New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 356557 = | 29 (0.750) | 6 (0.160) | 4/302 | NT | 16.9% | coding (855/1155 nt) | cynX | putative cyanate transporter |
? | CP009273 | 356650 = | 31 (0.840) | coding (948/1155 nt) | cynX | putative cyanate transporter |
TCCCCGCGCGTGGACGCTGGGTGTTTACTTCGGTCTGATTAACGGCGGTTACGCCAGCCTGATTGCCTGGTTACCCGCTTTCTATATTGAGATTGGTGCCAGCGCGCAGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTGATGGACTGGGCATTTCATGCGCTGTGCGTCGTTGGGCTGATGATCA > CP009273/356287‑356801 | caagttcagcgatctacattagccgcatacggcatgaacaaagcgcaggaacaagcgtcgcatcatgcctctttgacccacagctgcggcaaacgtactggtgcaaaacgcagggttatgatcatcagcccaacgacgcacagcgcatgaaatgcccagtccatgaggtaattgccgctgatantactcagcacgccagacaaccacggggccagcccggcgatgataaaaccgcttccctgcataaacgccaccagcttgccagccataCCCg < 1:537064‑M1/4‑1 (MQ=255) ttcTTCGGTGTGATTAACGGCGGTTACGCCAGCCTGATTGCCTGGTTATCCGCTTTCTATAGTGAGATTGGTGCCAGCGCGCAGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGt < 1:272879/272‑1 (MQ=255) tGATTAACGGCGGTTACGCCAGCCTGATTGCCTGGTTACCCGCTTTCTATATTGAGAGTGGTGCCAGCGCGCAGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTggg < 1:104279/274‑1 (MQ=255) gTTACGCCAGCCTGATTGCCTGGTTACCCGCTTTCTATATTGAGATTGGTGCCAGCGCGCAGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTTGGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGttt > 1:416335/1‑272 (MQ=255) tGGTTACCCGCTTTCTATATTGAGATTGGTGCCAGCGCGCAGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGgcggt > 1:164930/1‑273 (MQ=255) gtaaGCGAGCAGTTGAGTGGTTTTNTGCTGGCAGGGATGCCGCGTGTGTAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTgg < 2:416328/272‑1 (MQ=255) caaaacgcagggttatgatcatcagcccaacgacgcacagcgcatgaaatgcccagtccatcaggcaattgccgctgctactacgcagcacgccagaaaaccacggggcaagcccggcgatgataaaaccgattccctgcataaacgccaccagcttgccagcaataGCCGGt < 1:14031‑M1/6‑1 (MQ=255) aGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCNGGATCGGCNCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTACAACCGGCTATTGCTGGCAAGCtggt < 1:462624/274‑1 (MQ=255) ccTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCa > 1:242533/1‑274 (MQ=255) atcagcccaacgacgcacagcgcatgaaatgcccagtccatcaggtaattgccgctgatactacgcagcacgccagaaaaccacggggcaagcccggcgatgataaaaccgattccctgcataaacgccaccagcttgccagcaataGCCGGt < 1:74641‑M1/6‑1 (MQ=255) atgaCGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTTTTAATGCTGGCGCTTGTATTACCACTGGTGGGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGgtgtg < 1:54510/161‑1 (MQ=255) cAGGAGCGTTGCTGATGGCTTCTATGGCTGGCCATAAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGTGCTGCGGCTTTATCCGGCTGCCGATGCAATTGCCGATATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCACTGTTTGCTGCTCGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCg < 1:135279/275‑1 (MQ=255) agaTGGCTCGGCATCAGGTTCGGCGCATGCTGTTGATGCGGGCGTTGGTGTTACTCCTGGTGGGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCg < 1:966/272‑1 (MQ=255) aGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTAtggtgg > 2:143493/1‑95 (MQ=255) gcacgccagaaaaccacggggcaagcccggcgatgataaaaccgattccctgcataaacgccaccagcttgccagcaataGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCg < 1:423871‑M1/74‑1 (MQ=255) tCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGa < 1:143494/95‑1 (MQ=255) gccagaaaaccacggggcaagcccggcgatgataaaaccgattccctgcataaacgccaccagcttgccagcaataGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCa > 2:423864‑M1/77‑154 (MQ=255) aaCTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGtt > 1:360467/1‑100 (MQ=255) aaCTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGGGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCGCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCCAGCTGGTGGCGGTTGTGCAGTGATTCGGTTTTAGCATCGCCGGGCTTGTGCCGGTGGTTTGC‑GGCTTGCTGCGTATTATCAGCgtccagtgnctc > 2:256654/1‑258 (MQ=255) gtgaaTGCTGGCGCTGGTGTTACAGCGGGTGGGGTTCTGCGGCTTTATCGGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGt < 2:360461/97‑1 (MQ=255) ggcaagcccggcgatgataaaaccgattccctgcataaacgccaccagcttgccagcaataGCCGGt < 2:333740‑M1/6‑1 (MQ=255) ggCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGgcgc > 2:85105/1‑128 (MQ=255) cTGGTGTTACAACTGGTGGGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGa < 1:85106/128‑1 (MQ=255) aggTGTTTGAATTGGGGGGGTTCGGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGTGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTGATGGACTGGGCATTTCATGCGCt < 1:388052/273‑1 (MQ=255) ggTGTTACAACTGGTGGGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCg < 1:255065/103‑1 (MQ=255) ataaaaccgattccctgcataaacgccaccagcttgccagcaataGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCg < 2:126945‑M1/74‑1 (MQ=255) aaccgattccctgcataaacgccaccagcttgccagcaataGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCa > 1:126946‑M1/42‑119 (MQ=255) tggtggGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGGTTATGCATGGAATCGGTTTTATCATCGNCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTGATGGACTGGGAATTTCATGCGCTGTGCGCCGTTgg > 1:544369/1‑274 (MQ=255) ggtggGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTGATGGACTGGGCATTTCATGCGCTGTGCGTCGTTggg > 1:92083/1‑274 (MQ=255) tccctgcataaacgccaccagcttgccagcaataGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCg < 1:660425‑M1/74‑1 (MQ=255) tgcataaacgccaccagcttgccagcaataGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCa > 2:660416‑M1/31‑108 (MQ=255) cTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑ccc > 1:295552/1‑185 (MQ=255) cTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGc > 1:575378/1‑220 (MQ=255) tggggCTTTAGCTGGGTGCTGTTGCACTGGCCTGTATTGTGGGCGGTGGTGTGTGGGTTAGGTGTGGGGGGCGCGTTTCCGGTCTGTTTGCGGCTGGCGCTTGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTGATGGACTGGGCATTTCATGCGCTGTGCGTCGTTGGGCTGATGATCa < 2:242528/271‑1 (MQ=255) ggCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCTCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTg < 2:295546/185‑1 (MQ=255) tCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGc > 2:324610/1‑209 (MQ=255) gCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAAtt < 1:324616/209‑1 (MQ=255) cTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑c > 2:480987/1‑167 (MQ=255) cGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCg < 1:480994/167‑1 (MQ=255) | TCCCCGCGCGTGGACGCTGGGTGTTTACTTCGGTCTGATTAACGGCGGTTACGCCAGCCTGATTGCCTGGTTACCCGCTTTCTATATTGAGATTGGTGCCAGCGCGCAGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTGATGGACTGGGCATTTCATGCGCTGTGCGTCGTTGGGCTGATGATCA > CP009273/356287‑356801 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |