New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 1450888 | 20 (0.520) | 5 (0.140) | 5/290 | NT | 21.5% | coding (202/1071 nt) | paaE | ring 1,2‑phenylacetyl‑CoA epoxidase, NAD(P)H oxidoreductase component |
? | CP009273 | = 1451154 | 18 (0.510) | coding (468/1071 nt) | paaE | ring 1,2‑phenylacetyl‑CoA epoxidase, NAD(P)H oxidoreductase component |
ATTGTACCGCTGCGATAGTTGCCGCGAACCTTTCGATTATTTCAAATGTATTTGAGGATGCCATGACAACGTTTCATTCCTTAACAGTGGCAAAAGTCGAGTCGGAAACCCGTGATGCGGTGACCATTACCTTTGCGGTGCCCCAGCCTTTGCAGGAGGCGTATCGCTTTCGCCCCGGTCAACATTTGACCTTAAAAGCCAGCTTTGATGGTGAAGAATTACGCCGTTGTTACTCCATTTGCCGCAGCTATCTGCCTGGCGAAATTAGTGTGGCGGTGAAAGCCATTGAAGGCGGACGTTTCTCCCGCTATGCCCGCGAACACATCCGCCAGGGTATGACGCTGGAGGTCATGGTGCCGCAGGGGCATTTCGGCTATCAGCCGCAGGCCGAACGCCAGGGGCGCTATCTGGCAATTGCAGCAGGATCAGGTATTACGCCAATGCTGGCGATTATCGCCACCACTTTACAAACCGAGCCTGAAAGTCAGTTCACCCTGATCTACGGTAACCGTACCAGC > CP009273/1450625‑1451142 | aTTGTACCGCTGCGATAGTTGCCGCGAACCTTTCGATTATTTCAAATGTATTTGAGGATGCCATGACAACGTTTCATTCCTTAACAGTGGCAAAAGTCGAGTCGGAAACCCGTGCTGCGGTGACCATTACCTTTGCGGTGCCCCAGCCTTTGCAGGAGGCGTATCGCTTTCGCCCCGGTCAACATTTGACCTTAAAAGCCAGCATTGATGGTAAAGAATGACGCAGTTGTAACTCCCTTGGCCGCAGATATAGGCCTTGCAAAATTTgtttttct > 2:583928/1‑269 (MQ=255) cgttctatttgttCAAATGTATGTGAGGATGCCATGACAACGTTTCATTCCTTAACAGTGGCAAAAGTCGAGTCGGAAACCCGTGATGCGGTGACCATTACCTTTGCGGTGCCCCCGCCTTTGCCGGAGGCGTATCGCTTTCGCCCCGGTCAACATTTGACCTTAAAAGCCAGCTTTGATGGTGAAGAATTACGCCGTTGTTACTCCATTTGCCGCAGCTATCTGCCTGGCGAAATTAGTGTGGCGGTGAAAGCGATTGAAGGCGGACGTTtct < 1:583937/263‑1 (MQ=255) tttCATTCCTTAACAGTGGCAAAAGTCGAGTCGGAAACCCGTGATGCGGTGACCATTACCTTTGCGGTGCCCCAGCCTTTGCAGGAGGCGTATCGCTTTCGCCCCGGTCAACATTTGACCTTAAAAGCCAGCTTTGATGGTGAAGAATTACGCCGTTGTTACTCCCTTTGCCGCACCTATCTGCCTGGCGAAAcatcatgctctggctggtatggttaacgtagatcaggctgaactgcctttcagataaggtttgtaaaggtgtggcgataat > 1:91132‑M1/1‑193 (MQ=255) aCCTTTGCGGTGCCCCAGCCTTTGCAGGAGGCGTATCGCTTTCGCCCCGGTCAACATTTGACCTTAAAAGCCAGCTTTGATGGTGAAGAATTACGCCGTTGTTACTCCATTTGCCGCAGCTATCTGCCTGGCGAAATTAGTGTGGCGGTGAAAGCCATTGAAGGCGGACGTTTCTCCGGCTATGCCCGCGAACACATCCGCCAGGGTATGACGCTGGAGGTCATGGTGCCGCAGGGGCATTTCGGCTATCAGCCGCAGGCCGAACGCCAGGGgc > 1:387508/1‑274 (MQ=255) gCGGTGCCCCAGCCTTTGCAGGAGGCGTATCGCTTTCGCCCCGGTCAACATTTGACCTTAAAAGCCAGCTTTGATGGTGAAGAATTACGCCGTTGTTACTCCATTTGCCGCAGCTATCTGCCTGGCGAAATTAGTGTGGCGGTGAAAGCCATTGAAGGCGGACGTTTCTCCCGCTATGCCCGCGAACACATc > 2:29808/1‑192 (MQ=255) ggtgcgccgcgctttgctggacgCGGATCGCTTTAGCTCCGTTCGACATTTGGCCTTAAGTGGCTGCTTTGATGGTGAAGAATTACGCCGTTGTTACTCCATTTGCCGCAGCTATCTGCCTGGCGAAAcatcgtgctctggctggtacggttaccgtagatcagggttaactgactttcaggctaggattgtaaagtggtggcgataatcgccagcatgggcgtaatacctgatcctgctgcaattgacagatagcgcccctggcgttcggcctg < 2:91131‑M1/264‑148 (MQ=255) tGCCCCAGCCTTTGCAGGAGGCGTATCGCTTTCGCCCCGGTCAACATTTGACCTTAAAAGCCAGCTTTGATGGTGAAGAATTACGCCGTTGTTACTCCATTTGCCGCAGCTATCTGCCTGGCGAAATTAGTGTGGCGGTGAAAGCCATTGAAGGCGGACGTTTCTCCCGCTATGCCCGCGAACACATCCGcc < 1:29808/192‑1 (MQ=255) ttGCAGGAGGCGTATGGCTTTTGGCCCGAGCAACATTTGACCTTAAAAGCCAGCTTTGATGGTGAAGAATTACGCCGTTGTTACTCCATTTGCCGCAGCTATCTGCCTGGCGAAATTAGTGTGGCGGTGAAAGCCATTGAAGGCGGACGTTTCTCCCGCTATGCCCGCGAACACATCCGCCAGNGTATGACGATGGAGGTCATGGTGCCGCAGGGGCATTTCGGCTATCAGCCGCAGGCCGAACGCCAGGGGCGCAATCTGGCAATTGaagcag > 1:493711/1‑274 (MQ=255) cAGGAGGCGTATCGCTTTCGCCCCGGTCAACATTTGACCTTAAAAGCCAGCTTTGACGGTGAAGAATTACGCCGTTGTTACTCCATTTGCCTCAGCTATCTGCCTGGCGAAAcatcatgctctggctggtacggttaccgtagatcagggtgaactgactttcaggctcggtttgtaaagtggtggcgataatcaccagcatt < 1:645634‑M1/203‑92 (MQ=255) aggaggCGTATCGCTTTCGCCCCTGTCAACATTTGACCTTAAAAGCCAGCTTGGATGGTGAAGAATTACGCCGTTGTTACTCCATTTGCCGCAGCTATCTGCCTGGCGAAATTAGTGTGGCGGTGAAAGCCATTGAAGGCGGACGTTTCTCCCGCTATGCCCGCGAACACATCCGCCAGGGTATGACGCTGGAGGTCATGGTGCCGCAGGGGCATTTCGGCTATCAGCCGCAGGCCGAACGCCAGGGGCGCTATCTGGCAATTGCAGCAGGATc < 1:409631/274‑1 (MQ=255) gACCTTAAAAGCCAGCTTTGATGGTGAAGACTTACGCCGTTGTTACTCCATTTGCCGCAGCTATCTGCCTGGCGAAATTAGTGTGGCGGTGAAAGCCATTGAAGGCGGACGTTTCTCCCGCTATGCCCGCGAACACATCCGCCAGGGTATGACGCTGGAGGTCATGGTGCCGCAGGGGCATTTCGGCTATCAGCCGCAGGCCGACCGCCAGGGGCGCTATCTGGCAATTGCCGCAGGATCAGGTATTACGCAACTGCTGGCGATTATCGcccac > 1:100030/1‑271 (MQ=255) cTTAAAAGCCAGCTTTGATGGTGAAGAATTACGCCGTTGTTACTCCATTTGCCGCAGCTATCTGCCTGGCGAAATTAGTGTGGCGGTGAAAGCCATTGAAGGCGGACGTTTCTCCCGCTATGCCCGCGAACACATCCGCCAGGGTATGACGCTGGAGGTCATGGTGCCGCAGGGGCATTTCGGCTATCAGCCGCAGGCCGAACGCCAGGGGCGCTATCTGGCAATTGCAGCAGGATCAGGTATTACGCCAATGCTGGCGATTAACGccacca > 1:240139/1‑272 (MQ=255) aGCTTTGATGGTGAAGAATTACGCCGTTGTTACTCCATTTGCCGCAGCTATCTGCCTGGCGAAATTAGTGTGGCGGTGAAAGCCATTGAAGGCGGACGTTTCTCCCGCTATGCCCGCGAACACATCCGCCAgg > 2:332674/1‑133 (MQ=255) ttGATGGTGAAGAATTACGCCGTTGTTACTCCATTTGCCGCAGCTATCTGCCTGGCGAAATTAGTGTGGCGGTGAAAGCCATTGAAGGCGGACGTTTCTCCCGCTATGCCCGCGAACACATCCGCCAGGGTAt < 1:332680/133‑1 (MQ=255) gaagaaTTACGCCGTTGTTACTCCATTTGCCGCAGCTATCTGCCTGGCGAAATTAGTGTGGCGGTGAAAGCCATTGAAGGCGGACGTTTCTCCCGCTATGCCCGCGAACACATCCGCCAg > 1:721278/1‑120 (MQ=255) aagaaTTACGCCGTTGTTACTCCATTTGCCGCAGCTATCTGCCTGGCGAAATTAGTGTGGCGGTGAAAGCCATTGAAGGCGGACGTTTCTccc > 2:19428/1‑93 (MQ=255) aaTTACGCCGTTGTTACTCCATTTGCCGCAGCTATCTGCCTGGCGAAATTAGTGTGGCGGTGAAAGCCATTGAAGGCGGACGTTTCTCCCGCTATGCCCGCGAACACATCCGCCAGGGTa < 2:721268/120‑1 (MQ=255) aTTACGCCGTTGTTACTCCATTTGCCGCAGCTATCTGCCTGGCGAAATTAGTGTGGCGGTGAAAGCCATTGAAGGCGGACGTTTCTCCCGCTa < 1:19428/93‑1 (MQ=255) gttgttACTCCATTTGCCGCAGCTATCTGCCTGGCGAAATTATTGTGGCGGTGAAAGCCATTGAAGGCGGACGTTTCTCCCGCTATGCCCGCGAACACATCCGCCAGGGTATGACGCTGGAGGTCATGGTGCCGCAgg < 1:244737/138‑1 (MQ=255) ttgttACTCCATTTGCCGCAGCTATCTGCCTGGCGAAAcatcatgctctggctggtacggttaccgtagatcaggg > 2:584835‑M1/1‑38 (MQ=255) tACTCCATTTGCCGCAGCTATCTGCCTGGCGAAAcatcatgctctggctggtacggttaccgtagatcagggtgaa < 1:584844‑M1/76‑43 (MQ=255) tttGCCGCAGCTATCTGCCTGGCGAAATTAGTGTGGCGGTGAAAGCCATTGAAGGCGGACGTTTCTCCCGCTATGCCCGCGACCACATCCGCCAGGGTATGACGCTGGAGGTCATGGTGCCGCAGGGGCATTTCGGCTATCAGCCGCAGGCCGCACGCCAGGGGCGCTATCTGGCACTTGCAGCAGGATCAGGTATTACGCCAATGCTGGCGATTACCGCCACCACTTTACAACCCGAGCCTGAAAGCCAGTTCACCCCCGTCTAACGTAAccc > 2:220972/1‑273 (MQ=255) gcccggttttCTGCCGGGCGAAATTAGTGTGGCGGTGAAAGCCATTGAAGGCGGACGTTTCTCCCGCTATGCCCGCGAACACATCCGCCANGGTATGACGCTGGAGGTCATGGTGCCGCAGGGGCATTTCGGCTATCAGCCGCAGGCCGAACGCCAGGGGCGCTATCTGGCAATTGCAGCAGGATCAGGTATTACGCCAATGCTGGCGATTATCGCCACCACTTTACAAACCGAGCCTGAAAGTCAGTTCACCCTGATCTACGGTAACCGTAcc < 1:549635/265‑1 (MQ=255) gCAGCTATTTGACTGGCGAAATTAGTGTGGCGGGGAAAGCCATTGAAGGCGGACGTTTCTCCCGCTATGCCCGCGAACACATCCGCCAGGGTATGACGCTGGAGGTCATGGTGCCGCAGGGGGATTTCTGCTATCAGCCGCAGGCCGAACGCCAGGGGCGCTATCTGGCAATTGCAGCAGGATCAGGTATTACGCCAATGCTGGCGATTATCGCCACCACTTTACAAACCGAGCCTGAAAGTCAGTTCACCCTGATCTACGGTAACCGTAccagc < 1:621844/275‑1 (MQ=255) aGCTATCTGCCTGGCGAAATTAGTGTGGCGGTGAAAGCCATTGAAGGCGGACGTTTCTCCCGCTATGCCCGCGAACACATc > 2:47325/1‑81 (MQ=255) aTCTGCCTGGCGAAATTAGTGTGGCGGTGAAAGCCATTGAAGGCGGACGTTTCTCCCGCTATGCCCGCGAACACATCCGcc < 1:47325/81‑1 (MQ=255) | ATTGTACCGCTGCGATAGTTGCCGCGAACCTTTCGATTATTTCAAATGTATTTGAGGATGCCATGACAACGTTTCATTCCTTAACAGTGGCAAAAGTCGAGTCGGAAACCCGTGATGCGGTGACCATTACCTTTGCGGTGCCCCAGCCTTTGCAGGAGGCGTATCGCTTTCGCCCCGGTCAACATTTGACCTTAAAAGCCAGCTTTGATGGTGAAGAATTACGCCGTTGTTACTCCATTTGCCGCAGCTATCTGCCTGGCGAAATTAGTGTGGCGGTGAAAGCCATTGAAGGCGGACGTTTCTCCCGCTATGCCCGCGAACACATCCGCCAGGGTATGACGCTGGAGGTCATGGTGCCGCAGGGGCATTTCGGCTATCAGCCGCAGGCCGAACGCCAGGGGCGCTATCTGGCAATTGCAGCAGGATCAGGTATTACGCCAATGCTGGCGATTATCGCCACCACTTTACAAACCGAGCCTGAAAGTCAGTTCACCCTGATCTACGGTAACCGTACCAGC > CP009273/1450625‑1451142 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |