New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 356557 = | 22 (1.270) | 7 (0.420) | 5/292 | NT | 19.4% | coding (855/1155 nt) | cynX | putative cyanate transporter |
? | CP009273 | 356650 = | 37 (2.230) | coding (948/1155 nt) | cynX | putative cyanate transporter |
CAGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTGCCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTGATGGACTGGGCATTTCATGCGCTGTGCGTCGTTGGGCTGATGATCATAACCCTGCGTTTTGCACCAGTACGTTTTCCGCAGCTGTGGGTCAAAGAGGCATGATGCGACGCTTGTTCCTGCGCTTTGTTCATGCCGGATGCGGCTAATGTAGATCGCTGA > CP009273/356393‑356914 | gaGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCGTTGCTGAGGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCtgg < 1:43694/273‑1 (MQ=255) ccTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATGAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCGGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGTGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGTTGGCAAGATGGTGGCGTGTATGcgg > 1:68312/1‑273 (MQ=255) cTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGTGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAAATGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGTTCTGCGTCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGaa < 1:321458/274‑1 (MQ=255) gaCGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACGGTTAATGCTGGCGCTGGGGTTACAACTGGTGGGGTTCTGCGGCTTTATCTGCCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGTGCGATGGTGTGTGGGTTGGGTCTGGGCTGTCCGTTTCCGCTCTGTTTGTTCCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGGTATCTGGTGGCGTTTATGCCGGGACATGGttttcat > 2:37278/1‑271 (MQ=255) ggggcgtttGTTGATGCCGGCTGTGGCTCGCCATCAGGTTCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGGTGGTGTTACAACTGGTGGGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTGCCCCg < 2:230771/268‑1 (MQ=255) tttGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTa > 2:81745/1‑206 (MQ=255) cTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGc < 1:81747/206‑1 (MQ=255) tGGCTCGCCCTCAGGGTCGGCGCTCACTGTTTATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCTGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTGCCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCgtagt < 1:187541/275‑1 (MQ=255) tattgttGGGGCTGGGGTTACACCTGGTGGGGTTCTGTGGCTGTAGCTGGCTGCCGATGCATGGGCCGGTATTGTGGGCGAGGGTGTGTGGGTTAGGGCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTGCCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTGATGGACTGGGc < 1:37278/268‑1 (MQ=255) cTGGTGTTACAACTGGTGGGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATc < 1:162532/183‑1 (MQ=255) ggtggGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTGCCCCGTGGTTTTCTgg > 2:68321/1‑207 (MQ=255) tggGGATCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTGCCCAGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGTGGCAAGTACCTGa > 1:82971/1‑237 (MQ=255) tttcagatatttttttTCTGGGTTNGGATGCTATTGCCGGTATTGTTGGTGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCTCGTTTCCTCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTGCCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTGATGGACTGGGCATTTCATGCTCTGTGCGTCGTTGGGCtgat < 2:193295/263‑1 (MQ=255) gggTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTGCCCCGTGGTTTTCTGGCGtg < 1:68323/207‑1 (MQ=255) ggTTCTGCTGCTTTATCTGTCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTGCCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTGATGGACTGGGCATTTCATGCGCTGTGCGTCGTTGGGCtgat < 1:191864/274‑1 (MQ=255) cTGCGGTTTTTTCTGGCTGCTGTTGCTATTGCCGGTATTGTTGGGGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCTGCGCTTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTTTCATCGCCGGGCTTGCCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTGATGGACTGGGCATTTCATGCGCTGTGCGTCGTTGGGCTGATGATCa < 1:29431/275‑1 (MQ=255) gCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCTGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTGCCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTGATGGACTGGGCATTTCATGCGCTGTGCGTCGTTGGGGTGAGGATCATAAcccatgtctcatat > 1:193299/1‑263 (MQ=255) tgatcgagcgccagcagcaaacagagcggaaacgcgccgcccagacctaacccacacaccatcgcccacaataccggcTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCa > 1:205819‑M2/79‑108 (MQ=255) tgatcgagcgccagcagcaaacagagcggaaacgcgccgcccagacctaacccacacaccatcgcccacaataccggcTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAg > 1:110596‑M2/79‑109 (MQ=255) tgatcgagcgccagcagcaaacagagcggaaacgcgccgcccagacctaacccacacaccatcgcccacaataccggcTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTGc > 1:30894‑M2/79‑138 (MQ=255) gATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTGTCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTGATGGACTGGGCATTTCATGCGCTGTGCGTCGTTGGGCTGATGATCATAACCCTGCGTTTTGCAACAGTACGTTGTCCGCAGCTGTGGGTCa > 1:173886/1‑275 (MQ=255) tGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTGc > 1:332345/1‑136 (MQ=255) cgagcgccagcagcaaacagagcggaaacgcgccgcccagacctaacccacacaccatcgcccacaataccggcTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGaa < 2:110594‑M2/35‑1 (MQ=255) cgagcgccagcagcaaacagagcggaaacgcgccgcccagacctaacccacacaccatcgcccacaataccggcTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGa < 2:205813‑M2/34‑1 (MQ=255) cgagcgccagcagcaaacagagcggaaacgcgccgcccagacctaacccacacaccatcgcccacaataccggcTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTGCCCCg < 2:30894‑M2/64‑1 (MQ=255) cgagcgccagcagcaaacagagcggaaacgcgccgcccagacctaacccacacaccatcacccacaataccggcTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTGCCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTGATGGACTGGGCATTTCATGCGCTGTGCGTCGTTGGGCTGATGATCATAACCCt < 1:36732‑M2/159‑1 (MQ=255) gtgtgGGTTCGGTCTGGGCGGCTCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGTGCTCGATCACCCTGTGCCACCGGCTAGTGCTGGCACGCTGGTGGCGTTTATGCATGGAATCGGTTTTGTGATCGCCGGGCTTGTCCCg < 2:332333/136‑1 (MQ=255) aGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCg > 2:255822/1‑116 (MQ=255) gTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGGTCCCTCTGTGCAACCGGCTATTTCTGTCACGCTGGTGGCGTTTATTCAGGGAACCGGttt > 2:99770/1‑103 (MQ=255) gTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTatca > 2:169738/1‑108 (MQ=255) gTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTGCCCCGTGGTTTTCTgg > 1:90167/1‑136 (MQ=255) cTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCt < 1:255830/116‑1 (MQ=255) tGGGCGTCGCGTTTCTGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTNATGCAGGGNATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTGCCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTGATGGACTGGGCATTTCATGCGCTGTGCGTCGTTGGGCTGATGATCATAACCCTGCGTTTTGCACCAGTACGTTTTCTGCAGCTGTGGGTCAAAGAGGCATGATGCGACGCt < 1:224276/275‑1 (MQ=255) gggCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGc < 1:169742/108‑1 (MQ=255) gggCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTGCCCCGTGGTTTTCTGGCGtg < 2:90165/136‑1 (MQ=255) gggCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGAGCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTatc < 1:99772/103‑1 (MQ=255) ggcggcGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTg > 1:276834/1‑61 (MQ=255) ggcggcGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAg > 2:111899/1‑87 (MQ=255) ggcggcGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTGCCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTGATGGACTGGGCATTTCATGCGCTGTGCGTCGTTGGGCTGATGATCCTAACCCTGCGTTTTGCACCAGTACGTTTTCCGCAGCTGTGGGTCCAAGAGGCATGATGGGACGCTTg > 1:122557/1‑275 (MQ=255) gcgcGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTgg < 2:276823/61‑1 (MQ=255) gcgcGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGaa < 1:111901/87‑1 (MQ=255) ggagcTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCGGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGTTTTTATCATCGCCGGGCTTGCCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTGACGGACTGGGCATTTCATgcg < 1:322729/151‑1 (MQ=255) gcgcTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCtg > 2:203714/1‑42 (MQ=255) gcTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTGCCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGc > 2:45934/1‑121 (MQ=255) tCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCtggtgg < 1:203720/42‑1 (MQ=255) gATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTGCCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAAtt < 1:45935/121‑1 (MQ=255) tgCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTGCCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTGATGGACTGGGCATTTCATGCGCTGTGCGTCGTTGGGATGATGATCATAACCCTGCGTTTTGCACCAGTCCGTTTTCCGCAGCTGTGGGTCAAAGAGGCATGATGCGACGCTTGTTCCTGCGCTTTGTTCATGCAGGATGCGGCTAATGTAGATCGCTGa > 1:292545/1‑275 (MQ=255) cAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAggg > 1:32418/1‑41 (MQ=255) cggcTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATc < 2:32418‑M2/37‑1 (MQ=255) | CAGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTGCCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTGATGGACTGGGCATTTCATGCGCTGTGCGTCGTTGGGCTGATGATCATAACCCTGCGTTTTGCACCAGTACGTTTTCCGCAGCTGTGGGTCAAAGAGGCATGATGCGACGCTTGTTCCTGCGCTTTGTTCATGCCGGATGCGGCTAATGTAGATCGCTGA > CP009273/356393‑356914 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |