New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 3127021 | 10 (0.580) | 4 (0.240) | 3/294 | NT | 21.8% | coding (296/714 nt) | yghS | putative ATP‑binding protein |
? | CP009273 | = 3127787 | 19 (1.140) | coding (298/693 nt) | yghT | putative ATP‑binding protein |
AGCGATGGTTCAGGCAAGTCAACGGTGTGTGAACATCTTATTACCGTTGTCGAAAAATATGGTGCTGCCGAAAGAGTTCATTTAGGAAAACAGGCCGGAAATGTCGGTCGTGCAGTGACAAAATTACCGTTGATGGGAAAATCCTTACATAAAACAATTGAACGAAATCAGGTGAAAACAGCAAAAAAATTGCCTGGACCAGTTCCGGCGCTGGTAATTACAGCGTTTGTCGCCCGTCGCTTACTGCGCTTTCGTCATATGCTTGCCTGTCGTCGTCGCGGGTTAATTGTTCTAACCGACCGTTATCCTCAGGACCAAATTCCTGGCGCTTACGATGGTACGGTGTTCCCACCTAACGTTGAAGGTGGTCGTTTTGTCTCATGGCTGGCAAGCCAGGAACGTAAAGCGTTTCACTGGATGGCGAGCCATAAGCCTGATCTGGTCATCAAACTCAATGTTGACCTTGAAGTTGCCTGTGCACGTAAACCCGACCATAAACGGGAATCGCTGGCGAGGAAGATTGCCATAACGCC > CP009273/3127529‑3128061 | aGCGATGGTTCAGGCAAGTCAACGGTGTGTGAACATCTTATTACCGTTGTCGAAAAATATGGTGCTGCCGAAAGAGTTCATTTAGGAAAACAGGCCGGAAATGTCGGTCGTGCAGTGACAAAATTACCGTTGATGGGAAAATCCTTACATAAAACAATTGAACGAAATCAGGTGAAAACAGCAAAAAAATTGCCTGGACCAGTTCCGGCGCTGGTAATTACAGCGTTTGTCGCCCGTCGCTTCCTGCGCTTTCGTGATATGATTGCCTgttgtcg > 2:111554/1‑275 (MQ=255) ttCAGGCAAGTCAACGGTGTGTGAACATCTTATTACCGTTGTCGAAAAATATGGTGCTGCCGAAAGAGTTCATTTAGGAAAACAGGCCGGAAATGTCGGTCGTGCAGTGACAAAATTACCGTTGATGGGAAAATCCTTACATAAAACAATTGAACGAAATCAGGTGAAAAAAGCAAAAAAATTGCCTGGACCAGTTCCGGCGCTGGTAATTAAAGCGTTTGTCGCCCGTCGCTTACTGCGCTTTCGTCATATGCTTGCCTGTCGTGGTCGCGGGt > 1:204889/1‑275 (MQ=255) gtaaccGGTCTTTGAAAATATGATTCCCGTTGTCGAAAAATATGGNGCTGCCGAAAGAGTTCATTTAGTAAAACAGGCCGCAAATGTCGGTCGTGCAGTGACAAAATTACCGTTGATGGGAAAATCCTTACATAAAACAATTGAACGAAATCAGGTGAAAACAGCAAAAAAATTGCCTGGACCAGTTCCGGCGCTGGTAATTACAGCTTTTGTCGCCCGTCGCTTACTGCGCTTTCGTCATATGCTTGCCTGTCGTTGTCGCGGGTTAATTGtt < 2:204883/269‑1 (MQ=255) cttacacccGTTGTGAAAAAAGTTGGCGATGCCGAAAAGGTTCAGTTAGAAAAACAGGCGGGAAATGTCGGGCTTACAGTGACAAAATTACCGTTGATAGGAAAAACCTTACATAAAACAATAGAACGAAATCAGGTAAAAACAGCAAAAAAATGGCCTGGACTAGTTCCGGTGCGGGTAATTACAGCGTTTGTCGCCCGTCGCTTACTGCGCTTTCGTCATATGCTTGCCTGTCGTCGTCGCGGGTTAATTGTTCTAACCGACCGTTATCCTCa < 2:290792/268‑1 (MQ=255) ttGTCGAAAAATATGGTGCTGCCGACAGAGTTCATTTAGGAAAACAGGCCGGAAATGTCGGTCGTGCAGTGACAAAATTACCGTTGATGGGAAAATCCTTACATAAAACAATTGAACGAAATCAGGTGAAAACAGCAAAAAAATTGCCTGGACCAGTTCCGGCGCTGGTAATTACAGCGTTTGTCGCCCGTCGCTTACTGCGCTTTCGGCATATGCTTGCCTGTCGTCGTCGCGGGTTAATGGTTCTACTCGACCGTTATCCTCAGGACCgaact > 2:106016/1‑273 (MQ=255) tatGGTGCTGCCGAAAGAGTTCATTTAGGAAAACAGGCCGGAAATGTCGGTCGTGCAGTGACAAAATTACCGTTGATGGGAAAATCCTTACATAAAACAATTGAACGAAATCAGGTGAAAACAGCAAAAAAATTGCCTGGACCAGTTCCGGCGCTGGTAATTACAGCGTTTGTCGCCCGTCGCTTAATGCGCTTTCGTCATAtgctttcctgctggcgggcgtacaagtttcgaaaaaggtggtgtaaaagccagcaaggctttctgatcatca < 2:310981‑M2/274‑73 (MQ=255) gTGCTGCCGAAAGAGTTCATTTAGGAAAACAGGCCGGAAATGTCGGTCGTGCAGTGACAAAATTACCGTTGATGGGAAAATCCTTACATAAAACAATTGAANGAAATCAGGTGTAAACAGCAAAAAAATTGCCTGGACCAGTTCCGGCGCTGGTAATTACAGCGTTTGTCGCCCGTCGCTTACTGCGCTTTCGTCATAtgctttcctgctggcgggcgtacaagtttcgcaaaatgttgtgtaaaagccagcaaggcttt > 1:310992‑M2/1‑198 (MQ=255) aTTGAACGAAATCAGGTTAAAACAGCAAAAAAATTGCCTGGACCAGTTCCGGCGCTGGTAATTACAGCGTTTGTCGCCCGTCGCTTACTGCGCTTTCGTCATATGCTTGCCTGTCGTCGTCGCGGGTTAATTGTTCTAACCGACCGTTATCCTCAGGACCAAATTCCTGGCGCTTACGATGGTACGGTGTTCCCACCTAACGTTGAAGGTGGTCGTTTTGTCTCATGGCTGGCAAGCCAGGAACGTAAAGCGTTTCACTGGATGGCGAGCCATaa < 1:111556/275‑1 (MQ=255) ttGAACGAAATCAGGTGAAAACAGCAAAAAAATTGCATGGACCAGTTCCGGCGCTGGTAATTACAGCGTTTGTCGCCCGTCGCTTACTGCGCTTTCGTCATATGCTTGCCTGTCGTCGTCGCGGGTTAATTGTTCTaa > 2:244484/1‑138 (MQ=255) aCGAAATCAGGTGAAAACAGCAAAAAAATTGCATGGACCAGTTCCGGCGCTGGTAATTACAGCGTTTGTCGCCCGTCGCTTACTGCGCTTTCGTCATATGCTTGCCTGTCGTCGTCGCGGGTTAATTGTTCTAaccga < 1:244492/138‑1 (MQ=255) tGAAAACAGCAAAAAAATTGCCTGGACCAGTTCCGGCGCTGGTAATTACAGCGTTTGTCGCCCGTCGCTTACTGCGCTTTCGTCATATGCTTGCCTGTCGTCGTCGCGGGTTAATTGTTCTAACCGACCGTTATCCTCAGGACCAAATTCCTGGCGCTTACGATGGTACGGTGTTCCCACCTAACGTTGAAGGTGGTCGTTTTGTCTCATGGCTGGCAAGCCAGGAACGTAAAGCGTTTCACTGGATGGCGAGCCATAAGCCTGATCTGGtcatc < 1:182064/275‑1 (MQ=255) ttGCCTGCACCCGTTCCGGCGCTGGTTATTACAGCGTTTGTCGCCCGTCGCTTACTGCGCTTTCGTCATATGCTTGCCTGTCGTCGTCGCGGGTTAATTGTTCTAACCGACCGTTATCCTCAGGACCAAATTCCTGGCGCTTACGATGGTACGGTGTTCCCACCTAACGTTGAAGGTGGTCGTTTTGTCTCATGGCTGGCAAGCCAGGAACGTAAAGCGTTTCACTGGATGGCGAGCCATAAGCCTGATCTGGTCATCAAACTCAATGTTGAcc < 1:106018/274‑1 (MQ=255) gACCAGTTCCGGCGCTGGTAATTACAGCGTTTGTCGCCCGTCGCTTACTGCGCTTTCGTCATATGCTTGCCTGTCGTTGTCGCGGGTTAATTGTTCTAACCGACCGTTATCCTCAGGACCAAATTCCTGGCGCTTACGATGGTACGGTGTTCCCACCTAACGTTGAAGGTGGTCGTTTTGTCTCATGGCTGGCAAGCCAGGAACGTAAAGCGTTTCACTGGATGGCGAGCCATAAGCCTGATCTGGTCATCAAACTCAATGTGGACCTTGAAg < 1:333087/273‑1 (MQ=255) cGTTTGTCGCCCGTCGCTTACTGCGCTTTCGTCATAtgctttcctgctggcgggcgtacaagtttcgcaaaatgttgtgtaaaagccagcaagg < 2:193123‑M2/94‑59 (MQ=255) cGTTTGTCGCCCGTCGCTTACTGCGCTTTCGTCATATGCTTGCCTGTCGTCGTCGCGGGTTAATTGTTCTAACCGACCGTTATCCTCAGGACCAAATTc > 2:46886/1‑99 (MQ=255) cGTTTGTCGCCCGTCGCTTACTGCGCTTACGTCATATGCTTGCCGGTCGTCGTCGCGGGTTAATTGTTCTAACCGACCGTTATCCTCAGGACCAAATTCCTGGCGCTTCCGATGGTACGGTGTTCCCACCTAACGTTGAAGGTGGTCGTTTTGTCTCATGGCTGGCAAGCCAGGAACGTAAAGNGTTTCACTGGATGGCGAGCCATAAGCCTGATCTGGTCATCCAACTCAATGTTTACCTTGAAGTTGCCTGTGCACGTAAACCCGACAATaa > 1:247737/1‑274 (MQ=255) cGTTTGTCGCCCGTCGCTTACTGCACTTATGTCATATGCTTGCCTGTCGTCGTCGCGGGTTAATTGTTCTAACCGACCGTTATCCTCAGGACCAAATTCCTGGCGCTTACGATGGTACGGTGTTCCCACCTAACGTTGAAGGTGGTCGTTTTGTCTCATGGCTGGCAAGCCAGGAACTGAAAGNGTTTCACTGGATGGCGCGCCATAAGCCTGATCTGGTCATCAAACTCAATGTTTACCTTGAAGGTGCCTGTGCACGTAAACCCGACCATaaa > 1:228073/1‑275 (MQ=255) tGTCGCCCGTCGCTTACTGCGCTTTCGTCATAtgctttcctgctggcgggcgtacaagtttcgcaaaatgttgtgtaaaagccagcaaggcttt > 1:193127‑M2/1‑32 (MQ=255) tGTCGCCCGTCGCTTACTGCGCTTTCGTCATATGCTTGCCTGTCGTCGTCGCGGGTTAATTGTTCTAACCGACCGTTATCCTCAGGACCAAATTCCTgg < 1:46887/99‑1 (MQ=255) cgcTTTCGTCATATGCTTGCCTGTCGTCGTCGCGGGTTAATTGTTCTAACCGACCGTTATCCTCAGGACCAAATTCCTGGCGCTTACGATGGTACGGTGTTccc > 2:122672/1‑104 (MQ=255) ttCGTCATATGCTTGCCTGTCGTCGTCGTGGGTTAATTGTTCTAACCGACCGTTATCCTCAGGACCAAATTCCTGGCGCTTACGATGGTACGGTGTTCCCACCTAACGTTGAAGTTGGTCGTTTTGTCTCATGGCTGGCAAGCCAGGAACGTAAATCGTTTCAGTGGATGGCGAGCCATAAGCNTGATCTGGTCATCAAACTCAATGTTGACCTTGAAGTTGCCTGTGCACTTAAACCCGACCATAAACGGGAATCGCTGGCGAGGAAGATTGc > 1:260043/1‑274 (MQ=255) ttCGTCATATGCTTGCCTGTCGTCGTCGCGGGTTAATTGTTCTAACCGACCGTTATCCTCAGGACCAAATTCCTGGCGCTTACGATGGTACGGTGTTCCCACCt < 1:122674/104‑1 (MQ=255) ttCGTCATATGCTTGCCTGTCGTCGTCGCGGGTTAATTGTTCTAACCGACCGTTATCCTCAGGACCAAATTCCTGGCGCTTACGATGGTACGGTGTTCCCACCTAACGTTGAAGGTGGTCGTTTTGTCTCATGGCTGGCAAGCCAGGAACGTAAAGCGTTTCACTGGATGGCGAGCCATAAGCCTGATCTGGTCATCAAACTCAATGTTGACCTTGAAGTTGCCTGTGCACGTAAAcc < 1:163748/238‑1 (MQ=255) atGCTTGCCTGTCGTCGTCGCGGGTTAATTGTTCTAACCGACCGTTATCCTCAGGACCAAATTCCTGGCGCTTACGATGGTACGGTGTTCCCACCTAACGTTGAAGGTGGTCGTTTTGTCTCATGGCTGGCAAGCCAGGAACGTAAAGCGTTNCACTGGATGGCGAGCCATAAGCCTGATCTGGTCATCAAACTCAATGTTGACCTTGAAGTTGCCTGTGCACGTAAAGCCGACCATAAACGGGAATAGCTGGCGAGGAAGATTGCAAAAACGcc > 1:283815/1‑275 (MQ=255) | AGCGATGGTTCAGGCAAGTCAACGGTGTGTGAACATCTTATTACCGTTGTCGAAAAATATGGTGCTGCCGAAAGAGTTCATTTAGGAAAACAGGCCGGAAATGTCGGTCGTGCAGTGACAAAATTACCGTTGATGGGAAAATCCTTACATAAAACAATTGAACGAAATCAGGTGAAAACAGCAAAAAAATTGCCTGGACCAGTTCCGGCGCTGGTAATTACAGCGTTTGTCGCCCGTCGCTTACTGCGCTTTCGTCATATGCTTGCCTGTCGTCGTCGCGGGTTAATTGTTCTAACCGACCGTTATCCTCAGGACCAAATTCCTGGCGCTTACGATGGTACGGTGTTCCCACCTAACGTTGAAGGTGGTCGTTTTGTCTCATGGCTGGCAAGCCAGGAACGTAAAGCGTTTCACTGGATGGCGAGCCATAAGCCTGATCTGGTCATCAAACTCAATGTTGACCTTGAAGTTGCCTGTGCACGTAAACCCGACCATAAACGGGAATCGCTGGCGAGGAAGATTGCCATAACGCC > CP009273/3127529‑3128061 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |