New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 275149 | NA (NA) | 5 (0.110) | 5/264 | NT | 13.2% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
? | NC_000913 | 674024 = | 33 (0.760) | coding (760/2583 nt) | leuS | leucine‑‑tRNA ligase |
TTTTCTCCATCGTCGCCATTTCAGCTTCGGCAACTTTGGTGTTACGGCATTCGTCAATAAAGGCCGCCAGTTCAGGATTATTTTCCGCCGCTTTCTGCGCCAGCGGATGACCCGCAGCTACCGCCAGGTAGGTACAACCCATAAAGGTGTCCGGGCGGGTAGTGTAAACGGTCAGCGTGTTGTCATAGTCGTTAACGTTGAAGGTGATCTCCACGCCTTCGGAACGACCGATCCAGTTACGCTGCATGGTTTTAACGGTGTCTGGCCAGTGATCCAGTTTAT > NC_000913/673883‑674164 | ttttCTCCATCGTCGCCATTTCAGCTTCGGCAACTTTGGTGTTACGGCATTCGTCACTAAAGGCCGCCAGTTCCTGATTCTTTTCCGCCGCTTTCTGCGCCAGCGGATGACCCGCAGCTACCGCCAGCTCGGTACAACCCATa > 2:433074/1‑143 (MQ=255) tctcCATCGTCGCCATTTCAGCTTCGGCAACTTTGGTGTTACGGCATTCGTCAATAAAGGCCGCCAGTTCAGGATTATTTTCCGCCGCTTTCTGCGCCAGCGGATGACCCGCAGCTACCGCCAGGTAGGTACAACCCATAAAg < 2:191755/143‑1 (MQ=255) tccccctcgtcgCCATCTAAGCATCGGCAGCTCTCCTGTTACGGCATTCCTCAATACACGCCGCCAGTTCAGTATTATTTTCCGCCGCTTTCTGCGCCAGCGGATGACCCGCAGCTACCGCCAGGTAGGTACAACCCATAAAg < 1:567722/137‑1 (MQ=255) gCCATTTCAGCTTCGGCAACTTTGGTGTTACGGCATTCGTCAATAAAGGCCGCCAGTTCAGGATTATTTTCCGCCGCTTTCTGCGCCAGCGGATGACCCGCAGCTACCGCCAGGTAGGTCCAACCCATAAAGGTGTCcgggcg > 1:846009/1‑143 (MQ=255) cATTGCAGCTTCGGCAACTTTGGGGTTACGGCATTCGTCAATAAAGGCCGCCAGTTCAGGATTATTTTCCGCCGCTTGCTGCGCCAGCGGATGACCCGCAGCTACCGCCAGGTAGGTACAACCCATAAAGGTGTCcgggcggg < 1:719189/143‑1 (MQ=255) ttCAGCTTCGGCAACTTTGGTGTTACGGCATTCGTCAATAAAGGCCGCCAGTTCAGGATTATTTTCCGCCGCTTTCTGCGCCAGCGGATGACCCGCAGCTACCGCCAGGTAGGTACAGCCCGTAAAGGTGTCCGGGCGGGTAg > 2:726236/1‑143 (MQ=255) tccgCTTCGGCCACTTTGGTGTTACCGCATTCGTCACTCAAGGCCGCCAGTTCAGGATTATTTTCCGCCGCTTTCTGCGCCAGCGGATGACCCGCAGCTACCGCCATGTAGGTACAACCCATAAAGTTGTCTGGGCGGGTAgt < 2:260135/140‑1 (MQ=255) tCAGCTTCGGCAACTTGGGTGTTACGGCATTCGTCAATAAAGGCCGCCAGTTCAGGATTATTTTCCGCCGCTTTCTGCGCCAGCGGATGACCCGCAGCTACCGCCAGGTAGGTACAACCCATAAAGGTGTCCGGGCGGGTAgt < 1:100554/143‑1 (MQ=255) gacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTAAAGGTGTCCGGGCGGGTAgtg > 1:555810‑M2/121‑143 (MQ=255) cTTCGGCAACTTTGGTGTTACGGCATTCGTCAATAAAGGCCGCCAGTTCAGGATTATTTTCCGCCGCTTTCTGCGCCAGCGGATGACCCGCAGCTACCGCCAGGTAGGTACAACCCATAAAGGTGTCCGGGCGGGTAgtgtga > 1:246745/1‑141 (MQ=255) gcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTAAAGGTGTCCGGGCGGGTAGTGTgaa > 1:731759‑M2/117‑143 (MQ=255) gaCTTTGGTGTTACGGGATTCGTCAACAAAGGCCGCCAGGTCAGGATGATTGTCCGCCGCTTTCTGCGCCAGCGGATGACCCGCAGCTACCGCCAGGTAGGTACAACCCATAAAGGTGTCCGGGCGGGTAGTGTAAACGGTCa < 2:763085/142‑1 (MQ=255) cgcTTTGGTGTTACCGCCTTCGTTACGAGAGACCGCTAGTGCAGTATTATTTGCCGCCGCTTTCTGCGCCAGCGGCTGACCCGCAGCTACCGCCAGGTAGGTACAACCCACAAAGGTGTCCGGGCGGGTAGTGTAAACGGTCa < 2:229256/141‑1 (MQ=255) ctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacgtgttcgcaccttccTAAAGGTGTCCGGGCGGGTAGTGTAAACGGTCAGCgt < 1:373510‑M2/37‑1 (MQ=255) gtgtTACGGCATTCGTCAATAAAGGCCGCCAGTTCAGGATTATTTTCCGCCGCTTTCTGCGCCAGCGGATGACCCGCAGCTACCGCCAGGTAGGTACAACCCATAAAGGTGTCCGGGCGGGTAGTGTAAACGGTCAGCGtgtt < 1:736543/143‑1 (MQ=255) ttACGGCATTCGTCAATAAAGGCCGCCAGTTTAGGATTATTTTCCGCCGCTTTCTGCGCCAGCGGATGACCCGCAGCGACCGCCAAGTACGTACAACCCATAAAGGTGTCCGGGCGGGTAGTGTAAACGGTCAGCGTGTTGTc < 1:844463/143‑1 (MQ=255) aTTCGTCACTAAAGGCCGCCAGTTCAGGATTATTTTCCGCCGCTTTCTGCGACAACGCATGACCCGCAGCTACCGCCAGGTAGGTACAACCCATAAAGGTGTCCGGGCGGGTAGTGTAAACGGTCAGCGTGTTGTCATAGTCg < 2:505319/143‑1 (MQ=255) tCGTCAATAAAGGCCGCCAGTTCAGGATTCTTTTCCGCCGCTTTCTGAGCGAGTAGTAAATCGTCAGATATAGCCAAGGAGGTACAACCCATAAAGGTGTCCGGGCGGGTAGTGTGCACGGGCAGCGTGTTGTCATAGTCGtt > 1:842612/1‑143 (MQ=255) tCGTCAATAAAGGCCGCCAGTTCAGGATTATTTTCCGCCGCTTTCTGCGCCAGCGGATGACCCGCAGCTACCGCCAGGTAGGTACAACCCATAAAGGTGTCCGGGCGGGTAGTGTAAACGATCAGCGTGTTGTCATAGTCGtt > 1:224618/1‑143 (MQ=255) tCAATAAAGGCCGCCAGTTCAGGATTATTTTCCGCCGCTTTCTGCGCCAGCGGATGACCCGCAGCTACCGCCAGGTAGGTACAACCCATAAAGGTGTACGGGCGGGTAGTGTAAACGGTAAGCGTGTTGTCATATACGTTaaa > 2:405749/1‑142 (MQ=255) caacaaGGGCCGCCAGTCCAGGATTATTTTCCGCCGCTTTCTGCGCCAGCGGATCACCCGCAGCTACCGCCAGGTAGGTACAACCCATAAAGGTGTCCGGGCGGGTAGTGTAACCGGTCAGCGTGTTGTCATAGTCGTTAACg < 1:251589/143‑1 (MQ=255) gaGGCCGTCGGTGCAGGATTATGTTCCGCGGGTTGCGGCGCCAGCGGATGACCCGCAGTTACCGCCAGGCAGGTACAACCCATAAAGGTGTCCGGGCGGGTAGTGTAAACGGTCAGCGTGTTGTCATAGTCGTTAACGTTGaa < 2:322993/142‑1 (MQ=255) ggCCGCCGGTTCGGGATGGTTTTCCTCCGCGTTCTGCGCCAGCGGATGACCCGCAGCTACCGCCAGGTAGGTACAACCCATAAAGGGGTCCGGGCGGGTAGTGTAAACGGTCAGCGTGTTGTCATAGTCGTTAACGTTGAAgg < 2:328907/143‑1 (MQ=255) cgccAGTTCAGGATTATTTTCCGCCGCTTTCTGCGCCAGCGGATGACCCGCAGCTACCGCCAGGCAGCTACAACCCATAAAGGTGTCCGGGCGGCTAGTGTAAACGGTCAGCGTGCTGTCATAGTCGTTACCGTTGAACGTGa > 1:178959/1‑143 (MQ=255) cAGTTCAGGATTATTTTCCGCCGCTTTCTGCGCCAGCGGATGACCCGCAGCTACCGCCAGGTAGGTACAACCCATAAAGGTGTCCGGGCGGGTAGTGTAAACGGTCAGCGGGGTGTGGTAGTCGTTGACGGTGAAGGTGAtct > 2:380328/1‑143 (MQ=255) aGTTCAGGCTTATTTTCCGCCGCTTTCTGCGCCAGCGAATGACCCGCAGCTACCGCCAGGTAGGTACAACCCATAAAGGTGTCCGGGCGGGTAGTGTAAACGGTCAGCGTGTTGTCATAGTCGTTAACGTTGAAGGTGAtctc < 1:210501/143‑1 (MQ=255) tCAGGATGGTTTGCCGCCGTTTTCTGCGCCGGCGGAGGACCCGCAGCTACCGCCAGGTAGGTACAACCCATAAAGGTGTCCGGGCGGGTAGTGTAAACGGTCAGCGTGTTGTCATAGTCGTTAACGTTGAAGGTGATCTCCAc < 2:474399/143‑1 (MQ=255) cAGGATTATTTTCCGCCGCTTTCTGCGCCAGCGGATGACCCGCAGCTACCGCCCGGTAGGTACAACCCATAAAGGTGTCCGGGCGGGAGGTGTAAACGGTCAGCGTGTCGTCATAGGCGTTAACGTTGAAGGTGATCTCGAca > 2:730681/1‑142 (MQ=255) atgttCCGCCGCTTTCTGCGCCAGCGGAAGAGCCGCGGCGGCCGCCAGGTAGGTACAACCCATAAAGGTGTCCGGGCGGGTAGTGTAAACGGTCAGCGTGTTGTCATAGTCGTTAACGTTGAAGGTGATCTCCACGCCTTCgg < 1:571007/140‑1 (MQ=255) tctatggctccagatgaccaacaggatctcctgtcagggacttggtcgcgccttccTAAAGGTGTCCGGGCGGGTAGTGTAAACGGTCAGCGTGTTGTCATAGTCGTTAACGTTGAAGGTGATCTCCACGCCTTCGGAACGAc < 2:698804‑M2/87‑1 (MQ=255) cgccgcTTTCTGCGCCAGCGGATGACCCGCAGCTACCGCCAGGTAGGTACAACCCATAAAGGTGTCCGGGCGGGTAGTGTAAACGGTCAGCCAGTGGTCGTAGTCGTTAACGTTGAAGGTGATCTCCCCGCCTTCGCAACGAc > 1:430453/1‑143 (MQ=255) tggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTAAAGGTGTCCGGGCGGGTAGTGTAAACGGTCAGCGTGTTGTCATAGTCGTTAACGTTGAAGGTGATCTCCACGCCTTCGGAACGACCGAt < 1:826549‑M2/91‑1 (MQ=255) cTTTCTGCGCCAGCGGATGACCCGCAGCTACCGCCAGGTAGGTACAACCCATAAAGGTGTCCGGGCGGGTAGTGTAAACGGTCAGCGTGTTGTCATAGTCGTTAACGTTGAAGGTGATCTCCACGCCTTCGGAACGACCGATc < 1:314517/143‑1 (MQ=255) tttCTGCGCCAGCGGATGACCCGCAGCTACCGCCAGGTAGGTACAACCCACAAAGGTGTCCGGGCGGGTAGTGTAAACGGTCAGCGTGTTGTCATAGTCGTTAACGTTGAAGGTGATCTCCACGCCTTCGGAACGACCGATcc < 1:49941/143‑1 (MQ=255) ttCTGCGCCAGCGGATGACGCGCAGCTACCGCCAGGTAGGTACAACCCATAAAGGTGTCCGGGCGGGTAGTGTAAACGGTCAGCGTGTTGTCATAGTCGTTAACGTTGAAGGTGATCTCCACGCCTTCGGAACGACCGATCCa < 1:266974/143‑1 (MQ=255) cgcCAGCGGATGACCCGCAGCTACCGCCAGGTAGGTACAACCCATAAAGGTGTCCGGGCGGGTAGTGTAAACGGTCAGCGTGTTGTCATAGTCGTTAACGTTGAAGGTGATCTCCACGCCTTCGGAACGGCCGATCCAGTTAc < 1:172240/143‑1 (MQ=255) gACCCGCAGCTACCGCCAGGTAGGTACAACCCATAAAGGTGTCCGGGCGGGTAGTGTAAACGGTCAGCGTGTTGTCATAGTCGTTAACGTTGAAGGTGATCTCCACGCCTTCGGAACGACCGATCCAGTTACGCTGCATGGtt > 1:607763/1‑143 (MQ=255) tACCGCCAGGTAGGTACAACCCATAAAGGTGTCCGGGCGGGTAGTGTAAACGGTCAGCGTGTTGTCATAGTCGTTAACGTTGAAGGTGATCTCCACGCCTTCGGAACGACCGATCCAGTTACGCTGCATGGCTTTAACGgtgt > 2:802796/1‑143 (MQ=255) taCAACCCATAAAGGTGTCCGGGCGGGTAGTGTAAACGGTCAGCGTGTTGTCATAGTCGTTAACGTTGAAGGTGATCTCCACGCCTTCGGACCGACCGATCCAGTTACGCTGCATGGGTGTAACGGTGTCTGGCCAGCGATcc > 2:283958/1‑143 (MQ=255) cAACCCATAAAGGTGTCCGGGCGGGTAGTGTAAACGGTCAGCGTGTTGTCATAGTCGTTAACGTTGAAGGTGATTTCCACGCCTTCGGAACGACCGATCCAGTTACGCTGCACGGTTTTAACGGCGTCCGGCCGGTGACCCAg > 2:554290/1‑143 (MQ=255) aaCCCATAAAGGTGTCCGGGCGGGTAGTGTAAACGGTCAGCGTGTTGTCATAGTCGTTAACGTTGAAGGTGATCTCCACGCCTTCGGAACGACCGATCCAGTTACGCTGCCACGTTTTAATGGTGGCTGGCCAGTGATCCAGt > 2:710253/1‑143 (MQ=255) cATAAAGGTGTCCGGGCGGGTAGTGTAAACGGTCAGCGTGTTGTCATAGTCGTTAACGTTGAAGGTGATCTCCACGCCTTCGGAACGACCGATCCAGTTACTGTGCATGTTTTTAACGGTGTCTGGCCAGTGATCCAGTTTAt > 1:474704/1‑143 (MQ=255) | TTTTCTCCATCGTCGCCATTTCAGCTTCGGCAACTTTGGTGTTACGGCATTCGTCAATAAAGGCCGCCAGTTCAGGATTATTTTCCGCCGCTTTCTGCGCCAGCGGATGACCCGCAGCTACCGCCAGGTAGGTACAACCCATAAAGGTGTCCGGGCGGGTAGTGTAAACGGTCAGCGTGTTGTCATAGTCGTTAACGTTGAAGGTGATCTCCACGCCTTCGGAACGACCGATCCAGTTACGCTGCATGGTTTTAACGGTGTCTGGCCAGTGATCCAGTTTAT > NC_000913/673883‑674164 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |