New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 237781 | 38 (1.380) | 4 (0.150) | 3/260 | NT | 8.9% | coding (2010/2445 nt) | fadE | acyl coenzyme A dehydrogenase |
? | CP009273 | = 238095 | 46 (1.760) | coding (1696/2445 nt) | fadE | acyl coenzyme A dehydrogenase |
CGCATCTTGTACGCCCCAGTGCACCAGCGGCAGGTCGGCTTCATTACGGCCTTCGTCGTCATAACGCTTCAGCACGGCAGAGGCGAGGTAGAGCTGGCTTAAAATATCCCCCAGACGGGCCGAGATGCGCTCGCGACGTTTCAGGCTGCCGCCCAGCACTGCCATCGAGACATCAGAAAGCAGGGCGAGGTTGGCGCTCAGGCGGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTGACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACGGTGATGGCAATCGGTGCGCCCTGGTAAGCACGCGCCAGGAAG > CP009273/237847‑238348 | cgcATCTTGTACGCCCCAGTGCACCAACGGCAGGTCGGCTTCATTACGGCCTTCGTCGTCATAACGCTTCAGCACGGCAGAGGCGAGGTAGAGCTGGCTTAAAATATCCCCCAGACGGGCCGAGATGCGCTCGCGACGTTTCAGGCTGCCGCCCAGCACTGCCATCGAGAGATCAGAAAGCAGNGCGAGGTTNGCGCTCAGGCGGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCGGTGTAAACCGCGCGGCAGGc > 1:375294/1‑275 (MQ=255) gTCGGCTTCATTACGGCCGTCGTCGTNATAACGCTNCAGCACGGCAGACGCGAGGTAGAGCTGGCTTAAAATATCCCCCAGACGGGCCGAGATGCGCTCGCGACGTTTCAGGCTGCCGCCCAGCACTGCCATCGAGACATCAGAAAGCAGGGCGAGGTTGGCGCTCAGGCGGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTgct > 1:384591‑M2/1‑216 (MQ=255) gCCTTCGTCGTCATAACGCTTCAGCACGGCAGAGGCGAGGTAGAGCTGGCTTAAAATATCCCCCAGACGGGCCGAGATGCGCTCGCGACGTTTCAGGCTGCCGCCCAGCACTGCCATCGAGACATCAGAAAGCAGGGCGAGGTTGGCGCTCAGGCGGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCccag > 2:217873/1‑231 (MQ=255) tcgtcgTCATAACGCTTCAGCACGGCAGAGGCGAGGTAGAGCTGGCTTAAAATATCCCCCAGACGGGCCGAGATGCGCTCGCGACGTTTCAGGCTGCCGCCCAGCACTGCCATCGAGACATCAGAAAGCAGGGCGAGGTTGGCGCTCAGGCGGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCccagccag < 1:217875/231‑1 (MQ=255) gtcgtcATAACGCTTCAGGACGGCAGAGGCGAGGTAGAGCTGGCTTAAAATATCCCCCAGACGGGCCGAGATGCGCTCGCGACGTTTCAGGCTGCCGCCCAGCACTGCCATCGAGACATCAGNAAGCAGGGCGAGGTTGGCGCTCAGGCGGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGaaca < 1:477480/275‑1 (MQ=255) cTTCAGCACGGCAGAGGCGAGGTAGAGCTGGCTTAAAATATCCCCCAGACGGGCCGAGATGCGCTCGCGACGTTTCAGGCTGCCGCCCAGCACTGCCATCGCGACATCAGAAAGCAGGGCGAGGTTGGCGCTCAGGCGGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGAAGGTTGGCGTGCTGCTGGTTa > 1:122208/1‑194 (MQ=255) tCAGCACGGCAGAGGCGAGGTAGAGCTGGCTTAAAATAGCCCCCAGACGGGCCGAGATGCGCTCGCGACGTTTCAGGCTGCCGCCCAGCACTGCCAACGAGACATCAGAAAGCAGGGCGAGGTTGGCGCTCAGGCGGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGaa < 1:312718/274‑1 (MQ=255) cAGCACGGCAGAGGCGAGGTAGAGCTGGCTTAAAATATCCCCCAGACGGGCCGAGATGCGCTCGCGACGTTTCAGGCTGCCGCCCAGCACTGCCATCGAGACATCAGAAAGCAGGGCGAGGTTGGCGCTCAGGCGGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGGTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCGGCGAACTTTGGTTCTCACGACGTTACCTATCTTTTTTAATAAACATTTATcttac > 2:312714/1‑270 (MQ=255) agGCGAGGTAGAGCTGGCTTAAAATATCCCCCAGACGGGCCGAGATGCGCTCGCGACGTTTCAGGCTGCCGCCCAGCACTGCCATCGAGACATCAGAAAGCAGTGCGAGGTTGGCGCTCAGGCGGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTTGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTGACGTCa < 1:162893/275‑1 (MQ=255) gCGAGGTAGAGCTGGCTTAAAATATCCCCCAGACGGGCCGAGATGCGCTCGCGACGTTTCAGGCTGCCGCCCAGCACTGCCATCGAGACATCAGAAAGCAGGGCGAGGTTGGCGCTCAGGCGGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGaac > 1:268160/1‑246 (MQ=255) gTAGAGCTGGCTTAAAATATCCCCCAGACGGGCCGAGATGCGCTCGCGACGTTTCAGGCTGCCGCCCAGCACTGCCATCGAGACATCAGAAAGCAGGGCGAGGTTGGCGCTCAGGCGGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTc > 2:237720/1‑184 (MQ=255) agCTGGCTTAAAATTTCCCCCAGACGGGCCGAGATGCGCTCGCGACGTGTCAGTCTGCCGCCCAGCACTGCCATCGAGACATCAGAAAGCAGGGCGCGGTTTGCGCTCAGGCGGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTGACGTCATTGTTCTTcg < 1:324495/274‑1 (MQ=255) agCTGGCTTAAAATATCCCCCAGACGGGCCGAGATGCGCTCGCGACGTTTCAGGCTGCCGCCCAGCACTGCCATCGAGACATCAGAAAGCAGGGCGAGGTTGGCGCTCAGGCGGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGc < 1:237722/184‑1 (MQ=255) aaaaTATCCCCCAGACGGGCCGAGATGCGCTCGCGACGTTTCAGGCTGCCGCCCAGCACTGCCATCGAGACATCAGAAAGCAGGGCGAGGTTGGCGCTCAGGCGGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTg < 1:300707/225‑1 (MQ=255) ccAGACGGGCCGAGATGCGCNCGCGACGTTTCAGGCTGCCGCCCAGCACTGCCATCGAGACATCAGAAAGCAGGGCGAGGTTGGCGCTCAGGCGGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGACTCTGCGATCTTTGTTGCTACCGACGTGAc < 1:392439/204‑1 (MQ=255) ccGAGATGCGCTCGCGACGTTTCAGGCTGCCGCCCAGCACTGCCATCGAGACATCAGAAAGCAGGGCGAGGTTGGCGCTCAGGCGGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCNGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACCGTTTATCGAACGCGTTGACGTCATTGTTCTTAGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTAc > 1:488916/1‑272 (MQ=255) cagagaGGCGCTAGGGACGTTTCAGCCTGCCGCCCATCCCTGCCGTCGAGACATCAGAAAGCAGGGCGAGGTTGGCGCTCAGGCGGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTGTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGGGCTGCGGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTGACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGa < 2:488909/273‑1 (MQ=255) gcTCGCGACGTTTCAGGCTGCCGCCCAGCACTGCCATCGAGACATCAGAAAGCAGGGCGAGGTTGGCGCTCAGGCGGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTg < 1:39009‑M2/122‑2 (MQ=255) gcgACGTTTCAGGCTGCCGCCCAGCACTGCCATCGAGACATCAGAAAGCAGGGCGAGGTTGGCGCTCAGGCGGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTgctgc > 2:39009‑M2/1‑117 (MQ=255) ttCAGGCTGCCGCCCAGCACTGCCATCGAGACATCAGAAAGCAGGGCGAGGTTGGCGCTCAGGCGGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGttt > 2:347881/1‑185 (MQ=255) ggCTGCCGCCCAGCACTGCCATCGAGACATCAGAAAGCAGGGCGAGGTTGGCGCTCAGGCGGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGaac < 1:347886/185‑1 (MQ=255) aGCACTGCCATCGAGACATCAGAAAGCAGGGCGAGGTTGGCGCTCAGGCGGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTgctgctgaatgtggtgatcttcccgaccggacgtcattatctggcaccttctgacaagctggatca < 1:171113‑M2/161‑67 (MQ=255) aGCACTGCCATCGAGACATCAGAAAGCAGGGCGAGGTTGGCGCTCAGGCGGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTgctgctgaatgtggtgatcttcccgaccggac < 1:236406‑M2/127‑33 (MQ=255) cTGCGATCGAGACAGCAGGAAGCAGGGCGAGGTTGGCGCTCAGGCGGTTCAGGGGCTGATAGTAGCGTTTAGGGGCATCGCCGGTTGGCGTgctgctgaatgtggtgatcttcccgaccggacgtca > 2:236404‑M2/1‑91 (MQ=255) cTGCCATCGAGACATCAGAAAGCAGGGCGAGGTTGGCGCTCAGGCGGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTgctgctgaatgtggtgatcttcccgaccggacgtcattatctggcaccttctgacaagctggatcataaa > 2:171112‑M2/1‑91 (MQ=255) tGCCATCGAGACATCAGAAAGCAGGGCGAGGTTGGCGCTCAGGCGGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGa > 1:37030/1‑149 (MQ=255) ccATCGAGTCATCAGAAAGCAGGGCGAGGTTGGCGCTCAGGCGGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTg > 2:303148/1‑164 (MQ=255) ccATCGAGACATCAGAAAGCAGGGCGAGGTTGGCGCTCAGGCGGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTaa > 1:249194/1‑100 (MQ=255) aTCGAGACATCAGAAAGCAGGGCGAGGTTGGCGCTCAGGCGGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTg < 2:37030/149‑1 (MQ=255) cGAGTCATCAGAAAGCAGGGCGAGGTTGGCGCTCAGGCGGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGaaca < 1:303152/164‑1 (MQ=255) cGAGACATCAGAAAGCAGGGCGAGGTTGGCGCTCAGGCGGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACcg < 2:249192/100‑1 (MQ=255) cAGGCGGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGAc > 1:288366/1‑116 (MQ=255) cGGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGat < 2:288363/116‑1 (MQ=255) ttCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCa > 1:475179/1‑67 (MQ=255) ggTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGcc < 2:475172/67‑1 (MQ=255) tGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTGACGTCATTGttc > 1:109076/1‑150 (MQ=255) gATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTGACGTCATTGTTCTTcg < 2:109076/150‑1 (MQ=255) gATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTGACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCAtctc > 2:484909/1‑163 (MQ=255) gtagCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTGACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTcc < 1:484916/163‑1 (MQ=255) agCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACttt > 1:34651/1‑76 (MQ=255) cGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTGCCGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATNTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACGGTGATGGCAATCGGTGCGCACTGGTAAGCAAgcgc > 1:483054/1‑272 (MQ=255) tttAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTttgttg < 2:34651/76‑1 (MQ=255) tttAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTGACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTACATCTCTTCCANCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACGGTGATGGCAATCGGTGCGCCCTGGTAAGCACGCGCCAgg > 1:523112/1‑274 (MQ=255) ttAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTGACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCtt > 2:84036/1‑154 (MQ=255) aGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGa > 1:188839/1‑85 (MQ=255) aGTGGCACGGCCCGTTGGCTGGGTGTTGGTTAAACCGCCCATCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTGGTTGCTACCGACGGTACCGATATGGTTGAACAACAGTTTATCGACCGCGTTGACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCGACGGTGATGGCAATCGGTGCGCCCTGGTAAGCACGCGCCAGGAAg < 2:483047/274‑1 (MQ=255) gTGGCATCGCCGGTGTGCGTGCTGGTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGACGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTTACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTGACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACGGTGATGGCAATCGGTGCGCCCTGGTAAGCACGCGCCAGGAAg < 2:523104/273‑1 (MQ=255) tGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTGACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAg < 1:84036/154‑1 (MQ=255) gCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGa < 2:188838/85‑1 (MQ=255) tCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTGACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTTTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCAtg > 1:465465/1‑195 (MQ=255) cGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTttgtt > 1:364486/1‑64 (MQ=255) ccGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTGACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATcatcat > 1:91/1‑191 (MQ=255) cGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTGACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTTTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCAtgctgc < 2:465458/195‑1 (MQ=255) ggTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTa < 2:364481/64‑1 (MQ=255) ttGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTGACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCAtgctg < 2:91/191‑1 (MQ=255) | CGCATCTTGTACGCCCCAGTGCACCAGCGGCAGGTCGGCTTCATTACGGCCTTCGTCGTCATAACGCTTCAGCACGGCAGAGGCGAGGTAGAGCTGGCTTAAAATATCCCCCAGACGGGCCGAGATGCGCTCGCGACGTTTCAGGCTGCCGCCCAGCACTGCCATCGAGACATCAGAAAGCAGGGCGAGGTTGGCGCTCAGGCGGTTCAGGTGCTGATAGTAGCGTTTAGTGGCATCGCCGGTTGGCGTGCTGCTGGTTAAACCGCGCGTCAGGCCCAGCCAGAAGCTGCGAACTTTGTTGCTACCGACGTGACCGATATGTTTGAACAACAGTTTATCGAACGCGTTGACGTCATTGTTCTTCGCCGCTTCCATCTCTTCCAGCACGTACGGATGGCAACGAATCGCTCCTTGTCCGAAGATCATCATGCTGCGGGTCAGAATGTTAGCCCCTTCAACGGTGATGGCAATCGGTGCGCCCTGGTAAGCACGCGCCAGGAAG > CP009273/237847‑238348 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |