New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 3316282 = | 40 (1.040) | 7 (0.190) | 5/300 | NT | 16.2% | coding (1148/1338 nt) | glmM | phosphoglucosamine mutase |
? | CP009273 | 3316507 = | 34 (0.930) | coding (923/1338 nt) | glmM | phosphoglucosamine mutase |
CGGAAAAAAAC‑AGCAAAACCGATGTGTTCGCTGAGAAAAAAGGCGACAATCGCCGCCTTTTTAGCCAGTTATCTAACGCTTTAAACGGCTTTTACTGCATCGGCGATGCGGTGTGCAAATTCAGTCACCTGCGCTTCGTCTTCGCCTTCCACCATCACGCGAATTAACGGTTCGGTGCCGGATTTACGCAGCAACACGCG‑TCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGTTACGTGCCATCGCCGCCAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATCACATGACCGGAATTCTCTGCACCGATACGCCAGCCTTTCTCCTGCATTTTTTCCAGTACGTAGCGGTCACCCACTTTCGCGCGCGCAAATGGAATTCCTAACTGTTTCAG > CP009273/3316012‑3316550 | cGGAAAAAAAC‑AGCAAAACCGATGTGTTCGCTGAGAAAAAAGGCGACAATCGCCGCCTTTTTAGCGAGTTATCTAACGCTTTAAACGGCTTTTACTGGATCGGCGATGCGGTGTGCAAATTCAGTCACCTGCGCTTCGTCTTCGCCTTCCACCATCACGCGAATTAACGGTTCGGTGCCGGATTTACGCAGCAACACGCG‑TCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCt < 1:398976/275‑1 (MQ=255) gAAAAAAAC‑AGCAAAACCTATGTGTTCGCTGAGAAAAAAGGCGACAATCGCCGCCTTTTTAGCCAGTTATCTAACGCTTTAAACGGCTTTTACTGCATCGTCGATGCGGTGTGCAAATTCAGNCACCTGCGCTTCGTCTTCGCCTTCCACCATCACGCGAATTAACGGTTCGGTGCCGGATTTACGCAGCAACACGCG‑TCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTAc < 1:604533/275‑1 (MQ=255) aaaaCAAGCAGAACCGATGTATTCGCTGGAAAAAAAGGCGACATGTGGCGCGTTTTTATGCAGTTATCTAACGCTTTAAACGGCTTTTACGTAGCCGGCGATGCGGTGTGCAAATTCAGTCACCTGCGCTTCGTCTTCGCCTTCCACCAGCCCGCGAATTAACGGTTCGGTGCCGGATTTACGCAGCAACACGCG‑TCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTg < 2:128923/275‑1 (MQ=255) aC‑AGCAAAACCGATGTGTTCGCTGAGAAAAAAGGCGACAATCGCCGCCTTTTTAGCCAGTTATCTAACGCTTTAAACGGCTTTTACTGCATCGGCGATGCGGTGTGCAAATTCAGTCACCTGCGCTTCGTCTTCGCCTTCCACCATCACGCGAATTAACGGTTCGGTGCCGGATTTACGCAGCAACACGCG‑TCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGgt < 1:2835/275‑1 (MQ=255) ttCGCTGAGAAAAAAGGCGACAATCGCCGCCTTTTTAGCCAGTTATCTAACGCTTTAAACGGCTTTTACTTCATCGGCGATGCGGTGTGCAAATTCAGTCACCTGCGCATCGTCTTCGCCTTCCACCATCACGCGAATTAACGGTTCGGTGCCGGATCTACGCAGCAACACGCG‑TCCACGGTTGCCCTGCGCAGCTTCAACCTCTCCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGCTCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAAccc > 1:671995/1‑274 (MQ=255) aaGGCGACAATCGCCGCCTTTTTAGCCAGTTATCTAACGCTTTAAACGGCTTTTACTGCATCGGCGATGCGGTGTGCAAGTTCAGTCACCTGCGCTTCGTCTTCGCCTTCCACCATCACGCGCATTAACGGTTCTGTGCCGGATTTACGCAGCAACACGCG‑TCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGaa < 1:684205/275‑1 (MQ=255) tgccgccTTTTTAGCCAGTTATCTAACTCTTTTAACGGC‑TTTACTGCATCGGCGATACGGTGTGCAAATTCAGTCTCCTGCGCTTCGTCTTCGCCTTCCACCATCACGCGAATTAGCGGTTCGGTGCCGGATTTACGCAGCAACACGCG‑TCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGcc < 1:222182/274‑1 (MQ=255) aGTTATCTAACGCTTTAAACGGCTTTTACTGCATCGGCGATGCGGTGTGCAAATTCAGTCACCTGCGCTTCGTCTTCGCCTTCCACCATCACGCGAATTAACGGTTCGGTGCCGGATTTACGCAGCAACACGCG‑TCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTg < 1:707233/275‑1 (MQ=255) gTTATATAACGATGTAAAAGGCGTTTACTTCATCGGCGATGCGTGGTGAAAATTCTGGCACCTGCGCTGTGGCTTCTCCTTCCACCAGCACGCGAAGTAACGGTTCGGTGCCGGAGTTACGCAGCAACACGCG‑TCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCCTGCTCAAGTGGATCGCCGCGACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTg < 2:615200/274‑1 (MQ=255) ttATCTAACGCTTTAAACTGCTTTTACTGCATCGGCGATGCGGTGTGCAAATTCAGTCACCTGCGCTTCGTCTTCGCCTTCCACCATCACGCGAATTAACGGTTCGGTGCCGGATTTACGCAGCAACACGCG‑TCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCa < 1:30762/275‑1 (MQ=255) tATTTAACGCTGTAAACGTCTTTGATTTCCTCGGCGATGCGGTTTTCAAATTCAGTCACCTGCGCTTCGTCTTCGCCTTCCACCATCCCGCGAATTAACGGTTCGGTGCCGGATTTACGCAGCAACACGCG‑TCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCa < 2:637183/274‑1 (MQ=255) cTTTAAACGGCTTTTACTGCATCGGCGATGCGGTGTGCAAATTCAGTCACCTGCGCTTCGTCTTCGCCTTCCACCATCACGCGAATTAACGGTTCGGTGCCGGATTTACGCAGCAACACGCG‑TCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCGCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACCCATGCTCAAGTGGAGCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCACTGCAAAGGTCGTGAAGGCACatat > 1:588240/1‑274 (MQ=255) tAAACGGCTTTTACTGCATCGGCGATGCGGTGTGCAAATTCAGTCACCTGCGCTTCGTCTTCGCCTTCCACCATCACGCGAATTAACGGTTCGGTGCCGGATTTACGCAGCAACACGCG‑TCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATcgc > 2:20355/1‑190 (MQ=255) cGGCTTTTACTGCATCGGCGATGCGGTGTGCAAATTCAGTCACCTGCGCTTCGTCTTCGCCTTCCACCATCACGCGAATTAACGGTTCGGTGCCGGATTTACGCAGCAACACGCG‑TCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCt < 1:20355/190‑1 (MQ=255) tgCAAATTCAGTCACCTGCGCTTCGTCTTCGCCTTCCACCATCACGCGAATTAACGGTTCGGTGCCGGATTTACGCAGCAACACGCG‑TCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATcgccg > 1:411308/1‑160 (MQ=255) aaTTCAGTCACCTGCGCTTCGTCTTCGCCTTCCACCATCACGCGAATTAACGGTTCGGTGCCGGATTTACGCAGCAACACGCG‑TCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGACGCTAc < 2:411301/160‑1 (MQ=255) ggcgatcagatcatgtatatcatcgcgcgtgaaggtcttcgtcagggccagctgcgtggtggcgctgtgggtacattgatgagcaacatggggcttgaactggcgctgaaacagttaggaattccatttgcgcgcgcgaaagtgggtgaCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGTTACGTGCCATCGCCGCCAGCACCTCCAAGCCCGCAACGATg < 1:58237‑M1/126‑1 (MQ=255) cTGCGCTTCGTCTTCGCCTTCCACCGTCACGCGAATTAACGGTTCGGTGCCGGATGTACGCAGCAACACGCG‑TCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGTTACGTGCCATCGCCGCCAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCAc < 1:449508/275‑1 (MQ=255) cTTCGTCTTCGCCTTCCACCATCACGCGAATTAACGGTTCGGTGCCGGATTTACGCAGCAACACGCG‑TCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGNCTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGTTACGTGCCATCGCCGCCAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCAc < 1:611331/270‑1 (MQ=255) cGCCTTCCACCATCACGCGAATTAACGGTTCGGTACCGGATTTACGCAGCAACACGCG‑TCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGTTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTa > 2:345589/1‑134 (MQ=255) cgcgcgtgaaggtcttcgtcagggccagctgcgtggtggcgctgtgggtacattgatgagcaacatggggcttgaactggcgctgaaacagttaggaattccatttgcgcgcgcgaaagtgggtgac < 1:9805‑M1/1‑1 (MQ=255) ttCCACCATCACGCGAATTAACGGTTCGGTACCGGATTTACGCAGCAACACGCG‑TCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGTTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTg < 1:345595/134‑1 (MQ=255) tgcaaacaccccgcgATTTAACGGGTCGGGGCCGGGTTTCACCAGCAAC‑CGTGTTCCCCGGTTTCCCGGCGTCGCTTCAAACTCGGCGGTCACGGCTTGAACGGACTCACGTGCAAGTGGATGGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTGCATGCCGCTGCAAATGTCGTGCAGGCTCATATGGTTACGGGCCATCGCCGCCAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATcc < 2:671986/263‑1 (MQ=255) cgtgaaggtcttcgtcagggccagctgcgtggtggcgctgtgggtacattgatgagcaacatggggcttgaactggcgctgaaacagttaggaattccatttgcgcgcgcgaaagtgggtgaCCGCt > 2:9805‑M1/123‑127 (MQ=255) cACGCGAATTAACGGTTCGGTGCCGGATTTACGCAGCAACACGCG‑TCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGt > 2:256844/1‑182 (MQ=255) aCGCGGATTAACGGTTCGTTGCCGGATTTACGCAGCAACACGCG‑TCAACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGTTACGTGCCATCGCCGCCAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATcac < 1:116403/275‑1 (MQ=255) cgcgAATTAACGGTTCGGTGCCGGATTTACGCAGCAACACGCG‑TCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGc > 2:43581/1‑171 (MQ=255) gcgAATTAACGGTTCGGTGCCGGATTTACGCAGCAACACGCG‑TCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGTTACGTGCCATAGACGCCAGCACCTACAAGCCCGCAACGATGCCGGCACCGGGAGGAGGTTTATCTANAAGGATgaccg > 2:69837/1‑273 (MQ=255) cgAATTAACGGTTCGGTGCCGGATTTACGCAGCAACACGCG‑TCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTg < 1:256849/182‑1 (MQ=255) aaTTAACGGTTCGGTGCCGGATTTACGCAGCAACACGCG‑TCCACGGTTGCCNAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATAAGGTTACGTGCCATCGGCGCCAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATg < 1:529674/235‑1 (MQ=255) aaTTAACGGTTCGGTGCCGGATTTACGCAGCAACACGCG‑TCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCa < 1:43581/171‑1 (MQ=255) aaCGGTTCGGTGCCGGATTTACGCAGCAACACGCG‑TCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGGACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGTTACGTGCCATCGCCGCCAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCAGTCACCGGTAGGCGTTTTATCCCGCAGGCTCACCTTAccag > 2:207907/1‑272 (MQ=255) ggccagctgcgtggtggcgctgtgggtacattgatgagcaacatggggcttgaactggcgctgaaacagttaggaattccatttgcgcgcgcgaaagtgggtgaCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCGAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGTTACGTGCCATCGCCGCCAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATCACATGACCGGaa < 1:590387‑M1/171‑1 (MQ=255) ggTTCGGTGCCGGATTTACGCAGCAACACGCG‑TCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTa > 2:181882/1‑119 (MQ=255) cGGTGCCGGATTTACGCAGCAACACGCG‑TCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAacgt < 1:181885/119‑1 (MQ=255) cGGTGCCGGATTTACGCAGCAACACGCG‑TCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGTNACGTGCCATCGCCGCCAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGGAGTTTTATCCAGCAGGACCACATGCCCGGAAATctct > 1:514619/1‑275 (MQ=255) ggATTTACGCAGCAACCCGCG‑GCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGTTACGTGCCATCGCCGCCAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATCACATGACCGGAATTCTCTGCACCGa < 1:207911/275‑1 (MQ=255) aCGCAGCAACTCGCG‑TCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCTCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTNCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGTTACGTGCCATCGCCGCCAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATCACATGACCGGAATTCTCTGCACCGATACGcc < 1:605978/275‑1 (MQ=255) tacattgatgagcaacatggggcttgaactggcgctgaaacagttaggaattccatttgcgcgcgcgaaagtgggtgaCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGTTACGTGCCATCGCCGCCAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATCACATGACCGGAATTCTCTGCACCGATACGCCAGCCtt < 1:189548‑M1/196‑1 (MQ=255) ctccatggggcttgacctggcgctgaaacagttaggaattccttttgcgcgcgcgaaagtgggtgaCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGTTACGTGCCATCGCCGCCAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATCACATGACCGGAATTCTCTGCACCGATACGCCAGCCTTTCTCCTGCAttt > 2:189545‑M1/67‑274 (MQ=255) aacgtggggcttgtactggcgctgaaacagttaggaattccatgtgcgcgcgcgaaagtgggggaCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGTTACGTGCCATCGCCGCCAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCTGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATCACATGACCGGAATTCTCTGCACCGATACGCCAGCCTTTCTCCTGCAtttt > 1:397715‑M1/66‑274 (MQ=255) aaacgggggcncaaaatggcgctgaaacagttaggaattccatttgcgcgcgcgaaagtgggtgaCCGTTACCTGCGGGGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGGGCAGGCTCATAGGGTTACGTGCCATCGCCGCCAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATCACATGACCGGAATTCTCTGCACCGATACGCCAGCCTTTCTCCTGCAtttt > 2:58236‑M1/66‑274 (MQ=255) aaaagggggatggtactggcgctgaaacagttaggaattccatttgcgcgcgcgaaagtgggtgaCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGTTACGTGCCATCGCCGCCAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATCACATGACCGGAATTCTCTGCACCGATACGCCAGCCTTTCTCCTGCAtttt > 2:590378‑M1/66‑274 (MQ=255) acatggggcttgaactggcgctgaaacagttaggaattccatttgcgcgcgcgaaagtgggtgac > 2:437821‑M1/65‑65 (MQ=255) ttGCCAAGCCCAANNTCAACCTCTGAGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGGGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTGCAGGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGTTACGTGCCATCGCCGCCAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATCACATGACCGGAATTCTCTGCACCGATACGCCAGCCTTTCTCCTGCATTTTTTc < 2:514612/275‑1 (MQ=255) cccAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGTTACGTGCCATCGCCGCCAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGATAGTAGTTTTATCCAGCAGGATCACATGACCGGAATTCTCTGCACCGATACGCCAGCCTTTCTCCTgtcccttaaacac > 1:714625/1‑263 (MQ=255) gcgcAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGTTACGTGCCATCGCCGCCAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATCACATGACCGGAATTCTCTGCACCGATACGc < 2:714615/245‑1 (MQ=255) cgcAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGTTACGTGCCATCGCCGCCAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATc > 1:10192/1‑214 (MQ=255) gCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGTTACGTGCCATCGCCGCCAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATCACAt < 2:10192/214‑1 (MQ=255) gCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGATCGTGCAGGCTCATATGGTTACGTGCCATCGCCGCCATCa > 2:712057/1‑136 (MQ=255) tAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGTTACGTGCCATCGCCTCCAGCACCTg < 1:712067/136‑1 (MQ=255) cTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCNTGCAGGCTCATATGGTTACGTGCCATCGCCGCCAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATCACATGACCGGAATTCTCTGCACCGATACGCCAGCCTTTCTCCTGCATTTTTTCCAGTACGTAGCCGTCACCCACTTTCCCGCGCGCAAATGGa < 1:533306/275‑1 (MQ=255) gACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCatat > 2:265066/1‑103 (MQ=255) cATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGtt < 1:265071/103‑1 (MQ=255) gATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGTTACGTGCCATCGCCGCCAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATCACATGAc > 1:158186/1‑171 (MQ=255) aTCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGTTACGTGCCATCGCCGCCAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATCAAATGCCCGGAATTCTCTGCACCGATCCGCCAGCCTTTCTCCTGCATTTTTTCCCGTACGTAGCGGTCACCCACTTTCGCGCGCTNCAATGGACTTCCTCACtttattta > 2:461864/1‑266 (MQ=255) gccgcTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGTTACGTGCCATCGCCGCCAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATCACATGACCGGa < 2:158183/171‑1 (MQ=255) | CGGAAAAAAAC‑AGCAAAACCGATGTGTTCGCTGAGAAAAAAGGCGACAATCGCCGCCTTTTTAGCCAGTTATCTAACGCTTTAAACGGCTTTTACTGCATCGGCGATGCGGTGTGCAAATTCAGTCACCTGCGCTTCGTCTTCGCCTTCCACCATCACGCGAATTAACGGTTCGGTGCCGGATTTACGCAGCAACACGCG‑TCCACGGTTGCCCAGCGCAGCTTCAACCTCTGCGGTCACGGCTTTAACTGACTCATGCTCAAGTGGATCGCCGCTACCTGCGGTGTAACGTACGTTAACCAGAATCTGCGGGAACATTTTCATGCCGCTGCAAAGGTCGTGCAGGCTCATATGGTTACGTGCCATCGCCGCCAGCACCTGCAAGCCAGCAACGATGCCGTCACCGGTAGTAGTTTTATCCAGCAGGATCACATGACCGGAATTCTCTGCACCGATACGCCAGCCTTTCTCCTGCATTTTTTCCAGTACGTAGCGGTCACCCACTTTCGCGCGCGCAAATGGAATTCCTAACTGTTTCAG > CP009273/3316012‑3316550 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |