New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 850003 | 39 (1.010) | 4 (0.110) | 4/292 | NT | 13.3% | coding (901/1119 nt) | ybiR | putative transporter |
? | CP009273 | = 851018 | 16 (0.450) | coding (183/921 nt) | ldtB | L,D‑transpeptidase linking Lpp to murein |
CGTCTTTCTGACGGCGCTGGAGTTCAAACAAGAGCTGTGGGGACTGGTGATTGTGGCGGCAGGCTTTGCGCTGCTGGCACGTCGCGTGGTGCTCAGTGTGGACTGGACGCTGCTGCTGGTGTTTATGGCGATGTTTATCGACGTCCATTTACTGACCCAGCTTCCAGCGTTGCAAGGCGTGTTGGGTAACGTGAGTCATCTATCTGAACCCGGGTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCATATTGTTGCTGAACTATGTGCCGCCGTCTTTATTACTGGTATGGGCGGTAAACGTAGGTGGCTTTGGGTTATTACCCGGATCGCTGGCAAATTTGATTGCGCTACGTATGGCGAACGATCGCCGCATCTGGTGGCGTTTCCATCTCTATTCAATACCGATGCTGTTGTGGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATG > CP009273/849735‑850250 | gtgggttttggcggcggTGGCGGTCACACCAGGGCTGTGGGGACTGGTGATTGTTGCGGCCTGCTTTGTGCGGCTGGCACGTCGCGTGGTGCTCAGTGTGGACTGGACGCTGCTGCTGGTGTTTATGGCGATGTTTATCGACGTCCATTTACTGACCCAGCTTCCAGCGTTGCAAGGCGTGTTGGGTAACGTGAGTCATCTATCTGAACCCGGGTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCATAttg < 2:85433/263‑1 (MQ=255) ttCTGACGGCGCTGGAGTTCAAACAAGAGCTGTGGGGACTGGTGATTGTGGCGGCAGGCTTTGCGCTGCTGGCACGTCGCGTGGTGCTCAGTGTGGACTGGACGCTGCTGCTGGGGTTTATGGCGATGTTTATCGACGTCCATTTACTGACCCAGCTTCCAGCGTTGCAAGGCGTGTTGGGTAACGTGAGTCAGCTATATGACCCCGGGTTATGGTTAAGGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGGTCAGGAACGTTCGGAGTCCCATATTGTTGCTg > 2:301684/1‑275 (MQ=255) tGACGGCGCTGGAGTTCAAACAAGAGGTGTGGGGACTGGTGATTGTGGCGGCAGGCTTTGCGCTGCTGGCACGTCGCGTGGTGCTCAGTGTGGACTGGACGCTGCTGCTGGTGTTTATGGCGATGTTTATCGACGTCCATTTACTGACCCAGCTTCCAGCGTTGCAAGGCGTGTTGGGTAACGTGAGTCATCTATCTGAACCCGGGTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCATATTGTTGCTGaa < 1:301690/274‑1 (MQ=255) aaGAGCTGTGGGGACTGGTGATTGTGGCGGCAGGCTTTGCGCTGCTGGCACGTCGCGTGGTGCTCAGTGTGGACTGGACGCTGCTGCTGGTGTTTATGGCGATGTTTATCGACGTCCATTTACTGACCCAGCTTCCAGCGTTGCAAGGCGTGTTGGGTAACGTGAGTCATCTCTCTGAACCCGGGTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCAGAGTACCATATTGTTGCTGAACTATGTGCCGCGGTCTttattg > 2:653180/1‑274 (MQ=255) gatgttttGCGCTTCTTGTACGTTGCTTGGTGCTTAGTGTTGACTGGCCGCTGCTGCTGGTTTTTATGGCGATGTTTATCTACGTCCATTTNCTGACCCAGCTTCCAGCGTTGCAAGGCATGTTGGGTAACGTGAGTCATCTATCTGAACCCGGGTTATGGTTAACGGCCATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCATATTGTTGCTGAACTATGTGCCGCCGTCTTTATTACGGGTATGGGCGGTAAACGTAGGTGGCttt < 1:552087/270‑1 (MQ=255) atgTCGCGTGGTGCTCAGTGTGGACTGGACGCTGCTGCTGGTGTTTATGGCGATGTTTATCGACGTCCATTTACTGACCCAGCTTCCAGCGTTGCAAGGCGTGTTGGGTAACGTGAGTCATCTATCTGAACCCGGGTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCATATTGTTGCTGAACTATGTGCCGCCGTCTTTATTACTGGTATGGGCGGTAAACGTAGGTGGCTTTGGGTTATTACCCGGATCg < 1:252223/272‑1 (MQ=255) gactggtgCTCAGTGTTGACTGGACGCTGCTGCTGGTGTTTATGGCGATGTTTATCGACGTCCATTTACTGACCCAGCTTCCAGCGTTGCAAGGCGCGTTGGGTAACGTGAGTCATCTATCTGAACCCGGGTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCATATAGTTGCTGAACTATGTGCCGCCGTCTTTATTACTGGTATGGGCGGTAAACGTAGGTGGCTTTGGGTTATTACCCGGATCGCTGGc < 1:367134/271‑1 (MQ=255) ggtgCTCAGTGTGGACTGGACGCTGCTGCTGGTGTTTATGGCGATGTTTATCGACGTCCATTTACTGACCCAGCTTCCAGCGTTGCAAGGCGTGTTGGGTAACGTGAGTCATCTATCTGAACCCGGGTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCatat < 1:131190/185‑1 (MQ=255) gCTCAGTGTGGACTGGACGCTGCTGCTGGTGTTTATGGCGATGTTTATCGACGTCCATTTACTGACCCAGCTTCCAGCGTTGCAAGGCGTGTTGGGTAACGTGAGTAATCTATCTGAACCCGGGTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCAgatggggctttccaatatgatggaagcgaacccgggtgtggctaccttcctgccgaaaggcggtactgtactgaacattccgcagcnactgcgc > 2:264287‑M1/1‑179 (MQ=255) gacGCGGCNGCTGGTGTTTATGGCGATGTTTATCGACGTCCATTTACTGACCCAGCTTCCAGCGTTGCAAGGCGTGTTGGGTAACGTGAGTCATCTATCTGAACCCGGGTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTCACGTGCCGAGTACCGTATTGTTGCTGGACTATGTGCCGCCGTc < 1:524237/192‑1 (MQ=255) acGCTGCTGCTGGTGTTTATGGCGATGTTTATCGACGTCCATTTACTGACCCAGCTTCCAGCGTTGCAAGGCGTGTTGGGTAACGTGAGTCATCTATCTGAACCCGGGTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCATAtt > 1:349305/1‑167 (MQ=255) acGCTGCTGCTGGTGTTTATGGCGATGTTTATCGACGTCCATTTACTGACCCAGCTTCCAGCGTTGCAAGGCGTGTTGGGTAACGTGAGTCATCTATCTGAACCCGGGTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCATATTGTTGCTGAACTATGTGCCGCCGTCTTTATTACTGGTATGGGCGGTAAACGTAGGTGGCTTTGGGttat > 1:554265/1‑235 (MQ=255) ttctgctgGNTTTTATGGCGATGTTTATAGACGTCCATTTACTGACCCAGCTTCCAGCGTTGCAAGGCGTGTTGGGTAACGTGAGTCATCTATCTGAACCCGGGTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCATATTGCTGCTGAACTATCTGCCGCCGTCTttatt < 1:513115/191‑1 (MQ=255) tgctgctgGTGTTTATGGCGATGTTTATCGACGTCCATTTACTGACCCAGCTTCCAGCGTTGCAAGGCGTGTTGGGTAACGTGAGTCATCTATCTGAACCCGGGTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCATATTGTTGCTGAACTATGTGCCGCCGTCTTTATTACTGGTATGGGCGGTAAACGTAGGTGGCTTTGGGTTATTAcc < 2:554256/235‑1 (MQ=255) tgcggcggGTGTTTATGGCGATGTTTATCGACGGCCATTTACTGACCCAGCTTCCAGCGTTGCAAGGCGTGTTGGGTAACGTGAGTCATCTATCTGAACCCGGGTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCATAttgttg < 2:349299/167‑1 (MQ=255) tgGTGTTTATGGCGATGTTTATCGACGTCCATTTACTGACCCAGCTTCCAGCGTTGCAAGGCGTGTTGGGTAACGTGAGTCATCTATCTGAACCCGGGTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCAgatggggctttccaatatgatggaagcgaacccgggtgtggataccttcctgccgaaaggcggtactgtactgaacattccgcagcagctgatcctgccggataccgttcatgaaggcatc < 1:264292‑M1/274‑122 (MQ=255) cGATGTTTATCGACGTCCATTTACTGACCCAGCTTCCAGCGTTGCAAGGCGTGTTGGGTAACGTGAGTCATCTATCTGAACCCGGGTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCAgatggggctttccaatatgatggaagcgaacccgggtgtggataccttcctgccga > 1:450181‑M1/1‑141 (MQ=255) aggTTTTTCGTCTTCCTTTTACTGACCCAGCTTCCAGCGTTGCAAGGCGTGTTGGGTAACGTGAGTCATCTATCTGAACCCGGGTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCATATTGTTGCTGAACTATGTGCCGCCGTCTTTATTACTGGTATGGGCGGTAAACGTAGGTGGCTTTGGGTTATTACCCGGATCGCTGGCAAATTTGATTGCGCTACGTATGGCGAACGATCGCCGCATCTGGTGGc < 1:299028/272‑1 (MQ=255) gTTTATCGACGTCCATTTACTGACCCAGCTTCCAGCGTTGCAAGGCGTGTTGGGTAACGTGAGTCATCTATCTGAACCCGGGTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCAgatggggctttccaatatgatggaagcgaacccgggtgtggataccttcctgccgaaagg < 2:450174‑M1/197‑61 (MQ=255) tgtgtCGATGTCCATTTACTGACCCAGCTTCCAGCGTTGCAATGCGTGTTGGGTAACGTGAGTCAACTATCTGAACCCGGGTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCATATTGTTGCTGAACTATGTGCCGCCGTCTTTATTACTGGTATGGGCGGTAAACGTAGGTGGCTTTGGGTTATTACCCGGATCGCTGGCAAATTTGATTGCGCTACGTATGGCGAACGATCGCCGCATCTGGTGGCGtt < 1:17540/270‑1 (MQ=255) tCCATTTACTGACCCAGCTTCCAGCGTTGCAAGGCGTGTTGGGTAACGTGAGTCATCTATCTGAACCCGGGTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCATATTGTTGCTGAACTATGTGCCGCCGTCTttat > 1:275956/1‑159 (MQ=255) tCCATTTACTGACCCAGCTTCCAGCGTTGCAAGGCGTGTTGGGTAACGTGAGTCATCTATCTGAACCCGGGTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCATATTGTTGCTGAACTATGTGCCGCCGTCTTTATTACTGGTATGGTCGGTAAACGTAGGTGGCTTTGGTTTCTTACCCGGATCGCTGGCAAATTTGATTGCGCTAAGTATGGCGAACGATCGCCTGATTTGGTGGGGGTTCCTTatct > 2:328371/1‑273 (MQ=255) tCCATTTACTGACCCAGCTTCCAGCGTTGCAAGGCGTGTTGGGTAACGTGAGTCATCTATCTGAACCCGGGTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCATATTGTTGCTGAACTATGTGCCGCCGTCTTTATTACTGGTATGGGCGGTAAACGTAGGTGGCTTTGGGTTATTATCCGAATCGCTGGCAAATTTGATGGGGCAACGTAGGGGGAACGATCGCCAGATCTGGGGGGGTTTCCTtcccgtg > 2:299022/1‑270 (MQ=255) tttACTGACCCAGCTTCCAGCGTTGCAAGGCGTGTTGGGTAACGTGAGTCATCTATCTGAACCCGGGTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCatat < 2:721047/125‑1 (MQ=255) tttACTGACCCAGCTTCCAGCGTTGCAAGGCGTGTTGGGTAACGTGAGTCATCTATCTGAACCCGGGTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCATATTGTTGCTGAACTATGTGCCGCCGTCTTTATTACt < 2:275951/159‑1 (MQ=255) tttACTGACCCAGCTTCCAGCGTTGCAAGGCGTGTTGGGTAACGTGAGTCATCTATCTGAACCCGGGTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCATATTGTTGCTGAACTATGTGCCGCCGTCTTTATTACTGGTATGGGCGGTAAACGTAGGTGGCTTTGGGTTATTACCCGGATCGCTGGCAAATTTGATTGCGCTACGTATGGCGAACGATCGCCGCATCTGGTGGc < 1:328377/257‑1 (MQ=255) aCCCAGCTTCCAGCGTTGCAAGGCGTGTTGGGTAACGTGAGTCATCTATCTGAACCCGGGTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCATATTGTTGCTGAACTATGTGCCGCCGTCTTTATTACTGGTATGGGCGGTAAACGTAGGTGGCTTTGGGTTATTACCCGGATCGCTGGCAAATTTGAt > 2:207864/1‑212 (MQ=255) aCCCAGCTTCCAGCGTTGCAAGGCGTGTTGGGTAACGTGAGTCATCTACCTGAACCCGGGTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGAGCAGTAACGTGCCGAGTACCATATTGTGGCTGAACTATGTGCGCCCGTCTTGATTATTGGCATGGGCGGTAAACGTAGGTGGCTTTGGGTTGTTACCCGGATGGCTGGCAAATTTGATTGCGATTGGTATGGCAAAGGAAGGCGGGAGCTGGTGGGGGTTCCGTCTTTATTAAATAcgg > 2:194561/1‑271 (MQ=255) ccAGCTTCCAGCGTTGCAAGGCGTGTTGGGTAACGTGAGTCATCTATCTGAACCCGGGTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTCACGTGCCGAGTACCATATTGTTGCTGAACTATGTGCCCCCGTCTTTATTACTGGTATGGGCGGTAAACGTAGGTGCCTTTGGGTTATTACCCGGATCGCTTGCACATTTGATTGCGCTACTAATGGCGAACGATCGCCGCATCTGGTGGCGTTTCGATCTCTATTCAATACCGCTGc > 2:241335/1‑275 (MQ=255) aGCTTCCAGCGTTGCAAGGCGTGTTGGGTAACGTGAGTCATCTATCTGAACCCGGGTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCATATTGTTGCTGAACTATGTGCCGCCGTCTTTATTACTGGTATGGGCGGTAAACGTAGGTGGCTTTGGGTTATTACCCGGATCGCTGGCAAATTTGATTgcg < 1:207868/212‑1 (MQ=255) aaCGTGAGTCATCTATCTGAACCCGGGTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCATATTGTTGCTGAACTATGTgc > 2:660534/1‑103 (MQ=255) cGTGAGTCATCTATCTGAACCCGGGTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCATATTGTTGCTGAACTATGTGCCGCCGTCTTTATTACTGGTATGGGCGGTAAACGTAGGTGGCTTTGGGTTATTACCCGGATCGCTGGCACATTTGATTGCGCTACGTATGGCGAACGATCGCCGACTCTGGTGGCGTTTCCATCTCTCTTCAATACCGATGCTGGTGTNTGCGGGTTtgggggtttttttttctt > 2:472767/1‑263 (MQ=255) tGAGTCATCTATCTGAACCCGGGTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCATATTGTTGCTGAACTATGTgccgcc < 1:660543/103‑1 (MQ=255) cATCTATCTGATCCCTGGTTATGGTTAACGTCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCATATTGTAGCTGAACTATGTGCCGCCGTCTTTATTACTGGTATGGGCGGTAAACGTAGGTGGCTTTGGGTTATTACCCGGATCGCTGGCAAATTTGATTGCGCTACGTATGGCGAACGATCGCCGCATCTGGTGGCGTTTCCATCTCTATTCAATACCGATGCTGTTGTGGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTgttagtta < 1:355607/274‑1 (MQ=255) ggTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCATATTGTTGCTGAACTATGTgc > 1:162699/1‑78 (MQ=255) ggTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCATATTGTTGCTGAACTATGTGCCGCCGTCTTTATTACTGGTATGGGCGGTAAACGTAGGTGGc > 2:333468/1‑119 (MQ=255) ggTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCATATTGTTGCTGAACTATGTGCCGCCGTCTTTATTACTGGTATGGGCGGTAAACGTAGGTGGCTTTGGGTTATTACCCGGATCGCTGGCAAATTTGATTGCGCTACGTATGGCGAACGATCGCCGCATCTGGTGGCg > 2:504997/1‑193 (MQ=255) aTGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCATATTGTTGCTGAACTATGTgccgcc < 2:162696/78‑1 (MQ=255) aTGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCATATTGTTGCTGAACTATGTGCCGCCGTCTTTATTACTGGTATGGGCGGTAAACGTAGGTGGCTTTg < 1:333474/119‑1 (MQ=255) aTGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCATATTGTTGCTGAACTATGTGCCGCCGTCTTTATTACTGGTATGGGCGGTAAACGTAGGTGGCTTTGGGTTATTACCCGGATCGCTGGCAAATTTGATTGCGCTACGTATGGCGAACGATCGCCGCATCTGGTGGCGTTTc < 1:505004/193‑1 (MQ=255) aCGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCATATTGTTGCTGAACTATGTGCCGCCGTCTTTATTACTGGTATGGGCGGTAAACGTAGGTGGCTTTGGGTTATTACCCGGATCGCTGGCAAATTTGATTGCGCTACGTATGGCGAACGATCGCCGCATCTGGTGGCGTTTcc > 2:596053/1‑187 (MQ=255) cAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCATATTGTTGCTGAACTATGTGCCGCCGTCTTTATTACTGGTATGGGCGGTAAACGTAGGTGGCTTTGGGTTATTACCCGGATCGCTGGCAAATTTGATTGCGCTACGTATGGCGAACGATCGCCGCATCTGGTGGCGTTTCCAtct < 1:596062/187‑1 (MQ=255) tCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCATATTGTTGCTGAACTATGTgc > 2:608829/1‑60 (MQ=255) tttATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCATATTGTTGCTGAACTATGTgccgcc < 1:608838/60‑1 (MQ=255) tCAGTAACGTGCCGAGTACCATATTGTTGCTGAACTATGTGCCGCCGTCTTTATTACTGGTATGGGCGGTAAACGTAGGTGGCTTTGGGTTATTACCCgg > 2:6017/1‑100 (MQ=255) tAACGTGCCGAGTACCATATTGTTGCTGAACTATGTGCCGCCGTCTTTATTACTGGTATGGGCGGTAAACGTAGGTGGCTTTGGGTTATTACCCGGATCg < 1:6017/100‑1 (MQ=255) gCCGAGTACCAgatggggctttccaatatgatggaagcgaacccgggtgtggataccttcctgccgaaagg < 1:539567‑M1/71‑61 (MQ=255) cGAGTACCAgatggggctttccaatatgatggaagcgaacccgggtgtggataccttcctgccgaaaggcggtactgtactgaacattccgcagcagntgatcctgccggataccgttcatgaaggcatcgtcattaacagtgctgagatgcgtctttattactatccgaaagggaccaacaccgttatcgtgctgccgatcggcattggtcagttaggcaaagatacgcctatcaactggaccaccaaagttgag < 1:667706‑M1/256‑248 (MQ=255) aGTACCATATTGTTGCTGAACTATGTGCCGCCGTCTTTATTACTGGTATGGGCGGTAAACGTAGGTGGCTTTGGGTTATTACCCGGATCGCTGGCAAATTTGATTGCGCTACGTGTGGGTTACGATCGCCGCATCTGGTGGCGTTTCCATCGATATTCAATACCGATGCTGTTTTGGGCGGCGTTGTTGGTTTATGTTTTgtta > 1:133714/1‑204 (MQ=255) | CGTCTTTCTGACGGCGCTGGAGTTCAAACAAGAGCTGTGGGGACTGGTGATTGTGGCGGCAGGCTTTGCGCTGCTGGCACGTCGCGTGGTGCTCAGTGTGGACTGGACGCTGCTGCTGGTGTTTATGGCGATGTTTATCGACGTCCATTTACTGACCCAGCTTCCAGCGTTGCAAGGCGTGTTGGGTAACGTGAGTCATCTATCTGAACCCGGGTTATGGTTAACGGCAATCGGTTTATCGCAGGTGATCAGTAACGTGCCGAGTACCATATTGTTGCTGAACTATGTGCCGCCGTCTTTATTACTGGTATGGGCGGTAAACGTAGGTGGCTTTGGGTTATTACCCGGATCGCTGGCAAATTTGATTGCGCTACGTATGGCGAACGATCGCCGCATCTGGTGGCGTTTCCATCTCTATTCAATACCGATGCTGTTGTGGGCGGCGTTGGTGGGATATGTTTTGTTAGTTATACTCCCGGCCAACTAGGGTCTGGCAAATAAAAAAGGCGGATTATG > CP009273/849735‑850250 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |