTACAACCGCAat > 2:107178/1‑143 (MQ=255) aTTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAatga < 1:437896/143‑1 (MQ=255) aCTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGACGGATCAGCTGTAAAACAGCAATgatgat > 2:101434/1‑143 (MQ=255) gtgcgtgtatataGTCTCTGCCCACACACTTATTTATTGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGTTTCACCGGACGCACCTTAAGTATGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACCGCAATGATGATTTtga < 2:180848/136‑1 (MQ=255) gTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTTACGGTGTGTCCTACTGGTTAACCTAACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTtga < 2:357152/143‑1 (MQ=255) gTTAATTTAGATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTtga < 2:409764/143‑1 (MQ=255) gtttATATAGTATCTGCCCAGTCGCTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGAc < 2:685557/142‑1 (MQ=255) ttttTATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTTAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCATCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGAcc < 2:368704/143‑1 (MQ=255) ttATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTCAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGAccc > 1:153719/1‑143 (MQ=255) cTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAgg > 2:44335/1‑143 (MQ=255) gCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTa < 1:533237/143‑1 (MQ=255) cAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCg < 1:794355/143‑1 (MQ=255) ggaaccgtatttctAGTTATGAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTACATCAGCAATGATTATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCgg < 2:788804/136‑1 (MQ=255) acacTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTCGAGTACGTTTCCAAGTGATATAAGAACAGAAGGATCAGCAGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCa > 1:419782/1‑143 (MQ=255) tttatAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACcggacgcacctttaataactataaataagtgtctgggcagatactatataaattaacttagtgaatgattatgctaatgtcatcaattaaataaatataatggcgtta < 2:281503‑M2/143‑109 (MQ=255) tataGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACcggacgcacctttaataactataaataagtgtctgggcagatactatataaattaacttagtgaatgattatgctaatgtcatcaattaaataaatataatggcgttaag < 1:284193‑M2/143‑111 (MQ=255) taGTTATTAAAGGTGCGTCCTACTGTTTCGCCCCACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTc < 1:335210/143‑1 (MQ=255) ttattaAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTCAGTTTTTTTTTTTTTTTTTAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCGtt < 1:370317/143‑1 (MQ=255) tattaAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACcggacacacctttaataactataaataagtgtctgggcagatactatataaattaacttagtgaatgattatgctaatgtcatcaattaaataaatataatggcgttaaggcttcc < 1:693550‑M2/143‑117 (MQ=255) attaTAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGCACGTACCTTAAGTACGTTTCTTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCGtttt < 2:408826/143‑1 (MQ=255) tGCGTCCGCATGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTTGAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCGTTTTTCCTTaaa < 1:449712/143‑1 (MQ=255) tGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCGTTTTTCCTTaaa > 1:678687/1‑143 (MQ=255) cGTCCGAATGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATGATGATGACACGTCGAACAAGCACTCGCCAATCAGACATTCGTATTTCCTTAAACa > 2:779891/1‑143 (MQ=255) gttcGATTGGTTCTCCTGACGCGCCTTAGATTCGTTTCCTTGTGTTGTAACAACAGAATGATCAGCTGTATAAGAGCAATGATGAGTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCGTTTTTCCTTAAACaa < 2:429086/140‑1 (MQ=255) tCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCGTTTTTCCTTAAACAAg < 1:435848/143‑1 (MQ=255) aCTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCGTTTTTCCTTAAACAAGGaac > 2:541895/1‑142 (MQ=255) gTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCGTTTTTCCTTAAACAAGGAATGCAg > 2:164381/1‑143 (MQ=255) | ATTATATTACTGGGAAGCCTTAACGCCATTATATTTATTTAATTGATGACATTAGCATAATCATTCACTAAGTTAATTTATATAGTATCTGCCCAGACACTTATTTATAGTTATTAAAGGTGCGTCCGACTGGTTCACCGGACGCACCTTAAGTACGTTTCCTTGTGTTATAAGAACAGAAGGATCAGCTGTAAAACAGCAATGATGATTTTGATGACCCGTTTAATCAGGTATCGGCAATCAGTCATTCGTTTTTCCTTAAACAAGGAATGCAG > NC_000913/2699950‑2700224 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |