New junction evidence | |||||||||||
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? | CP009273 | = 96902 | 52 (1.440) | coding (772/1068 nt) | murG | N‑acetylglucosaminyl transferase |
CCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCGAAACTGGGTGATTCAGTCACTATCTGGCATCAGAGCGGCAAAGGTTCGCAACAATCC‑GTTGAACAGGCGTATGCCGAAGCGGGGCAACCGCAGCATAAAGTGACGGAATTTATTGATGATATGGCGGCGGCGTATGCGTGGGCGGATGTCGTCGTTTGCCGCTCCGGTGCGTTAACGGTGAGTGAAATCGCCGCGGCAGGACTACCGGCGTTGTTTGTGCCGTTTCAACATAAAGACCGCCAGCAATACTGGAATGCGCTACCGCTGGAAAAAGCGGGCGCAGCCAAAATTATCGAGCAGCCACAGCTTAG > CP009273/96528‑97059 | ccAATAAATGGTTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGCTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTGGCCGCATCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGATCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCGAAACTAGGTGATTCAGTCACTATCTGGCATCAGAGCGGCAAAGGTTCGcaaca < 1:672612/274‑1 (MQ=255) ccAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCAGCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCGAAACTGGGTGATTCAGTCACTATCTGGCATCAGAGCGGCAAAGGTTCGcaaca < 1:129596/274‑1 (MQ=255) tAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGAAAATGCCGCAGGTTGCTGCGAAACTGGGTGAGTCAGTCACTATCTGGCATCAGAGCGGCAAGGGTTAGCAGCAATc > 2:305441/1‑273 (MQ=255) aaGTAGCGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCTCAGCAACGTTTGGCTGGCCGCGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGTGCGCATGCATTCGTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCGAAACTGGGTGATTCAGTCAGTATCTGGCCTCAGAGCTGCAGAGGCTCGTAACAATCC‑GTAGAAAAGGCATATGCCGAAACGGGGCAACGGCAGCAAAAACTGACGAAAACTAtttgttatatt > 2:589855/1‑266 (MQ=255) 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gCATCAGAGCGGCAAAGGTTCGCAACAATCC‑GTTGAACAGGCGTATGCCGAAGCGGGGCAACCGCAGCATAAAGTGACGGAATTTATTGATGATATGGCGGCGGCGTATGCGTGGGCGGATGTCGTCGTTTGCCGCTCCGGTGCGTTAACGGTGAGTGAAATCGCCGCGGCAGGACTACCGGCGTTGTTTGTGCCGTTTCAACATAAAGACCGCCAGCAATACTGGAATGCGCTACCGCTGGAAAAAGCGGGCGCAGCCAAAATAATCGagcagc > 1:242297/1‑275 (MQ=255) cAGAGCGGCAAAGGTTCGCAACAATCC‑GTTGAACAGGCGTATGCCGAAGCGGGGCAACCGCAGCATAAAGTGACGGAATTTATTGATGATATGGCGGCGGCGTATGCGTGGGCGGATGTCGTCGTTTGCCGCTCCGGTGCGTTAACGGTGAGTGAAATCGCCGCGGCAGGACTAc > 2:578969/1‑175 (MQ=255) gagCGGCAAAGGTTCGCAACAATCC‑GTTGAACAGGCGTATGCCGAAGCGGGGCAACCGCAGCATAAAGTGACGGAATTTATTGATGATATggcggcgg > 1:103583/1‑98 (MQ=255) cgCGGCAAAGANACGGAAAAAGCCGGTGGAAGAGG‑GTAGGGCGAAGGGGGGGGATCGCAGCATAAAGTGGAGGTATTTATTGATGGAATGGGGGCGGCGTAGGCGTGGGCGGATGGCGTAGGTTGCCGCTCCGGTGCGTTAACGGTGAGTGAAATCGCCGCGGCAGGACTACCGGCGTGGTTGGTGCCGGTTCAACATAAAGACCGCCAGCAATACTGGAATGCGCTACCGCTGGAAAAAGCGGGCGCAGCCAAAATTATCGAGCAGCCACAGCt < 2:52760/274‑1 (MQ=255) agCGGCAAAcgacgacatccgcccacgcatacgccgccgccatatcatcaataaattccgtcactttatgctgcggttgccccgcttcggcatacgc < 1:189145‑M1/97‑89 (MQ=255) agCGGCAAAcgacgacatccgcccacgcatacgcagccgccatatcatcaataaattccgtcactttatgctgcggttgccccgctt < 2:602216‑M1/87‑79 (MQ=255) gCGGCAAAGGTTCGCAACAATCC‑GTTGAACAGGCGTATGCCGAAGCGGGGCAACCGCAGCATAAAGTGACGGAATTTATTGATGATATGGCGGCGGCGTATGCGTGGGCGGATGTCGTCGTTTGCCGCTCCGGTGCGTTAACGGTGAGTGAAATCGCCGCGGCAGGACTACCGGc < 1:578978/175‑1 (MQ=255) cGGCAAAcgacgacatccgcccacgcatacgccgccgccatatcatcaataaattccgtcactttatgctgcggttgccccgcttcggcatacgcctgttcaacggat < 1:550123‑M1/108‑102 (MQ=255) cGGCAAAcgacgacatccgcccacgcatacgccgccgccatatcatc < 1:616500‑M1/47‑41 (MQ=255) ggCAAAGGTTCGCAACAATCC‑GTTGAACAGGCGTATGCCGAAGCGGGGCAACCGCAGCATAAAGTGACGGAATTTATTGATGATATGGCGGCGGCGTa < 2:103582/98‑1 (MQ=255) cAAAcgacgacatccgcccacgcatacgccgccgccatatcatcaataaattacgtcactttatgctgcggttgccccgcttcggcatacgcctgttcaacggattgttgcgaacctttgccgcactgatgccagatagtgactgactcacccagtttcgcagccacctgcggcattgtctggttcagaatgcgtgcgccctgagaaccacccactacaagcccacgaaccggacctacacgtccaccccaacgttgctgcgccaccggccccg > 2:241500‑M1/1‑4 (MQ=255) | CCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCGAAACTGGGTGATTCAGTCACTATCTGGCATCAGAGCGGCAAAGGTTCGCAACAATCC‑GTTGAACAGGCGTATGCCGAAGCGGGGCAACCGCAGCATAAAGTGACGGAATTTATTGATGATATGGCGGCGGCGTATGCGTGGGCGGATGTCGTCGTTTGCCGCTCCGGTGCGTTAACGGTGAGTGAAATCGCCGCGGCAGGACTACCGGCGTTGTTTGTGCCGTTTCAACATAAAGACCGCCAGCAATACTGGAATGCGCTACCGCTGGAAAAAGCGGGCGCAGCCAAAATTATCGAGCAGCCACAGCTTAG > CP009273/96528‑97059 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |