New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 3771292 = | 44 (1.140) | 4 (0.110) | 4/308 | NT | 7.7% | coding (534/1656 nt) | lldP | L‑lactate permease |
? | CP009273 | 3771695 = | 53 (1.410) | coding (937/1656 nt) | lldP | L‑lactate permease |
GCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGACGCTGGCCCACACCGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGTGGCGCGCTGTATGAGTGGGTGATCAATATTCCGGTGCCGTACCTCGATAAACTGGTTGCCCGTATGCCGCCAGTGGTCAGCGAGGCTACAGCCTATGCCGCCGTGTTTAAGTTTGACTGGTTCTCTGCCACCGGCACCGCCATTCTGTTTGCTGCACTGCTCTCGATTGTCTGGCTGAAGATGAAACCGTCTGACGCTATCAGCACCTTCGGCAGCAC > CP009273/3771430‑3771960 | gCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGGCATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATCTGACGCTGGCCCACACCGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAacacct > 1:32548/1‑272 (MQ=255) gcTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGACGCTGGCCCACACCGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGcc < 1:309507/275‑1 (MQ=255) tccGCTCAGTACTTTATCTCTTCCTTCCTTGGCCCGGCGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCCCTGCTCTGCCTGCCGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCTTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGACGCTGGCCCACACCGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCa < 2:653261/271‑1 (MQ=255) aCCTTTGCTTTATTTTCATTGGGCCGGATCTGCCCGACTTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTTACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGACGCTGGCCCACACCGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGTGgcgcg < 1:306181/275‑1 (MQ=255) ccTGAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGGGTTGCCGGACATTATCTCTTCGCTTGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGGGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGACGCTGGCCCACACCGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGTGgcgcg < 1:253177/274‑1 (MQ=255) ctctAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGACGCTGGCCCACACCGGTTACACTGGGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCATGTTCCTGAAAGCTACCGTAACCCTGTGGAGTAGCACGCCGGTTGAAGGCCTGTTCGGAGCGGGTGGCGAGCGGttgg > 2:306175/1‑272 (MQ=255) ctAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAACCGCTGGCCGCCAGTGCGTGTCTTCCGTTTTGGTGCTTTGGGGGCGTCCCAGGTTGATATGACGCTGGCCCACCCCGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGACTGGACACCTGTCCTGATCCTGCCAGCACCCGTAACACTGTGGAGTATACCGCCGTTTAAAGCCCGTTTCGCCTCGGGTggtccgatgtgttc > 2:253172/1‑262 (MQ=255) cATTATTTCTTCGCTTGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGACGCTGGCCCACACCGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGTGGCGCGCTGTATGAGTGGGTGATCAATATTCCGGTGCCGTAc < 1:187257/274‑1 (MQ=255) aTTTTCTCTTCGTTGGTATCTCTGCTCTTCCTGACGTTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGCTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGACGCTGGCCCACACCGGTTACACTGCTGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGTGGCGCGCTGTATGAGTGGGTGATCAATATTCCGCTGCCGTACCt < 1:719313/275‑1 (MQ=255) ctTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGACGCTGGCCCACACCGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGAATCGGGTGGCGGGCTGTATGGGTGGGTGATCAATAGTCCGGTGCCGGACCCCGGTaaa > 2:719303/1‑275 (MQ=255) 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tGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGACGCTGGCCCACACCGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGTGGCGCGCTGTATGAg < 1:278588/185‑1 (MQ=255) tATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGACGCTGGCCCACACCGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGTGgcg < 1:71328/168‑1 (MQ=255) tttGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGACGCTGGCCCACACCGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGTGGCGCGCTGTATGAGTGGGTGATCAATATTCCGGTGCCGTCCCTCGATAAACTgg > 2:167123/1‑211 (MQ=255) atcgccatgatccagaacagcacgataatggtcataaacggtagctgccgccccaccatctgaccaatctcaaagctgtcgatacctgttacctgtccggcaaccGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGTGGCGCGCTGTATGAGTGGGTGATCAATATTCCGGTGc > 1:55625‑M2/106‑190 (MQ=255) gTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGACGCTGGCCCACACCGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGTGGCGCGCTGTATGAGTGGGTGATCAATATTCCGGTGCCGTACCTCGATAAACTGGTTGc < 1:167126/211‑1 (MQ=255) ccatgatccagaacagcacgataatggtcataaacggtagctgccgccccaccatctgaccaatctcaaagctgtcgatacctgttacctgtccggcaaccGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGTGGCGCGCTGTATGAGTGGGTGATCAATATTCCGGTGCCGTa < 2:55625‑M2/89‑1 (MQ=255) aTTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGACGCTGGCCCACACCGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTaa > 2:646630/1‑105 (MQ=255) gggggCGTCACAGGTTGATATGACGCTGGCCCACACCGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACt < 1:646639/105‑1 (MQ=255) gTCACAGGTTGATATGACGCTGGCCCACACCGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGTTGCGCGCTGTATGAGTGGGTGATCAATATTCCGGTGCCGTACCTCGATAAACTGGTTGCCCGTATGCCGCCAGTGGTCAGCGAGGCTACAGCCTATGCCGGCGTGTTGAAGTTTGACTGGTTCTCTGCCACCgtcc > 2:596750/1‑272 (MQ=255) ttttGACGCTGGCCAACACCGGTTACACTGCTGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGNAACACTGTNGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGTGGCGCGCTGTATGAGTGGGTGATCAATATTCCGGTGCCGTACCTCGATAAACTGGTTGCCCGTATGCCGCCAGTGGTCAGCGAGGCTACAGCCTATGCCGCCGTGTTTAAGCTTGACTGCTTCTCTGCCACCGGCACCGCCATTCt < 1:479364/271‑1 (MQ=255) atGACGCTGGCCCACACCGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCNTCGGGTGGCGCGCTGTATGAGTGGGTGATCAATATTCCGGTGCCGTACCTCGATAAACTGGTTGCCCGTATGCCGCCAGTGGTCAGCGAGGCTACAGCCTATGCCGCCGTGTTTAAGTTTGACTGGTTCTCTGCCACCGGCACCGCCATTCt < 1:596759/272‑1 (MQ=255) acacagggCCCACACCGGTTCCACGGCGGTTCAGTTGTTACGTGCCTGGCTACCGTTCCTGTGCCGGACAGCTACCTTAACACTGTGGAGTAGCCCGCCGGTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGTGGCGCGCTGTATGAGTGGGTGATCAATATTCCGGTGCCGTACCTCGATAAACTGGTTGCCCGTATGCCGCCAGTGGTCAGCGAGGCTACAGCCTATGCCGCCGTGTTTAAGTTTGACTGGTTCTCTGCCACCGGCACCGCCATTCTGtt < 2:320746/267‑1 (MQ=255) gCTGGCCCACACCGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGTGGCGCGCTGTATGAGTGGGTGATCAATATTCCGGTGCCGTCCCTCGATAAACTGGTTGCCCGTATGCCGCCAGTGGTCAGCGAGGCTACAGCCTAAGGCGCCGTGTTTAAGTTTGACTGGTTCGCGTCACCCGGCACCTCCCTTCTtttttgtg > 2:322848/1‑271 (MQ=255) gCCCACACCGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGt > 2:495501/1‑117 (MQ=255) ttacCGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGTGGCGCGCTGTATGAGTGGGTGATCAATATTCCGGTGCCGTACCTCGATAAACTGGTTGCCCGTATGCCGCCAGt > 2:451038/3‑187 (MQ=255) gtagctgccgccccaccatctgaccaatctcaaagctgtcgatacctgttacctgtccggcaaccGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGTGGCGCGCTGTATGAGTg > 2:487320‑M2/66‑130 (MQ=255) acacCGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGTAATTTGCAGCCCTGTTCGCATCGGGTGgcg < 1:495508/117‑1 (MQ=255) ctgccgccccaccatctgaccaatctcaaagctgtcgatacctgttacctgtccggcaaccGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGCGTGGCGCGCTGTATGAGTGGGTg < 1:487327‑M2/69‑1 (MQ=255) cGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGTGGCGCGCTGTATGAGTGGGTGATCAATATTCCGGTGCCGTACCTCGATAAACTGGTTGCCCGTATGCCGCCAGTGGTc < 1:451045/187‑1 (MQ=255) gTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGTGGCGCGCTGTATGAGTGGGTGATCAATATTCCGGTGCCGTACCTCGATAAACTGGTTGCCCGTATGCCGCCAGTGGTCAGCGAGGCTACAGCCTATGCCGCCGTGTTTAAGTTTGACTGGTTCTCTGCCACCGGCACCGCCATTc > 1:320752/1‑252 (MQ=255) gCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGTGGCGCGCTGTATGAGTGGGTGATCAATATTCCGGTGCCGTACCTCGATAAACTGGTTGCCCGTATGCCGCCAGTGGTCAGCGAGGCTACAGCCTATGCCGCCGTGTTTAAGTTTGACTGGTTCTCTGCCACCGGCACCGCCATTCTGTTTGCTGCATTGCTCTCGATTGTCTGGCt < 1:577359/275‑1 (MQ=255) 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cAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGTGgcg < 1:76726/97‑1 (MQ=255) cAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGTGGCGCGCTGTAt < 2:664561/105‑1 (MQ=255) cAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCAGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGTGGCGCGCTGTATGAGTGGGTGATCAATATGCCGGTGCCGTACCTCGATAAACTGGTTGCCCGTATGCCGCCAGTGGTCAGCGAGGCTACa < 1:323360/183‑1 (MQ=255) aGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGTGGCGCGCTGTATGAGTGGGt < 2:696271/112‑1 (MQ=255) gtgtTACGTGCCTGGACACCGGTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGt > 2:400524/1‑90 (MQ=255) ttACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGt > 2:532996/1‑87 (MQ=255) tACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGTGgcg < 1:400531/90‑1 (MQ=255) aCGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCccgccg > 2:602986/1‑61 (MQ=255) gTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCCTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGTGgcg < 1:533004/87‑1 (MQ=255) gCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTa < 1:602995/61‑1 (MQ=255) ccTGGTCTCCGTTCCTTTTCCTGACAGCTTCCGTAACACGGTTGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGTGGCGCGCTGTNTGAGTGGGTGATCAATATTCCGGTGCCGTACCTCGATAAACTGGTTGCCCGTATGCCGCCAGTGGTCAGCGAGGCTACAGCCTATGCCGCCGTGTTTAAGTTTGACTGGTTCTCTGCCACCGGCACCGCCATTCTGTTTGCTGCACTGCTCTCGTTTGTCTGGCTGAAGATGAAACAGTCTGa < 1:513194/274‑1 (MQ=255) cTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGt > 2:157514/1‑79 (MQ=255) acacCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGTGgcg < 1:157517/79‑1 (MQ=255) gttcctgACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGTGGCGCGCTGTATGAGTGGGTGATCAATATTCCGGTGCCGTAc > 2:636200/1‑106 (MQ=255) cctgACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGTGGCGCGCTGTATGAGTGGGTGATCAATATTCCGGTGCCGTACCTCGATAAACTGGTTGCCCGTATGCCGCCAGTGGTCAGCGAGGCTACAGCCTATGCCGCCGTGTTTAAGTTTGACTGGTTCTCTGCCACCGGCACCGCCATTCTGTTTGCTGCACTGCTCTCGATTGTCTGGCTGAAGATGAAACCGTCTGACGCTATCAGCACCTTCGgc > 1:448765/1‑274 (MQ=255) ctgACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGTGGCGCGCTGTATGAGTGGGTGATCAATATTCCGGTGCCGTACCTCg < 1:636209/106‑1 (MQ=255) gACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGTGgcg > 2:533236/1‑62 (MQ=255) gACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGTGGCGCGCTGTATGAGTGGGTGATCAATATTCCGGTGCCGTACCTCGATAAACTGGTTGCCCGTATGCCGCCAGTGGTCAGCGAGGCTACAGCTTATGCCGCCGTGTTTAAGTTTGACTGGTTCTCTGCCACCGGCACCGCCATTCTGTTTGCTGCACTGCTCTCGATTGTCTGGCTGAAGATGAAACCGTCTGACGCTATCAGAACCTTCGgcagca > 1:569698/1‑275 (MQ=255) ctgCTACCGGAAACTTGTGGTGTAGCCCGCCGTTTACAGCCTTGTTGTCATCGGGTGGCGCGCTGTATGGGTGGGTGATCACTATTCCGGTTGCGTACCTCTCTAACCTGGTTGCCCGTATGCCGCCAGTGTTCAGCGAGGCTACAGCCTATGCCGCCTTGTTTAAGTTTGACCGGTTCTCTGCCACCGGCACCGCCATTCTGTTTGCTGCACTGCTCTCGATTGTCTGGCTGAAGATGAAACCGTCTGACGCTATCAGCACCTTCGGCAGCAc < 2:299093/272‑1 (MQ=255) gCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGTGGCGCGCt < 1:533244/62‑1 (MQ=255) | GCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGTCACAGGTTGATATGACGCTGGCCCACACCGGTTACACTGCGGGTCAGGTGTTACGTGCCTGGACACCGTTCCTGTTCCTGACAGCTACCGTAACACTGTGGAGTATCCCGCCGTTTAAAGCCCTGTTCGCATCGGGTGGCGCGCTGTATGAGTGGGTGATCAATATTCCGGTGCCGTACCTCGATAAACTGGTTGCCCGTATGCCGCCAGTGGTCAGCGAGGCTACAGCCTATGCCGCCGTGTTTAAGTTTGACTGGTTCTCTGCCACCGGCACCGCCATTCTGTTTGCTGCACTGCTCTCGATTGTCTGGCTGAAGATGAAACCGTCTGACGCTATCAGCACCTTCGGCAGCAC > CP009273/3771430‑3771960 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |