| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3309317 | 24 (0.300) | 51 (0.680) | 46/262 | 0.6 | 72.2% | coding (1852/2136 nt) | pnp | polynucleotide phosphorylase |
| ? | NC_000913 | 3309408 = | 17 (0.230) | coding (1761/2136 nt) | pnp | polynucleotide phosphorylase | |||||
AGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCTGCAGTGATCTCTTCGATACGACGAATAGCATGTTTCGCTTTCTCGCCGTCGGTCGCTGCAATCTTCACAGTACCGTCATCTTCGATTTCGATGGTGGTGCCAGTTTCTTCGGTCAGAGCACGGATTACAGAACCGCCTTTACCGATAACATCTTTGATCTTGTCCGGGTTGATCTTGATGGTATGGATACGCGGTGCGAACTCAGAGATATCGCCACGCGGCGCGTTGATC > NC_000913/3309266‑3309549 | aatcggtcactttctcaacgcgtttgtcagcgatttgagagatgtggaccagaccttctttaccgccgccgatggcaacaaatgcgccaaagtcaacgatacgggtcactttaccagtgtagacgcggcccacttcgatttcg > 1:839982‑M2/143‑143 (MQ=255)aatcggtcactttctcaacgcgtctgtcagcgatttgagagatgtggaccagaccttctttaccgccgccgatggcaacaaatgcgccaaagtcaacgatacgggtcactttaccagtgtagacgcggcccacttcgatttcg < 1:796517‑M2/1‑1 (MQ=255) atcggtcactttctcaacgcgtttgtcagcgatttgagagatgtggaccagaccttctttaccgccgccgatggcaacaaatgcgccaaagtcaacgatacgggtcactttaccagtgtagacgcggcccacttcgatttcga < 1:1126426‑M2/2‑1 (MQ=255) tcggtcactttctcagcgcgtttgtcagcgatttgagagctgtggaccagaccttctttaccgccgccgatggcaacaaatgcgccaaagtcaacgatacgggtcactttaccagtgtagacgcggcccacttcgatttcgat < 2:218009‑M2/3‑1 (MQ=255) ggtcactttctcaacgcgtttgtcagcgatttgagagatgtggaccagaccttctttaccgccgccgatggcaacaaatgcgccaaagtcaacgatacgggtcactttaccagtgtagacgcggcccacttcgacttcGAcgg > 1:188368‑M2/139‑143 (MQ=255) gtcactttctcaacgcgtttgtcagcgatttgagagatgtggaccagaccttctttaccgccgccgatggcaacaaatgcgccaaagtcaacgatacgggtcactttaccagtgtagacgcggcccacttcgatttcGAtggt < 1:1122511‑M2/6‑1 (MQ=255) cggtACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCTGCAGTGATCTCTTCGATACGACGAATAGCATGTTTCGCTTTCTCGCCGTCGGTCGCTGCAATCTTCACAGTACCGTCATCTTCGATTTCGAtggtg < 1:697140/140‑1 (MQ=255) aTACGGGTCGTGTTACCTGTGCGGACGCGGCCCACTGCGATTTCTGCGGTGATCGTCTCGATACGACGAATAGCATGTTTCGCTTTCTCGCCGTCGGTCGCTGCAATCTTCACAGTACCGTCATCTTCGATTTCGATggtggt < 2:803975/143‑1 (MQ=255) tttctcaacgcgtttgtcagcgatttgagagatgtggaccagaccttctttaccgccgccgatggcaaccaatgcgccaaagtcaacgatacgggtcaccttaccagtgtagacgcggcccacttcgatttcggtgggcgagc > 2:715468‑M2/133‑137 (MQ=255) tcaacgcgtttgtcagcgatttgagagatgtggaccagaccttctttaccgccgccgatggcaacaaatgcgccaaagtcaacgatacgggtcactttaccagtgtagacgcggcccacttcgatttcGATGGTGGTGCCAGt < 1:1221795‑M2/15‑1 (MQ=255) tttACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCTGCAGTGATCTCTTCGATACGACGAATAGCATGTTTCGCTTTCTCGCCGTCGGTCGCTGCAATCTTCACAGTACCGTCATCTTCGATTTCGATGGTGGTGCCAGTttctt < 1:366928/143‑1 (MQ=255) tttACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCTGCAGTGATCTCTTCGATACGACGAATAGCATGTTTCGCTTTCTCGCCGTCGGTCGCTGCAATCTTCACAGTACCGTCATCTTCGATTTCGAAGGCGGTGCCAGTttctg > 2:1003285/1‑142 (MQ=255) ccgtttgtcagcgatttgagagatgtggaccagaccttctttaccgccgccgatggcaacaaatgcgccaaagtcaacgatacgggtcactttaccagtgtagacgcggcccacttcgatttcGATGGTGGTGCCAGTttctt < 1:1028367‑M2/20‑1 (MQ=255) cgtttgtcagtgttttgatcgatctggaccagaccttctttaccgccgccgatgccaacaaatgcgccaaagtcaactatacgggtcactttaccagtgtagacgcggcccacttcgatttcGATGGTGGTGCCAGTttcttc < 2:994325‑M2/21‑1 (MQ=255) gttgtcagcgatttgagagatgtggaccagaccttctttaccgccgccgatggcaacaaatgcgccaaagtcaacgatacgggtcactttaccagtgtagacgcggcccacttcgatttcGATGGTGGTGCCAGTTTCTTCgg < 1:34443‑M2/23‑1 (MQ=255) cAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCTGCAGTGATCTCTTCGATACGACGAATAGCATGTTTCGCTTTCTCGCCGTCGGTCGCTGCCATCTTCACAGTACCGTCATCTTCGATTTCGATGGTGGTGCCAGTGTCTTCGGTc > 2:1388525/1‑143 (MQ=255) tcagcgatttgagagatgtggaccagaccttctttaccgccgccgatggcaacaaatgcgccaaagtcaacgatacgggtcactttaccagtgtagacgcggcccacttcgatttcGATGGTGGTGCCAGTTTCTTCGGTCag > 1:520357‑M2/117‑143 (MQ=255) tcagcgatttgagagatgtggaccagaccttctttaccgccgccgatggcaacaaatgagccaaagtcaacgatacgggtcactttaccagtgtagacgcggcccacttcgatttcGCTGGTGGTGGCAGTTTCTTCGGGCag > 1:632401‑M2/117‑143 (MQ=255) agcgatttgtgagatgtggaccagaccttctttaccgccgccgatggcaacaaatgcgccaaagtcaacgagacgggtcactttaccagtgtagacgcggcccacttcgatttcGATGGTGGTGCCAGTTTCTTCGGTCagag > 1:728540‑M2/115‑143 (MQ=255) agcgatttgagagatgtggaccagaccttctttaccgccgccgatggcaacaaatgcgccaaagtcaacgatacgggtcactttaccagtgtagacgcggcccacttcgatttcGATGGTGGTGCCAGTTTCTTCGGtcaggg > 1:1414226‑M2/115‑141 (MQ=255) ttgagagatgtggaccagaccttctttaccgccgccgatggcaacaaatgcgccaaagtcaacgatacgggtcactttaccagtgtagacgcggcccacttcgatttcGATGGTGGTGCCAGTTTCTTCGGTCAGAGCACGGa > 1:1050648‑M2/109‑143 (MQ=255) tgagagatgtggaccagaccgtctttaccggcgcggatggcaacaaatgcgccaaagtcaacgatacgggtcactttaccagtgtagacgcggcccacttcgatttcGATGGTGGGGCCAGTTTCTTCGGTCAGAGCACGGAt < 2:752544‑M2/36‑1 (MQ=255) gagagatgtggaccagaccttctttaccgccgccgatggcaacaaatgcgccaaagtcaacgatccgggtcccttttccagtgtagacgcggcccacttcgatttcGAAGGTGGAGCCAGCTTCTTCGGTCAGAGCACGGAtt > 1:57363‑M2/107‑143 (MQ=255) agagatgtggaccagaccttcgttaccgccgccgatggcaacaaatgcgccaaagtcaacgatacgggtcactttaccagtgtagacgcggcccacttcgatttcGATGGTGGTGCCAGTTTCTTCGGTCAGAGCACGgatca > 2:592207‑M2/106‑141 (MQ=255) agatgtggaccagaccttctttaccgccgccgatggcaacaaatgcgccaaagtcaacgatacgggtcactttaccagtgtagacgcggcccacttcgatttcGATGGTGGTGCCAGTTTCTTCGGTCAGAGCACGGATTACa < 1:778550‑M2/40‑1 (MQ=255) ttCGATTTCTGCAGTGATCTCTTCGATACGACGAATAGCATGTTTCGCTTTCTCGCCGTCGGTCGCTGCAATCTTCACAGTACCGTCATCTTCGATTTCGATGGTGGTGCCAGTTTCTTCGGTCAGAGCACGGATTACAGAAc > 2:420322/1‑143 (MQ=255) tctaTTTCTGTAGTGAGCTCTTCGAGACGACGAATAGCATGTTTCGCTTGCTCGCCGTCGGTCGCTGCATTCTTCACAGTACCGGCATCTTCGATTTCGATGGTGGTGCCAGTTTCTTCGGTCAGAGCACGGATGACAGAAcc < 2:1002066/140‑1 (MQ=255) gaccagaccttctttaccgccgccgatggcaacaaatgcgccaaagtcaacgatacgggtcactttaccagtgtagacgcggcccacttcgatttcGATGGTGGTGCCAGTTTCTTCGGTCAGAGCACGGATTACAGAACCGc > 1:356400‑M2/97‑143 (MQ=255) accagaccttctttaccgccgccgatggcaacaaatgcgccaaagtcaacgatacgggtcactttaccagtgtagacgcggcccacttagatttcGATGGTGGTGCCAGTTTCTTCGGTCAGAGCACGGATTACAGAACCGcc > 1:685686‑M2/96‑143 (MQ=255) 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attttGATGGTGGTGCCAGTTTCTTCGGTCAGAGCACGGATTACAGAACCGCCTTTACCGATAACATCTTTGATCTTGTCCGGGTTGATCTTGATGGTATGGGTACGCGGTGCGAACTCGGGGATATCGCCAGGCGGCGCGtt > 1:23978‑M2/6‑143 (MQ=255) atttcGATGGTGGTGCCAGTTTCTTCGGTCAGAGCACGGATTACAGAACCGCCTTTACCGATAACATCTTTGATCTTGTCCGGGTTGATCTTGATGGTATGGATACGCGGTGGGAACTCAGAGATATCGCCACGCGGCGCGtt > 1:315941‑M2/6‑143 (MQ=255) atttcGATGGTGGTGCCAGTTTCTTCGGTCAGAGCACGGATTACAGAACCGCCTTTACCGATAACATCTTTGATCTTGTCCGGGTTGATCTTGATGGTATGGATACGCGGTGCGAACTCAGAGATATCGCCACGCGGCGCGtt < 1:862486‑M2/138‑1 (MQ=255) atttcGATGGTGGTGCCAGTTTCTTCGGTCAGAGCACGGATTACAGAACCGCCTTTACCGATAACATCTTTGATCTTGTCCGGGTTGATCTTGATGGTATGGAGACGCGGTGCGAACGCGGCGATATCGCGACGCGGCGCGtt > 1:94829‑M2/6‑143 (MQ=255) tttcGATGGTGGTGCCAGTTTCTTCGGTCAGAGCACGGATTACAGAACCGCCTTTACCGATAACATCTTTGATCTTGTCCGGGTTGATCTTGATGGTATGGATACGCGGTGCGAACTCAGAGATATCGCCACGCGGCGCGTTg > 2:1142309‑M2/5‑143 (MQ=255) tcGATGGTGGTGCCAGTTTCTTCGGTCAGAGCACGGATTACAGAACCGCCTTTACCGATAACATCTTTGATCTTGTCCGGGTTGATCTTGATGGTATGGATACGCGGTGCGAACTCAGAGATATCGCCACGCGGCGCGTTGAt < 2:223944‑M2/141‑1 (MQ=255) cgatGGTGGTGCCAGTTTCTTCGGTCAGAGCACGGATTACCGACCCCCGTCGCGGGCGATCTTCTCTCATCTTTCCCTGGGGGAGCGTGATGGTATGGCTCCGCGGTGCGACCTCAGAGATATGGCCACGCGGCGCGTTGATc > 1:339898/1‑143 (MQ=255) cGATGGTGGTGCCAGTTTCTTCGGTCAGAGCACGGATTACAGAACCGCCTTTACCGATAACATCTTTGATCTTGTCCGGGTTGATCTTGATGGTATGGATACGCGGTGCGAACTCAGAGATATCGCCACGCGGCGCGTTGATc < 1:1368454‑M2/142‑1 (MQ=255) | AGTCAACGATACGGGTCACTTTACCAGTGTAGACGCGGCCCACTTCGATTTCTGCAGTGATCTCTTCGATACGACGAATAGCATGTTTCGCTTTCTCGCCGTCGGTCGCTGCAATCTTCACAGTACCGTCATCTTCGATTTCGATGGTGGTGCCAGTTTCTTCGGTCAGAGCACGGATTACAGAACCGCCTTTACCGATAACATCTTTGATCTTGTCCGGGTTGATCTTGATGGTATGGATACGCGGTGCGAACTCAGAGATATCGCCACGCGGCGCGTTGATC > NC_000913/3309266‑3309549 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |