| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3979708 = | 75 (1.950) | 6 (0.170) | 4/296 | NT | 9.7% | intergenic (‑341/‑84) | aslA/glmZ | putative Ser‑type periplasmic non‑aryl sulfatase/sRNA antisense activator of glmS mRNA, Hfq‑dependent |
| ? | CP009273 | 3980211 = | 41 (1.130) | coding (1032/1197 nt) | hemY | putative protoheme IX synthesis protein | |||||
ATTGGAAAATCAGGAGAGCGTTTTCAATCCTACCTCTGGCGCAGTTGATATGTAAGGCAGGTTTATTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCAATTAATATATGTGTTATTAATTGAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCATAATAAACGAGTAGATGCTCATTCCATCTCTTATGTTCGCCTTAGTGCCTCATAAACTCCGGAATGACGCAGAGCCGTTTACGGTGCTTATCGTCCACTGACAGATGTCGCTTATGCCTCATCAGACACCATGGACACAACGTTGAGTGAAGCACCCACTTGTTGTCATAC > CP009273/3979501‑3979952 | aTTGGAAAATCAGGAGAGCGTTTTCAATCCTACCTCTGGCGCAGTTGATATGTAAGGCAGGTTTATTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCAATTAATATATGTGTTATTAATTGAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAagag > 1:355961/1‑221 (MQ=255) gAAAATCAGGAGAGCGTTTTCAATCCTACCTCTGGCGCAGTTGATATGTAAGGCAGGTTTATTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCAATTAATATATGTGTTATTAATTGAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGAtt < 2:355955/221‑1 (MQ=255) cTGTTTTTAGTTTTAACGGCAATTAATATATGTGTTATTAATTGAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCTCGATTCTCTGTGGCATAATAAACGAGTAGa > 1:382448/1‑208 (MQ=255) ttttAGTTTTAACGGCAATTAATATATGTGTTATTAATTGAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCATAATAAACGAGTAGATGCt < 2:382442/208‑1 (MQ=255) tcaaaaacgtcggcgatcgcccgctgttgtggagcacactgggccagtcactgatgaagcacggagaatggCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCataata < 1:233552‑M1/79‑1 (MQ=255) caaaaacgtcggcgatcgcccgctgttgtggagcacactgggccagtcactgatgaagcacggagaatggCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCataata < 1:17002‑M1/79‑1 (MQ=255) aaacgtcggcgatcgcccgctgttgtggagcacactgggccagtcactgatgaagcacggagaatggCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCATAATAAACg > 2:233547‑M1/68‑150 (MQ=255) aacgtcggcgatcgcccgctgttgtggagcacactgggccagtcactgatgaagcacggagaatggCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCATAATAAACg > 2:17002‑M1/67‑149 (MQ=255) acgtcggcgatcgcccgctgttgtggagcacactgggccagtcactgatgaagcacggagaatggCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCataata < 1:675769‑M1/79‑1 (MQ=255) aTCATTCATAATAAGTATGTGTAGGATCAAGCTCAGTTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGTTTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTa > 1:67177/1‑109 (MQ=255) ttcatAATAAGTATGTGTAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAggg < 2:67176/109‑1 (MQ=255) ttcatAATAAGTATGTGTAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCATAATAAACGAGTAGATGCTCa > 2:109186/1‑156 (MQ=255) cggcgatcgcccgctgttgtggagcacactgggccagtcactgatgaagcacggagaatggCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCATAATAAACg > 2:675760‑M1/62‑144 (MQ=255) taataaGTATGTGTAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCATAATAAACGAGTAGATGCTCATTcc < 1:109187/156‑1 (MQ=255) tgtgTAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCAt > 2:206834/1‑81 (MQ=255) tgtgTAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGCCATAATAAACGAGTAGATGCTCAtt > 1:39505/1‑145 (MQ=255) tgtAGGATCAAGCTCCGGTTAAACCTTCGTTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGcct > 1:493884/1‑119 (MQ=255) tgtAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAgg > 2:694989/1‑61 (MQ=255) tgtAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAAtt > 2:552368/1‑72 (MQ=255) tgtAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTAt > 2:203907/1‑101 (MQ=255) tgtAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCATAATAAACGAGTAGa > 1:408253/1‑135 (MQ=255) tgtAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCATAATAAACGAGTAGATGCTCAtt > 1:612655/1‑143 (MQ=255) tgtAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCATAATAAACGAGTAGATGCTCATTCCATCTCTTATGTTCGCCTTAGTGCCTCATAAACTCCGGAATGACGCAGAGCCGTTTACGGTGCTTATCGTCCACTGACAGATGTCGCTTATGCCTCATCAGa > 2:324056/1‑246 (MQ=255) tAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAgg > 2:287978/1‑59 (MQ=255) tAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACa < 1:206838/81‑1 (MQ=255) tAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCATAATAAACGAGTAGATGCTCATTCCATCTCTTATGTTCGCCTTAGTGCCTCATAAACTCCGGAATGACGCAGAGCCGTTTACGGTGCTTATCGTCCACTGACAGATGTCGCTGATGCCTCATCAGACACCATGGACACAACGTTGAGTGAAgacccc > 2:160389/1‑270 (MQ=255) tAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGCCATAATAAACGAGTAGATGCTCATTCCAt < 2:39505/145‑1 (MQ=255) ggATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTAtct < 1:552377/72‑1 (MQ=255) ggATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTcc < 1:203911/101‑1 (MQ=255) ggATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCATAATAAACGAGTAGATGCt < 2:408246/135‑1 (MQ=255) ggATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCATAATAAACGAGTAGATGCTCATTCCAt < 2:612646/143‑1 (MQ=255) ggATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCATAATAAACGAGTAGATGCTCATTCCATCTCTTATGTTCGCCTTAGTGCCTCATAAACTCCGGAATGACGCAGAGCCGTTTACGGTGCTTATCGTCCACTGACAGATGTCGCTTATGCCTCATCAGACAcc < 1:324062/246‑1 (MQ=255) ggATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGAATa < 1:694998/61‑1 (MQ=255) ggATCAAGCTCAGGTTAAATAGTCACTCAGGGAGTGAATAATCATGAAGCCAAGAGGATTACAGAATGATCTCATGACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGAATCTCTGTGGCataata < 2:493877/121‑1 (MQ=255) gATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCa > 2:238647/1‑73 (MQ=255) aTCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTa < 1:287983/59‑1 (MQ=255) aTCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCATAATAAACGAGTAGATGCTCATTCCATCTCTTATGTTCGCCTTAGTGCCTCATAAACTCCGGAATGACGCAGAGCCg > 1:407461/1‑191 (MQ=255) aaGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAAc < 1:238652/73‑1 (MQ=255) aGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCa > 2:464300/1‑68 (MQ=255) aGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCa > 1:697324/1‑68 (MQ=255) aGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAAc > 2:426706/1‑72 (MQ=255) aGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCat > 2:705804/1‑111 (MQ=255) aGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCATAATAAACg > 2:434889/1‑119 (MQ=255) aGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCATAATAAACGAGTAGATGCTCAt > 2:688216/1‑132 (MQ=255) aGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCATAATAAACGAGTAGATGCTCATTCCAtc > 2:148397/1‑138 (MQ=255) aGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCATAATAAACGAGTAGATGCTCATTCCATCTCTTATGTTCGc > 1:118428/1‑150 (MQ=255) aGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCATAATAAACGAGTAGATGCTCATTCCATCTCTTATGTTCGCCTTAGTGCCTCATAAACTCCGGAATGACGCAGANCCGTTTACNGTGCTTATCGTCCACTGACAGATGTCGCTTATGCCTCATCAGACACCATGGACACAACGTTGAGTGAAGCACCCACttgct > 1:472318/1‑272 (MQ=255) aGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCATAATAAACGAGTAGATGCTCATTCCATCTCTTATGTTCGCCTTAGTGCCTCATAAACTCCGGAATGACGCAGAGCCGTTTa < 2:407454/191‑1 (MQ=255) cAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAAc < 1:464307/68‑1 (MQ=255) cAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAAc < 2:697315/68‑1 (MQ=255) cAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAgt < 1:426713/72‑1 (MQ=255) cAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCGCGATTCTCTGTGGCATAATAAACGAGTAGATGCTCATTCCATCTCTTATGTTCGCCTTAGTGCCTCATAAACTCCGGAATGACGCAGAGCCGTTTACGGTGCTTATCGTCCACTGACAGATGTCGCTTATGCCTCATCAGACACCATGGACACAACGTTGAGTGAAGCACCCACttg < 1:389099/268‑1 (MQ=255) cAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCATAATAAACGAGTa < 1:434896/119‑1 (MQ=255) cAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCATAATAAACGAGTAGATGCTCATTCCa < 1:688225/132‑1 (MQ=255) cAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCATAATAAACGAGTAGATGCTCATTCCATCTCtt < 1:148398/138‑1 (MQ=255) cAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCATAATAAACGAGTAGATGCTCATTCCATCTCTTATGTTCGCCTTa < 2:118427/150‑1 (MQ=255) cAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTCTGGCataata < 1:705814/111‑1 (MQ=255) aGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAgg > 1:707685/1‑46 (MQ=255) aGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCATAATAAACGAGTAGATGCTCATTCCATCTCTTa > 1:458809/1‑138 (MQ=255) gTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGa > 1:295611/1‑45 (MQ=255) gTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCATAATAAACGAGTAGCTGCTCATTCCATCTCTTATGTTCGCCTTAGTGCCTCATAAACTCCGGATTGACGCAGAGCCGTTTACGGTGCTTATCGTCCACTGATAGATGTCGCTTATGCCACATCAGCCACCATGGAAACAACGTGGATGTAAGCAGACACTTGTTGTCAtcc > 2:671440/1‑272 (MQ=255) tAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTa < 2:707675/46‑1 (MQ=255) tAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCATAATAAACGAGTAGATGCTCATTCCATCTCTTATGtt < 2:458802/138‑1 (MQ=255) aaaTATCCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTTCAGAATTATCTCATAACAAg > 1:523971/1‑65 (MQ=255) aaTATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTAc < 2:295605/45‑1 (MQ=255) aaTATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACa > 1:651244/1‑46 (MQ=255) aaTATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCa > 2:424410/1‑57 (MQ=255) atatTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAAtt > 2:583895/1‑50 (MQ=255) atatTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCata > 2:162892/1‑100 (MQ=255) ttCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCCAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAAc < 1:424417/57‑1 (MQ=255) ttCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAAt < 2:651235/46‑1 (MQ=255) tCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTAtct < 1:583904/50‑1 (MQ=255) tCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCAtaataa < 1:162895/100‑1 (MQ=255) cACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCataat > 2:130828/1‑97 (MQ=255) cACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCataat > 2:332548/1‑97 (MQ=255) cAGGAAGTTATTACTCAGGAAGGAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCATAATAAAc < 1:130829/97‑1 (MQ=255) cAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCATAATAAAc < 1:332554/97‑1 (MQ=255) cAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCATAATAAACGAGTAGATGCTCATTCCAtc > 2:468690/1‑117 (MQ=255) gAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCATAATAAACGAGTa > 2:138721/1‑99 (MQ=255) aaGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCATAATACACGAGTAGATGCTCATTCCATCTCtt < 1:468697/117‑1 (MQ=255) ttattaCTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCATAATAAACGAGTAGATg < 1:138722/99‑1 (MQ=255) | ATTGGAAAATCAGGAGAGCGTTTTCAATCCTACCTCTGGCGCAGTTGATATGTAAGGCAGGTTTATTATATCGCGTTGATTATTGATGCTGTTTTTAGTTTTAACGGCAATTAATATATGTGTTATTAATTGAATGAATTTTATCATTCATAATAAGTATGTGTAGGATCAAGCTCAGGTTAAATATTCACTCAGGAAGTTATTACTCAGGAAGCAAAGAGGATTACAGAATTATCTCATAACAAGTGTTAAGGGATGTTATTTCCCGATTCTCTGTGGCATAATAAACGAGTAGATGCTCATTCCATCTCTTATGTTCGCCTTAGTGCCTCATAAACTCCGGAATGACGCAGAGCCGTTTACGGTGCTTATCGTCCACTGACAGATGTCGCTTATGCCTCATCAGACACCATGGACACAACGTTGAGTGAAGCACCCACTTGTTGTCATAC > CP009273/3979501‑3979952 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |