| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3774236 = | NA (NA) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | NA | intergenic (+42/‑188) | mtlA/mtlD | mannitol‑specific PTS enzyme IICBA component/mannitol‑1‑phosphate 5‑dehydrogenase |
| ? | NC_000913 | 3774261 = | NA (NA) | noncoding (25/29 nt) | other | REPv271a | |||||
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
GAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGGAGAGGGTTTGGGTGAGGGAAAAGCCTCACCCCAGCCCTCTCGGGTAAAAA > NC_000913/3774120‑3774403 | gaGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAACTGCTGGAACGGCTGGCAGGTCGTACGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGACAAGGTGGGCTTAATTGCCTGCTGCGCTACGCTTATCAGGccg > 2:728682/1‑142 (MQ=255) gTCCGTCATCGAGCGTCTGACACACACAACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGACGTAAGTAATCCAATCCCACCATCTTCACATCGACACGGCGGGGTTAATTGCCTCATGCGCTACGCTTATCAGGCCTAc > 2:116190/1‑143 (MQ=255) ccGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTCATCGCCGCATGCGCTCAGCTTATCAGAccaccag > 2:178582/1‑138 (MQ=255) cGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAgg > 1:908496/1‑143 (MQ=255) cGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGATTATCAGGCCGAAAgg > 2:897838/1‑143 (MQ=255) gTCATGGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCATCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGa > 2:818865/1‑143 (MQ=255) cATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCAGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATg < 1:181336/143‑1 (MQ=255) tCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCa < 1:590426/143‑1 (MQ=255) gAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCCCCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCGACGCTTAGCAGGCCTACACGATGCAta > 2:935979/1‑142 (MQ=255) gAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCAtt > 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tCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAAt > 2:286570/1‑143 (MQ=255) tGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAAttt > 2:562850/1‑143 (MQ=255) tGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAAttt > 1:698594/1‑143 (MQ=255) ggCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATttg > 1:7655/1‑143 (MQ=255) gCACACACCGCCAGCGGGGATGAAGTGCTGGAGCTGCTGGCGGGTCGTGAGTAATCCAATCCCACCCTCCCCACGTGGTGAAGGTGGGGCTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATttgt < 2:859077/143‑1 (MQ=38) gCACACACCACCAGCGTGGATGACGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGCAGGGGGGGGTAATTGCCTGATGAGCTACGCTTATCAGGCCTACGGGATGCAGCATaagtagt > 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acacCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGACCTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCACTCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGTTGCATCACAAGttgttgca > 2:271591/1‑141 (MQ=255) accaccAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATCTGTTGAAtt > 2:459768/1‑143 (MQ=255) caGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCAc < 1:503003/143‑1 (MQ=255) caGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATCGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCAc > 2:485605/1‑143 (MQ=255) gATGAAGTTCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGCGGATAAGTGGCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTg < 1:370122/143‑1 (MQ=255) aTGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCtttt > 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tccttgAACTGCGGGCAGGTCGTGAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCg < 2:707699/138‑1 (MQ=255) cTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCggc > 1:66598/1‑142 (MQ=255) cTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGa > 1:832616/1‑143 (MQ=255) cTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGa > 1:425512/1‑143 (MQ=255) tGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACACTTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGAt > 2:882996/1‑143 (MQ=255) ctgGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCt > 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1:380974/143‑1 (MQ=255) aGGTGGGGGCAATTGCCTGCTGCGCTACGCTTATCAGGCCCACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGGAGAGGGTTTgg < 1:317367/143‑1 (MQ=255) aGGTGGGGCTAATTGCCTGGTGCGATACGCTTATCAGGCCTACAGGGTGCGTCACAATTTGTGGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCGTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGGAGAGGGTTTgg < 2:945416/143‑1 (MQ=37) aGGGGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGGAGAGGGTTTgg < 1:562850/143‑1 (MQ=255) atgcatcctgtaggcctgataagcgtagcgcatcaggcCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCg < 2:964592‑M2/72‑1 (MQ=255) ggggTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGGAGAGGGTTTGGGTGa > 2:904760/1‑143 (MQ=255) ggTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCAGAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGGCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGGAGAGGGTTTGGGTGAgg < 2:675257/143‑1 (MQ=255) aaTTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGAGAAGGCGCTTACGCCGCAGCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGGAGAGGGTTTGGGTGAGGGaaa < 2:394212/143‑1 (MQ=255) ttGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGGAGAGGGTTTGGGTGAGGGACAAg > 2:161322/1‑143 (MQ=255) tGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGGAGAGGGTTTGGGTGAGGGAAAAGc < 1:808754/143‑1 (MQ=255) tGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCATACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATGTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCACTCTCCTGACGGAGAGGGTTTGGGGGAGGGAAAAGc > 1:728346/1‑143 (MQ=37) gccgggtGCGTTCCGCTTACCAGGCCTACAGCACGCATCACACTCTCTTGAATTTGCACGTTCTTGTCGCCCGGCTAAGGCGCTTACGCCGCCTCCGGCGCTGCCCCTCCCCTCACGGAGAGGGTTTGGGTGAGGGCCAAGcc < 2:682396/137‑1 (MQ=255) CCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGGCCCTCTCCTCCCGGAGAGCGGTGGGGGGGGGGCAAACCCt < 2:958435‑M1/143‑1 (MQ=255) tgcggcgcTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACTCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGGAGAGGGTTTGGGTGAGGGAAAAGCCTCa < 2:490606/139‑1 (MQ=255) GATGGGCTACGCTTATGAGGGCTCCAGGTTGCATCACAATTTGGTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGGAGAGGGTTTGGGTGAGGGAAAAGCCTCAc > 2:884708‑M1/1‑143 (MQ=255) TGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGGAGAGGGTTTGGGTGAGGGAAAAGCCTCAccc > 2:7655‑M1/1‑143 (MQ=255) cgcTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGGAGAGGGTTTGGGTGAGGGAAAAGCCTCACCCCa < 2:425512/143‑1 (MQ=255) cTACGCGTGTCAGGCCTACAGGTTGCATTACAATTTGTTGGATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCGTCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGGGGAGGGTTTGGGTGAGGGAAAAGCCTCACCCCAGc < 2:32710/143‑1 (MQ=38) cTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGGCGAGGGTTTGGGTGAGGGAAAAGCCTCACCCCAGCActat > 1:834074/1‑141 (MQ=255) ttATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGGAGAGGGTTTGGGTGAGGGAAAAGCCTCAGCCCGGCCCtctc > 1:30104/1‑143 (MQ=255) atcaggcCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGGAGAGGGTTTGCGTGAGGGACACGCCTCACCCCTGCCCTCTcgc > 1:794884‑M2/8‑142 (MQ=255) tcaggcCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGGATAGGGTGTGGGCGACGTACACTCCTCACCCCAGCCCACTCggg > 1:615385‑M2/7‑143 (MQ=255) tcaggcCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGGAGAGGGTTTGGGTGAGGGAAAAGCCTCACCCCAGCCCTCacgcg > 2:127148‑M2/7‑141 (MQ=255) gcCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGGAGAGGGTTTGGGTGAGGGAAAAGCCTCACTCCAGCCCTCTCGGGTaaa > 2:521381‑M2/3‑143 (MQ=255) | GAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGGAGAGGGTTTGGGTGAGGGAAAAGCCTCACCCCAGCCCTCTCGGGTAAAAA > NC_000913/3774120‑3774403 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |