| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4248643 = | 68 (1.770) | 5 (0.130) | 4/304 | NT | 6.7% | coding (974/1380 nt) | dinF | oxidative stress resistance protein; putative MATE family efflux pump; UV and mitomycin C inducible protein |
| ? | CP009273 | 4248767 = | 73 (1.960) | coding (1098/1380 nt) | dinF | oxidative stress resistance protein; putative MATE family efflux pump; UV and mitomycin C inducible protein | |||||
GCGGAATTTCCGGCGAAATGCTGAAAACTGCCTGGCGAGGAAACTTCCGTCGCTTGCTGGCGCTTAACCGCGATATCATGCTGCGTTCGCTGTTGTTGCAACTCTGTTTCGGCGCGATCACCGTACTTGGCGCGCGACTGGGGAGTGACATTATCGCTGTTAACGCGGTTCTGATGACGCTACTCACCTTTACCGCCTATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCT > CP009273/4248370‑4248916 | gcaaaccaggtaccattgcgccagtgacgccgccagatagccgccagagaaagcccgcgcaacgccagaaagacggttaatgccagccacaaagcatgattacccagccacggcagcgtaaggagcgtcagcgcaaaacctgcggcggccaccgccatactgttacgcatttcggtggcacgcgttgcgcctataaacatgccgtccagcagataacaccagacgccaaccaccggcaaaatcacctgccagataagatagcggtcagccagctg > 1:186143‑M1/274‑275 (MQ=255) gAATTTCCGGCGAAATGCTGAAAACTGCCTGGCGAGGAAACTTCCGTCGCTTGCTGGCGCTTAACCGCGATATCATGCTGCGTTCGCTGTTGTTGCAACTCTGTTTCGGCGCGATCACCGTACTTGGCGCGCGACTGGGGAGTGACATTATCGCTGTTAACGCGGTTCTGATGACGCTACTCACCTTTACCGCCTATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTg > 1:2862/1‑275 (MQ=255) gCTGAAAACTGCCTGGCGAGGAAACTTCCGTCGCTTGCTGGCGCTTAACCGCGATATCATGCTGCGTTCGCTGTTGTTGCAACTCTGTTTCGGCGCGATCACCGTACTTGGCGCGCNACTGGGGAGTGACATTATCGCTGTTAACGCGGTTCTGATGACGCTACTCACCTTTACCGCCTATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAg < 1:661631/275‑1 (MQ=255) tCCGTCGCTTGCTGGCGCTTAACCGCGATATCATGCTGCGTTCGCTGTTGTTGCAACTCTGTTTCGGCGCGATCACCGTGCTTGGCGCGCGACTGGGGAGTGACATTATCGCTGTTAACGCGATTCTGATGACGCTACTCACCTTTACCGCCTATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCg < 1:678168/275‑1 (MQ=255) gcgATATCATGCTGCTTTCGCTGTTGTTGCAACTCTGTTTCGGCGCGATCACCGTACTTGGCGCGCGACTGGGGAGTGACATTATCGCTGTTAACGCGGTTCTGATGACGCTACTCACCTTTACCGCCTATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTg < 1:278873/275‑1 (MQ=255) gtttttatgtggcGTTGGCGTTTGTTGAACTTGTGTGTCGGCGCGATCACCGTACTTGGCTCGCGACTGGGGAGTGACATTATCGCTGTTAACGCGGTTCTGATGACGCTACTCACCTTTACCGCCTATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTgc < 2:340264/263‑1 (MQ=255) gATATCATGCTGCGTTCGCTGTTGTTGCAACTCTGTTTCGGCGCGATCACCGTACTTGGCGCGCGACTGGGGAGTGACATTATCGCTGTTAACGCGGTTCTGATGACGCTACTCACCTTTACCGCCTATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTgct < 1:142280/275‑1 (MQ=255) tcgtgcggcccacGCTGTTGTTGAACCACTGTTTCGGCGCGATCACCGTATGTGGCGGGCGTCTGGGGATTGACATTATCGCTGTTAACGCGGTTCTGATGACGCTACTTACCTTTACCGCCTATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCTGTCAGGCATACGGTGCGCGAGACGGGAGCCAGATACTGGGTGGCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCCTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTgctgg < 2:33209/261‑1 (MQ=255) tgctgcGTTCGCTGTTGTTGCAACTCTGTTTCGGCGCGATCACCGTACTTGGCGCGCGACTGGGGAGTGACATTATCGCTGTTAACGCGGTTCTGATGACGCTACTCACCTTTACCGCCTATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGGGCCGACAgacatcca > 1:262065/1‑227 (MQ=255) tgcGTTCGCTTTTTTTGCAATTTTGTTTCGGCGCGGTCATCGTAATTGGCGCGCGACTGGGGAGTGACATTATCGCTTTTAACGCGGTTCTGATGACGCTACTCACCTTTACCGCCTATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGaa < 1:213971/275‑1 (MQ=255) tgcGTTCGCTGTTGTTGCAACTCTGTTTCGGCGCGATCACCGTACTTGGCGCGCGACTGGGGAGTGACATTATCGCTGTTAACGCGGTTCTGATGACGCTACTCACCTTTACCGCCTATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGaa > 1:350492/1‑275 (MQ=255) gtataagtgacaggttgCAACTCTGTTTCGGCGCGATCAACGTACTTGGCGCGCGACTGGGGAGTGACATTTTCGCTGTTAACGCGGTTCTNATGACGCTACTCACCTTTACCGCCTATGCGCTGGATGTTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGACAGTTGCTGGATGTCTGGCTGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTGTTTGCTGGCCGGGGaa < 1:537709/262‑1 (MQ=255) gcGTTCGCTGTTGTTGCAACTCTGTTTCGGCGCGATCACCGTACTTGGCGCGCGACTGGGGAGTGACATTATCGCTGTTAACGCGGTTCTGATGACGCTACTCACCTTTACCGCCTATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAac < 1:130517/275‑1 (MQ=255) aaagcatgattacccagccacggcagcgtaaggagcgtcagcgcaaaacctgcggcggccaccgccatactgttacgcatttcggtggcacgcgttgcgcctataaacatgccgtccagcagataacaccagacgccaaccaccggcaaaatcacctgccagataagatagcggtcagccagcTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCtggctggggaaacaatcatt < 1:265402‑M1/92‑10 (MQ=255) ctctGTTTTGGCTCGATCGCCGTACTTGGCGCGCTACTGGGGAGTGTCAGTATCGCTGTTAACGCGGTTCTGATGACGCTACTCTCCTTTACCGCCTATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGAc < 1:309144/275‑1 (MQ=255) ctctGTTTCGGCGCGATCACCGTACTTGGCGCGCGACTGGGGAGTGACATTATCGCTGTTAACGCGGTTCTGATGACGCTACTCACCTTTACCGCCTATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTACGTAACTGa > 1:152408/1‑274 (MQ=255) acccagccatggcagcgaaatgggcgtcagcgcaaaacttgcggcggccaccgccatactgttatgcatttcggtggcacgcgttgcgcctataaacatgccgtccagcagataacaccagacgccaaccaccggcaaaatcacctgccagataagatagcggtcagccagcTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGAc > 1:281022‑M1/173‑275 (MQ=255) cggcggcagnggaaggggcgtcagcgacaaccctgcgccggccaccgccatactgttacgcatttcggtggcacgcgttgcgcctataaacatgccgtccagcagataacaccagacgccaaccaccggcaaaatcacctgccagataagatagcggtcaggcagcTGCTGGATGTCGGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGtt > 2:265397‑M1/167‑275 (MQ=255) gATCACCGTACTTGGCGCGCGACTGGGGAGTGACATTATCGCTGTTAACGCGGTTCTGATGACGCTACTCACCTTTACCGCCTATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTgctggctg < 1:592300/236‑1 (MQ=255) attttgcgcgcGACTGGGGAGTGACATCTTCGCTGTTAACGCGGTTCTGATGACGCTACTCACCTTTTCCGCCTAGGCGCTGGAGGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGTCATACTGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTcagcag < 1:632235/269‑1 (MQ=255) ggCGCGCGACTGGGGAGTGACATTATCGCTGTTAACGCGGTTCTGATGACGCTACTCACCTTTACCGCCTATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTgccg > 2:67198/1‑173 (MQ=255) ggCGCGCGACTGGGGAGTGACATTATCGCTGTCAACGCGGTTCTGATGACGCTACTCACCTTTACCGCCTATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCTGGCATACGGTGCGCGCGACGGTCGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTCCTGTTTGCGGGGGTTTATTTTCTGGCCGGTGAACACATAAGTGCGTTACTGACGGCGGTAACCCCGACTcaggcgcgtgg > 2:216023/1‑267 (MQ=255) cgcgACTGGGGAGTGACATTATCGCTGTTAACGCGGTTCTGATGACGCTACTCACCTTTACCGCCTATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAg < 1:67199/173‑1 (MQ=255) gtgttttgggAGTGATATTATCGCTGTTAACGCGGTTCTGATGACGCTACTCACCTTTTCCGCCTATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGAGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGAcc < 1:642223/268‑1 (MQ=255) agggAGTGANATTATCGCTGGTAACGCGGTTCTGATGACGCTACTCACCTTTCTCGCATATGCGCTTGATGGTTTGGCCGACGCGGGTGAAGCGCACTCCTGTCAGGCATACGGTTCGCGCGACGGTATCCAGTGGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCTGGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCTTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCta < 2:71082/272‑1 (MQ=255) aCATTATAGCTGTTAACGCGGTTCTGATGACGCTACTCACCTTTACCGCCTATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGc > 2:539894/1‑145 (MQ=255) tataGCTGTTAACGCGGTTCTGATGACGCTACTCACCTTTACCGCCTATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCg < 1:539902/145‑1 (MQ=255) aTCGCTGTTAACGCGGTTCTGATGACGCTACTCACCTTTACCGCCTATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGTGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGAAGCCAGTCGGGNATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGt > 1:657837/1‑275 (MQ=255) aTCGCTGTTAACGCGGTTCTGATGACGCTACTCACCTTTACCGCCTATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACTGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTAATGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGAcc > 1:71083/1‑256 (MQ=255) gCTGTTAACGCGGTTCTGATGACGCTACTCACCTTTACCGCCTATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACTACATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCCGATTCAACAGCCGGCTGACCGGcatcttagtcctgtcttt > 2:679649/1‑262 (MQ=255) ttAACGCGGTTCTGATGACGCTACTCACCTTTACCGCCTATGCGCTGGATGGTTCTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCg < 1:679658/250‑1 (MQ=255) ctgttacgcatttcggtggcacgcgttgcgcctataaacatgccgtccagcagataacaccagacgccaaccaccggcaaaatcacctgccagataagatagcggtcagccagcTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCCTTGCGTTAc < 2:235908‑M1/99‑1 (MQ=255) tacgcatttcggtggcacgcgttgcgcctataaacatgccgtccagcagataacaccagacgccaaccaccggcaaaatcacctgccagataagatagcggtcagccagcTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGAc > 1:235913‑M1/111‑213 (MQ=255) gTTCTGATGACGCTACTCACCTTTACCGCCTATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTggg > 1:125796/1‑186 (MQ=255) tgatgaCGCTACTCACCTTTACCGCCTATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAac < 2:125795/186‑1 (MQ=255) tattagatacagccTTTACCGCCTATGCGCTTGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGt < 1:23380/262‑1 (MQ=255) gCTACTCACCTTTACCGCCTCTGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATCTGCTGGCTGGGGAACACATNATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGCCCGCTATCTTATCTGGCAGGTGCTTTTGCCGGTGGTTGGCGGCTGgt > 1:561534/1‑275 (MQ=255) cacgcgttgcgcctataaacatgccgtccagcagataacaccagacgccaaccaccggcaaaatcacctgccagataagatagcggtcagccagctgctg < 2:447871‑M1/5‑1 (MQ=255) tACCGCCTATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTNGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGATGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTgg > 1:600826/1‑275 (MQ=255) cttgggggcgggttGGTTTTGCCTACGTGGTTGAGCCGCGCTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCGGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGc < 2:657828/262‑1 (MQ=255) cccattcgcTGGTTGGTTTTGCCTACGTGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGc < 2:600817/269‑1 (MQ=255) tATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACAGCATTGCGTTACTGACGTCGNTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGGCTGGTGTTATCTGCTGTACGGCa > 1:545027/1‑274 (MQ=255) tATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACAACTCATTGCTTTACTGCCGTCGTTAACCCAGCATCAGCAGCTGGCAGACACCTCTCTTAACTGGCAGGGTCTTGTTCCGGGGGTTGGGTTCTGGTGTTGTcctgtagtttttta > 2:23380/1‑262 (MQ=255) tATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCT‑GGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGCCGGCATg > 1:344684/1‑275 (MQ=255) tATGCGCTGGATGGTTTTGACTACGCGGTTGAAGCGCACGCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGTCTGGGGAac > 1:426123/1‑160 (MQ=255) cgcTGGATGGTTTTGGCGACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACAcat < 2:426116/160‑1 (MQ=255) gATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGc > 2:217561/1‑82 (MQ=255) gATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGAGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTgctg > 1:330911/1‑141 (MQ=255) gTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGc < 1:217565/82‑1 (MQ=255) gTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTgctggctg < 2:330905/141‑1 (MQ=255) ttttGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGt > 1:278711/1‑86 (MQ=255) ttttGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCAAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGAAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGGTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTAc > 1:420736/1‑161 (MQ=255) gCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTgccg < 2:278706/86‑1 (MQ=255) ccTACGCGGTTGAGGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGGAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTNGGGGATCGTAGCGTTACTGCTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAAcgcg < 1:542079/274‑1 (MQ=255) ccTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCgggg > 1:63446/1‑95 (MQ=255) tACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGc < 1:78180/252‑1 (MQ=255) cgcgGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCg < 2:63445/95‑1 (MQ=255) gcgGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTgccgcc > 2:367657/1‑82 (MQ=255) ttGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTc < 1:367663/82‑1 (MQ=255) cACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGa > 1:351251/1‑233 (MQ=255) tgccGGTCGGGCATACGGTGCGCGAGACGGTATCCATTTGCTGGATGTCTGGCTGGCAGCGTGCCGCCAGTCTGGGATCGTAGCGTTATTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACTCATCACTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACa < 1:641689/273‑1 (MQ=255) cTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTg > 2:539855/1‑63 (MQ=255) ggTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTgccgc < 1:539863/63‑1 (MQ=255) gTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAacac > 2:390465/1‑119 (MQ=255) ggCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACAcatca < 1:390471/119‑1 (MQ=255) tACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTTTTATCTGCTGGCCGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGc > 1:353833/1‑256 (MQ=255) cGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGGATGGCGGTGgccg > 1:683579/1‑275 (MQ=255) tGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTg > 1:597170/1‑91 (MQ=255) tGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTTGAAGGCATGTTTATGAGCGCaa > 1:334230/1‑233 (MQ=255) cgcgcgACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACNGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCa > 1:601580/1‑275 (MQ=255) cgcgACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGNCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGCCTGGCGTATGGTGCTATCTGCTGGACGGc < 1:495548/213‑1 (MQ=255) cgcgACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTgctgg < 2:597161/91‑1 (MQ=255) cgcgACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGc < 1:297829/213‑1 (MQ=255) cgACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGNCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGc < 1:553135/211‑1 (MQ=255) cgACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGCCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAgct > 1:411901/1‑141 (MQ=255) ggTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAgctggct < 2:411894/141‑1 (MQ=255) ttGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTa > 1:46393/1‑68 (MQ=255) tTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGAACGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGGGTTATCTGTTGGGCGGCATGTTTATCGGCGCAACGCGTGCCCACGAAATGCGTAAAAGTATGGCGGTGGCCGCCGCCGAGTttgcgctcaagct < 1:138363‑M1/274‑7 (MQ=255) | GCGGAATTTCCGGCGAAATGCTGAAAACTGCCTGGCGAGGAAACTTCCGTCGCTTGCTGGCGCTTAACCGCGATATCATGCTGCGTTCGCTGTTGTTGCAACTCTGTTTCGGCGCGATCACCGTACTTGGCGCGCGACTGGGGAGTGACATTATCGCTGTTAACGCGGTTCTGATGACGCTACTCACCTTTACCGCCTATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCT > CP009273/4248370‑4248916 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |