New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2942789 = | 31 (1.110) | 3 (0.110) | 3/250 | NT | 10.3% | noncoding (94/205 nt) | gcvB | small regulatory RNA GcvB |
? | NC_000913 | 2942808 = | 23 (0.870) | noncoding (113/205 nt) | gcvB | small regulatory RNA GcvB |
GTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAAT > NC_000913/2942656‑2942918 | ttCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGa < 2:165109/142‑1 (MQ=255) tCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGAt > 2:34308/1‑143 (MQ=255) gTTGAGCTTCGACCAGCAGAGACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCa < 1:198860/143‑1 (MQ=255) tGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGa < 1:460375/143‑1 (MQ=255) gCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGAGCa > 1:40600/1‑143 (MQ=255) cTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGATGCTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCAt > 1:5151/1‑143 (MQ=255) tACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTa < 2:6988/143‑1 (MQ=255) tACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTa < 2:272141/143‑1 (MQ=255) cAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGCTGAACTTTTGGCTTACCGTTGTGATGGTGTGTTGTTCTGTTTGCAATTGGTCTGCGACTCGCACCACGGTATCa > 2:195379/1‑143 (MQ=255) gtggttcgcgagagggaggtaaaaagaggcaccgcaattgggcggtgctacattaatcactatggacagacagggtaaatgtacaggaagtgaaaaaaggtagctttgctaccaTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCaaa > 2:390112‑M1/115‑143 (MQ=255) gCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCaaa < 1:441011/143‑1 (MQ=255) cTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGAGAGTCAGACAATGGTAGCACACCTACCtt > 2:337444/1‑143 (MQ=255) tGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCa > 1:190705/1‑143 (MQ=255) ggcggcACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCAc < 1:323317/143‑1 (MQ=255) ggcACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGGTGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTc > 1:198776/1‑143 (MQ=255) gcACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTcc > 1:1904/1‑143 (MQ=255) gCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTAc < 2:412566/143‑1 (MQ=255) ccGAAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTAcc < 1:241660/143‑1 (MQ=255) aTCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGa < 1:415685/143‑1 (MQ=255) aaTGCGTTTTCTGGGGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTTCCCTGTCTGTCCATAGTGATTAAt < 2:540354/143‑1 (MQ=255) cGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAg < 1:391651/143‑1 (MQ=255) gtgtTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGc < 2:9429/143‑1 (MQ=255) gtgtTCTGGTGAACTTTTGCCTTACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGc < 1:157261/143‑1 (MQ=255) ttCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGAAGTGATGATGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGAGTCAGACCAAGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCATGTCTGTCAATAGGCGTTAATGTAGCaac > 2:514897/1‑141 (MQ=255) tGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCCCCGCCTaa > 1:138256/1‑143 (MQ=255) acagggtaaatgtacaggaagtgaaaaaaggtagctttgctaccaTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTa < 1:454147‑M1/24‑1 (MQ=255) acagggtaaatgtacaggaagtgaaaaaaggtagctttgctaccaTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTa > 2:454147‑M1/46‑69 (MQ=255) ttttGGCTTACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTCTGTTTTCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATCGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCAGAGTGAGTAGTGTCGCACCGCCTAATTGCg > 1:128662/1‑143 (MQ=255) tttgCTTACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGt < 2:488890/140‑1 (MQ=255) ggTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCGTTTTTCACGTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACAGCCTAATTGCGGTGCgtgtttt > 2:436896/1‑143 (MQ=255) tgtgATGTTGTTTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTAc < 2:68581/143‑1 (MQ=255) aTGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTg < 1:141512/143‑1 (MQ=255) gtgttgttgtgttTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATc < 1:278076/143‑1 (MQ=255) ttgtgttTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCCCCTAATTGCGGGGCTTTTTTTAACTTTTCGATCGCGAAt > 2:299266/1‑143 (MQ=255) | GTCCGTTGAGCTTCTACCAGCAAATACCTATAGTGGCGGCACTTCCTGAGCCGGAACGAAAAGTTTTATCGGAATGCGTGTTCTGGTGAACTTTTGGCTTACGGTTGTGATGTTGTGTTGTTGTGTTTGCAATTGGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAAT > NC_000913/2942656‑2942918 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |