New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1570641 = | 59 (0.890) | 5 (0.080) +ATAACGTTGTAAA |
3/238 | NT | 8.1% | intergenic (‑152/+4) | gadC/gadB | L‑glutamate:4‑aminobutyrate antiporter/glutamate decarboxylase B |
? | NC_000913 | 3666120 = | 67 (1.010) | intergenic (‑310/+60) | gadX/gadA | DNA‑binding transcriptional dual regulator GadX/glutamate decarboxylase A |
TAAAACGGTATTCCTGTCGGAACCGCACCTGTTTTGTTCTGAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGAAGCCGCGACGACACATAATGCGC > NC_000913/1570500‑1570783 | tAAAACGGTATTCCTGTCGGAACCGCACCTGTTTTGTTCTGAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGt < 1:577711/143‑1 (MQ=255) tAAAACGGTATTCCTGTCGGAACCGCACCTGTTTTGATCTGAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTAGCGTTAAGCGt > 2:1031811/1‑143 (MQ=255) aaacCGGTATTCCTGTCGGAACCGCACCTGTTTTGTTCTGAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGtt < 1:1157262/143‑1 (MQ=255) aaaCGGTATTCCTGTCGGAACCGCACCTGTTTTGTTCTGAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTa > 2:997866/1‑143 (MQ=255) aaaCGGTATTCCTGTCGGAACCGCACCTGTTTTGTTCTGAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGGTCGTTTCGGGACACCGTTaccgttaaccgtta > 2:713635/1‑143 (MQ=255) aaCGGTATTCCTGTCGGAACCGCACCTGTTTTGTTCTGAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGCAATCGAACCGATAGGGTTTTGTAATCGGTCCCCGTTACCGTTAAACGTTac > 1:1139350/1‑142 (MQ=255) ttCCTGTCGGAACCGCACCTGTTTTGTTCTGAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAAAGTTATCAGGTaa > 2:329735/1‑142 (MQ=255) cTGTCGGAACCGCACCTGTTTTGTTCTGAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGACACGGGTCAGTTTCGGGACGCCGCTACCGTTAAACGTTGTCAGGCTTGtt > 1:172096/1‑143 (MQ=255) tGTCGGAACCGCACCTGTTTTGTTCTGAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTGAACGTTATCAGGTATGctt > 2:594730/1‑143 (MQ=255) cGGACCCGCACCTGTTTTGTTCTGAAGCTTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGTACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGCTCCTGGTAGTACTCCTTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTaaa < 2:573221/143‑1 (MQ=255) aaCCGCTCCTGTTTTGTTCTGAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGct < 2:1129248/143‑1 (MQ=255) aCCGCACCTGTTTTGTTCTGAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGctg < 1:1252410/143‑1 (MQ=255) gCACCTGTTTTGTTCTGAAGCATATACAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACCTTGAAAATTGTCCCGAAACGAGCTCGTTTCGGGACACAGTAACCCGTAGACGGTAACAGGTATGGCAAAAGctggac > 2:8082/1‑140 (MQ=255) ccTGTTTTGTTCTGAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGctgttctgt > 2:464358/1‑143 (MQ=255) cTGTTTTGTTCTGAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGctgttctgtt < 1:941691/143‑1 (MQ=255) tGTTTTGTTCTGAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTg > 1:43570/1‑143 (MQ=255) tGTTTTGTTCTGAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTg > 1:1123168/1‑143 (MQ=255) gTTTTGTTCTGAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACGCCGCTACCGTTCAACGTTCTCAGGCAGGTGTAAAGCTGGTCCCTTgg > 2:331094/1‑143 (MQ=255) ttttGTTCTGAAGCTTATTCAGAACATTATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTTAACATTCTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACAGCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTggg < 1:12527/143‑1 (MQ=255) ttttGTTCGGAACCTTATTGAGAACTATCTTTGCCGTTCCCAATGCGAGTGAACAGACTTTGGAGGTTTGCCCGAAACGGGTTCGTTTCGTGACACCGTTATCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTggg < 2:343691/143‑1 (MQ=255) tGTTCTGAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGGACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACGGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGGTGACAGCGGTTCTGTTGGGCaa > 2:923021/1‑143 (MQ=255) ttCTGAAGCGTATTCCGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATa < 1:743509/143‑1 (MQ=255) tGAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGtt < 2:916976/105‑1 (MQ=255) tGAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGtt > 1:916976/1‑105 (MQ=255) tGAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATAccc > 1:501470/1‑143 (MQ=255) gAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTACCAGGTATGTTTAACGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCt > 2:1003520/1‑143 (MQ=255) aggCGTACTCAGAAGCAGAGTTTCGGTTGCTCGCGCCACTGAGCGGGCGTTGGAAATTGTCCCGAAGCGGGTGCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTg < 2:959308/141‑1 (MQ=255) aaGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGCAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGCGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGGATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTg > 1:174901/1‑143 (MQ=255) gCGTATTCAGAACAAGGTTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCa < 2:517062/143‑1 (MQ=255) cGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATAACCTGCAg > 1:851952/1‑143 (MQ=255) ttCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACATAGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACCCTGTTACCGTTCAACGCTATAAGGTATGTTTAACGCCGTTCCGCTGGGCAATAGCATGCGGTGTc > 2:896966/1‑143 (MQ=255) tCAGAACAATATTTTCCGTTGCGAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCg < 1:1279899/143‑1 (MQ=255) cAGAAAAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCgg < 2:1124334/143‑1 (MQ=255) aGAACGATATTTTGCGTGGCTAGGGGCCGTGGACAGAGTCGGGGCATTGTCCCGAAACGGGTGCGTTTCGGGACACCGGGACCGTTATACGTTTTCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCGGCAGTTTCggg < 2:1243377/143‑1 (MQ=255) cagtagtttCCGTTGCGAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGAt < 2:1050912/137‑1 (MQ=255) cAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGAt > 2:1201540/1‑143 (MQ=255) cAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGAt > 2:526114/1‑143 (MQ=255) ttttCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAATCAAATTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTg < 1:238060/143‑1 (MQ=255) tgtCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTga < 1:267388/141‑1 (MQ=255) ttCCGTTGCTAACGCCAGTGAACAGACTGTGGCAATTGTCCCCAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTgag < 1:329735/143‑1 (MQ=255) tCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTgaga < 1:464358/143‑1 (MQ=255) aacataacgttgtaaaaaccgaatgcccagcctttaaaaaaacagctgggcattcggtttttacaacgttatGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTc < 2:796724‑M1/71‑1 (MQ=255) aacataacgttgtaaaaaccgaatgcccagcctttaaaaaaacagctgggcattcggtttttacaacgttatGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTc < 2:169504‑M1/71‑1 (MQ=255) tAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACGGGTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTGCAg > 1:734324/1‑143 (MQ=255) gTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTGAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGGAATACCCTGCAGTTTCGAGTCATCGCTGAGATATTTCACGGAGGcct > 2:149977/1‑141 (MQ=255) tGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTCAGCTCTTTCCGGGCGGCttt > 1:372828/1‑143 (MQ=37) aCAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTa < 2:919465/143‑1 (MQ=255) aGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTCTGTTTAAAGCTGTTCTGTTAGGCACTACCCTGCAGTTCCGGGTGATGACTGACATAATTCAGGGAGGCtgggaagc > 2:328610/1‑136 (MQ=255) gACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTc < 1:847141/143‑1 (MQ=255) acgttGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCt < 1:528658/140‑1 (MQ=255) ggAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAg > 1:332780/1‑143 (MQ=255) gAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGc < 2:100133/143‑1 (MQ=255) cccagcctttaaaaaaacagctgggcattcggtttttacaacgttatGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGGTATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCa < 1:647089‑M1/96‑1 (MQ=255) aTTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTGTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAAc < 1:29151/143‑1 (MQ=255) ttGTCCGGAAGGGGGTCCGTGTCGGGAGCGCGTTACCGTTAAACCGGATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCGGGTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGGTCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACa < 2:1261838/143‑1 (MQ=14) tGTCCCGAAACGAACCCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTGATCATGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGTGCAATACCCCGCAGTTTCGGCCGATCGCTGAGACATTTGAGGGAGGCTTGGTAGTCTTCCCGCacctg > 2:547097/1‑139 (MQ=255) ttaaaaaaacagctgggcattcggtttttacaacgttatGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCa > 1:796724‑M1/40‑143 (MQ=255) ttaaaaaaacagctgggcattcggtttttacaacgttatGTTATCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGCTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCa > 1:169504‑M1/40‑143 (MQ=255) gccgatcGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCa < 2:255757/137‑1 (MQ=255) ccGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCACTACCCTGCAGTGTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCGTTGTAGTCTTCCAGCAACAGGTCa > 2:1166810/1‑143 (MQ=255) ccGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCa < 1:1108882/143‑1 (MQ=255) ccGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGATGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCCACAGTTCa > 1:30114/1‑143 (MQ=255) ggaaggggTGCGCTGCGGGGCACCGTGACCGTTAAACGTGAGCAGGTGTGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGc < 1:1188337/138‑1 (MQ=14) gTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAGAGTCCAgtt > 1:1035854/1‑143 (MQ=255) tttCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGCTCGCTGAGATCTGTGAGGGGGGAGCCCGCGCCGTCCAGCACCAGATCAGCAAAGTCCATTTc > 2:1240135/1‑143 (MQ=17) tCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGa < 1:997866/143‑1 (MQ=255) ctgtacacCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGaa < 2:548497/139‑1 (MQ=255) gggACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTCCTGTTGGGCAATACTCTTCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGAAg < 1:174338/143‑1 (MQ=255) ccggtacccttaAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGTGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTGCAGCAAAGTCCATTTCGAAGCCGcga < 2:1281205/143‑1 (MQ=255) gttaccgttaAACGTTATCAGATATGTTTAAAACTGATCTGTTGTGCAATACACTGCAGTATCAAGAGATCGATGAGATATTTCAACAAAGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGATCAGCAAAGTACAATTCGAATCAGcgaag > 2:238863/1‑141 (MQ=9) ttaccgttaAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGAAGCCGcgacga < 1:713635/143‑1 (MQ=255) cgttaAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTTTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGAAGCCGCGACGCcaca > 1:972357/1‑143 (MQ=255) gTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGCAGCCGCGACGCCACCTAATgcgg > 1:128837/1‑142 (MQ=255) gTTATCAGGTATGTTTAAAGCGGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCGTTTCGAAGCCGCGACGACGCCTTATgcgc > 1:759929/1‑143 (MQ=11) | TAAAACGGTATTCCTGTCGGAACCGCACCTGTTTTGTTCTGAAGCGTATTCAGAACAATATTTTCCGTTGCTAATGCCAGTGAACAGACTTTGGAAATTGTCCCGAAACGGGTTCGTTTCGGGACACCGTTACCGTTAAACGTTATCAGGTATGTTTAAAGCTGTTCTGTTGGGCAATACCCTGCAGTTTCGGGTGATCGCTGAGATATTTCAGGGAGGCTTTGTAGTCTTCCAGCAACAGTTCAGCAAAGTCCATTTCGAAGCCGCGACGACACATAATGCGC > NC_000913/1570500‑1570783 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |