New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 1937922 | 20 (1.160) | 4 (0.240) | 4/294 | NT | 16.9% | coding (252/786 nt) | znuB | zinc transporter subunit: membrane component of ABC superfamily |
? | CP009273 | = 1937991 | 20 (1.200) | coding (321/786 nt) | znuB | zinc transporter subunit: membrane component of ABC superfamily |
GGTCCGCTGGGTTCGTTTGTAGTCTGGCGTCGTATGTCTTATTTCGGTGATACGCTGGCTCATGCCTCATTACTTGGCGTCGCGTTTGGTTTGTTGCTGGACGTGAATCCATTCTATGCGGTGATTGCCGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCC‑‑‑TGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGACGCCAGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTGGCGTGGTCATCGTGGTGGCTATTTTGTTCTGGCAATGGCGCAATTTGCTGTCAATGACGATAAGCCCGGATCTGGCGTTTGTTGATGGTGTGAAATTACAGCGAGTGAAATTGTTGTTGATGCTGGTGACGGCATTGACGATTGGTGTAGCGATGAAATTTGTCGGTGCGTTGATTATTACTTCGTTGCTGA > CP009273/1937728‑1938259 | tgtgcgttgtgTTCGGTTGTGGTCTGGGGTCGTTTGTTTTTTTTTGGTTTTGCGCTGGCTCATGCCTCTTTATTTGGGGTTGCGTTTGGTTTGTTGCTGGATGTGAATCCATTCTATGCGGTGATTGCCGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCC‑‑‑TGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgattt < 2:6517/265‑1 (MQ=255) ggTCCGCTGGGTTCGTTTGTAGTCTGGCGTCGTATGTCTTATTTCGGTGATACGCTGGCTCATGCCTCATTACTTGGCGTCGCGTTTGGTTTGTTGCTGGACGTGAATCCATTCTATGCGGTGATTGCCGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCC‑‑‑TGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGttgattt > 1:79267/1‑275 (MQ=255) gTGATACGCTGGCTCATGCCTCATTACTTGGCGTCGCGTTTGGTTTGTTGCTGGACGTGAATCCATTCTATGCGGTGATTGCCGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGGGATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCC‑‑‑TGGTGGTCGTGAGTCTGGTGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGACGCCagaa > 1:269018/1‑272 (MQ=255) gCTCATGCCTCATTACTTGGCGCCGCGTTTGGTTTGTTGCTGGACGTGAATCCATTCTATGCGGTGATTGCCGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGTGTCCACAGCGGGTGACCGCCACGTTAGTAGGGGTTATGGCGCTCAGTGCCCTGTCGCTGTGCC‑‑‑TGGTGGTGGTGCGTCTGCTGTCTAATAATCGTGTTCATTTGATGGCTTGCCTGTTCGGTGGTTTGCTGGCAGTGGCGCAcgaagtgttaatccttgt > 2:138656/1‑262 (MQ=255) acgtggtttctttCTATGCGGTGATTGCGGTGACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGATAAGCGTCAACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCGCTGTCGCTGGGCC‑‑‑TGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGACGCCAGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTGGCGTGGTCATCGTGGTGGCTATTTTGTTCTGGCaa < 1:138659/264‑1 (MQ=255) cTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCC‑‑‑TGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGACGCCAGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTGGCGTGGTCATCgtg > 2:161948/1‑192 (MQ=255) cTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCC‑‑‑TGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTCACGCCTGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTGGCGTGGTCATCGTGGTGGCTATTTTGTTCTGGCAATGGCGCAATTTGCTGTCAATGACGATAAGCCCGGATCTGGCGTTTGTTGTTGGTGTGAAAtt > 1:293645/1‑275 (MQ=255) cTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATGATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCC‑‑‑TGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGACGCCAGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTGGCGTGGTCGTCTGGGTGGCGATTTTGTTCTGGCAATGGCGCAATTTGCTGTCAATGACGAGTAGCTCGGTGCTGGTGTTTGTTGGTgtggtgttatt > 2:114387/1‑265 (MQ=255) agaAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCC‑‑‑TGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGACGCCAGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTGGCGTGGTCATCGtggtgg < 1:161952/192‑1 (MQ=255) ttattaGGGATTATGGCGCACTGTGCCCTGTCGCTGGGCC‑‑‑TGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGACGCCAGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTGGCGTGGTCATCGTGGTGGCTATTTTGTTCTGGCAATGGCGCAATTTGCTGTCAATGACGATAAGCCCGGATCTGGCGTTTGTTGATGGTGTGAAATTACAGCGAGTGAAATTGTTGTTGATGCTGGTGAc < 1:114389/275‑1 (MQ=255) tATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGACGCCAGAAGatc > 2:235355/1‑119 (MQ=255) gcgcACAGTGCCCTGTCGCTGGGCCTGGTGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATGTGCTAGCAGTGATGCCAGAAGatctcat < 1:235362/119‑1 (MQ=255) cgcACAGTGCCCTGTCGCTGGGCC‑‑‑TGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTcgtgtcgatcgccagctgtggacgcttctccagccataccaga < 1:133253‑M2/96‑44 (MQ=255) gcACAGTGCCCTGTCGCTGGGCC‑‑‑TGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTcgtgtcgatcgccagctgtggacgcttctccag < 1:199172‑M2/85‑34 (MQ=255) cacaGTGCCCTGTCGCTGGGCC‑‑‑TGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGACGCCAGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTGGCGTGGTCATCgtg > 1:47604/1‑141 (MQ=255) caGTGCCCTGTCGCTGGGCC‑‑‑TGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTcgtgtcgatcgccagctgtggacgcttctccagccataccagaccgc > 2:133251‑M2/1‑49 (MQ=255) aGTGCCCTGTCGCTGGGCC‑‑‑TGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTcgtgtcgatcgccagctgtggacgcttctccagccat > 2:199166‑M2/1‑48 (MQ=255) gTGCCCTGTCGTTGGGCC‑‑‑TGGTGGTCGTGAGTTTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGACGCCAGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTNGCGTGGTCATCGTGGTGGCTATTTTGTTCTGGCAATGGCGCAATTTGCTGTCAATGACGATAAGCCCGGATCTGGCGTTTGTTGATGGTGTGAAATTACAGCGAGTGAAATTGTTGTTGATGCTGGTGACGGCATTGACGATTGGTGTAGCg < 1:278254/275‑1 (MQ=255) gTGCCCTGTCGCTGGGCC‑‑‑TGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGACGCCAGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTGGCGTGGTCATCGtggtgg < 2:47603/141‑1 (MQ=255) tGCCCTGTCGCTGGGCC‑‑‑TGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGACGCCAGAAGatc > 2:170079/1‑104 (MQ=255) cTGTCGCTGGGCC‑‑‑TGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGACGCCAGAAGatctcat < 1:170083/104‑1 (MQ=255) gTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGACGCCAGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTGGCGTGGTCATCGTGGTGGCTATTTTGTTCTGGCaa > 2:196864/1‑132 (MQ=255) gTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGACGCCAGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTGGCGTGGTCATCGTGGTGGCTATTTTGTTCTGGCAATGgc < 1:196868/132‑1 (MQ=255) aaTATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGACGCCAGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTGGCGTGGTCATCGTGGTGGCTATTTTGTTCTGGCAATGGCGCAATTTGCTGTCAATGACGATAAGTCCGGAGCTGGCGTTTGTTGATGGTGTGAAATTACAGCGAGTGAAATTGTTGTTGATGCTGGTGACGGCATTGACGATTGGTGTAGCGATGAAATTTGTCGGTGCGTTGATTATTACTTCGTTGCTGa > 1:292011/1‑274 (MQ=255) | GGTCCGCTGGGTTCGTTTGTAGTCTGGCGTCGTATGTCTTATTTCGGTGATACGCTGGCTCATGCCTCATTACTTGGCGTCGCGTTTGGTTTGTTGCTGGACGTGAATCCATTCTATGCGGTGATTGCCGTTACGCTGCTGCTGGCGGGCGGTCTGGTATGGCTGGAGAAGCGTCCACAGCTGGCGATCGACACGTTATTAGGGATTATGGCGCACAGTGCCCTGTCGCTGGGCC‑‑‑TGGTGGTCGTGAGTCTGATGTCTAATATTCGTGTTGATTTGATGGCTTACCTGTTCGGTGATTTGCTGGCAGTGACGCCAGAAGATCTCATCTCTATTGCGATTGGCGTGGTCATCGTGGTGGCTATTTTGTTCTGGCAATGGCGCAATTTGCTGTCAATGACGATAAGCCCGGATCTGGCGTTTGTTGATGGTGTGAAATTACAGCGAGTGAAATTGTTGTTGATGCTGGTGACGGCATTGACGATTGGTGTAGCGATGAAATTTGTCGGTGCGTTGATTATTACTTCGTTGCTGA > CP009273/1937728‑1938259 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |