New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1418580 = | 13 (0.800) | 3 (0.190) | 3/252 | NT | 18.5% | intergenic (‑351/‑91) | kilR/sieB | Rac prophage; inhibitor of FtsZ, killing protein/Rac prophage; phage superinfection exclusion protein |
? | NC_000913 | 1418602 = | 14 (0.900) | intergenic (‑373/‑69) | kilR/sieB | Rac prophage; inhibitor of FtsZ, killing protein/Rac prophage; phage superinfection exclusion protein |
AATGTCGTTATTTACAACCGGAGGCGCACTCCCACCATTTAAATTTAACAGACAAGACCGACTCTTTATGGATATCGGAAATGCGCCTTCGTGTTGTGCCCGGTTTTATTTCACCACCTCCGGGCTTCGGTGGTCTCGGCTATACCCCTACAGCGAGAGCTTGTGTTAACATTTCAATACCCTTACAGTTGAGAGTTATTGATATGTTGGATGTATTTACTCCATTGTTGAAACTTTTTGCTAACGAGCCACTCGAAAGACTTATGTATACGA > NC_000913/1418468‑1418740 | aaTGTCGTTATTTACAACCGGAGGCGCACTCCCACCATTTAAATTTAACAGACAAGACCGACTCTTTATGGATATCGGAAATGCGCCTTCGTGTTGTGCCCGGTTTTATTTCACCACCTCCGGGCTTCGGTGGTCTCGGCtat > 2:240959/1‑143 (MQ=255) aagtttcaacaatggagtaaatacatccaacatatcaataactctcaactgtaagggtattgaaatgttaacacaagctctcgctgtaggggtatagccgagACCACCTCCGGGCTTCGGTGGTCTCGGCTATACCCCTACAg > 1:75535‑M1/103‑143 (MQ=255) gtaaatacatccaacatatcaataactctcaactgtaagggtattgaaatgttaacacaagctctcgctgtaggggtatagccgagACCACCTCCGGGCTTCGGTGGTCTCGGCTATACCCCTACAGCGAGAGCTTGTGTTaa > 1:115334‑M1/87‑143 (MQ=255) aCAAGACCGCCTCTTTATCGGTAGCGGAAATGCGCCTTCGTGTTGTGTTGCATCGTATTTCATCGCCTCCGAACTTCGGTGGTCTCGGCTATACCCCTACAGCGAGAGCTTGTGTTAACATTTCAATACCCTTACAGTTgaga < 2:67261/143‑1 (MQ=255) cGACTCTTTATGGATATCGGAAATGCGCCTTCGTGTTGTGCCCGGTTTTATTTCACCACCTCCGGGCTTCGGTGGTCTCGGCTATACCCCTACAGCGAGAGCTTGTGTTAACATTTCAATACCCTTACAGTTGAGAGTTATTg > 1:36615/1‑143 (MQ=255) tcaTGGATATCGCAAATGCGCCTTCGTGTTGTGCCCGGTTTTATTCCACCACCTCCGGGCTTCGGTGGTCTCGGCTATACCCCTACAGCGAGAGCTTGTGTTAACATTTCAATACCCTTACAGTTGAGAGTTATTGATATGtt < 2:90810/141‑1 (MQ=255) ttaacacaagctctcgctgtaggggtatagccgagaccaccgaagcccggaggtggtCTCGGCTATACCCCTACAGCGAGAGCTTGTGTTAACATTTCAATACCCTTACAGTTGAGAGTTATTGATATGTTGGATGTATTTAc > 1:115334‑M2/58‑143 (MQ=255) gAAATGCGCCTTCGTGTTGTGCCCGGTTTTATTTCACCACCTCCGGGCTTCGGTGGTCTCGGCTATACCCCTACAGCGAGCGCTTGTGTTAACATTTCAATACCCTTACAGTTGAGAGTTATTGATAGGTTGGAGGTATTGAc > 1:144163/1‑143 (MQ=255) ttCGTGTTGTGCCCGGTTTTATTTCACCACCTCCGGGCTTCGGTGGTCTCGGCTATACCCCTACAGCGCGAGCTTGTGTTAACATTTCAATACCCTTACAGTTGAGAGTTATTGATATGTTGGATGTATTTACTCCAttgttg > 2:280959/1‑143 (MQ=255) tCGTGTTGTGCCCGGTTTTATTTCACCACCTCCGGGCTTCGGTGGTCTCGGCTATACCCCTACAGCGAGAGCTTGTGTTAACATTTCAATACCCTTACAGTTGAGAGTTATTGATATGTTGGATGTATTTACTCCATTGTTGa > 2:125753/1‑143 (MQ=255) ctgtaggggtatagccgagaccaccgaagcccggaggtggtCTCGGCTATACCCCTACAGCGAGAGCTTGTGTTAACATTTCAATACCCTTACAGTTGAGAGTTATTGATATGTTGGATGTATTTACTCCATTGTTGAAACtt > 1:75535‑M2/42‑143 (MQ=255) tgtgCCCGGTTTTATTTCACCACCTCCGGGCTTCGGTGGTCTCGGCTATACCCCTACAGCGAGAGCTTGTGTTAACATTTCAATACCCTTACAGTTGCGAGTTATTGATATGTTGGATGGATTTACTCCATTGTGGAAACttt > 2:117032/1‑143 (MQ=255) tgCCCGGTTTTATTTCACCACCTCCGGGCTTCGGTGGTCTCGGCTATACCCCTACAGCGAGAGCTTGGGTTAACATTTCAATAACCTTACAGTTGAGAGTTATTGATAAGTTGGGTGTATTTACTCCATTGTTGAAACttttt > 2:44031/1‑143 (MQ=255) tgCCCGGTGGTATTTCACCACCTCCGGGCTTCGGTGGTCTCGGCTATACCCCTACAGCGAGAGCTTGTGTTAACATTTCAATACCCTTACAGTTGAGAGTTATTGATATGTTGGATGTATTTACTCCATTGTTGAAACttttt < 1:240959/143‑1 (MQ=255) gttttgATTTCACCACCTCCGGGCTTCGGTGGTCTCGGCTATACCCCTACAGCGAGAGCTTGTGTTAACATTTCAATACCCTTACAGTTGAGAGTTATTGATATGTTGGATGTATTTACTCCATTGTTGAAACTTTTTGCTaa < 1:192715/141‑1 (MQ=255) ggTTTCATTCCACCACCTCCGGGCTTCGGTGGTCTCGGCTATACCCCTACAGCGAGAGCTTGTGTTAACATTTCAATACCCTTACAGTTGAGAGTTATTGATATGTTGGATGTATTTACTCCATTGTTGAAACTTTTTGCTaa < 1:99798/143‑1 (MQ=255) gTTTCACTTCACCACCTCCGGGCTTTGGTGGTCTCGGCTATACCCCTACCGCGAGAGCTTGTGTTAACATTTCAATACCCTTACAGTTGAGAGTTATTGATTTGTTGGATGTATTTACTCCATTGTTGAAACTTTTTGCTAAc < 2:31918/143‑1 (MQ=255) caccgaagcccggaggtggtCTCGGCTATACCCCTACAGCGAGAGCTTGTGTTAACATTTCAATACCCTTACAGTTGAGAGTTATTGATATGTTGGATGTATTTACTCCATTGTTGAAACTTTTTGCTAACGAGCCACTCGaa < 2:75535‑M2/123‑1 (MQ=255) ACCTCCGGGCCTCGCCTCTCTCTGCTATACCCCTCCAGCGAGAGCTTGTGTTAACATTTCAATACCTTAACTCTTGATATTTATTGATATGCTGGATGTATTTACTCCATTGTTGAAACTTTTTGCTAACGAGCCACTCGaaa > 2:279779‑M1/1‑143 (MQ=255) tCCGGGCTTCGGTGGTCTCGGCTATACCCCTACAGCGAGAGCTTGTGTTAACATTTCAATACCCTTACAGTTGAGAGTTATTGATATGTTGGATGTATTTACTCCATTGTTGAAACTTTTTGCTAACGAGCCACTCGAAAGAc > 1:30412/1‑143 (MQ=255) tggtCTCGGCTATACCCCTACAGCGAGAGCTTGTGTTAACATTTCAATACCCTTACAGTTGAGAGTTATTGATATGTTGGATGTATTTACTCCATTGTTGAAACTTTTTGCTAACGAGCCACTCGAAAGACTTATGTATACGa > 1:151064‑M2/5‑143 (MQ=255) | AATGTCGTTATTTACAACCGGAGGCGCACTCCCACCATTTAAATTTAACAGACAAGACCGACTCTTTATGGATATCGGAAATGCGCCTTCGTGTTGTGCCCGGTTTTATTTCACCACCTCCGGGCTTCGGTGGTCTCGGCTATACCCCTACAGCGAGAGCTTGTGTTAACATTTCAATACCCTTACAGTTGAGAGTTATTGATATGTTGGATGTATTTACTCCATTGTTGAAACTTTTTGCTAACGAGCCACTCGAAAGACTTATGTATACGA > NC_000913/1418468‑1418740 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |