New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 4248643 = | 68 (1.770) | 5 (0.130) | 4/304 | NT | 6.7% | coding (974/1380 nt) | dinF | oxidative stress resistance protein; putative MATE family efflux pump; UV and mitomycin C inducible protein |
? | CP009273 | 4248767 = | 73 (1.960) | coding (1098/1380 nt) | dinF | oxidative stress resistance protein; putative MATE family efflux pump; UV and mitomycin C inducible protein |
ACTTGGCGCGCGACTGGGGAGTGACATTATCGCTGTTAACGCGGTTCTGATGACGCTACTCACCTTTACCGCCTATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGC > CP009273/4248494‑4249039 | attttgcgcgcGACTGGGGAGTGACATCTTCGCTGTTAACGCGGTTCTGATGACGCTACTCACCTTTTCCGCCTAGGCGCTGGAGGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGTCATACTGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTcagcag < 1:632235/269‑1 (MQ=255) gtgttttgggAGTGATATTATCGCTGTTAACGCGGTTCTGATGACGCTACTCACCTTTTCCGCCTATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGAGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGAcc < 1:642223/268‑1 (MQ=255) agggAGTGANATTATCGCTGGTAACGCGGTTCTGATGACGCTACTCACCTTTCTCGCATATGCGCTTGATGGTTTGGCCGACGCGGGTGAAGCGCACTCCTGTCAGGCATACGGTTCGCGCGACGGTATCCAGTGGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCTGGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCTTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCta < 2:71082/272‑1 (MQ=255) aTCGCTGTTAACGCGGTTCTGATGACGCTACTCACCTTTACCGCCTATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGTGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGAAGCCAGTCGGGNATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGt > 1:657837/1‑275 (MQ=255) aTCGCTGTTAACGCGGTTCTGATGACGCTACTCACCTTTACCGCCTATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACTGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTAATGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGAcc > 1:71083/1‑256 (MQ=255) gCTGTTAACGCGGTTCTGATGACGCTACTCACCTTTACCGCCTATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACTACATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCCGATTCAACAGCCGGCTGACCGGcatcttagtcctgtcttt > 2:679649/1‑262 (MQ=255) ttAACGCGGTTCTGATGACGCTACTCACCTTTACCGCCTATGCGCTGGATGGTTCTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCg < 1:679658/250‑1 (MQ=255) tattagatacagccTTTACCGCCTATGCGCTTGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGt < 1:23380/262‑1 (MQ=255) gCTACTCACCTTTACCGCCTCTGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATCTGCTGGCTGGGGAACACATNATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGCCCGCTATCTTATCTGGCAGGTGCTTTTGCCGGTGGTTGGCGGCTGgt > 1:561534/1‑275 (MQ=255) tACCGCCTATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTNGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGATGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTgg > 1:600826/1‑275 (MQ=255) cttgggggcgggttGGTTTTGCCTACGTGGTTGAGCCGCGCTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCGGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGc < 2:657828/262‑1 (MQ=255) cccattcgcTGGTTGGTTTTGCCTACGTGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGc < 2:600817/269‑1 (MQ=255) tATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACAGCATTGCGTTACTGACGTCGNTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGGCTGGTGTTATCTGCTGTACGGCa > 1:545027/1‑274 (MQ=255) tATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACAACTCATTGCTTTACTGCCGTCGTTAACCCAGCATCAGCAGCTGGCAGACACCTCTCTTAACTGGCAGGGTCTTGTTCCGGGGGTTGGGTTCTGGTGTTGTcctgtagtttttta > 2:23380/1‑262 (MQ=255) tATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCT‑GGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGCCGGCATg > 1:344684/1‑275 (MQ=255) ccTACGCGGTTGAGGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGGAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTNGGGGATCGTAGCGTTACTGCTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAAcgcg < 1:542079/274‑1 (MQ=255) tACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGc < 1:78180/252‑1 (MQ=255) cACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGa > 1:351251/1‑233 (MQ=255) tgccGGTCGGGCATACGGTGCGCGAGACGGTATCCATTTGCTGGATGTCTGGCTGGCAGCGTGCCGCCAGTCTGGGATCGTAGCGTTATTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACTCATCACTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACa < 1:641689/273‑1 (MQ=255) tACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTTTTATCTGCTGGCCGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGc > 1:353833/1‑256 (MQ=255) cGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGGATGGCGGTGgccg > 1:683579/1‑275 (MQ=255) tGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTTGAAGGCATGTTTATGAGCGCaa > 1:334230/1‑233 (MQ=255) cgcgcgACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACNGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCa > 1:601580/1‑275 (MQ=255) cgcgACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGNCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGCCTGGCGTATGGTGCTATCTGCTGGACGGc < 1:495548/213‑1 (MQ=255) cgcgACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGc < 1:297829/213‑1 (MQ=255) cgACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGNCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGc < 1:553135/211‑1 (MQ=255) cgACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGCCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAgct > 1:411901/1‑141 (MQ=255) ggTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAgctggct < 2:411894/141‑1 (MQ=255) tTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGAACGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGGGTTATCTGTTGGGCGGCATGTTTATCGGCGCAACGCGTGCCCACGAAATGCGTAAAAGTATGGCGGTGGCCGCCGCCGAGTttgcgctcaagct < 1:138363‑M1/274‑7 (MQ=255) tGTCTGGCTGGCATGGTGACTCCAGGCGGGGTTGGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGTTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGTCTTCGTTAACCCAGTTTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTTTCTGGCAGGTGATGTGGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGTCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACg < 1:379893/274‑1 (MQ=255) tCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTgg > 1:189805/1‑170 (MQ=255) tCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCCTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGa > 1:688448/1‑184 (MQ=255) ggggCGGGCAGTGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTTTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTg < 2:601571/272‑1 (MQ=255) gCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGtt < 2:189802/170‑1 (MQ=255) 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tttGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTc < 2:505653/109‑1 (MQ=255) tttGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGc < 1:265135/130‑1 (MQ=255) gcgggttggGGTNCACAGCATTCTGTTCCTGACGGCGTTCACCCAGTGTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGCCGGCTGTTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTgcgcct < 2:530454/267‑3 (MQ=255) ggctggGGAACACATCATTGCGTTACTGCCGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACATTATGGCGGTGGCCGCCGCNGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTgcccctataaa > 1:530462/1‑266 (MQ=255) ggctggGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGGTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGAGGTGGCCGCCGCNGGTTTTGCNCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTATTTCTGGCGTTGCGCGGGCt > 1:475812/1‑273 (MQ=255) gctggGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTCTCTGCTGGAAGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGACGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACAGTCTTTCTGGCGTTGCGCgggtt > 1:129548/1‑270 (MQ=255) tggGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGcc > 2:392043/1‑210 (MQ=255) ggggAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGc < 1:378068/120‑1 (MQ=255) gAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTgg < 1:392049/210‑1 (MQ=255) catTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGGAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTGTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGCGGCTCGGGAATCATGCTTTGTGGCTGGCAGTAACCGGCTTTCTGGCGTTGGGCGGGCGTTCTCTGGCGGCttttt > 2:675462/1‑271 (MQ=255) tACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAgctggctg > 2:52041/1‑36 (MQ=255) tACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGAtttt > 2:509439/1‑64 (MQ=255) tACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTgg > 2:335279/1‑83 (MQ=255) cTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCggtggt > 1:631996/1‑71 (MQ=255) cTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTAt > 1:4291/1‑87 (MQ=255) gACGTCGTTAACCCTGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGa < 1:359525/170‑1 (MQ=255) gACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCg < 1:52041/36‑1 (MQ=255) gACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCg < 1:509446/64‑1 (MQ=255) gACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGtt < 1:335285/83‑1 (MQ=255) aCGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCAc > 2:353773/1‑122 (MQ=255) cgtcgtTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGc < 2:631987/71‑1 (MQ=255) cgtcgtTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATctgc < 2:4291/87‑1 (MQ=255) cgtTAACCCAGCTTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCACGCTTTGtggc < 1:700166/207‑1 (MQ=255) cgtTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGaa < 1:353779/122‑1 (MQ=255) gtTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGa > 2:432793/1‑87 (MQ=255) gtTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTcc > 2:60360/1‑170 (MQ=255) aCCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGc < 1:432800/87‑1 (MQ=255) aCCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTAc < 1:60361/170‑1 (MQ=255) aGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGCTGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACTGTATGGCGGTGCCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCAGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTAcc < 1:675471/275‑1 (MQ=255) gATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAAcg > 1:447878/1‑100 (MQ=255) aTTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGAGGCAATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTg > 1:37842/1‑275 (MQ=255) cagcaGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTg < 2:447871‑M2/95‑1 (MQ=255) caGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGc > 1:186143‑M2/3‑275 (MQ=255) | ACTTGGCGCGCGACTGGGGAGTGACATTATCGCTGTTAACGCGGTTCTGATGACGCTACTCACCTTTACCGCCTATGCGCTGGATGGTTTTGCCTACGCGGTTGAAGCGCACTCCGGTCAGGCATACGGTGCGCGCGACGGTAGCCAGTTGCTGGATGTCTGGCGGGCAGCGTGCCGCCAGTCGGGGATCGTAGCGTTACTGTTTTCGGTGGTTTATTTGCTGGCTGGGGAACACATCATTGCGTTACTGACGTCGTTAACCCAGATTCAGCAGCTGGCTGACCGCTATCTTATCTGGCAGGTGATTTTGCCGGTGGTTGGCGTCTGGTGTTATCTGCTGGACGGCATGTTTATAGGCGCAACGCGTGCCACCGAAATGCGTAACAGTATGGCGGTGGCCGCCGCAGGTTTTGCGCTGACGCTCCTTACGCTGCCGTGGCTGGGTAATCATGCTTTGTGGCTGGCATTAACCGTCTTTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGC > CP009273/4248494‑4249039 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |