New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 1235328 = | 38 (0.990) | 4 (0.110) | 4/294 | NT | 12.4% | coding (994/1071 nt) | dadX | alanine racemase, catabolic, PLP‑binding |
? | CP009273 | 1236074 = | 21 (0.580) | coding (1454/1737 nt) | cvrA | putative cation/proton antiporter |
GCGCGCGATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATGGACACTATTTCCCCGGAACCTGAACTCACCGCACAGGCGTTCTACATAAAACGCTTA > CP009273/1235109‑1235588 | gcgcgcGATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCTGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGGTGAGCTGTGGAGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGGCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGACGTGCGCGCTGgcggcacg > 1:720753/1‑270 (MQ=255) gATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATTGGTACGCCGGTTGAGNTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCCATGAGTTGATTTGCGCGCTGGCGCTACGCGGccc > 1:527339/1‑275 (MQ=255) ggTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTAcg > 1:134978/1‑238 (MQ=255) cGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGTGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGAGTTAACGCCTTGCCCGCAGTCGGCTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCAGCCGCTGCCGGaa > 1:370453/1‑191 (MQ=255) tcggcactgcgcgatttgcatatgccaaaagagacgcgtattgcggcactgtttcgtgataaccagttgcttcatcctaccggcagcacccgactgcgcgaaggcgatgtgttgtgtgtaattggtcgggaacgcgatcttccggcgctcggtaaactgttcagccaGt < 2:115024‑M1/2‑1 (MQ=255) cactgcgcgatttgcatatgccaaaagagacgcgtattgcggcactgtttcgtgataaccagttgcttcatcctaccggcagcacccgactgcgcgaaggcgatgtgttgtgtgtaattggtcgggaacgcgatcttccggcgctcggtaaactgttcagccaGTcgcc > 1:115025‑M1/164‑169 (MQ=255) cccTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGTTGGGCTATGAGTTGATGTGNGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTTTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATcaaccat > 1:528326/1‑275 (MQ=255) gACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAAATTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGGCTGCTGGGTGCAAAAAAAACATCCAGCCGGCTGGGCAGc > 2:141177/1‑275 (MQ=255) cGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGCTCGGAGGCCACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGcca > 1:324382/1‑273 (MQ=255) cGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGAGGGCTATGAGTTGATTTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCTGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCa > 1:584084/1‑274 (MQ=255) cGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCACGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGCTGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGAGTCCCGGTTGTATCGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGCTCGGGGGCACCGTCCTCTGGGGGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCATCaa > 1:695524/1‑275 (MQ=255) gcgcACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGGGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAAGCATCCATCCGGCTGGTCAGAAACTGTAg > 1:336573/1‑275 (MQ=255) taaccagttgcttcatcctaccggcagcacccgactgcgcgaaggcgatgtgttgtgtgtaattggtcgggaacgcgatcttccggcgctcggtaaactgttcagccaGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGAc < 1:183467‑M1/167‑1 (MQ=255) tGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGGTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGGGACGGTGTAACGTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGGCTCATGGGGGCGAAAAAATCATCCATCCGGCTGGGGAGCAACTGTCGTTGTTTATGTGAcc > 2:660712/1‑274 (MQ=255) accagttgcttcatcctaccggcagcacccgactgcgcgaaggcgatgtgttgtgtgtaattggtcgggaacgcgatcttccggcgctcggtaaactgttcagccaGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCCACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATACATACGACTGGGCAGcaactggtgttgtgactgtt < 2:239939‑M1/165‑8 (MQ=255) tgggcgcGATGGGTATGCTAGCGGTCGGGTTTACGCCTTGCGCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGGGCTGGGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGCCGTGCGCGCTTGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCa < 2:720743/269‑1 (MQ=255) ccGTCTCGATGGGTATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGTAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGCGACAGAGCCa < 1:717032/275‑1 (MQ=255) gtttcGATGGGTATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGGAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCACGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGGCGGCTATGAGTTTATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCAtt < 1:677255/272‑1 (MQ=255) gTCTTGATGGTTATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAANTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCAtt < 1:559827/275‑1 (MQ=255) gTCTCGCTGGATATGCTAGCGGTCGATTTATCGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTCGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCACGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGCCAGAGCCAtt < 1:704264/275‑1 (MQ=255) gTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCAtt < 1:109814/275‑1 (MQ=255) tctcGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCAtt < 1:335439/274‑1 (MQ=255) tctcGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCAtt < 1:103787/274‑1 (MQ=255) ctccacccccccggccgcccccgactgcgcgaaggcgatttgttgtgtgtaattggtcgggaacgcgatcttccggcgctcggtaaactgtgcagccaGTGGCCGCCGCGGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCAtt > 2:183464‑M1/99‑274 (MQ=255) aTGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGGTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCTCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCGGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTCAAGGTGACAGAGCCATTGCCCa < 1:402526/274‑1 (MQ=255) gCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTCCGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGNGTTGATGTGCTCGCGGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAgtgt < 1:660721/275‑1 (MQ=255) cGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACgg > 2:211116/1‑102 (MQ=255) cGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACg > 1:267847/1‑152 (MQ=255) cGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGCTGAGCTGTGGGGCAAGGAGACCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGGGGGCTATGAGTTGATGTCCGCGCTGGCTCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGCGTCACTGCTTGTAAGCCGGGTCGGAGGCACCGTCTTCCGGGTGCAAAAAAATCATCAATACGGCTGGTCGGCAACCGTAGTAGGTGATGGGAAAGAGCCAATCCCCAttgtaccgtctt > 2:607561/1‑262 (MQ=255) gTCGATTTTACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTa < 1:141178/274‑1 (MQ=255) gTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCa > 1:246128/1‑225 (MQ=255) gTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTAGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACNTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTaa > 1:528299/1‑275 (MQ=255) cGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTggg < 1:211120/102‑1 (MQ=255) cGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGgtgt < 2:267842/152‑1 (MQ=255) aTTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTg < 2:246123/225‑1 (MQ=255) aggcgttgtgttgtgtgtgattggtcgggaacgcgatcttccggcgctcggtaaactgttcagccaGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGCGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATGGa > 1:239944‑M1/67‑272 (MQ=255) cAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGNCTATGAGTNGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGCTAGTGTCGATTAAAAGGATGGACACTATTTcccc < 1:482732/275‑1 (MQ=255) gCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGtctt > 1:79448/1‑150 (MQ=255) gTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTgg < 2:79447/150‑1 (MQ=255) tgtgGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCNGGTTGTGACGGTGTAACTTGATGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATGGACACTATTTCCTCGGCACCTGAACTCACCGCACAGGCGtt < 1:507859/274‑1 (MQ=255) gtgGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTcgccgccg > 1:120406/1‑38 (MQ=255) ggggCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTAGGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCGATCCGGCTGGGCAGCAACTGTAGTTGGTCATGTGACAGCACCATAGCACATGACAGTTACCCTCAAACGGAGGGACACTATTGCCCCGGAACCTGCCCTACCGGCCCCGGCGTTCTag > 2:12850/1‑274 (MQ=255) ggCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGc < 2:120405/38‑1 (MQ=255) cAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTNCCGGTGTANCTTGTTGTAAGCTGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATGGACACTATTTCCCCGGAACCTGCACTCACCGCACAGGCGTTCTACATAAAacgctta < 1:467863/274‑1 (MQ=255) | GCGCGCGATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTGTCCATTAAAAGGATGGACACTATTTCCCCGGAACCTGAACTCACCGCACAGGCGTTCTACATAAAACGCTTA > CP009273/1235109‑1235588 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |