| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 189030 = | 23 (0.140) | 171 (1.030) | 110/200 | 0.2 | 88.1% | coding (689/726 nt) | pyrH | uridylate kinase |
| ? | CP009273 | = 189041 | NA (NA) | coding (700/726 nt) | pyrH | uridylate kinase | |||||
Only 100 of 181 total aligned reads displayed.
GGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTA > CP009273/188941‑189141 | ggACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGaaa > 2:2441447/1‑101 (MQ=255)ggACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGaaa < 1:2903110/101‑1 (MQ=255) ttcacgctggctcgtgaccataaattaccgattcgtgttttcaatatgaacaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGaaaa > 1:3938702‑M1/89‑101 (MQ=255) ttcacgctggctcgtgaccataaattaccgattcgtgttttcaatatgaacaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGaaaa < 1:2131076‑M1/13‑1 (MQ=255) ttcacgctggctcgtgaccataaattaccgattcgtgttttcaatatgaacaaaccgggtgcgctgcgccgggtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGaaaa < 2:1023620‑M1/13‑1 (MQ=255) tcacgctggctcgtgaccataaattaccgattcgtgttttcaatatgaacaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGaaaaa < 1:1737153‑M1/14‑1 (MQ=255) acgctggctcgtgaccataaattaccgattcgtgttttcaatatgaacaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAaaga > 2:1474192‑M1/86‑101 (MQ=255) acgctggctcgtgaccataaattaccgattcgtgttttcaatatgaacaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggggaaaTAATGGGTGAAAaaga < 2:498426‑M1/16‑1 (MQ=255) gctggctcgtgaccataaattaccgattcgtgttttcaatatgaacaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAaagaag > 2:1352822‑M1/84‑101 (MQ=255) gctcgtgaccataaattaccgattcgtgttttcaatatgaacaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGAc > 1:3540652‑M1/80‑101 (MQ=255) tcgtgaccataaattaccgattcgtgttttcaatatgaacaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACtt > 1:1607927‑M1/78‑101 (MQ=255) cgtgaccataaattaccgattcgtgttttcaatatgaacaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACttt > 2:921275‑M1/77‑101 (MQ=255) tgaccataaattaccgattcgtgttttcaatatgaacaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTaa > 1:3435305‑M1/75‑101 (MQ=255) gaccataaattaccgattcgtgttttcaatatgaacaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAAt > 2:2479852‑M1/74‑101 (MQ=255) accataaattaccgattcgtgttttcaatatgaacaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATc < 2:2129374‑M1/29‑1 (MQ=255) ccataaattaccgattcgtgttttcaatatgaacaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCa > 1:1584988‑M1/72‑101 (MQ=255) ccataaattaccgattcgtgttttcaatatgaacaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCa > 1:595903‑M1/72‑101 (MQ=255) cataaattaccgattcgtgttttcaatatgaacaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCAc < 2:2400517‑M1/31‑1 (MQ=255) cataaattaccgattcgtgttttcaatatgaacaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCAc > 1:3399653‑M1/71‑101 (MQ=255) cataaattaccgattcgtgttttcaatatgaacaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCAc > 1:2688814‑M1/71‑101 (MQ=255) taaattaccgattcgtgttttcaatatgaacaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACgg < 1:670765‑M1/33‑1 (MQ=255) aaattaccgattcgtgttttcaatatgaacaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGa < 2:2205320‑M1/34‑1 (MQ=255) aaattaccgattcgtgttttcaatatgaacaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGa > 1:3328100‑M1/68‑101 (MQ=255) aattaccgattcgtgttttcaatatgaacaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGaa < 2:3154470‑M1/35‑1 (MQ=255) aattaccgattcgtgttttcaatatgaacaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGaa < 2:2610768‑M1/35‑1 (MQ=255) taccgattcgtgttttcaatatgaacaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGaataa > 1:190673‑M1/64‑101 (MQ=255) accgattcgtgttttcaatatgaacaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGaataat < 1:3394334‑M1/39‑1 (MQ=255) tgtgttttcaatatgaacaaaccgggtgcggtgcgccgggggggaatgggtgaaaTAAAGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTg > 1:970819‑M1/56‑101 (MQ=255) cgtgttttcaatatgaacaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTg < 2:319480‑M1/46‑1 (MQ=255) gttttcaatatgaacaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATg > 1:464464‑M1/53‑101 (MQ=255) tttcaatatgaacaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGa < 2:54379‑M1/51‑1 (MQ=255) caatatgaacaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGataa < 2:2433517‑M1/54‑1 (MQ=255) aatatgaacaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGataaa > 2:681442‑M1/47‑101 (MQ=255) aatatgaacaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGataaa < 1:1024506‑M1/55‑1 (MQ=255) atatgaacaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGataaat < 2:759860‑M1/56‑1 (MQ=255) atgaacaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGataaataa > 1:1396806‑M1/44‑101 (MQ=255) tgaacaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAg < 2:753297‑M1/59‑1 (MQ=255) tgaacaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAg > 1:2870645‑M1/43‑101 (MQ=255) acaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGt > 2:2856091‑M1/40‑101 (MQ=255) acaaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGt > 1:2388774‑M1/40‑101 (MQ=255) caaaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTa < 1:3598512‑M1/63‑1 (MQ=255) aaccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAg < 2:1275020‑M1/65‑1 (MQ=255) ccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGAt < 1:3564044‑M1/67‑1 (MQ=255) ccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGAt > 1:1441653‑M1/35‑101 (MQ=255) ccgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGAt > 2:2430457‑M1/35‑101 (MQ=255) cgggtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGAtt > 1:3878137‑M1/34‑101 (MQ=255) gtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCcg < 1:942815‑M1/71‑1 (MQ=255) gtgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCcg > 2:3568433‑M1/31‑101 (MQ=255) tgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCcgc < 2:3485341‑M1/72‑1 (MQ=255) tgcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCcgc < 2:1056096‑M1/72‑1 (MQ=255) gcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCcgcg > 2:1705893‑M1/29‑101 (MQ=255) gcgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCcgcg < 2:1229719‑M1/73‑1 (MQ=255) cgctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGt < 1:1144701‑M1/74‑1 (MQ=255) gctgcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTa < 1:2566315‑M1/75‑1 (MQ=255) gcgccgtgtggtaatgggtgaaaTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGt > 1:2475074‑M1/24‑101 (MQ=255) 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aTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGt < 1:1467221‑M1/100‑1 (MQ=255) aTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGt < 1:150337‑M1/100‑1 (MQ=255) tAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGtt > 2:3287462/1‑101 (MQ=255) tAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGtt < 1:1347826/101‑1 (MQ=255) aaTGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTta < 1:320834/101‑1 (MQ=255) aTGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTtat > 2:3081434/1‑101 (MQ=255) gggTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATaa > 2:3042242/1‑101 (MQ=255) gTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAgg < 1:3082356/101‑1 (MQ=255) tGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGc < 1:3887399/101‑1 (MQ=255) tGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGc < 1:3703638/101‑1 (MQ=255) gAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCg > 1:3508524/1‑101 (MQ=255) aaaGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTa < 1:1592066/101‑1 (MQ=255) aaaGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTa > 1:1999178/1‑101 (MQ=255) aaaGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTa > 2:3808438/1‑101 (MQ=255) aaaGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTa < 2:836389/101‑1 (MQ=255) aaaGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTa > 2:2632585/1‑101 (MQ=255) aaaGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTa > 1:586024/1‑101 (MQ=255) | GGACCTGGCGGCCTTCACGCTGGCTCGTGACCATAAATTACCGATTCGTGTTTTCAATATGAACAAACCGGGTGCGCTGCGCCGTGTGGTAATGGGTGAAAAAGAAGGGACTTTAATCACGGAATAATTCCCGTGATGGATAAATAAGGGTAAGATTCCGCGTAAGTATCGCGGGGGCGTAAGTCTGGTTATAAGGCGTTA > CP009273/188941‑189141 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |