New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 356557 = | 29 (0.750) | 6 (0.160) | 4/302 | NT | 16.9% | coding (855/1155 nt) | cynX | putative cyanate transporter |
? | CP009273 | 356650 = | 31 (0.840) | coding (948/1155 nt) | cynX | putative cyanate transporter |
GCCAGCGCGCAGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTGATGGACTGGGCATTTCATGCGCTGTGCGTCGTTGGGCTGATGATCATAACCCTGCGTTTTGCACCAGTACGTTTTCCGCAGCTGTGGGTCAAAGAGGCATGATGCGACGCTTGTTCCTGCGCTTTGTTCATGCCGGATGCGGCTAATGTAGATCGCTGAACTTG > CP009273/356384‑356919 | gtaaGCGAGCAGTTGAGTGGTTTTNTGCTGGCAGGGATGCCGCGTGTGTAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTgg < 2:416328/272‑1 (MQ=255) aGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCNGGATCGGCNCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTACAACCGGCTATTGCTGGCAAGCtggt < 1:462624/274‑1 (MQ=255) ccTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCa > 1:242533/1‑274 (MQ=255) cAGGAGCGTTGCTGATGGCTTCTATGGCTGGCCATAAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGTGCTGCGGCTTTATCCGGCTGCCGATGCAATTGCCGATATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCACTGTTTGCTGCTCGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCg < 1:135279/275‑1 (MQ=255) agaTGGCTCGGCATCAGGTTCGGCGCATGCTGTTGATGCGGGCGTTGGTGTTACTCCTGGTGGGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCg < 1:966/272‑1 (MQ=255) aaCTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGGGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCGCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCCAGCTGGTGGCGGTTGTGCAGTGATTCGGTTTTAGCATCGCCGGGCTTGTGCCGGTGGTTTGC‑GGCTTGCTGCGTATTATCAGCgtccagtgnctc > 2:256654/1‑258 (MQ=255) aggTGTTTGAATTGGGGGGGTTCGGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGTGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTGATGGACTGGGCATTTCATGCGCt < 1:388052/273‑1 (MQ=255) tggtggGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGGTTATGCATGGAATCGGTTTTATCATCGNCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTGATGGACTGGGAATTTCATGCGCTGTGCGCCGTTgg > 1:544369/1‑274 (MQ=255) ggtggGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTGATGGACTGGGCATTTCATGCGCTGTGCGTCGTTggg > 1:92083/1‑274 (MQ=255) cTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑ccc > 1:295552/1‑185 (MQ=255) cTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGc > 1:575378/1‑220 (MQ=255) tggggCTTTAGCTGGGTGCTGTTGCACTGGCCTGTATTGTGGGCGGTGGTGTGTGGGTTAGGTGTGGGGGGCGCGTTTCCGGTCTGTTTGCGGCTGGCGCTTGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTGATGGACTGGGCATTTCATGCGCTGTGCGTCGTTGGGCTGATGATCa < 2:242528/271‑1 (MQ=255) ggCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCTCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTg < 2:295546/185‑1 (MQ=255) tCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGc > 2:324610/1‑209 (MQ=255) gCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAAtt < 1:324616/209‑1 (MQ=255) cTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑c > 2:480987/1‑167 (MQ=255) cGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCg < 1:480994/167‑1 (MQ=255) ttGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCTGTCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTGATGGACTGGGCATTTCATGCGCTGTGCGTCGTTGGGCTGATGATCATAACCCt < 1:403986/245‑1 (MQ=255) tgatcgagcgccagcagcaaacagagcggaaacgcgccgcccagacctaacccacacaccatcgcccacaataccggcTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCa > 2:660416‑M2/79‑108 (MQ=255) tgatcgagcgccagcagcaaacagagcggaaacgcgccgcccagacctaacccacacaccatcgcccacaataccggcTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGtt > 1:126946‑M2/79‑119 (MQ=255) tgatcgagcgccagcagcaaacagagcggaaacgcgccgcccagacctaacccacacaccatcgcccacaataccggcTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTGGc > 2:423864‑M2/79‑154 (MQ=255) cgagcgccagcagcaaacagagcggaaacgcgccgcccagacctaacccacacaccatcgcccacaataccggcTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGa < 1:660425‑M2/34‑1 (MQ=255) cgagcgccagcagcaaacagagcggaaacgcgccgcccagacctaacccacacaccatcgcccacaataccggcTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTat < 2:126945‑M2/45‑1 (MQ=255) cgagcgccagcagcaaacagagcggaaacgcgccgcccagacctaacccacacaccatcgcccacaataccggcTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTGGCGtgc < 1:423871‑M2/80‑1 (MQ=255) aGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑ccc > 1:463995/1‑125 (MQ=255) gTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTGATGGACTGGGCATTTCATGCGCTGTGCGTCGTTGGGCTGATGATCATAACCCTGCGt > 1:621835/1‑224 (MQ=255) cTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTg < 2:463988/125‑1 (MQ=255) gggCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTGATGGACTGGGCATTTCATGCGCTGTGCGTCGTTGGGCTGATGATCATAACCCTGCGTTTTg < 2:621826/224‑1 (MQ=255) ttCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATNATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTGATGGACTGGGCATTTCATGCGCTGTGCGTCGTTGGGCTGATGATCATAACCCTGCGTTTTGCACCAGTACGTTTTCCGCAGCTGTGGGTCAAAGTGGCATGATGCGACGCTTGTTCCTGCGCt < 1:535518/275‑1 (MQ=255) gTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTgg > 2:447918/1‑112 (MQ=255) tttGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTGATGGACTGGGCATTTCATGCGCTGTGCGTCGTTGGGCTGATGATCATAACCCTGCGGTTTGCACCAGTACGTTTTCCGCAGCTGGGGGTCAAAGAGGCATGGTGCGAATCGTGTTCCTNCTCTTTTTTTAtt > 2:535510/1‑273 (MQ=255) gctgctGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTGGCGtg < 1:447925/112‑1 (MQ=255) tgctgGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGc > 2:272305/1‑128 (MQ=255) ggtgGCGTTCTATCACTTTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCGAGCTTGTGGCGTTTATGGAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTTGTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTGATGGACTGGGCATTTCATGCGCTGTGCGTCGTTGGGCTGATGATCATAACCCTGCGTTTTGCACCAGTACGTTTTCCGCAGCTGTGGGTCAAAGAGGCATGATGCGACGCTTGTTCCTGCGCTTTGTTCATGCCGGAt < 2:92082/272‑1 (MQ=255) tgGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGAGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTa > 1:552105/1‑130 (MQ=255) ggCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAAtt < 1:272310/128‑1 (MQ=255) gcTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGAGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTg < 2:552096/130‑1 (MQ=255) tgCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCt > 1:333746/1‑67 (MQ=255) tgCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTGATGGACTGGGCATTTCATGCGCTGTGCGTCGTTGGGc > 2:74640/1‑153 (MQ=255) tgCAACCGGCTATTGCTGCCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTCCTGGCGTGTTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACACGAGGGACTGTGCGTTTCATGTGCTTTGCGGCGTCGGGCTGCTGATCACAATCTTGCGt > 2:14031/1‑173 (MQ=255) accggcTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑cc < 2:333740‑M2/61‑1 (MQ=255) accggcTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTGATGGACTGGGCATTTCATGCGCTGTGCGTCGTTGGGCtgat < 1:74641‑M2/147‑1 (MQ=255) accggcTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTAGCAGCGGCAATTGCCTGATGGACTGGGCATTTCATGCGCTGTGCGTCGTTGGGCTGATGATCATAACCCTGCGTTTTg < 1:14031‑M2/167‑1 (MQ=255) cgggTATGGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAAGCGGTTTTATCATCGCCGGGCTGG‑CCCCGTGGTTGTCTGGCGTGCTGAGTANTATCAGCGGCAATTACCTCATGGACTGGGCATTTCATGCGCTGTGCGTCGTTGGGCTGATGATCATAACCCTGCGTTTTGCACCAGTACGTTTGCCGCAGCTGTGGGTCAAAGAGGCATGATGCGACGCTTGTTCCTGCGCTTTGTTCATGCCGTATGCGGCTAATGTAGATCGCTGAACTTg < 1:537064‑M2/270‑1 (MQ=255) | GCCAGCGCGCAGTACAGCGGTTCCTTACTGGCATTGATGACGCTTGGGCAAGCCGCAGGAGCTTTGCTGATGCCTGCTATGGCTCGCCATCAGGATCGGCGCAAACTGTTAATGCTGGCGCTGGTGTTACAACTGGTGGGGTTCTGCGGCTTTATCTGGCTGCCGATGCAATTGCCGGTATTGTGGGCGATGGTGTGTGGGTTAGGTCTGGGCGGCGCGTTTCCGCTCTGTTTGCTGCTGGCGCTCGATCACTCTGTGCAACCGGCTATTGCTGGCAAGCTGGTGGCGTTTATGCAGGGAATCGGTTTTATCATCGCCGGGCTTG‑CCCCGTGGTTTTCTGGCGTGCTGCGTAGTATCAGCGGCAATTACCTGATGGACTGGGCATTTCATGCGCTGTGCGTCGTTGGGCTGATGATCATAACCCTGCGTTTTGCACCAGTACGTTTTCCGCAGCTGTGGGTCAAAGAGGCATGATGCGACGCTTGTTCCTGCGCTTTGTTCATGCCGGATGCGGCTAATGTAGATCGCTGAACTTG > CP009273/356384‑356919 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |