New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 1937922 | 20 (1.160) | 4 (0.240) | 4/294 | NT | 16.9% | coding (252/786 nt) | znuB | zinc transporter subunit: membrane component of ABC superfamily |
? | CP009273 | = 1937991 | 20 (1.200) | coding (321/786 nt) | znuB | zinc transporter subunit: membrane component of ABC superfamily |
CGTCGGGGAAATGATCGCTCATGATTGAATTATTATTTCCCGGTTGGTTAGCCGGGATCATGCTCGCCTGTGCCGCGGGTCCGCTGGGTTCGTTTGTAGTCTGGCGTCGTATGTCTTATTTCGGTGATACGCTGGCTCATGCCTCATTACTTGGCGTCGCGTTTGGTTTGTTGCTGGACGTGAATCCATTCTATGCGGTGATTGCCGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGACGCCAGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTGGCGTGGTCATCGTGGTGGCTATTTTGTTCTGGCAATGGCGCAATTTGCTGTCAATGACGATAAGCCCGGATCTGGCGTTTGTTGATGGTGTGAAATT > CP009273/1937651‑1938164 | cGTCGGGGAAATGATCGCTCATGATTGAATTATTATTTCCCGGTTGGTTAGCCGGGATCATGCTCGCCTGTGCCGCGGGTCCGCTGGGTTCGGTTGTAGTCTGGCGTCGTATGTCTTATTTCGGTGATACGCTGGCTCATGCCTCATTACTTGGCGTCGCGTTTGGTTTGTTGCTGGACGTGAATCCATTCTATGCGGTGATTGCCGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCGGGTATGGCTGGAGCAGCGTCAAAAGCTGGCGGTCGACCCGgta > 1:34202‑M1/1‑272 (MQ=255) gggATCATGCTCGCCTGTGCCGCGGGTCCGCTGGGTTCGTTTGTAGTCTGGCGTCGTATGTCTTATTTCGGTGATACGCTGGCTCATGCCTCATTACTTGGCGTCGCGTTTGGTTTGTTGCTGGACGTGAATCCATTCTATGCGGTGATTGCCGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTGGTGAGTCt > 1:6517/1‑275 (MQ=255) tgggggtggCCTTTGCGGCGGGTCTGCTGGGTTTGTTTGTTGTCTGGCGTTGTATGTCTTATTTCGGTGATACGCTGGCTCATGCCTCATTACTTGGTGTCGCGTTTGGTTTGTTGCTGGACGGGAATCCATTCTATGCGGTGATTGCCGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTgct < 2:110188/266‑3 (MQ=255) tgtgcgttgtgTTCGGTTGTGGTCTGGGGTCGTTTGTTTTTTTTTGGTTTTGCGCTGGCTCATGCCTCTTTATTTGGGGTTGCGTTTGGTTTGTTGCTGGATGTGAATCCATTCTATGCGGTGATTGCCGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgattt < 2:6517/265‑1 (MQ=255) ggTCCGCTGGGTTCGTTTGTAGTCTGGCGTCGTATGTCTTATTTCGGTGATACGCTGGCTCATGCCTCATTACTTGGCGTCGCGTTTGGTTTGTTGCTGGACGTGAATCCATTCTATGCGGTGATTGCCGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgattt > 1:79267/1‑275 (MQ=255) gcgctACGCTCGCTCAGGCCGCATTGCTAGACGTCGCGGTTGGTTAGTTACTGGACGTGAATCGATACTCTGCGGTGATTGCCGTTTTGTTCCTGCTGGCGGGCGCTCTGGTACGGCTTGCGTAGAGTCCTCAGCTGGCGCTCGACACGTTATTAGAGAATATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCCGGGCCTGGTGGTCATGAGTc > 2:68560/5‑204 (MQ=255) gTGATACGCTGGCTCATGCCTCATTACTTGGCGTCGCGTTTGGTTTGTTGCTGGACGTGAATCCATTCTATGCGGTGATTGCCGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGGGATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGGTGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGACGCCagaa > 1:269018/1‑272 (MQ=255) tACGCTGGCTCATGCCTCATTACTTGGCGTCGCGTTTGGTTTGTTGCTGGACGTGAATCCATTCTATGCGGTGATTGCCGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGAt < 1:68562/204‑1 (MQ=255) gCTCATGCCTCATTACTTGGCGCCGCGTTTGGTTTGTTGCTGGACGTGAATCCATTCTATGCGGTGATTGCCGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGTGTCCACAGCGGGTGACCGCCACGTTAGTAGGGGTTATGGCGCTCAGTGCCCTGTCGCTGTGCCTGGTGGTGGTGCGTCTGCTGTCTAATAATCGTGTTCATTTGATGGCTTGCCTGTTCGGTGGTTTGCTGGCAGTGGCGCAcgaagtgttaatccttgt > 2:138656/1‑262 (MQ=255) acgtggtttctttCTATGCGGTGATTGCGGTGACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGATAAGCGTCAACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCGCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGACGCCAGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTGGCGTGGTCATCGTGGTGGCTATTTTGTTCTGGCaa < 1:138659/264‑1 (MQ=255) gAATCCATTCTATGCGGTGATTGCCGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTc > 2:334592/1‑123 (MQ=255) ccATTCTATGCGGTGATTGCCGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGACCTGTCGCTg < 1:334604/123‑1 (MQ=255) gCCGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGgcg > 1:222565/1‑87 (MQ=255) ttACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGcaca < 2:222559/87‑1 (MQ=255) gcggTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGaatattagacatcagactcacgaccaccaggcccagcgacagggcactg > 2:133251‑M1/1‑47 (MQ=255) tCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGaatattagacatcagactcacgaccaccaggcccagcgacagggcactgtgcg < 1:133253‑M1/96‑54 (MQ=255) aTGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGaatattagacatcagactcacgaccaccaggcccagcgacagggcact > 2:199166‑M1/1‑37 (MQ=255) cTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGaatattagacatcagactcacgaccaccaggcccagcgacagggcactgtgc < 1:199172‑M1/85‑53 (MQ=255) cTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGACGCCAGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTGGCGTGGTCATCgtg > 2:161948/1‑192 (MQ=255) cTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTCACGCCTGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTGGCGTGGTCATCGTGGTGGCTATTTTGTTCTGGCAATGGCGCAATTTGCTGTCAATGACGATAAGCCCGGATCTGGCGTTTGTTGTTGGTGTGAAAtt > 1:293645/1‑275 (MQ=255) cTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATGATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGACGCCAGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTGGCGTGGTCGTCTGGGTGGCGATTTTGTTCTGGCAATGGCGCAATTTGCTGTCAATGACGAGTAGCTCGGTGCTGGTGTTTGTTGGTgtggtgttatt > 2:114387/1‑265 (MQ=255) agaAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGACGCCAGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTGGCGTGGTCATCGtggtgg < 1:161952/192‑1 (MQ=255) gCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTc > 1:1909/1‑67 (MQ=255) tCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGAt < 2:1909/67‑1 (MQ=255) cGACACGTTATTAGGTATTATGGTACACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCtggtgg > 1:232861/1‑53 (MQ=255) acGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGt < 2:232854/53‑1 (MQ=255) | CGTCGGGGAAATGATCGCTCATGATTGAATTATTATTTCCCGGTTGGTTAGCCGGGATCATGCTCGCCTGTGCCGCGGGTCCGCTGGGTTCGTTTGTAGTCTGGCGTCGTATGTCTTATTTCGGTGATACGCTGGCTCATGCCTCATTACTTGGCGTCGCGTTTGGTTTGTTGCTGGACGTGAATCCATTCTATGCGGTGATTGCCGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGACGCCAGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTGGCGTGGTCATCGTGGTGGCTATTTTGTTCTGGCAATGGCGCAATTTGCTGTCAATGACGATAAGCCCGGATCTGGCGTTTGTTGATGGTGTGAAATT > CP009273/1937651‑1938164 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |