New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 3771292 = | 44 (1.140) | 4 (0.110) | 4/308 | NT | 7.7% | coding (534/1656 nt) | lldP | L‑lactate permease |
? | CP009273 | 3771695 = | 53 (1.410) | coding (937/1656 nt) | lldP | L‑lactate permease |
GTGTTCGTCTATAAGATCTCGGTGAAAACCGGGCAGTTTGACATCATTCGCTCGTCTATTCTTTCGATAACCCCTGACCAGCGTCTGCAAATGCTGATCGTCGGTTTCTGTTTCGGCGCGTTCCTTGAAGGAGCCGCAGGCTTTGGCGCACCGGTAGCAATTACCGCCGCATTGCTGGTCGGCCTGGGTTTTAAACCGCTGTACGCCGCCGGGCTGTGCCTGATTGTTAACACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTGCTGTTCTGGATCATGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGT > CP009273/3771020‑3771551 | gtgtTCGTCTATAAGATCTCGGTGAAAACCGGGCAGTTTGACATCATTCGCTCGTCTATTCTTTCGATAACCCCTGACCAGCGTCTGCAAATGCTGATCGTCGGTTTCTGTTTCGGCGCGTTCCTTGAAGGAGCCGCAGGCTTTGGCGCACCGGTAGCAATTACCGCCGCATTGCTGGTCGGCCTGGGTTTTAAACCGCTGTACGCCGCCGGGCTGTGCCTGATTGTTAACACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTgg > 1:414542/1‑274 (MQ=255) tgtataAGATCTCGGTGAAATCCGGGCAGTTTGACATCATTCGCTCGTCTATTCTTTCGATAACCCCTGACCAGCGTCTGCAAATGCTGATCGTCGGTTTCTGTTTCGGCGCGTTCCTTGAAGGAGCCGCAGGCTTTGGCGCACCGGTAGCAATTACCGCCGCATTGCTGGTCGGCCTGGGTTTTAAACCGCTGTACGCCGCCGGGCTGTGCCTGATTGTTAACACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGa < 1:233228/273‑1 (MQ=255) atTCGCTCGTCTATTCTTTCGATAACCCCTGACCAGCGTCTGCAAATGCTGATCGTCGGTTTCTGTTTCGGCGCGTTCCGTGAAGGAGCCGCAGTCTTTGGCGCACCGGTAGCAATTACCGCCGCATTGCTGGTTGGCCTGGGTTTTCAACCGCTGTACGCCGCCGGGCTGTGCCTGATTGTTAACACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGAt < 1:713037/275‑1 (MQ=255) ttCGCTCGTCTATTCTTTCGATAACCCCTGACCAGCGTCTGCAAATGCTGATCGTCGGTTTCTGTTTCGGCGCGTTCCTTGAAGGAGCCGCAGGCTTTGGCGCACCGGTAGCAATTACCGCCGCATTGCT‑GTCGGCCTGGGTTTTAAACCGCTGTACGCCGCCGGGCTGTGCCTGATTGTTAACACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCCATCCAATCCTGGTTTCCGGACCGGTAACAGGTATCGCACGCTTTGCTATTGGTGAGAt > 2:190002/1‑273 (MQ=255) cgtcgGTTTTTGTTTCGGCGCGTTCCGTGAAGGGGCCGCAGGCTTTGGCGCACCGGTAGCAATTACCGCCGCATTGCT‑GTCGGCCTGGGTTTTAAACCGCTGTACGCCGCCGGGCTGTGCCTGATTGTTAACACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTGCTGTTCTGGATCATgg < 1:190005/274‑1 (MQ=255) cgTTTCTTGAAGGAGCCGCAGGCTTTGGCGCACTGGTAGCAATTACCGCCGCATTGCTGGTCGGCCTGGGTTTTAAACCGCTGTACGCCGCCGGGCTGTGCCTGATTGTTAACACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTGCTGTTCTGGATCATGGCGATTATGGACGGCTGgcg < 1:397992/274‑1 (MQ=255) ttCCTTGAAGGAGCCGCAGGCTTTGGCGGACCGGTAGCAATTACCGCCGCATTGCTGGTCGGCCTGGGTTTTAAACCGCTGTACGCCGCCGGGCTGTGCCTGATTGTTAACACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGc > 1:559081/1‑158 (MQ=255) ttCCTTGAAGGAGCCGCAGGCTTTGGCGCACCGGTAGCAATTACCGCCGCATTGCTGGTCGGCCTGGGTTTTAAACCGCTGTACGCCGCCGGGCTGTGCCTGATTGTTAACACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTAAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTGCTGTTCTGGATCATGGGGATTATGGACGGCTGGCGCgg > 1:697458/1‑275 (MQ=255) ttGAAGGAGCCGCAGGCTTTGGCGAACCGGTAGCAATTACCGCCGCATTGCTGGTCGGCCTGGGTTTTAAACCGCTGTACGCCGCCGGGCTGTGCCTGATTGTTAACACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGa < 2:559072/158‑1 (MQ=255) ccGCAGGCTTTGGCGCACCGGTAGCAATTACCGCCGCATTGCTGGTCGGCCTGGGTTTTAAACCGCTGTACGCCGCCGGGCTGTGCCTGATTGTTAACACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGCTTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTCTCGTGCTGTTCTGGATCATGGCGATTATGGACGGCAGGCGCGGTATCAAAGAGACg > 1:147423/1‑275 (MQ=255) ccGCAGGCTTTGGCGCACCGGTAGCAATTACCGCCGCATTGCTGGTCGGCCTGGGTTTTAAACCGCTGTACGCCGCCGGGCTGTGCCTGATTGTTAACACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATc > 1:587485/1‑221 (MQ=255) cgcgGGCTTGGGCGCCCCCGTAGCAATTCCCGCCGCATGGCTGTTCGGCCTGGGTTTTAAACCGCTGTACGCCGCCGTGCTGTTCTTGATTGTTAACACCGCGGCAGTGGCATTGGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTGCTGTTCTGGATCATGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAAGAGACg < 2:237584/274‑1 (MQ=255) aGGCTTTGGCTCACCGGTAGCAATTACCGCCGCATTGCTGGTCGGCCTGGGTTTTAAACCGCTGTACGCCGCCGGGCTGTGCCTGATTGTTAACACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTGc < 2:587476/221‑1 (MQ=255) ttGCTGGTCGGCCTGGGTTTTAAACCGCTGTACGCCGCCGGGCTGTGCCTGATTGTTAACACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTGCTGTTCTGGATCATGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCaaa < 1:428734/231‑1 (MQ=255) tacggcaccggaatattgatcacccactcatacagcgcgccacccgatgcgaacagggctttaaacggcgggatactccacagtgttacGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTGCTGTTCTGGATCATgg < 2:55625‑M1/101‑1 (MQ=255) gcaccggaatattgatcacccactcatacagcgcgccacccgatgcgaacagggctttaaacggcgggatactccacagtgttacGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTGCTGTTCTGGATCATGGCGAt > 1:55625‑M1/86‑190 (MQ=255) tAAACCGCTGTACGCCGCCGGGCTGTGCCTGATTGTTAACACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTAt > 1:221640/1‑162 (MQ=255) ccGCTGTACGCCGCCGGGCTGTGCCTGATTGTTAACACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTg < 2:221635/162‑1 (MQ=255) cacccactcatacagcgcgccacgcgatgcgaacagggctttaaacggcgggatactccacagtgttacGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAg < 1:487327‑M1/61‑1 (MQ=255) cgttgggCTGTGCCTGATTGTTTACTCCTCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGTNGGGGCGGCAGTTACCGTTTATGTCCATGATCGTGCTGTTCTGGATCATGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCgg < 1:653802/271‑1 (MQ=255) cgccgGGCTGTGCCTGATTGTTAACACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGTGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTGCTGTTCTGGATCATGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAATGAGACGTTGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGttt > 1:686642/1‑235 (MQ=255) cgccgGGCTGTGCCTGATTGTTAACACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGc > 2:182536/1‑72 (MQ=255) cactcatacagcgcgccacccgatgcgaacagggctttaaacggcgggatactccacagtgttacGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTAc > 2:487320‑M1/66‑130 (MQ=255) ctgggCTGGGCCTGATTGTTAACACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTGCTGTTCTGGATCATGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAg < 1:338846/273‑1 (MQ=255) gggCTGTGCCTGATTGTTAACACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGa < 1:182539/72‑1 (MQ=255) tgCCTGATTGTTAACACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGacag > 2:622225/1‑69 (MQ=255) cgCCTGATTGTTAACACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTAt > 1:24642/2‑137 (MQ=255) tGATTGTTAACACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGacaggtaa < 1:622234/69‑1 (MQ=255) tGATTGTTAACACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTg < 2:24642/137‑1 (MQ=255) aaCACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACCGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTGCTGTTCTGGATCATGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTCTCAAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGAGTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTAgctcc > 1:696797/1‑272 (MQ=255) cgcgCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTg > 2:137833/1‑74 (MQ=255) gggcCAGTGGGATGTGGTGCGATGGGGATTCCAAGCCGGGTTGCGGGACAGGTAACAGGTATCGAAAGCTTTGAGATTGGGCAGATGGGGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTGCTGTTCTGGATCATGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCGCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTgg < 1:124752/272‑1 (MQ=255) gcgcCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGacaggtaacaggta > 2:227334/1‑61 (MQ=255) gcgcCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGCGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCCTTATCGTGCTGTTCTGGATCCTGGCGATTATGGACGGCTGCCGCGGTATCAACGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGTTGGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCGCAGTACCTTCTCTCTACTTTCATTGGGCGGGGGCGTCCGTGCATTGtctccctcgcgct > 2:124751/1‑266 (MQ=255) gcgcCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTAt > 1:172857/1‑119 (MQ=255) gcgcCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTGCTGTTCTGGATCATGTCGATTATGGACGGNTGGCGCGGTATCAAAGAGACGTGGCCTGCGTTCGTGGTTGCGGGCGTCTCGTTTg > 1:608042/1‑208 (MQ=255) gcgcCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTGCTGTTCTGGATCATGGCGATTATGAACGGCTGGCGNGGTATAAAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTTCCATCGCTCAGTACCTTATCTCTAAATTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTAAATCTTCTCTg > 1:648220/1‑273 (MQ=255) cgcCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCCGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGggcg > 1:532616/1‑94 (MQ=255) ccAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGAt < 1:137834/74‑1 (MQ=255) cAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGa < 1:119194/44‑1 (MQ=255) cAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGa < 1:227339/61‑1 (MQ=255) cAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTg < 2:172854/119‑1 (MQ=255) aGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAg < 2:532608/94‑1 (MQ=255) tGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTGCTGTTCTGGATCATGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCCACGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGTTATCa > 1:120863/1‑272 (MQ=255) aTGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTg > 2:81916/1‑52 (MQ=255) ttgggaTTCCTATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTGCTGTTCTGGATCATGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTg < 1:326032/270‑1 (MQ=255) ggCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTGCTGTTCTGGATCATGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCCCTTCGCCGGTATCCCTGCTCTGCCTGTCGCTGt > 2:712910/1‑274 (MQ=255) gCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGAt < 1:81917/52‑1 (MQ=255) tCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAg > 2:658024/1‑70 (MQ=255) aTCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTAc < 1:658033/70‑1 (MQ=255) tCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTGCTGTTCTGGATCATGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAAGAGACGTGGCCTGCg > 1:614168/1‑149 (MQ=255) GGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTGCTGTTCTGGATCATGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAAGAGACGTGGCCTGCGGTCg > 2:614159‑M1/1‑149 (MQ=255) | GTGTTCGTCTATAAGATCTCGGTGAAAACCGGGCAGTTTGACATCATTCGCTCGTCTATTCTTTCGATAACCCCTGACCAGCGTCTGCAAATGCTGATCGTCGGTTTCTGTTTCGGCGCGTTCCTTGAAGGAGCCGCAGGCTTTGGCGCACCGGTAGCAATTACCGCCGCATTGCTGGTCGGCCTGGGTTTTAAACCGCTGTACGCCGCCGGGCTGTGCCTGATTGTTAACACCGCGCCAGTGGCATTTGGTGCGATGGGCATTCCAATCCTGGTTGCCGGACAGGTAACAGGTATCGACAGCTTTGAGATTGGTCAGATGGTGGGGCGGCAGCTACCGTTTATGACCATTATCGTGCTGTTCTGGATCATGGCGATTATGGACGGCTGGCGCGGTATCAAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGT > CP009273/3771020‑3771551 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |