New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1231303 | 43 (0.950) | 3 (0.070) | 3/250 | NT | 7.1% | coding (118/1269 nt) | umuC | DNA polymerase V catalytic protein |
? | NC_000913 | = 1231337 | 38 (0.880) | coding (152/1269 nt) | umuC | DNA polymerase V catalytic protein |
CCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAGCTTTACGCAGACATGAGCAATCGGGTGATGTCGACG > NC_000913/1231162‑1231446 | ccACGTAGTTGAGGCGGTGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGGGGTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCg < 2:306401/143‑1 (MQ=255) gtcgtTATGGCGATGGGCTGATGTTTGCCGTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAAc < 2:396563/143‑1 (MQ=255) tAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCCGATTCATGGGCGGGAGCGGGGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGACACGCAGa > 2:529587/1‑143 (MQ=255) aaGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTGAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGGGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAg < 2:591550/143‑1 (MQ=255) atgCGATGCGTTGATGTTTTCCCTCTGTTATGTAACCGTGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGGTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAgg < 1:621712/141‑1 (MQ=255) gCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGGTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCATTATCGCCCGAAACGCCGAGGCa > 2:21921/1‑143 (MQ=255) gATGCTGGCCATCTGGGATGTAATCGCGTTTTAGGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTGATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTg < 2:721658/143‑1 (MQ=255) tttGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCGCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGt > 1:460487/1‑143 (MQ=255) gtcatctGTGATGTAATCGCGTTTTATGCCAGCGGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTaa < 1:257738/139‑1 (MQ=255) gCCCACTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTaa < 1:229213/143‑1 (MQ=255) cccTTTGTGATGTAAGCGCGTTTTATGCTAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCgaaacgccaagcgcctttgcctcagcgtttcg < 2:133106‑M1/143‑33 (MQ=255) cccTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTCTCGAATAATGACGGTTGCGCTATCGCCCGAAACGCTGAGGCACAGGCGCCGGGCGTTaaa > 2:399623/1‑143 (MQ=255) ccTCTGGTATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTaaaa < 2:852264/143‑1 (MQ=255) tctGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAACCCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATg > 1:802194‑M2/1‑142 (MQ=255) gtgATGTACACGCGTTTTATGCCATCGGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGGGCGATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCTCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATgggc > 2:281187‑M2/1‑139 (MQ=255) aTGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCACCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTGTCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAGACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGGTAAAATgggcgat < 1:315989‑M2/143‑8 (MQ=255) tagacgcGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTTCTTCGCCCTGATTTATGGTGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCCAATAATTACGGTTGCGTTATCGCCCattttaacgccaagcgcctttgcctcagcgtttcgggcgataac < 1:274587‑M1/140‑45 (MQ=255) aaCGCGCTCTATGGCAGCTGTGCGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTg < 1:322298/143‑1 (MQ=255) aCGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGGTAAAATGGGCGATCCCTgg > 1:516567/1‑143 (MQ=255) cgcgTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCattttaacgccaagcgcctttgcctcagcgtttcgggcgataacgcaa < 2:248632‑M1/143‑49 (MQ=255) ttttATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTcaa < 1:536928/143‑1 (MQ=255) tttATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTcaaa < 1:679675/143‑1 (MQ=255) tgctatcTGTCAGACGGTTTTTCGTCCTGATTGAGGGGGTAAGCCGGTTGTTGTGCTATCGAATAATGGCGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTcaaacaaa < 1:808037/137‑1 (MQ=255) ccAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAACCaaaaa > 1:622451/1‑143 (MQ=255) tgAGACGGTGTTTCGCGCGGATGTAGGGGGTGAGCCGGTGGTTGTGCTAGCGAATAATGACGGCTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGt < 1:177237/143‑1 (MQ=255) gagaCGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCACCCGAAACGATCAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAACAGATCTgct > 2:529977/1‑141 (MQ=255) agaCGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAATCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGATGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGttt < 2:287220/143‑1 (MQ=255) agaCGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGttt > 1:253235/1‑143 (MQ=255) gtgtTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTtcgtcg < 1:703852/143‑1 (MQ=255) ccGCCCCGATTTATGGGGTAACCCGGTGGTTGTGCTATCGACTAATGACACTTGCGTTACCGCCCCTAACCCTGATGCAAAGGCTCTTGGCGTTAAAATGGGCGCTCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCtgtg < 2:58742/142‑1 (MQ=255) cccTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCg > 2:539048/1‑143 (MQ=255) ttATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTg < 1:749527/143‑1 (MQ=255) ttATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAAT‑ATGACGGGTGCGTTATCGCCCGGAACGCTGGAGCAAAGGCGATTGGCGTTAAAATGGGCGATTCCTGGTTCAAACAAAAAGAACTGATTCGTCGCTGTGGGGGGGTTTGc > 2:458938/1‑143 (MQ=255) tATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGc > 1:26924/1‑143 (MQ=255) gTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTagc > 2:450435/1‑143 (MQ=255) gTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTagc > 1:259248/1‑143 (MQ=255) tAAATCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGGCGGTTGCGTTGTCGCCCGAAACACTGAGGCAAAGGCGCGTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTagca < 1:369387/143‑1 (MQ=255) gtggtTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGACACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACCAAAAGCTCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCaagtc > 2:642265/1‑140 (MQ=255) ttGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAg < 1:237588/143‑1 (MQ=255) ttGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAg < 1:333297/143‑1 (MQ=255) tgCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGGCGCTGTGGCGTGGTTTTCTTTAGCCGCAATTATGAGCtt > 1:878814/1‑143 (MQ=255) tATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAGCTTTAc > 1:664640/1‑143 (MQ=255) tCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAGCTTTACGc > 1:273592/1‑143 (MQ=255) tCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCCGTGGCGTGGTTTGATTTAGCAGCAATGATGAGCGTTACGc > 2:406386/1‑143 (MQ=255) cGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGACACAGACGCCTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATGTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGGTTGCTTTAGCAGCAATTATGAGCTTAAGGCa > 2:61989/1‑143 (MQ=255) aataatGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAGCTTTACGCAGa > 1:371653/1‑143 (MQ=255) aatGACGGTTTCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAGAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAGCTTTACGCAGACAt < 2:653724/143‑1 (MQ=255) aatCACGGTCGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGCCAAAGGCGCTTGGCGTTAAACTGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTCTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCATTAGCAGCAATTATGAGCTTTACGCAGACAt < 1:177404/143‑1 (MQ=255) gACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAGCTTTACGCAGACATGAg < 1:529587/143‑1 (MQ=255) gggtGCGTGATCGCCCGAAACGCTGAGGCGAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGAGCCCTGGTTCAACCAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAGCTTTACGCAGACATGAGCaa < 2:511636/140‑1 (MQ=255) ttGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATgggcgataacgcaaccgtcattattcgatagcacaaccaccggtttaccccataaatcagggcgaaacaccgtctcacagctggcataaaacgcg < 2:248632‑M2/143‑96 (MQ=255) gCGTGATCGCTCGCAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAAGGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAGCTTTACGCAGACATGAGCAATCgg < 2:257705/143‑1 (MQ=255) gTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATgggcgataacgcaaccgtaattattggatagcacaaccaccggtttacaccataaatcagggcgaagaaccgtctcacagctggcataaaacgcgtcta < 1:274587‑M2/143‑100 (MQ=255) aTCGCCCattttaccgccaagcgcctttgcctcagcgtctcgggcgataacgcaaccgtcattattcgacagcacaaccaccggtttaccccataaatcagggtgaaacaccgtctcacagctggcataaaacgcgtttacat < 1:315989‑M1/143‑137 (MQ=255) gCCCattttaacgccaagcgcctttgcctcagcgtttcgagcgataacgcaaccgtcattattcgatcgcccaaccaccggtttaccccataaatcagggcgaaacaccgtctcaccgatggcataaaacgcgtgtacatcac > 2:281187‑M1/1‑4 (MQ=255) cattttaacgccaagcgcctttgcctcagcgtttcgggcgataacgcaaccgtcattattcgatagcacaaccaccgggttaccccataaatcagggcgaaacaccgtctcacagctggcataaaacgcgtttacatcacaga > 1:802194‑M1/1‑1 (MQ=255) cGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTTC‑‑ggcgataacgcaaccgtcattattcgatagcacaaccaccggtttaccccataaatcagggcgaaacaccgtctcacagctagcataaaacgcgcttacatcacaaaggg < 2:133106‑M2/143‑111 (MQ=255) | CCACGTCGTTAAGGCGATGCGCTGATGTTTGCCCTCTGTGATGTAAACGCGTTTTATGCCAGCTGTGAGACGGTGTTTCGCCCTGATTTATGGGGTAAACCGGTGGTTGTGCTATCGAATAATGACGGTTGCGTTATCGCCCGAAACGCTGAGGCAAAGGCGCTTGGCGTTAAAATGGGCGATCCCTGGTTCAAACAAAAAGATCTGTTTCGTCGCTGTGGCGTGGTTTGCTTTAGCAGCAATTATGAGCTTTACGCAGACATGAGCAATCGGGTGATGTCGACG > NC_000913/1231162‑1231446 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |