| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 119144 = | 21 (0.130) | 156 (0.940) | 112/200 | 0.2 | 88.1% | coding (566/765 nt) | pdhR | pyruvate dehydrogenase complex repressor; autorepressor |
| ? | CP009273 | = 119152 | NA (NA) | coding (574/765 nt) | pdhR | pyruvate dehydrogenase complex repressor; autorepressor | |||||
Only 100 of 180 total aligned reads displayed.
GCCGTCACCGAAGCGGCCCACAATGTGGTTCTGCTTCATCTGCTAAGGTGTATGGAGCCGATGTTGGCCCAGAATGTCCGCCAGAACTTCGAATTGCTCTATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGATTATGGCCGGTAAGCCGGAAGAAGCGCGCGAAGCATCGCAT > CP009273/119044‑119244 | gaagcggcgcacaatgtggttctgcttcagctgctaaggtgtatggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtca > 2:2628666‑M1/101‑101 (MQ=255)gaagcggcccacaatgtggttctgcttcatctgctaaggtgtatggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtca < 1:3473299‑M1/1‑1 (MQ=255)gCCGTCACCGAAGCGGCCCACAATGTGGTTCTGCTTCATCTGCTAAGGTGTATGGAGCCGATGTTGGCCCAGAATGTCCGCCAGAACTTCGAATTGCTCTa < 2:3936640/101‑1 (MQ=255)gCCGTCACCGAAGCGGCCCACAATGTGGTTCTGCTTCATCTGCTAAGGTGTATGGAGCCGATGTTGGCCCAGAATGTCCGCCAGAACTTCGAATTGCTCTa > 2:3378949/1‑101 (MQ=255)gCCGTCACCGAAGCGGCCCACAATGTGGTTCTGCTTCATCTGCTAAGGTGTATGGAGCCGATGTTGGCCCAGAATGTCCGCCAGAACTTCGAATTGCTCTa > 2:3171237/1‑101 (MQ=255) ccGTCACCGAAGCGGCCCACAATGTGGTTCTGCTTCATCTGCTAAGGTGTATGGAGCCGATGTTGGCCCAGAATGTCCGCCAGAACTTCGAATTGCTCTAt > 1:1209796/1‑101 (MQ=255) aagcggcccacaatgtggttctgcttcatctgctaaggtgtatggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcat < 2:1306938‑M1/2‑1 (MQ=255) cGTCACCGAAGCGGCCCACAATGTGGTTCTGCTTCATCTGCTAAGGTGTATGGAGCCGATGTTGGCCCAGAATGTCCGCCAGAACTTCGAATTGCTCTAtt > 1:1232205/1‑101 (MQ=255) agcggcccacaatgtggttctgcttcatctgctaaggtgtatggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcatt < 1:2260250‑M1/3‑1 (MQ=255) agcggcccacaatgtggttctgcttcatctgctaaggtgtatggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcatt < 2:3309579‑M1/3‑1 (MQ=255) gTCACCGAAGCGGCCCACAATGTGGTTCTGCTTCATCTGCTAAGGTGTATGGAGCCGATGTTGGCCCAGAATGTCCGCCAGAACTTCGAATTGCTCTATtc > 1:1944261/1‑101 (MQ=255) tCACCGAAGCGGCCCACAATGTGGTTCTGCTTCATCTGCTAAGGTGTATGGAGCCGATGTTGGCCCAGAATGTCCGCCAGAACTTCGAATTGCTCTATtcg > 1:2109765/1‑101 (MQ=255) cACCGAAGCGGCCCACAATGTGGTTCTGCTTCATCTGCTAAGGTGTATGGAGCCGATGTTGGCCCAGAATGTCCGCCAGAACTTCGAATTGCTCTATtcgc < 1:1973173/101‑1 (MQ=255) gcccacaatgtggttctgcttcatctgctaaggtgtatggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcattcgcg > 1:3038721‑M1/95‑101 (MQ=255) aCCGAAGCGGCCCACAATGTGGTTCTGCTTCATCTGCTAAGGTGTATGGAGCCGATGTTGGCCCAGAATGTCCGCCAGAACTTCGAATTGCTCTATtcgcg > 2:2562849/1‑101 (MQ=255) cccacaatgtggttctgcttcatctgctaaggtgtatggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcattcgcgt < 1:1089033‑M1/8‑1 (MQ=255) ccacaatgtggttctgcttcatctgctaaggtgtatggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcattcgcgtc < 2:1531094‑M1/9‑1 (MQ=255) ccacaatgtggttctgcttcatctgctaaggtgtatggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcattcgcgtc > 1:100117‑M1/93‑101 (MQ=255) ccacaatgtggttctgcttcatctgctaaggtgtatggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcattcgcgtc < 2:663558‑M1/9‑1 (MQ=255) cGAAGCGGCCCACAATGTGGTTCTGCTTCATCTGCTAAGGTGTATGGAGCCGATGTTGGCCCAGAATGTCCGCCAGAACTTCGAATTGCTCTATtcgcgtc > 1:2908193/1‑101 (MQ=255) cacaatgtggttctgcttcatctgctaaggtgtatggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATtcgcgtcg > 1:16127‑M1/92‑101 (MQ=255) aatgtggttctgcttcatctgctaaggtgtatggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCga < 2:327734‑M1/13‑1 (MQ=255) atgtggttctgcttcttctgctaaggtgtatggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCgag > 2:3850669‑M1/88‑101 (MQ=255) atgtggttctgcttcatctgctaaggtgtatggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCgag > 1:317613‑M1/88‑101 (MQ=255) tggttctgcttcatctgctaaggtgtatggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGAtg > 1:2883140‑M1/85‑101 (MQ=255) ggttctgcttcatctgctaaggtgtatggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGAtgc < 1:783038‑M1/18‑1 (MQ=255) ggttctgcttcatctgctaaggtgtatggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGAtgc < 1:27403‑M1/18‑1 (MQ=255) ttctgcttcatctgctaaggtgtatggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGAtgctg > 2:3496269‑M1/82‑101 (MQ=255) tctgcttcatctgctaaggtgtatggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGAtgctgc < 2:1242790‑M1/21‑1 (MQ=255) gcttcatctgctaaggtgtatggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGc < 2:3694729‑M1/24‑1 (MQ=255) cttcatctgctaaggtgtatggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCt < 1:2001299‑M1/25‑1 (MQ=255) ttcatctgctaaggtgtatggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTg < 2:1183033‑M1/26‑1 (MQ=255) tcatctgctaaggtgtatggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTgg > 2:1174782‑M1/75‑101 (MQ=255) tcatctgctaaggtgtatggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTgg > 1:2245773‑M1/75‑101 (MQ=255) catctgctaaggtgtatggagccgttgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGt > 2:915421‑M1/74‑101 (MQ=255) catctgctaaggtgtatggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGt < 2:1187005‑M1/28‑1 (MQ=255) atctgctaaggtgtatggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTg < 2:1653276‑M1/29‑1 (MQ=255) tctgctaaggtgtatggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGa > 1:3767496‑M1/72‑101 (MQ=255) gctaaggtgtatggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGagta < 2:2838219‑M1/33‑1 (MQ=255) gctaaggtgtatggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGagta > 1:2474950‑M1/69‑101 (MQ=255) taaggtgtatggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGagtagt < 2:43391‑M1/35‑1 (MQ=255) taaggtgtatggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGagtagt < 1:1459188‑M1/35‑1 (MQ=255) aaggtgtatggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTc < 2:638615‑M1/36‑1 (MQ=255) aggtgtatggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCa > 1:1509215‑M1/65‑101 (MQ=255) ggtgtatggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCAc < 1:526098‑M1/38‑1 (MQ=255) tgtatggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCg > 1:3511269‑M1/62‑101 (MQ=255) atggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCAc < 2:2131811‑M1/43‑1 (MQ=255) tggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCAcc < 1:2296067‑M1/44‑1 (MQ=255) ggagccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCAccc > 1:83617‑M1/57‑101 (MQ=255) agccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGc < 1:869301‑M1/47‑1 (MQ=255) gccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCa > 2:3632549‑M1/54‑101 (MQ=255) gccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCa > 1:2772910‑M1/54‑101 (MQ=255) ccgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCat > 1:1566478‑M1/53‑101 (MQ=255) cgatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCata < 1:280377‑M1/50‑1 (MQ=255) gatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCatat < 2:1772668‑M1/51‑1 (MQ=255) gatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCatat < 1:1758184‑M1/51‑1 (MQ=255) gatgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCatat < 1:1118666‑M1/51‑1 (MQ=255) atgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATAtt > 1:3317934‑M1/50‑101 (MQ=255) atgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATAtt < 2:2004070‑M1/52‑1 (MQ=255) atgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATAtt < 2:170131‑M1/52‑1 (MQ=255) atgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATAtt < 1:703579‑M1/52‑1 (MQ=255) tgttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATAttt < 1:2023970‑M1/53‑1 (MQ=255) gttggcccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTg < 1:1735888‑M1/54‑1 (MQ=255) cccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCg > 1:535133‑M1/43‑101 (MQ=255) ccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGa > 1:3960852‑M1/42‑101 (MQ=255) ccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGa < 2:2534691‑M1/60‑1 (MQ=255) ccagaatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGa > 2:1351441‑M1/42‑101 (MQ=255) aatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGATTAt < 1:3855114‑M1/64‑1 (MQ=255) aatgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGATTAt < 1:452079‑M1/64‑1 (MQ=255) atgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTATTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGATTATg < 2:3162669‑M1/65‑1 (MQ=255) atgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGATTATg < 2:2330007‑M1/65‑1 (MQ=255) tgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGATTATgg < 1:3082834‑M1/66‑1 (MQ=255) tgtccgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGATTATgg < 1:956422‑M1/66‑1 (MQ=255) cgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGATTATGGCCgg > 1:598392‑M1/32‑101 (MQ=255) cgccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGATTATGGCCgg > 2:2788257‑M1/32‑101 (MQ=255) gccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGATTATGGCCGGt < 2:661168‑M1/71‑1 (MQ=255) ccagaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGATTATGGCCGGTa < 2:1455794‑M1/72‑1 (MQ=255) agaacttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGATTATGGCCGGTAAg > 2:3521067‑M1/28‑101 (MQ=255) cttcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGATTATGGCCGGTAAGCCgg < 1:1610265‑M1/78‑1 (MQ=255) tcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGATTATGGCCGGTAAGCCGgaa > 2:474906‑M1/22‑101 (MQ=255) tcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGATTATGGCCGGTAAGCCGgaa > 1:3378949‑M1/22‑101 (MQ=255) tcgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGATTATGGCCGGTAAGCCGgaa > 2:2216963‑M1/22‑101 (MQ=255) cgaattgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGATTATGGCCGGTAAGCCGgaag > 2:1374338‑M1/21‑101 (MQ=255) aattgctctattcgcgtcATTCGAGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGATTATGGCCGGTAAGCGGgaagaa < 1:1380225‑M1/83‑1 (MQ=255) attgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGATTATGGCCGGTAAGCCGGaagaag < 1:3261294‑M1/84‑1 (MQ=255) ttgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGATTATGGCCGGTAAGCCGGAAGAAgc > 1:3030642‑M1/17‑101 (MQ=255) tgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGATTATGGCCGGTAAGCCGGAAGAAgcg > 1:3694729‑M1/16‑101 (MQ=255) tgctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGATTATGGCCGGTAAGCCGGAAGAAgcg > 2:1204213‑M1/16‑101 (MQ=255) ctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGATTATGGCCGGTAAGCCGGAAGAAgcgcg < 2:273747‑M1/88‑1 (MQ=255) ctctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGATTATGGCCGGTAAGCCGGAAGAAgcgcg > 2:2260250‑M1/14‑101 (MQ=255) tctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGATTATGGCCGGTAAGCCGGAAGAAgcgcgc < 1:1405424‑M1/89‑1 (MQ=255) ctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGATTATGGCCGGTAAGCCGGAAGAAGcgcgcg < 1:3636078‑M1/90‑1 (MQ=255) ctattcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTAGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGATTATGGCCGGTAAGCCGGAAGAAGcgcgcg > 2:1944261‑M1/12‑101 (MQ=255) tcgcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGATTATGGCCGGTAAGCCGGAAGAAGCGCGCGAAGc < 2:612967‑M1/94‑1 (MQ=255) gcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGATTATGGCCGGTAAGCCGGAAGAAGCGCGCGAAGCAt > 1:648511‑M1/6‑101 (MQ=255) gcgtcATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGATTATGGCCGGTAAGCCGGAAGAAGCGCGCGAAGCAt > 2:2766036‑M1/6‑101 (MQ=255) cATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGATTATGGCCGGTAAGCCGGAAGAAGCGCGCGAAGCATCGCa < 1:266055‑M1/100‑1 (MQ=255) aTTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGATTATGGCCGGTAAGCCGGAAGAAGCGCGCGAAgcatcgcat > 1:2381128/1‑101 (MQ=255) aTTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGATTATGGCCGGTAAGCCGGAAGAAGCGCGCGAAgcatcgcat < 2:706995/101‑1 (MQ=255) aTTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGATTATGGCCGGTAAGCCGGAAGAAGCGCGCGAAgcatcgcat > 2:784728/1‑101 (MQ=255) | GCCGTCACCGAAGCGGCCCACAATGTGGTTCTGCTTCATCTGCTAAGGTGTATGGAGCCGATGTTGGCCCAGAATGTCCGCCAGAACTTCGAATTGCTCTATTCGCGTCGCGAGATGCTGCCGCTGGTGAGTAGTCACCGCACCCGCATATTTGAAGCGATTATGGCCGGTAAGCCGGAAGAAGCGCGCGAAGCATCGCAT > CP009273/119044‑119244 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |