New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 2471834 | 30 (0.780) | 5 (0.140) | 5/292 | NT | 16.2% | coding (509/1338 nt) | dsdX | D‑serine transporter |
? | CP009273 | = 2472115 | 24 (0.670) | coding (790/1338 nt) | dsdX | D‑serine transporter |
CAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGAGTTTGCAGATCTCAAAGTTCGCGATGAAAAAACACTACCGTCATTAGGCGCAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGGTTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTATTATGTGTTGGGTATACGCCAGCATATGAGCATGGGGACGATGCTCACACATACGGAAAATGGCTTCGGTTCTATTGCTAATATTTTGCTGATTATCGGGGCCGGAGGCGCATTCAACGCCATTTTAAAAAGCAGCAGTCTCGCTGATACGCTGGCAGTTATTCTCTCCAATATGCATATGCACCCGATTCTTCTGGCCTGGTTAGT > CP009273/2471843‑2472371 | tagtttttggttcggtgatcgtctACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAACTTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGAGATTGCAGATCTCAAAGTTCGCGATGAAAAAACACTACCGTCATTAGGCGCAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCCAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGGTTTGTATATCTTGGTTGAGTtt > 1:678301‑M2/9‑273 (MQ=255) atatCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGAGTTTGCAGATCTCAAAGTTCGCGATGAAAAAACACTACCGTCATTAGGCGCATCGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGAGCGTGAGAGTGGTTTGTATATCTTGGTTGAGTttat < 1:440433‑M2/274‑5 (MQ=255) atatCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGAGTTTGCAGATCTCAAAGTTCGCGATGAAAAAACACTACCGTCATTAGGCGCAACGTTATTCACCATACTGCTACCCAGTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGGTTTGTATATCTTGGTTGAGTttat < 1:685938‑M2/274‑5 (MQ=255) tCACTTGTCGGAGGCCCACATTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCGCTTAAAACCTGTACATATAGAGTTTGGAGGTCTGAAAGTGCGCGATGAAAAAACACTATCACCATTAGTCGCAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATCGCGCTGATGTTGGTTAAAAAGCTTGCCGAATTGAATATGTCGCGTGAGCGAGGTTGGTATATCTAGATCGAGTTTAGTGTGAACCCTATAACTGCCATTGGTAACTCAGTGTTTGtgtttttttc > 2:247979/1‑266 (MQ=255) aggttggcctcTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAAAGGCTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGAGTTTGAAGATCTCAAAGTTCGCGATGAAAAAACACTACCGTCATTAGGCGCAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGGTTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTATTATGTGtt < 2:89791/263‑1 (MQ=255) aaagtttCCTTCGCTTTCTGTTTCAACTATTGACCTGTAAACCTGTACCCACAGAGTTTGCAGATCTCAAAGTTCGCGATGAAAAAACAATACCGTCATTAGGCGCAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGGTTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTATTATGTGTTGGGTATACGc < 2:149035/271‑1 (MQ=255) tGCAGATCTCAAAGTTCGCGATGAAAAAACACTACCGTCATTAGGCGCAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGAGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGATTTGAATATGGCGCGTGAGAGTGGGTAGTAACTCTTGGTTGTGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCTCCGTGTTTGTCGCCTATTATGTGTTGGGTATACGCCAACATCTGAGCATGGGTACGATGCTCACACAGACGGCAACTGACGTCTGCTCTAt > 2:155196/1‑273 (MQ=255) gATCTCAAAGTTCGCGATGAAAAAACACTACCGTCATTAGGCGCAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGGTTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTATTATGTGTTGGGTATACGCCAGCATATGAGCATGGGGACGATGCTCACACATACGGAAAATGGCTTCGGTTCTAt < 1:155199/269‑1 (MQ=255) tctcAAAGTTCGCGATGAAAAAACACTACCGTCATTAGGCGCAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGGTTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTATTATGTGTTGGGTATAc > 1:516080/1‑209 (MQ=255) tctcAAAGTTCGCGATGAAAAAACACTACCGTCATTAGGCGCAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGGGTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCAATGTTTATCGCCGGGTTTGTCGCCTATTATGTGTTGGGTATACGCCAGCATATGAGCATGGGGACGATGCTCCAACAGACGGAAAATGGCTTCGtttattttttttt > 2:573651/1‑263 (MQ=255) aaaGTTCGCGATGAAAAAACACTACCGTCATTAGGCGCAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGGTTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTATTATGTGTTGGGTATACGCCa < 2:516073/209‑1 (MQ=255) aTTAGGCGCAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGGTTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTATTATGTGTTGGGTATACGCCAg > 1:654378/1‑181 (MQ=255) ggCGCAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGGTTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTATTATGTGTTGGGTATACGCCAGCata < 2:654369/181‑1 (MQ=255) tGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGGTTTGTATATCTTGGTTGAGTttat < 1:422769‑M2/78‑5 (MQ=255) cTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGGTTTGTATATCTTGGTTGAGTttattggc > 2:422762‑M2/1‑70 (MQ=255) aTGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGGTTTGTATATCTTGGTTGAGTttattggcaacatataaagcagccggatgtggagg < 2:493874‑M2/102‑36 (MQ=255) tGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGGTTTGTATATCTTGGTTGAGTttattggcaacatataacgcagccggatgtggaggaacc > 1:493881‑M2/1‑63 (MQ=255) ggTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGGTTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTATTATGTGTTGGGTATACGCCAGc > 1:330388/1‑134 (MQ=255) gTTAAAACGATTGCCGAATTGAACATGGCGCGTGAGAGTGGTTTGTATATCTTGGTTGAGTttattggcaacatataaagcagccggatgtggaggaaccacgcagtgcactgccatcaatgcggtacatagcggaatggcaagctttgataatgaggtattggtttttttggcaattgaaaangccagaggaatcaatagcacgacgcccac < 1:485504‑M2/213‑153 (MQ=255) aaaaCGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGGTTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTATTATGTGTTGGGTATACGCCAGCatat < 2:330382/134‑1 (MQ=255) aaaCGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGCGTGGTTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTATTATGTGTTGGGTATACGCCAGCATATGAGCATGGGGACGATGCTCACACATACGGAAAATGGCTTCGGTTCTATTGCTAATATTTTGCTGATTATCGGGGCCGGAGGCGCATTCAACGCCATTTTa > 1:144815/1‑233 (MQ=255) gATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGGTTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTATTATGTGTTGGGTATACGCCAGCATATGAGCATGGGGACGATGCTCACACATACGGAAAATGGCTTCGGTTCTATTGCTAATATTTTGCTGATTATCGGGGCCGGAGGCGCATTCAACGCCATTTTaaaaa < 2:144814/233‑1 (MQ=255) aTTGCCGAATTGAATATGGTGCGTGAGAGTGGTTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTATTATGTGTTGGGTATACGCCAGAATATGAGCATGGGGACGATGCTCACACATACGGAAAATGGCTTCGGTTCTATTGCTAATATTTTGCTGATTATCGGGGCCGGAGGCGCATTCAACGCCATTTTAAAAAGCAGCAGTCTCGCTGATACGCTGGCAGTTATTCTCTCCAata < 1:573660/274‑1 (MQ=255) tGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGGTTTGTATATCTTGGTTGAGTttattggcaacatataaagcagccggatgtggaggaaccacgcagtgcactgccatc < 1:108264‑M2/107‑58 (MQ=255) gAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGGTTTGTATATCTTGGTTGAGTttattggcaacatataaagcagccggatgtggaggaaccacgcagtgcactgccatcaatg > 2:108263‑M2/1‑46 (MQ=255) gTGAGAGTGGTTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTg > 2:519082/1‑72 (MQ=255) gTGAGAGTGGTTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTg > 2:554455/1‑72 (MQ=255) gagTGGTTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGc < 1:554464/72‑1 (MQ=255) gagTGGTTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGc < 1:519089/72‑1 (MQ=255) ttttttttttGGTTGTGTTTATTGTCCTCCCTATTGCGGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTTGTATGTGTTGGGTATACGCCAGCATATGAGCATGTGGACGATGCTCACACATACGGAAAATGGCTTCGGTTCTATTGCTAATATTTTGCTGATTATCGGGGCCGGAGGCGCATTCAACGCCATTTTAAAAAGCAGCAGTCTCGCTGATACGCTGGCAGTTATTCTCTCCAATATGCATATGCACCCGATTCTTCTGGCCTGGTTAGt < 1:247984/266‑1 (MQ=255) cTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTATTAtgtg > 1:312428/1‑67 (MQ=255) cTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTATTATGTGTTGGGTATACGCCAGCATATGAGCATGGGGACGATGCTCACACATACGGAAAATGGCTTCGGTTCTATTGCTAATATTTTGCTGATTATCGGGGCCGGAGGCGCATTCAACGCCATTTTAAAAAGCAGCAGTCTCGCTGATACGCTGGCAGTTATtctct > 1:253619/1‑227 (MQ=255) gTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTATTATGTGTTgg < 2:312422/67‑1 (MQ=255) ttGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCtattat > 1:235941/1‑59 (MQ=255) gTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTATTATgtgt < 2:235936/59‑1 (MQ=255) | CAGATATCGGTTCGGTGATCGTCTACGGTTTGCTGGTTGGGCTGATGGCATCACTGATCGGTGGCCCACTTTTCCTTAAATTTCTGGGTCAACGACTGCCCTTTAAACCTGTACCCACAGAGTTTGCAGATCTCAAAGTTCGCGATGAAAAAACACTACCGTCATTAGGCGCAACGTTATTCACCATACTGCTACCCATTGCGCTGATGTTGGTTAAAACGATTGCCGAATTGAATATGGCGCGTGAGAGTGGTTTGTATATCTTGGTTGAGTTTATTGGCAACCCTATCACTGCCATGTTTATCGCCGTGTTTGTCGCCTATTATGTGTTGGGTATACGCCAGCATATGAGCATGGGGACGATGCTCACACATACGGAAAATGGCTTCGGTTCTATTGCTAATATTTTGCTGATTATCGGGGCCGGAGGCGCATTCAACGCCATTTTAAAAAGCAGCAGTCTCGCTGATACGCTGGCAGTTATTCTCTCCAATATGCATATGCACCCGATTCTTCTGGCCTGGTTAGT > CP009273/2471843‑2472371 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |