New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3309317 | 24 (0.300) | 51 (0.680) | 46/262 | 0.6 | 72.2% | coding (1852/2136 nt) | pnp | polynucleotide phosphorylase |
? | NC_000913 | 3309408 = | 17 (0.230) | coding (1761/2136 nt) | pnp | polynucleotide phosphorylase |
AATCGGTCACTTTCTCAACGCGTTTGTCAGCGATTTGAGAGATGTGGACCAGACCTTCTTTACCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCTGCAGTGATCTCTTCGATACGACGAATAGCATGTTTCGCTTTCTCGCCGTCGGTCGCTGCAATCTTCACAGTACCGTCATCTTCGATTTCGATGGTGGTGCCAGTTTCTTCGGTCAGAGCACGGATTACAGAACCGCCTTTA > NC_000913/3309176‑3309459 | aaTCGGTCACTTTCTCAACGCGTTTGTCAGCGATTTGAGAGATGTGGACCAGACCTTCTTTACCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCg > 1:839982‑M1/1‑142 (MQ=255) aaTCGGTCACTTTCTCAACGCGTCTGTCAGCGATTTGAGAGATGTGGACCAGACCTTCTTTACCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCg < 1:796517‑M1/143‑2 (MQ=255) aTCGGTCACTTTCTCAACGCGTTTGTCAGCGATTTGAGAGATGTGGACCAGACCTTCTTTACCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCga < 1:1126426‑M1/143‑3 (MQ=255) tCGGTCACTTTCTCAGCGCGTTTGTCAGCGATTTGAGAGCTGTGGACCAGACCTTCTTTACCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgat < 2:218009‑M1/143‑4 (MQ=255) ggTCACTTTCTCAACGCGTTTGTCAGCGATTTGAGAGATGTGGACCAGACCTTCTTTACCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGACTTCgacgg > 1:188368‑M1/1‑138 (MQ=255) gTCACTTTCTCAACGCGTTTGTCAGCGATTTGAGAGATGTGGACCAGACCTTCTTTACCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggt < 1:1122511‑M1/143‑7 (MQ=255) tttCTCAACGCGTTTGTCAGCGATTTGAGAGATGTGGACCAGACCTTCTTTACCGCCGCCGATGGCAACCAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACCTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCggtgggcgagc > 2:715468‑M1/1‑132 (MQ=255) tcgaCGCGTTTGTCAGCGATTTGAGAGATGTGGACCAGACCTTCTTTACCGCCGCCGATGGCAACAAATTCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCTGCAGTGATctcctc < 2:1406291/140‑1 (MQ=255) tcAACGCGTTTGTCAGCGATTTGAGAGATGTGGACCAGACCTTCTTTACCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGTCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCTGCAGTGATCTCTTc < 1:458487/143‑1 (MQ=255) tcAACGCGTTTGTCAGCGATTTGAGAGATGTGGACCAGACCTTCTTTACCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagt < 1:1221795‑M1/143‑16 (MQ=255) cAACGCGTTTGTCAGCGATTTGAGAGATGTGGACCAGACCTTCTTTACCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCTGCAGTGATCTCTTCg > 1:820639/1‑143 (MQ=255) ccgtTTGTCAGCGATTTGAGAGATGTGGACCAGACCTTCTTTACCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttctt < 1:1028367‑M1/142‑21 (MQ=255) cgTTTGTCAGTGTTTTGATCGATCTGGACCAGACCTTCTTTACCGCCGCCGATGCCAACAAATGCGCCAAAGTCAACTATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttc < 2:994325‑M1/143‑22 (MQ=255) gTTTGTCAGCGATTTGAGAGATGTGGACCAGACCTTCTTTACCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCGGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCTGCAGTGATCTCTTCGCTacca > 1:12561/1‑141 (MQ=255) gttgTCAGCGATTTGAGAGATGTGGACCAGACCTTCTTTACCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttcgg < 1:34443‑M1/142‑24 (MQ=255) ttGTCAGCGATTTGAGAGATGTGGACCAGACCTTCTTTACCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCCCTTCCATTTCTGCAGTGATCTCGTCGATacgacg > 2:632434/1‑143 (MQ=255) tGTCAGCGATTTGAGAGATGTGGACCAGACCTTCTTTACCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCTGCAGTGATCTCTTCGATAcgacga > 1:1277329/1‑143 (MQ=255) gTCAGCGATTTGAGAGATGTGGACCAGACCTGCTTTACTGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGTTTCGAGTCACTATACCAGTGTAGACGCGGCCCACGTCGATTTCTGCAGTAATCGCGTAGATAcgacgac > 2:796928/1‑142 (MQ=255) tCAGCGATTTGAGAGATGTGGACCAGACCTTCTTTACCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttcggtcag > 1:520357‑M1/1‑116 (MQ=255) tCAGCGATTTGAGAGATGTGGACCAGACCTTCTTTACCGCCGCCGATGGCAACAAATGAGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgctggtggtggcagtttcttcgggcag > 1:632401‑M1/1‑116 (MQ=255) cAGCGATTTGAGAGATGTGGACCAAACCTTCTTTACCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCTGCAGTGCTCCCTTCGGTACAACGAAtc > 1:140499/1‑142 (MQ=255) aGCGATTTGTGAGATGTGGACCAGACCTTCTTTACCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGAGACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttcggtcagag > 1:728540‑M1/1‑114 (MQ=255) aGCGATTTGAGAGATGTGGACCAGACCTTCTTTACCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttcggtcaggg > 1:1414226‑M1/1‑114 (MQ=255) ttGAGAGATGTGGACCAGACCTTCTTTACCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacgga > 1:1050648‑M1/1‑108 (MQ=255) tGAGAGATGTGGACCAGACCGTCTTTACCGGCGCGGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggggccagtttcttcggtcagagcacggat < 2:752544‑M1/143‑37 (MQ=255) gagagaTGTGGACCAGACCTTCTTTACCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATCCGGGTCCCTTTTCCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgaaggtggagccagcttcttcggtcagagcacggatt > 1:57363‑M1/1‑106 (MQ=255) agagaTGTGGACCAGACCTTCGTTACCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggatca > 2:592207‑M1/1‑105 (MQ=255) gagaTGTGGACCAGACCTTCTTTACCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCTGCAGTGATCTCTTCGATACGACGAATAGCATGTTTCGc > 1:1432814/1‑143 (MQ=255) agaTGTGGACCAGACCTTCTTTACCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattaca < 1:778550‑M1/143‑41 (MQ=255) tgtgTACCAGACCGTCTTTACCGCCGCCGATGCCCGTACGGGCTCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCTGCAGTGATCTCTTCGATACGACGAATAGCATGTTTCGCTTtc < 2:302583/143‑1 (MQ=255) ggACCAGACCTTCTTTCCCGCCGCCGAGGGCAACACATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCCGTATAGACGCGGTCCTCTTCGATTTCTGCAGTGATCTCTTCGATATGACGAATAGCATGTTTCGCTTTCTCg < 1:1285693/143‑1 (MQ=255) ggACCAGACCTTCTTTACCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCTGCAGTGATCTCTTCGATACGACGAATAGCATGTTTCGCTTTCTCg > 2:1098849/1‑143 (MQ=255) gACCAGACCTTCTTTACCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCACCGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCAATTTCTGCAGTGATCTCTTCGCTACGGCGAAAAGCCTCTTTTGCGTCCTCGc > 2:798982/1‑143 (MQ=255) gACCAGACCTTCTTTACCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagaaccgc > 1:356400‑M1/1‑96 (MQ=255) aCCAGACCTTCTTTACCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCTGCAGTGATCTCTTCGCTACGACGAATAGCATGTTGCGCTTTGTCGcc > 2:1321760/1‑143 (MQ=255) aCCAGACCTTCTTTACCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTAGATTTCgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagaaccgcc > 1:685686‑M1/1‑95 (MQ=255) cAGACCTTCTTTACCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagacccgcctt > 2:685049‑M1/1‑93 (MQ=255) aGACCTTCTTTACCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttcg < 1:1017632‑M1/114‑23 (MQ=255) aGACCTTCTTTACCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttcg > 2:1017632‑M1/1‑92 (MQ=255) gACCTTCTTGACCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCGGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCTGCAGTGATCTCTTCGATACGACGAATAGCATGTTTCGCTTTCTCGCCgtcg < 2:812970/143‑1 (MQ=255) aCCTTCTGTCCCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCGAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagaaccgcctttac < 2:1454118‑M1/143‑54 (MQ=255) cttcttTACCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagcaccgcctttcccg > 2:983430‑M1/1‑88 (MQ=255) ccgccgccgATGGCAAAAACTGCGCCAAGGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagaaccgcctttaccgataccatc > 2:525396‑M1/1‑80 (MQ=255) gccgccgATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagaaccgcctttaccgataacatctt > 2:55188‑M1/1‑78 (MQ=255) ccgccgATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagaaccgcctttaccgataacatcttt < 1:382672‑M1/143‑67 (MQ=255) ccgccgATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagaaccgcctttaccgataacatcttt < 1:1119623‑M1/143‑67 (MQ=255) ccgATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagaacagcctttaccgataacatctttgat > 2:800994‑M1/1‑74 (MQ=255) cgATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagaaccgcctttaccgataacatctttgatc < 1:1216472‑M1/143‑71 (MQ=255) gATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagaaccgcctttaccgataaaatctttaaaaa > 1:696840‑M1/1‑72 (MQ=255) ggCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagaaccgcctttaccgataacatctttgatcttgt < 1:43400‑M1/143‑75 (MQ=255) aaaTGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCTGCAGTGATCTCTTCGATACGACGAATAGCATGTTTCGCTTTCTCGCCGTCGGTCGCTGCAATCTTCACAGTACCGTCAt > 2:366928/1‑143 (MQ=255) tGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagaaccgcctttaccgataacatctttggtctggtccgggttgg > 1:117968‑M1/1‑60 (MQ=255) gcCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCTGCAGTGATCTCTTCGATACGACGAATAGCATGTTTCGCTTTCTCGCCGTCGGTCGCTGCAATCTTCACAGTACCGTCATCttcga < 1:1098849/143‑1 (MQ=255) cAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagaaccgcctttaccgataacatctttgatcttgtccgggttgatcttgatggta < 1:1163349‑M1/143‑95 (MQ=255) aaCGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagaaccgcctttaccgataacatctttgatcttgtccgggttgatcttgatggtat > 1:1163985‑M1/1‑48 (MQ=255) aCGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagaaccgcctttaccgctaacatctttgatcttgtccgggttgatcttgatggtatg > 2:134627‑M1/1‑47 (MQ=255) cggtACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCTGCAGTGATCTCTTCGATACGACGAATAGCATGTTTCGCTTTCTCGCCGTCGGTCGCTGCAATCTTCACAGTACCGTCATCTTCGATTTCGAtggtg < 1:697140/140‑1 (MQ=255) aTACGGGTCGTGTTACCTGTGCGGACGCGGCCCACTGCGATTTCTGCGGTGATCGTCTCGATACGACGAATAGCATGTTTCGCTTTCTCGCCGTCGGTCGCTGCAATCTTCACAGTACCGTCATCTTCGATTTCGATggtggt < 2:803975/143‑1 (MQ=255) cACTTGACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatgctggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagaaccgcctttaccgataacatctttgatcttgtccgggttgatcttgatggtatggatacgcggtg < 2:918457‑M1/143‑108 (MQ=255) cctcgaccactGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagaaccgcctttaccgataacatctttgatcttgtccgggttgatcttgatggtatggatacgcggtgc < 1:483441‑M1/138‑109 (MQ=255) atcttacgAGTGTTGACGCGTGCTACTTTGATTTCgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagaaccggctttaccgataacatctttgatcttgtccgggttgatcttgatggtatggatacgcggtgc < 2:869349‑M1/140‑109 (MQ=255) aCTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagaaccgcctttaccgataacatctttgatcttgtccgggttgatcttgatggtgtggatacgcggtgc > 1:4419‑M1/1‑35 (MQ=255) tttACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagaaccgcctttaccgataacatctttgatcttgtccgggttgatcttgatggtatggatacgcggtgcga > 1:1221843‑M1/1‑33 (MQ=255) tttACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCTGCAGTGATCTCTTCGATACGACGAATAGCATGTTTCGCTTTCTCGCCGTCGGTCGCTGCAATCTTCACAGTACCGTCATCTTCGATTTCGATGGTGGTGCCAGTttctt < 1:366928/143‑1 (MQ=255) tttACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCTGCAGTGATCTCTTCGATACGACGAATAGCATGTTTCGCTTTCTCGCCGTCGGTCGCTGCAATCTTCACAGTACCGTCATCTTCGATTTCGAAGGCGGTGCCAGTttctg > 2:1003285/1‑142 (MQ=255) ttACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacaggaccgcctttaccggcaacatctttgatcttgtccgggttgatcttgcgggtagggatacgcggtgggac > 2:94638‑M1/1‑32 (MQ=255) ttACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagaaccgcctttaccgataacatctttgatcttgtccgggttgatcttgatggtatggatacgcggtgcgaa > 1:1444585‑M1/1‑32 (MQ=255) ccAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagaaccgcctttaccgataacatctttgatcttgtccgggttgatcttgatggtatggatacgcggtgcgaactc < 1:800994‑M1/143‑115 (MQ=255) cAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCTGCAGTGATCTCTTCGATACGACGAATAGCATGTTTCGCTTTCTCGCCGTCGGTCGCTGCCATCTTCACAGTACCGTCATCTTCGATTTCGATGGTGGTGCCAGTGTCTTCGGTc > 2:1388525/1‑143 (MQ=255) gtgtAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagaaccgcctttaccgataacatctttgatcttgtccgggttgatcttgctggtatggatacgcggtgcgaactccgc > 1:556565‑M1/1‑26 (MQ=255) gtgtAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagaaccgcctttaccgataacatctttgatcttgtccgggttgatcttgatggtatggatacgcggtgcgaactcaga < 1:1426633‑M1/143‑118 (MQ=255) tgtAGACGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagaaccgcctttaccgataacatctttgatcttgtccgggttgatcttgatggtatggatccgcggtgcgaactccgag > 1:347475‑M1/1‑25 (MQ=255) aCGCGGCCCACTTCGATTTCgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagaaccgcctttaccgataacatctttgatcttgtccgggttgatcttgatggtatggatacgctgtgcgaactcagagatatc > 1:425432‑M1/1‑20 (MQ=255) ttcgatttcgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagaaccgcctttaccgataacatctttgatcttgtccgggttgatcttgatggtatggatacgcggtgcgaactcagagatatcgccaccgggag > 2:673161‑M1/1‑9 (MQ=255) ttCGATTTCTGCAGTGATCTCTTCGATACGACGAATAGCATGTTTCGCTTTCTCGCCGTCGGTCGCTGCAATCTTCACAGTACCGTCATCTTCGATTTCGATGGTGGTGCCAGTTTCTTCGGTCAGAGCACGGATTACAGAAc > 2:420322/1‑143 (MQ=255) tctaTTTCTGTAGTGAGCTCTTCGAGACGACGAATAGCATGTTTCGCTTGCTCGCCGTCGGTCGCTGCATTCTTCACAGTACCGGCATCTTCGATTTCGATGGTGGTGCCAGTTTCTTCGGTCAGAGCACGGATGACAGAAcc < 2:1002066/140‑1 (MQ=255) cgatttcgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagaaccgcctttaccgataacatctttgatcttgtccgggttgatcttgatggtatggatacgcggtgcgaactcagagatatcgccacgcggcgcg < 1:909861‑M1/143‑137 (MQ=255) attttgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagaaccgcctttaccgataacatctttgatcttgtccgggttgatcttgatggtatgggtacgcggtgcgaactcggggatatcgccaggcggcgcgtt > 1:23978‑M1/1‑5 (MQ=255) atttcgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagaaccgcctttaccgataacatctttgatcttgtccgggttgatcttgatggtatggatacgcggtgggaactcagagatatcgccacgcggcgcgtt > 1:315941‑M1/1‑5 (MQ=255) atttcgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagaaccgcctttaccgataacatctttgatcttgtccgggttgatcttgatggtatggatacgcggtgcgaactcagagatatcgccacgcggcgcgtt < 1:862486‑M1/143‑139 (MQ=255) atttcgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagaaccgcctttaccgataacatctttgatcttgtccgggttgatcttgatggtatggagacgcggtgcgaacgcggcgatatcgcgacgcggcgcgtt > 1:94829‑M1/1‑5 (MQ=255) tttcgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagaaccgcctttaccgataacatctttgatcttgtccgggttgatcttgatggtatggatacgcggtgcgaactcagagatatcgccacgcggcgcgttg > 2:1142309‑M1/1‑4 (MQ=255) tcgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagaaccgcctttaccgataacatctttgatcttgtccgggttgatcttgatggtatggatacgcggtgcgaactcagagatatcgccacgcggcgcgttgat < 2:223944‑M1/143‑142 (MQ=255) cgatggtggtgccagtttcttcggtcagagcacggattacagaaccgcctttaccgataacatctttgatcttgtccgggttgatcttgatggtatggatacgcggtgcgaactcagagatatcgccacgcggcgcgttgatc < 1:1368454‑M1/143‑143 (MQ=255) | AATCGGTCACTTTCTCAACGCGTTTGTCAGCGATTTGAGAGATGTGGACCAGACCTTCTTTACCGCCGCCGATGGCAACAAATGCGCCAAAGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCTGCAGTGATCTCTTCGATACGACGAATAGCATGTTTCGCTTTCTCGCCGTCGGTCGCTGCAATCTTCACAGTACCGTCATCTTCGATTTCGATGGTGGTGCCAGTTTCTTCGGTCAGAGCACGGATTACAGAACCGCCTTTA > NC_000913/3309176‑3309459 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |