New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 2471834 | 30 (0.780) | 5 (0.140) | 5/292 | NT | 16.2% | coding (509/1338 nt) | dsdX | D‑serine transporter |
? | CP009273 | = 2472115 | 24 (0.670) | coding (790/1338 nt) | dsdX | D‑serine transporter |
ACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGCGTCGTGCTATTGATTCCTCTGGCTTTTTCAATTGCCAAAAAAACCAATACCTCATTATTAAAGCTTGCCATTCCGCTATGTACCGCATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGAGTTTGCAGATCTCAAAGTTCGCGATGAAAAAACACTACCGTCATTAGGCGCAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGGTTTGTATATCTT > CP009273/2471599‑2472107 | acacTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTCTTGAAGTGGGCGTCGTGCTATTGATTCCTCTGGCTTTTTCAATTGCCAAAAAAACCAATACCTCATTATTAAAGCTTGCCATTCCGCTATGTACCGCATTGATGGCAGTGCACTGCGTGTTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATTGGTTGCCAATACGCTGGGCGGCGATATCGGTTCGGTGATCGTCTGCGGttg > 2:5790/1‑274 (MQ=255) tGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGCGTCGTGCTATTGATTCCTCTGGCTTTTTCAATTGCCAAAAAAACCAATACCTCATTATTAAAGCTTGCCATTCCGCTATGTACCGCATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCg < 1:317796/275‑1 (MQ=255) cTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGATGAAGTGGGCGTCGTGCTATTGATTCCTCTGGCTTTTTCAATTGCCAAAAAAACCAATACCTCATTATTAAAGCTTGCCATTCCGCTATGTACCGCATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTNCCAATAAGNTGGGCGCAGATATCGGTTCGGGGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCAGATGGCATCATTGAGCGGTGGCCACCTTTTct > 1:467778/1‑273 (MQ=255) ttGGCCTGATTTGTGGCATCACGNTGTTTGTTGAAGTGTGCGTCGTGCTATTGATTCCTCTGGCTTTTTCAATTGCCAAAAAAACCAATACCTCATTATTAAAGCTTGCCATTCCGCTATGTACCGCATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTCGGCGCAGATAtcggtt < 1:535046/207‑1 (MQ=255) ttgAAGTTGGCGTCGTGCTATTGATTCCTCTGGCTTTTTCAATTGCCAAAAAAACCAATACCTCATTATTAAAGCTTGCCATTCCGCTATNTACCGCATTGATGGCAGTGTACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAAcc < 1:551546/274‑1 (MQ=255) gTGGGCGTCGTGCTATTGATTCCTCTGGCNTTTTCAATTGCCAAAAAAACCAATACCTCATTATCAAAGCTTGCCATTCCGCTATGTACCGCATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAactcaaccaagatatacaaaccactctcacgcgccatgttcaattcggcaatcgttttaac < 1:485504‑M1/213‑62 (MQ=255) ttGTTTCCTATGGCTTTTTCAATTGCCAAAAAAACCAATACCTCATTATTAAAGCTTGCCATTCCGCTATGTACCGCATTGATGGCAGTGCACTGCGTGTTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAATCCTGTACCCACAGAGTTTGCAg < 1:334024/274‑1 (MQ=255) tCCTCTGGCTTTTTCAATTGCC‑AAAAAACCAATACCTCATTATTAAAGCTTGCCATTCCGCTATGTACCGCATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGCGTTTGCAGATCTCaa > 1:183592/1‑275 (MQ=255) tGGCTTTTTCAATTGCCAAAAAAACCAATACCTCATTATTAAAGCTTGCCATTCCGCTATGTACCGCATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATAtcggttc > 2:288151/1‑148 (MQ=255) tttttCAATTGCCAAAAAAACCAATACCTCATTATTAAAGCTTGCCATTCCGCTATGTACCGCATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTg < 1:288156/148‑1 (MQ=255) cTCATTATTAAGGCTTGCCATTCCGCTATGTACCGCATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGAGTTTGCAGATCTCAAAGTTCGCGATGAAAAAACACTACCGTCATTAGgcg < 1:5790/275‑1 (MQ=255) tGCCATTCCGCTATGTACCGCATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGc > 1:126758/1‑131 (MQ=255) aTTCCGCTATGTACCGCATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGAt < 2:126757/131‑1 (MQ=255) tGTACCGCATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGAGTTTGCAGATCTCAAAGTTCGCGATGAAAAAACACTACCGt > 1:7955/1‑238 (MQ=255) tACCGCATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGAGTTTCCAGATCTCAAAGTTCGCGATGAAAAAACCACACCGTCATTAGTCTACACGTTATTCACCATACTGCTACCCCttc > 2:678292/1‑274 (MQ=255) cATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAactcaaccaagatatacaaaccactctcacgcgccatattcaattc > 2:108263‑M1/1‑61 (MQ=255) cATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACgg > 2:338787/1‑97 (MQ=255) cATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGAGTTTGCAGATCTCAAAGTTCGCGATGAAAAAACACTACCGTCATTAGGCGCAACGTTATTCACCATACTACTACCCATTGCGCTg > 1:89792/1‑275 (MQ=255) ttGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCANATCCGGCTNTTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGACTTTGCAGATCTCAAAGTTCGCGATGAAAAAacac < 1:481518/223‑1 (MQ=255) tGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATc > 1:143972/1‑125 (MQ=255) gATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAactcaaccaagatatacaaaccactctcacgcgccatattcaattcggca < 1:108264‑M1/107‑51 (MQ=255) gATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTg < 1:338793/97‑1 (MQ=255) ggCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTg < 2:143971/125‑1 (MQ=255) ggTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGt > 1:450280/1‑84 (MQ=255) ggTTCCTCCACATCCGGCTGCGTTATATGTTGCCAATAAactcaaccaagatatacaaaccactctcacgcgccatattcaattcggcaatcgttttaacca > 1:493881‑M1/1‑39 (MQ=255) gTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGTGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGAGTTTGCAGATCTCAAAGTTCGCGATGAAAAAACACTACCGTCATTAGGCGCAACGTTATTCACCa < 1:60283/232‑1 (MQ=255) cctccACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAactcaaccaagatatacaaaccactctcacgcgccatattcaattcggcaatcgttttaaccaacat < 2:493874‑M1/102‑68 (MQ=255) cctccACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTggg < 2:450273/84‑1 (MQ=255) ctccACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTg > 1:412169/1‑38 (MQ=255) ccACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCg > 1:42510/1‑100 (MQ=255) acaTCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGATGGgcg < 2:412162/38‑1 (MQ=255) aTCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTgg < 2:42510/100‑1 (MQ=255) ttATGTGTTGCCAATTAGCTGGGCGCAGATGTCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGAGTTTGCAGATCTCAAAGTTCGCGATGAAAAAACACTACCGTCATTAGGCGCAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTgaga < 1:60136/274‑1 (MQ=255) tGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTg > 2:360110/1‑61 (MQ=255) tGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGAGTTTGCAGATCTCATAGTTCGCGATGAAAAAACACTACCGTCATTAGGCGCAACg > 1:643039/1‑193 (MQ=255) gCCAATAAactcaaccaagatatacaaaccactctcacgcgccatattcaattcggcaatcgttttaaccaacatcag > 2:422762‑M1/1‑8 (MQ=255) ccgatgaGCTGGGGGCAGGTATAGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATTGCATCACTGATCTGTGGCCCACTTGTCCTTAAATTTCTGGGTCCACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGAGGTTGCAGATCTCAAATTTCGCGATGAAAAAACACTACCGTCATTAGGCGCAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGGTGGTTAAAACGATTGCAGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGGGTTGta < 2:183589/268‑1 (MQ=255) ccAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGCGAGCGCCTACGGCTTGCCGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCAATTTTCCTTCAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCGTGAAACTTGTACCCACAGAGTTTGCAGATCGCACAGGGCTCGATGAAGAAACACTACCGCCATTAGGCGCCCCGATATTCAGCATACTGATACCAATACAGCAGATATTGGTTAAAAAGATTACCGAATTGACTATGTCGAGTgatncggggtagtc > 2:60135/1‑262 (MQ=255) aaTAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATgg < 1:360116/61‑1 (MQ=255) aaTAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGAGTTTGCAGATCTCAAAGTTCGCGATGAAAAAACACTACCGTCATTAGGCGCAACGTTAt < 2:643030/193‑1 (MQ=255) aTAAactcaaccaagatatacaaaccactctcacgctccatattcaattcggcaatcgttttaaccaacatcagcgcaatgggtagcagtatggtgaataacgatgcgcctaatgacggtagtgttttttcatcgcgaactttgagatctgcaaactctgtgggtacaggtttaaagggcagtcgttgacccagaaatttaaggaaaagtgggccaccgatcagtgatgccatcagcccaaccagcaaaccgtagacgatcaccgaaccgatat < 1:440433‑M1/274‑271 (MQ=255) aTAAactcaaccaagatatacaaaccactctcacgcgccatattcaattcggcaatcgttttaaccaacatcagcgcactgggtagcagtatggtgaataacgttgcgcctaatgacggtagtgttttttcatcgcgaactttgagatctgcaaactctgtgggtacaggtttaaagggcagtcgttgacccagaaatttaaggaaaagtgggccaccgatcagtgatgccatcagcccaaccagcaaaccgtagacgatcaccgaaccgatat < 1:685938‑M1/274‑271 (MQ=255) aTAAactcaaccaagatatacaaaccactctcacgcgccatattcaattcggcaatcgttttaaccaacatcagcgca < 1:422769‑M1/78‑75 (MQ=255) aTAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGTTCGTCTACGGTTTGTTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGAGTTTGCAGATCTCAAAGTTCGCGATGAAAAAACACTACCGTCATTAGGCGCAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGGTTTGTatat < 1:588281/274‑1 (MQ=255) aTAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGAc > 2:109802/1‑108 (MQ=255) aaactcaaccaagatatacaaaccactctcacgcgccatattcaattgggcaatcgttttaaccaacatcagcgcaatgggtagcagtatggtgaataacgttgcgcctaatgacggtagtgttttttcatcgcgaactttgagatctgcaatctctgtgggtacaggtttaaagggcagtcgttgacccagaaagttaaggaaaagtgggccaccgatcagtgatgccatcagcccaaccagcaaaccgtagacgatcaccgaaccaaaaacta > 1:678301‑M1/1‑2 (MQ=255) | ACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGCGTCGTGCTATTGATTCCTCTGGCTTTTTCAATTGCCAAAAAAACCAATACCTCATTATTAAAGCTTGCCATTCCGCTATGTACCGCATTGATGGCAGTGCACTGCGTGGTTCCTCCACATCCGGCTGCTTTATATGTTGCCAATAAGCTGGGCGCAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGAGTTTGCAGATCTCAAAGTTCGCGATGAAAAAACACTACCGTCATTAGGCGCAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGGTTTGTATATCTT > CP009273/2471599‑2472107 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |