New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 4572049 | 52 (1.880) | 4 (0.150) | 3/260 | NT | 7.9% | coding (817/1590 nt) | hsdM | DNA methyltransferase M |
? | CP009273 | = 4572174 | 44 (1.680) | coding (692/1590 nt) | hsdM | DNA methyltransferase M |
TCCCTTTGGTAAAGAACAGCACGTTGGTCTTCACGCCCTGAGCGTAAAAAATACCGGTCGGCAGACGCAGAATGGTGTGCAGATGACACTTATCCATCAGGTCACGACGAATGTCGGTGCCTTTGCCGCCTTCAAACAGCACGTTATCCGGCACCACCACCGCCGCACGACCGCCGGGATGCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACGACGGGTGCCGGGCACCAGTTCGAGGCCGATAAACGCGCGGTGGATCTGGAAATCCTGCGTGTCGCCATCAAGGTCGTCCAGATCATTGGTTTGCGACTTAACATAGCGGTCGGCTTCAATCAA > CP009273/4571785‑4572322 | tCCCTTTGGTAAAGAACAGCACGTTGGTCTTCACGCCCTGAGCGTAAAAAATACCGGTCGGCAGACGCAGAATGGTGTGCAGATGACACTTATCCATCAGGTCACGACGAATGTCGGTGCCTTTGCCGCCTTCAAACAGCACGTTATCCGGAACCACCACCGCCGCACGACCGCCGGGATGAAGCTGTTCG‑CAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGGGCACAAAGGTGGGGGTAATGTGGGTGCATGCGGCGGTGCCaa > 2:521840/1‑275 (MQ=255) gCACGTTGGTCTTCACGCCCTGAGCGTAAAAAATACCGGTCGGCAGACGCAGAATGGTGTGCAGATGACACTTATCCATCAGGTCACGACGAATGTCGGTGCCTTTGCCGCCTTCAAACAGCACGTTATCCGGCACCACCACCGCCGCACGACCGCCGGGATGCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAGCTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGACAAACGGCGGGTTAGTGGc > 1:532291/1‑274 (MQ=255) gCCCTGAGCGTAAAAAATACCGGTCGGCAGACGCAGAATGGTGTGCAGATGACACTTATCCATCAGGTCACGACGAATGTCGGTGCCTTTGCCGCCTTCAAACAGCACGTTATCCGNCACCACCACCTCCGCACGACCGCCGGGATGCAGCGTTTCGA‑AATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCgg < 1:521848/275‑1 (MQ=255) gaCCGGTCGGCAGACGCAGAATGGTGTGCAGATGACACTTATCCATCAGGTCACGACGAATGTCGGTGCCTTTGCCGCCTTCAAACAGCACGTTATCCGGCACCACCACCGCCGCACGACCGCCGGGATGCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCg < 1:274895/274‑1 (MQ=255) gTCGGCAGACGCAGAATGGTGTGCAGATGACACTTATCCATCAGGTCACGACGAATGTCGGTGCCTTTGCCGCCTTCAAACAGCACGTTATCCGGCACCACCACCGCCGCACGACCGCCGGGATGCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAata > 1:194183/1‑243 (MQ=255) gCAGACGCAGAATGGTGTGCAGATGACACTTATCCATCAGGTCACGACGAATGTCGGTGCCTTTGCCGCCTTCAAACAGCACGTTATCCGGCACCACCACCGCCGCACGACCGCCGGGATGCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATgcg < 2:194181/243‑1 (MQ=255) gCAGATGACACTTATCCATCAGGTCACGACGAATGTCGGTGCCTTTGCCGCCTTCAAACAGCACGTTATCCGGCACCACCACCGCCGCACGACCGCCGGGATGCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGAtg > 1:361768/1‑274 (MQ=255) attATCCAGCAGTGCACGCCGAAGGTCGGGGCCTGTGCCGCCTTCAAAACGCACCTTATCCAGCTCCACCACCGCCGCCCGCCCGCCGGGATGCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGccgccg < 2:532283/273‑1 (MQ=255) tCCATCAGGTCACGACGAATGTCGGTGCCTTTGCCGCCTTCAAACAGCACGTTATCCGGCACCACCACCGCCGCACGACCGCCGGGATGCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTa > 2:242831/1‑237 (MQ=255) tCAGGTCACGACGAATGTCGGTGCCTTTGCCGCCTTCAAACAGCACGTTATCCGGCACCACCACCGCCGCACGACCGCCGGGATGCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCa < 1:242833/237‑1 (MQ=255) cAGGTCACGACGAATGTCGGTGCCTTTGCCGCCTTCAAACAGCACGTTATCCGGCACCACCACCGCCGCACGACCGCCGGGATGCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCCTAGTGTTGCCCAGACGGATTTCGCCGCCGTGGTCGa > 1:173332/1‑272 (MQ=255) ggTCACGACGAATGTCGGTGCCTTTGCCGCCTTCAAACAGCACGTTATCCGGCACCACCACCGCCGCACGACCGCCGGGATGCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGAGGGTAGTGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCCGCGTGTTGCCCAGACGGCTTGCGCCGCCGGGGTCGAGGTTg > 1:507087/1‑275 (MQ=255) gTCACGACGAATGTCGTTGCCTTTGCCGCCTTCAAACAGCACGTTATCCGGAACCACCACCGCCGCACGACCGCCGGGATGCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAANGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGc > 1:478756/1‑242 (MQ=255) tttGCCGCCTTCAAACCGCACTTTACCCGGCACCACCACCGCCGCACGACCGCCGGGATGCAGCGTTTCGAGAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTGGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAgca > 2:507080‑M2/1‑269 (MQ=255) gCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGttt > 1:75713/1‑137 (MQ=255) gCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTa > 1:163183/1‑149 (MQ=255) cGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCAc < 2:75713/137‑1 (MQ=255) cGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCa < 2:163182/149‑1 (MQ=255) tgcATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAg > 1:180161/1‑88 (MQ=255) cATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCaa > 1:563458/1‑74 (MQ=255) tAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGc < 2:180160/88‑1 (MQ=255) tAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACGACGGGTGCCGGGCACCAGTTCGAGGCCGATAAACGCGCGGTGGATCTGGACATCCTGCGTGTc > 1:31812/1‑274 (MQ=255) aaGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAAcgg < 2:563450/74‑1 (MQ=255) aaCTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCtgcacgatattgaaggcaacctcgaccacggcggcgcaatccgtctgggcaacactctgggtagcgacggtgaaaacctgccgaaggcgcata > 2:365479‑M1/1‑53 (MQ=255) aaCTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCtgcacgatattgaaggcaacctcgaccacggcggc > 1:436534‑M1/1‑53 (MQ=255) aaCTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACGACGGGTGCCGGGCACCAGTTCGAGGCCGATAAACGCGCGGTGGATCTGGAAATCCTGCGTGTCGCCATCAAg > 1:210644/1‑275 (MQ=255) aaCTGTTTGTTGCTGCTCGGGGGATCAAGGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGa > 1:399611/1‑157 (MQ=255) cTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGttt > 1:144482/1‑103 (MQ=255) gtttgttGGTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGTGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGtt < 2:399605/157‑1 (MQ=255) gtttgttGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTgcgg < 1:30544/51‑1 (MQ=255) gtttgttGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCtgcacgatattgaaggcaacctcgaccacggcggcgcaatccgtctgggcaacactctgggtagcgacggtgaaaacctgccgaaggcgcatattgt < 1:365484‑M1/146‑98 (MQ=255) gtttgttGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCtgcacgatattgaaggcaacctcgaccacggcggcgcaa < 2:436527‑M1/88‑40 (MQ=255) gtttgttGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAAGATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGtt < 1:323862/157‑1 (MQ=255) tttgttGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGttt > 1:363077/1‑100 (MQ=255) tttgttGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACGACGGGTGCCGGGCACCAGTTCGAGGCCGATAAACGCGCGGTGGATCTGGAAATCCTGCGTGTCGCCATCAAGgtagt > 1:58192/1‑275 (MQ=255) ttgttgCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCAc < 2:144481/103‑1 (MQ=255) tgttgCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGAtt > 2:154756/1‑134 (MQ=255) ttgCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCAc < 2:363072/100‑1 (MQ=255) tgCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCt > 1:252560/1‑84 (MQ=255) gCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTgcgc < 1:154757/134‑1 (MQ=255) ggTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCgg < 2:252558/84‑1 (MQ=255) gTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCC‑CCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGTCAGTTCATCAGTGCCAGACGACGGGTGCCGGGCCACAGTTCGAGGCCGATAAACGCGCGGTGGATCGGGAAATCCTGCGTGTCGCGATCCAGgtgcgcccgactat > 2:117986/1‑261 (MQ=255) ggTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAg < 1:192475/115‑1 (MQ=255) ggAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACGACGGGTGCCGGGCACCAGTTCGAGGCCGATAAACGCGCGGTGGATCTGGAAATCCTGCGTGTCGCCATCAAGGTCGTCCAGATCATTGGTTTg < 1:309692/274‑1 (MQ=255) aaCAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTgcgc > 2:536548/1‑122 (MQ=255) aaGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCgccgcc < 1:536556/122‑1 (MQ=255) gTGCGGGTAATGTTGTTGCCTGCCCCGCGTCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGCCGACGGGTGCCGNGCACCAGTTCGAGGACGATAAACGCGCGGTGGATCTGGAAATCCTGCGTGTCGCCATCAAGGCCGTCCAGATCAATGGTTTGCGACTTaa > 1:401261/1‑274 (MQ=255) gTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTg > 2:526082/1‑48 (MQ=255) gTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACGACAGGTGCCGGGCACCAGTTCGAGGCCGATa > 2:485906/1‑204 (MQ=255) cGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCt > 1:323603/1‑61 (MQ=255) cGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGttt > 1:384666/1‑72 (MQ=255) cGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCag > 1:9852/1‑89 (MQ=255) gggTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGa < 1:526090/48‑1 (MQ=255) gggTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACGACAGGTGCCGGGCACCAGTTCGAGGCCGATAAAcg < 1:485913/204‑1 (MQ=255) tAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATNCGCCTTCGGCACGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACGACGGGTGCCGGGCACCAGTTCGAGGCCGATAAACGCGCGGTGGa < 1:518699/210‑1 (MQ=255) tAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCgg < 2:323598/61‑1 (MQ=255) tAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCAc < 2:384660/72‑1 (MQ=255) tAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAgtg < 2:9852/89‑1 (MQ=255) ctgctgcacgatattgaaggcaacctcgaccacggcgcgcaatccgtctgggcaacactctgggtagcgacggtgaaaacctgccgaaggcgcatattgtcgccactaacccgccgtttggcagcgccgca < 2:77840‑M1/131‑128 (MQ=255) tgctgcacgatattgaaggcaacctcgaccacggcggcgcaatccgtctgggcaacactctgggtagcgacggtgaaaacctgccgaaggcgcatattgtcgccactaacccgccgtttggcagcgccgcaggcaccaacattacccgcacctttgttcacccgaccagcaaccaacagttgtgctttatgcagcatattctcgaaacgctgcatcccggcggtcgtgcggcggtggtggtgccgggtaaagtgcggtttgaaggcggcaaa > 2:507080‑M1/1‑3 (MQ=255) tGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCgccgcc > 1:113775/1‑99 (MQ=255) tGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGC‑GCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAgcag < 2:77840‑M2/131‑5 (MQ=255) gcggcgCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTg > 2:270292/1‑145 (MQ=255) cggcgCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACGACGGGTGCCGGGCCCCAGTTCGAGGCCGATAAACGCGCGGTGGATCTGGAAATCCTGCGTGTCGCCATCAAGGTCGTCCAGATCATTGGTTTGCGACTTAACATAGCGGTCGGCTtcaatcaa > 1:208121/1‑274 (MQ=255) | TCCCTTTGGTAAAGAACAGCACGTTGGTCTTCACGCCCTGAGCGTAAAAAATACCGGTCGGCAGACGCAGAATGGTGTGCAGATGACACTTATCCATCAGGTCACGACGAATGTCGGTGCCTTTGCCGCCTTCAAACAGCACGTTATCCGGCACCACCACCGCCGCACGACCGCCGGGATGCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCGTCGCTACCCAGAGTGTTGCCCAGACGGATTGCGCCGCCGTGGTCGAGGTTGCCTTCAATATCGTGCAGCAGGCAGTTCATCAGTGCCAGACGACGGGTGCCGGGCACCAGTTCGAGGCCGATAAACGCGCGGTGGATCTGGAAATCCTGCGTGTCGCCATCAAGGTCGTCCAGATCATTGGTTTGCGACTTAACATAGCGGTCGGCTTCAATCAA > CP009273/4571785‑4572322 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |